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单核苷酸多态性的研究进展 被引量:51
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作者 杜玮南 孙红霞 方福德 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期392-394,共3页
单核苷酸多态性 (SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种 DNA序列多态性。SNP现象在人类基因组中广泛存在 ,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个 SNP标记 ,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对 SN... 单核苷酸多态性 (SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种 DNA序列多态性。SNP现象在人类基因组中广泛存在 ,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个 SNP标记 ,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对 SNP检测和分析技术的进一步发展 ,尤其是与 DNA芯片等技术的结合 ,它已成为第三代遗传标记 ,初步满足对疾病相关基因定位研究的需要 ,尤其是对多基因遗传病高精度基因定位的要求 ,并将最终取代目前最常用的微卫星标记技术进入基因应用研究的领域。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 遗传标记 基因研究 DNA芯片
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淄博市汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶和甲硫氨酸合成酶还原酶基因多态性分布研究 被引量:85
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作者 从玉英 鲁衍强 +2 位作者 芮欣忆 曹修亮 王茜云 《现代妇产科进展》 CSCD 2012年第10期779-781,共3页
目的:分析淄博市汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G基因多态性的分布特征。方法:采用横断面调查研究方法,以淄博市1041例汉族女性为研究对象,采集口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,采用... 目的:分析淄博市汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G基因多态性的分布特征。方法:采用横断面调查研究方法,以淄博市1041例汉族女性为研究对象,采集口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,采用Taqman-MGB技术检测MTHFR和MTRR基因多态性。统计分析基因多态性的分布特征,并与已报道的其他地区数据进行比较。结果:淄博市汉族女性的MTHFR 677TT纯合突变基因型频率为43.6%,显著高于郑州、德阳、海南地区(P<0.01);MTHFR 1298CC纯合突变基因型频率为1.4%,显著低于德阳和海南地区(P<0.01)。MTRR 66GG纯合突变基因型频率为4.8%,显著低于海南地区(P<0.01)。结论:淄博市汉族女性有不同于其他地区的MTHFR和MTRR基因多态性分布特征。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性 汉族 妇女 遗传学 群体 口腔粘膜 基因型 出生缺陷
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新疆维吾尔族和汉族女性MTHFR和MTRR基因单核苷酸多态性比较 被引量:56
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作者 郝友瑛 赵红 +3 位作者 鲁衍强 李瑛 玛尔哈巴 杨琦 《中国妇幼保健》 CAS 北大核心 2014年第21期3495-3497,共3页
目的:探讨新疆维吾尔族和汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G单核苷酸多态性的分布特征。方法:选取2012年10月-2013年7月在该院行孕前与孕期检查的女性210名,采集口腔黏膜上皮... 目的:探讨新疆维吾尔族和汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G单核苷酸多态性的分布特征。方法:选取2012年10月-2013年7月在该院行孕前与孕期检查的女性210名,采集口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,通过荧光定量PCR方法进行MTHFR和MTRR基因多态性检测。统计分析该地区维吾尔族和汉族女性基因多态性的分布特征。结果:维吾尔族女性的MTHFRC677T位点CC、CT、TT基因型的频率分别是48.4%、40.7%、11.0%,与汉族女性的基因多态性分布比较,差异有统计学意义(P〈0.05),其中TT基因型的分布频率显著低于汉族女性;MTHFRA1298C位点AA、AC、CC基因型的频率分别为60.4%、31.9%、7.7%,与汉族女性的基因多态性分布比较,差异无统计学意义(P〉0.05);MTRRA66G位点AA、AG、GG基因型的频率分别为34.1%、49.5%、16.5%,与汉族女性的基因多态性分布比较,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论:新疆维吾尔族和汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性分布情况不同,具有民族特异性。 展开更多
关键词 维吾尔族 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性
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南宁市壮族和汉族女性MTHFR和MTRR基因单核苷酸多态性比较 被引量:50
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作者 蒋武 鲁衍强 +4 位作者 李瑛 沈寅琛 黄卫彤 覃頔 杨琦 《广西医学》 CAS 2014年第11期1517-1519,共3页
目的分析南宁市壮族和汉族女性5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G单核苷酸多态性的分布特征。方法以南宁市948例孕检女性为研究对象,其中壮族455例,汉族493例,采集口腔黏膜上皮细胞,提取5... 目的分析南宁市壮族和汉族女性5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G单核苷酸多态性的分布特征。方法以南宁市948例孕检女性为研究对象,其中壮族455例,汉族493例,采集口腔黏膜上皮细胞,提取5,10-DNA,通过荧光定量PCR方法进行MTHFR和MTRR基因多态性检测。统计分析本地区壮族和汉族女性基因多态性的分布特征。结果壮族女性MTHFR C677T位点TT基因型比例为5.1%,低于汉族女性(7.7%);MTHFR A1298C位点CC基因型比例为9.2%,高于汉族女性(5.5%);MTRR A66G位点GG基因型比例为9.7%,高于汉族女性(5.5%)。MTHFR C677T和MTHFR A1298C两位点多态性在壮族和汉族女性间的分布差异无统计学意义(P>0.05),而MTRR A66G位点多态性在两民族女性间的分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论南宁市壮族和汉族女性MTRR基因多态性分布情况不同,具有民族特异性。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 壮族 汉族 南宁市
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InDel和SNP标记在水稻图位克隆中的应用 被引量:41
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作者 潘存红 王子斌 +5 位作者 马玉银 殷跃军 张亚芳 左示敏 陈宗祥 潘学彪 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期447-453,共7页
在水稻功能基因的图位克隆中,常需要高密度的分子标记,而目前公布的各种标记的密度还远未达到令人满意的程度。InDel和SNP标记是新型的分子标记类型,基本可以满足精细定位目的基因的需要。InDel和SNP标记可以较容易地通过生物信息学的... 在水稻功能基因的图位克隆中,常需要高密度的分子标记,而目前公布的各种标记的密度还远未达到令人满意的程度。InDel和SNP标记是新型的分子标记类型,基本可以满足精细定位目的基因的需要。InDel和SNP标记可以较容易地通过生物信息学的方法获得,而且经济实用、特异性高、稳定性好。介绍了设计InDel和SNP标记的方法,并以一个水稻卷叶基因的研究为实例,介绍了在基因精细定位研究中利用这两种标记的方法和提高标记设计成功率的注意点。 展开更多
关键词 插入缺失长度多态性 单核苷酸多态性 分子标记 生物信息学 图位克隆 水稻 卷叶基因
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鸡瘦蛋白受体(OBR)基因外显子9单核苷酸多态性分析 被引量:27
6
作者 顾志良 赵建国 +4 位作者 李辉 孟和 王启贵 王清华 朱大海 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期259-262,共4页
瘦蛋白受体属于Ⅰ类细胞因子超家族受体 ,其在瘦蛋白的信号转导中起着关键的作用。本研究根据瘦蛋白受体基因外显子 9的序列设计引物 ,用PCR -SSCP的方法对高脂系 (fatnessline,FL)、低脂系 (leannessline ,LL)、北京油鸡、白耳鸡、石... 瘦蛋白受体属于Ⅰ类细胞因子超家族受体 ,其在瘦蛋白的信号转导中起着关键的作用。本研究根据瘦蛋白受体基因外显子 9的序列设计引物 ,用PCR -SSCP的方法对高脂系 (fatnessline,FL)、低脂系 (leannessline ,LL)、北京油鸡、白耳鸡、石歧杂、矮小黄鸡、小型黄鸡、惠阳胡须鸡、隐性白羽鸡和海兰蛋鸡等品种 (系 )进行了单核苷酸多态性分析 ,并检测到了多态性。对两种纯合子片段克隆和测序 ,结果表明在编码区的 116 7位碱基发生了突变 ,由C突变为A ,但是编码的氨基酸并没有发生改变。经独立性检验 ,基因型频率和基因频率分布与品种有关 ,北京油鸡的AA基因型频率显著高于其他品种 ;高脂系中A基因频率显著高于低脂系。 展开更多
关键词 瘦蛋白受体 外显子 单核苷酸多态性 OBR基因
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烟台市汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性的分布特征 被引量:43
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作者 严倩 鲁衍强 +3 位作者 李瑛 石春红 姜凌 于传亭 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2014年第1期79-84,共6页
目的分析山东省烟台市汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G单核苷酸多态性的分布特征。方法以烟台市2 670例汉族女性为研究对象,采集口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,通过荧光定量PCR方... 目的分析山东省烟台市汉族女性亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)A66G单核苷酸多态性的分布特征。方法以烟台市2 670例汉族女性为研究对象,采集口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,通过荧光定量PCR方法进行MTHFR和MTRR基因多态性检测。统计分析该地区基因多态性的分布特征,并与其他地区已报道的数据进行比较。结果烟台市汉族女性的MTHFR C677T位点CC、CT、TT基因型的频率分别是18.6%、49.2%、32.2%,其中TT基因型的分布频率低于潍坊市、淄博市、郑州市,高于镇江市、武汉市、德阳市、昆明市、广州市和琼海市,且与以上城市的基因多态性分布存在统计学差异(P<0.05)。MTHFR A1298C位点AA、AC、CC基因型的频率分别为72.5%、25.7%、1.8%,其中CC基因型的分布频率与潍坊市、淄博市、临沂市、镇江市、武汉市、德阳市、昆明市、广州市和琼海市间的差异均有统计学意义(P<0.05)。MTRR A66G位点AA、AG、GG基因型的频率分别为54.6%、38.1%、7.2%,其中GG基因型的分布频率仅与潍坊市、淄博市和琼海市间的差异有统计学意义(P<0.05)。结论烟台市汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性分布情况不同于其他地区,具有地域特异性。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性
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尚志市汉族女性MTHFR与MTRR基因多态性调查 被引量:40
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作者 马路密 鲁衍强 +4 位作者 李瑛 高红 陈彦清 刘婷婷 杨琦 《实用预防医学》 CAS 2015年第3期289-291,共3页
目的对黑龙江省尚志市汉族女性MTHFR、MTRR基因多态性进行研究。方法以尚志市455例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G的基因分型。统计分析基因多态性的频率特征,并与已报道的其他地区汉族女性的数据进行比较。结... 目的对黑龙江省尚志市汉族女性MTHFR、MTRR基因多态性进行研究。方法以尚志市455例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G的基因分型。统计分析基因多态性的频率特征,并与已报道的其他地区汉族女性的数据进行比较。结果尚志市汉族女性的MTHFR C677T基因型和等位基因频率,与潍坊、镇江、松滋、德阳、惠州、琼海等地差异有统计学意义(P<0.05)。MTHFR A1298C基因型和等位基因频率,与松滋、德阳、惠州、琼海等地差异有统计学意义(P<0.05)。MTRR A66G基因型和等位基因频率,与琼海差异有统计学意义(P<0.05)。结论尚志市汉族女性MTHFR和MTRR基因多态性频率分布具有地域特异性。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性
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全基因组关联分析的进展与反思 被引量:36
9
作者 凃欣 石立松 +1 位作者 汪樊 王擎 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期87-94,共8页
全基因组关联分析(genomewide association study,GWAS)是应用人类基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为标记进行病例-对照关联分析,以期发现影响复杂性疾病发生的遗传特征的一种新策略。近年来,... 全基因组关联分析(genomewide association study,GWAS)是应用人类基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为标记进行病例-对照关联分析,以期发现影响复杂性疾病发生的遗传特征的一种新策略。近年来,随着人类基因组计划和基因组单倍体图谱计划的实施,人们已通过GWAS方法发现并鉴定了大量与人类性状或复杂性疾病关联的遗传变异,为进一步了解控制人类复杂性疾病发生的遗传特征提供了重要的线索。然而,由于造成复杂性疾病/性状的因素较多,而且GWAS研究系统较为复杂,因此目前GWAS本身亦存在诸多的问题。本文将从研究方式、研究对象、遗传标记,以及统计分析等方面,探讨GWAS的研究现状以及存在的潜在问题,并展望GWAS今后的发展方向。 展开更多
关键词 全基因组关联分析 复杂疾病/性状 遗传变异 单核苷酸多态性
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亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与急性淋巴细胞白血病患者甲氨蝶呤化疗毒副反应的研究 被引量:34
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作者 刘晶霞 陈洁平 +1 位作者 谭文 林东昕 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2008年第3期488-492,共5页
本研究旨在观察mthfr基因多态性分布对急性淋巴细胞白血病患者使用大剂量MTX化疗后毒副反应的影响。收集44例ALL患者外周血,提取基因组DNA,用PCR-RFLP技术检测mthfr基因型;观察经大剂量甲氨蝶呤化疗后所有患者的药后毒副作用。结果表明:... 本研究旨在观察mthfr基因多态性分布对急性淋巴细胞白血病患者使用大剂量MTX化疗后毒副反应的影响。收集44例ALL患者外周血,提取基因组DNA,用PCR-RFLP技术检测mthfr基因型;观察经大剂量甲氨蝶呤化疗后所有患者的药后毒副作用。结果表明:mthfr C677T和A1298C各基因型间毒副反应差异显著,携带T突变基因患者发生毒副反应是携带CC基因型的3.75倍;携带AC+CC基因型发生毒副反应是AA基因型携带者的0·12倍。mthfr677TT基因型联合1298AA基因型与677CC基因型同时携带1298C等位基因变异患者在毒副反应上差异显著,前者发生毒副作用的可能性是后者的16.5倍。结论:mthfr基因多态性分布与ALL患者HDMTX化疗后的毒副反应有关。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 急性淋巴细胞白血病 单核苷酸多态性 甲氨蝶呤
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急性淋巴细胞白血病患儿MTHFR基因多态性与大剂量甲氨蝶呤毒副反应的关系 被引量:35
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作者 郑苗苗 岳丽杰 +5 位作者 陈小文 文飞球 李长钢 杨春兰 谢偲 丁慧 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期201-206,共6页
目的探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因单核苷酸多态性对急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿使用大剂量甲氨蝶呤(HD-MTX)化疗后毒副反应的影响。方法应用RT-PCR-变性梯度凝胶电泳结合DNA测序技术,对52例ALL患儿MTHFR C677T、A1298C和G1793... 目的探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因单核苷酸多态性对急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿使用大剂量甲氨蝶呤(HD-MTX)化疗后毒副反应的影响。方法应用RT-PCR-变性梯度凝胶电泳结合DNA测序技术,对52例ALL患儿MTHFR C677T、A1298C和G1793A基因型进行检测。按照国立癌症研究所常规毒性判定标准(NCI-CTC)对患儿HD-MTX化疗后的不良反应统一评价。结果 MTHFR 1298AC基因型患儿发生血小板减少的风险较AA型提高了13.7倍(OR=13.7,95%CI=1.18~159.36,P=0.036)。MTHFR C677T和G1793A各基因型发生各类HD-MTX化疗不良反应的差异无统计学意义(P>0.05)。结论 MTHFR A1298C多态性可能与ALL患儿HD-MTX化疗后的毒副反应相关。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 单核苷酸多态性 急性淋巴细胞白血病 甲氨蝶呤 毒副反应 儿童
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南宁市汉族女性不明原因复发性流产与MTHFR基因C677T位点多态性相关性研究 被引量:35
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作者 蒋武 鲁衍强 +6 位作者 李瑛 朱茂灵 覃頔 黄永全 沈寅琛 黄卫彤 杨琦 《广西医科大学学报》 CAS 2017年第12期1728-1730,共3页
目的:探讨南宁市汉族女性不明原因复发性流产与亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T位点多态性的关联性。方法:采用病例对照研究的方法,以南宁市汉族女性152例不明原因复发性流产患者(流产组)和313例正常妇女(对照组)为研究对象,用荧... 目的:探讨南宁市汉族女性不明原因复发性流产与亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T位点多态性的关联性。方法:采用病例对照研究的方法,以南宁市汉族女性152例不明原因复发性流产患者(流产组)和313例正常妇女(对照组)为研究对象,用荧光定量PCR技术,检测MTHFR基因C677T位点的单核苷酸多态性,并分析检测结果与不明原因复发性流产的相关性。结果:流产组MTHFR 677TT基因型占比(10.5%)较对照组(6.4%)明显升高,同时T等位基因在流产组的占比(30.3%)也显著高于对照组(21.7%),该位点基因型(CC、CT、TT)、等位基因(C、T)在两组中的分布差异均有统计学意义(P<0.05)。CT基因型者发生流产的风险为CC基因型的1.620倍,TT基因型者发生流产的风险为CC基因型的2.074倍。结论:南宁市汉族女性不明原因复发性流产的发生与MTHFR C677T位点的多态性变化具有相关性。 展开更多
关键词 南宁市汉族女性 不明原因复发性流产 亚甲基四氢叶酸还原酶 单核苷酸多态性
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丹参乙酰CoA酰基转移酶基因全长克隆和SNP分析 被引量:34
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作者 崔光红 王学勇 +2 位作者 冯华 赵静雪 黄璐琦 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期785-790,共6页
乙酰CoA酰基转移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase,AACT)为萜类化合物生物合成甲羟戊酸(MVA)途径的起始酶,催化使2个分子的乙酰CoA缩合为乙酰乙酰CoA。利用基因芯片结合RACE方法,从丹参毛状根中得到一个AACT基因(SmAACT,accession No.... 乙酰CoA酰基转移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase,AACT)为萜类化合物生物合成甲羟戊酸(MVA)途径的起始酶,催化使2个分子的乙酰CoA缩合为乙酰乙酰CoA。利用基因芯片结合RACE方法,从丹参毛状根中得到一个AACT基因(SmAACT,accession No.EF635969),该基因全长1623bp,含有1个1200bp的开放阅读框(open reading frame,ORF),编码399个氨基酸,对应基因组序列含有9个内含子。序列同源性分析和分子进化分析表明SmAACT是一种与植物类异戊二烯MVA途径相关的蛋白,其表达量受到生物和非生物诱导子酵母和Ag+的诱导,并伴随丹参酮类成分积累。在丹参根、茎、叶中均有表达,根中的表达量明显高于茎和叶中的表达量。单核苷酸多态性分析表明,在第6至第9内含子约600bp范围内,SmAACT共存在33个多态位点,且表现出产地特异基因型。该基因的克隆分析为研究丹参酮类成分的次生代谢调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 丹参 乙酰CoA酰基转移酶 单核苷酸多态性
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银川市汉族女性MTHFR与MTRR基因多态性研究 被引量:33
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作者 刘晓玲 鲁衍强 +2 位作者 李瑛 杨玉清 杨琦 《宁夏医科大学学报》 2014年第11期1216-1219,1309,共5页
目的探讨银川市汉族女性MTHFR、MTRR基因多态性的分布特征,以指导孕妇增补叶酸和出生缺陷的一级预防。方法以银川市443例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G的基因型频率和等位基因频率。并与已报道的其他地区汉族... 目的探讨银川市汉族女性MTHFR、MTRR基因多态性的分布特征,以指导孕妇增补叶酸和出生缺陷的一级预防。方法以银川市443例汉族女性为研究对象,检测MTHFR C677T、A1298C和MTRR A66G的基因型频率和等位基因频率。并与已报道的其他地区汉族女性的数据进行比较。结果银川市汉族女性的MTHFR C677T基因型和等位基因频率与淄博、郑州、武汉、昆明、德阳、惠州、琼海等地汉族差异有统计学意义(P<0.05);MTHFR A1298C基因型和等位基因频率与淄博、德阳、惠州、琼海等地汉族差异有统计学意义;MTRR A66G基因型和等位基因频率与琼海汉族女性的差异有统计学意义(P<0.05)。结论银川市汉族女性MTHFR、MTRR基因多态性频率分布不同于其他地区,具有地域特异性。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性
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紫苏属药用植物的rDNA ITS区SNP分子标记与位点特异性PCR鉴别 被引量:28
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作者 罗玉明 张卫明 +4 位作者 丁小余 沈洁 保曙琳 褚必海 毛善国 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期840-845,共6页
目的 分析单种属——紫苏属各变种间rDNA ITS区的序列以及存在的单核苷酸多态性(SNP)现象,设计出位点特异性PCR引物,用于紫苏属各变种间的分子标记鉴别。方法 对紫苏属各变种多个体的rDNA ITS区全序列进行了准确测定,运用Clustral... 目的 分析单种属——紫苏属各变种间rDNA ITS区的序列以及存在的单核苷酸多态性(SNP)现象,设计出位点特异性PCR引物,用于紫苏属各变种间的分子标记鉴别。方法 对紫苏属各变种多个体的rDNA ITS区全序列进行了准确测定,运用Clustral X1.8,MEGA3.0进行排序并进行SNP分析,从而设计出鉴别各变种的等位基因位点特异性PCR鉴别引物。结果 紫苏属各变种(紫苏、白苏、鸡冠苏和耳齿紫苏等)的rDNA ITS区全序列共有615~618bp的长度,ITS1为233~235bp,5.8S为179bp,ITS2为203~204bp,GC含量为61.5%~61.9%。从rDNA ITS区碱基变异的整体情况来看,紫苏属各变种间不仅在非编码的转录间隔区ITS1和ITS2内存在非编码区单核苷酸多态性(ncSNP),而且在保守的5.8S编码区内也存在3个位点的单核苷酸多态性,即编码区SNP(cSNP),所有的SNP均只具2等位多态性。5.8S区cSNP的出现与产生该变异的变种出现的显著形态差异关联。本文还利用这些SNP位点设计出了鉴别紫苏属各变种的位点特异性PCR引物,无需测序即可对紫苏属的原植物及“苏子”、“苏叶”等药材进行有效准确的分子鉴别。结论 紫苏属药用植物rDNA ITS区存在的SNP可用作紫苏属各变种鉴别的分子标记。 展开更多
关键词 紫苏属 rDNA ITS区 单核苷酸多态性 位点特异性PCR 分子鉴别
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等位基因特异性引物PCR技术及其应用研究 被引量:25
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作者 马厚勋 牛永红 +1 位作者 李章勇 谢正祥 《生物技术》 CAS CSCD 2005年第1期15-18,共4页
目的 :研究建立等位基因特异性引物PCR技术体系 ,并将其应用于基因单核苷酸多态性研究工作。方法 :通过美国国家生物信息中心 (NCBI)的genBank获取基因序列及其相应位点的SNP信息。利用Primer5 .0软件设计引物 ,并经NCBI的Blast2 .0软... 目的 :研究建立等位基因特异性引物PCR技术体系 ,并将其应用于基因单核苷酸多态性研究工作。方法 :通过美国国家生物信息中心 (NCBI)的genBank获取基因序列及其相应位点的SNP信息。利用Primer5 .0软件设计引物 ,并经NCBI的Blast2 .0软件检验其特异性。结果 :建立了单一等位基因特异性引物PCR(SASP -PCR)与嵌套式等位基因特异性引物PCR(NASP—PCR)两种技术 ,并应用于 β2 肾上腺素受体及内皮源性一氧化氮合酶基因单核苷酸多态性的研究 ,证实该技术的稳定性和优越性。结论 :等位基因特异性引物PCR技术是一种更为简便、特异性较高、费用少的、便于推广的SNP检测方法 。 展开更多
关键词 等位基因 单核苷酸多态性 特异性引物 PCR技术 SNP SASP Β2肾上腺素受体 位点 推广 群体
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单核苷酸多态性与连锁不平衡研究进展 被引量:16
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作者 何云刚 金力 黄薇 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2004年第5期487-490,共4页
单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)是人类基因组中最广泛的多态性现象 ,也是造成个体差异的最主要的遗传原因 ,发现和研究SNP的工作在目前人类基因组研究中倍受关注。连锁不平衡是不同遗传标记间存在着的非随机组合现... 单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)是人类基因组中最广泛的多态性现象 ,也是造成个体差异的最主要的遗传原因 ,发现和研究SNP的工作在目前人类基因组研究中倍受关注。连锁不平衡是不同遗传标记间存在着的非随机组合现象 ,SNP作为极具优势的遗传标记为深入研究连锁不平衡、以及利用连锁不平衡进行群体遗传学的参数估计、基因精细定位、关联分析等提供了良好的先决条件。最近 。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 连锁不平衡 研究进展 单倍域 关联分析
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母猪生殖器官大小和产仔数的分子遗传基础 被引量:22
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作者 张淑君 熊远著 +6 位作者 邓昌彦 曾凡同 邱祥聘 肖森木 夏瑜 徐建祥 阮征 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第12期1073-1077,共5页
采用单核苷酸多态分析技术 (SNP)分析母猪 3个生殖激素受体基因 (ESR、PRLR和FSHR)的变异 ;屠宰 10 3头母猪并测定其生殖器官大小 ;统计母猪的产仔数 ;利用SAS或SPSS分析软件分析基因变异与母猪的生殖器官大小、产仔数多少的连锁关系 ,... 采用单核苷酸多态分析技术 (SNP)分析母猪 3个生殖激素受体基因 (ESR、PRLR和FSHR)的变异 ;屠宰 10 3头母猪并测定其生殖器官大小 ;统计母猪的产仔数 ;利用SAS或SPSS分析软件分析基因变异与母猪的生殖器官大小、产仔数多少的连锁关系 ,以探讨母猪生殖器官大小和产仔数多少的分子遗传基础。结果表明 ,如母猪携带的基因型为位点ESR的BB型、位点FSHRB的BB型、位点ESRB的AA型、位点PRLR的AA型 ,则母猪的生殖器官较大 ,产仔数也较多 ;在位点ESRB或位点PRLR中 ,带有AA基因型母猪不仅产仔数显著地高于AB、BB型 ,而且生殖器官也显著大于AB、BB型 ;在位点ESR和FSHRB中 ,带有BB基因型母猪的生殖器官、产仔数显著高于带有AB或AA型母猪。 展开更多
关键词 母猪 生殖器官大小 产仔数 分子遗传基础 单核苷酸多态性
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佛山市汉族人群叶酸代谢通路关键酶基因MTHFR C677T多态性分布特征调查 被引量:30
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作者 郭晓玲 鲁衍强 +3 位作者 杨兴坤 钟进 刘丹 李瑛 《实用预防医学》 CAS 2019年第3期290-292,共3页
目的调查佛山市体检人群叶酸代谢障碍关键酶基因5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T位点基因多态性分布情况。方法以佛山市182位女性和120位男性为研究对象,均为汉族人群,检测其MTHFR C677T基因位点多态性,分析性别、地域与基因多... 目的调查佛山市体检人群叶酸代谢障碍关键酶基因5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T位点基因多态性分布情况。方法以佛山市182位女性和120位男性为研究对象,均为汉族人群,检测其MTHFR C677T基因位点多态性,分析性别、地域与基因多态性分布特征的关系。结果调查的302例佛山市汉族人群MTHFR C677T位点CC、CT、TT基因型所占比例分别为62. 6%、31. 8%、5. 6%,等位基因C、T所占比例分别为78. 5%、21. 5%。佛山市汉族男性与汉族女性MTHFR C677T位点多态性分布情况差异无统计学意义(P>0. 05)。佛山市汉族人群与已有数据报道的武汉、西安、长治、青岛、北京、乌鲁木齐等地的汉族人群的MTHFR C677T位点基因型、等位基因的分布情况差异均有统计学意义(P<0. 05)。佛山市汉族人群与回族、蒙族、维吾尔族、苗族MTHFR C677T位点基因型、等位基因的分布情况差异有统计学意义(P<0. 05),与布依族差异无统计学意义(P>0. 05)。结论佛山市汉族人群MTHFR C677T位点多态性分布情况与其他地区、其他民族有显著差异,在实施个性化日常保健措施时可将遗传因素纳入考虑。 展开更多
关键词 亚甲基四氢叶酸还原酶 单核苷酸多态性 性别 地区 民族
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长春市汉族妇女MTHFR与MTRR基因多态性分布研究 被引量:28
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作者 田红雨 鲁衍强 +1 位作者 付敏 阴春霞 《中国妇幼保健》 CAS 2017年第9期1962-1965,共4页
目的调查长春市汉族妇女叶酸代谢通路上5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸还原酶(MTRR)A66G位点基因多态性的分布特征,为出生缺陷一级预防工作提供遗传学支持。方法应用横断面调查研究方法,选取2014年11月-2016... 目的调查长春市汉族妇女叶酸代谢通路上5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸还原酶(MTRR)A66G位点基因多态性的分布特征,为出生缺陷一级预防工作提供遗传学支持。方法应用横断面调查研究方法,选取2014年11月-2016年10月到长春市妇产医院进行孕前及孕期检查的3 405例育龄汉族妇女为研究对象,检测其MTHFR C677T、A1298C及MTRR A66G基因位点多态性,统计分析基因多态性的分布特征,并与已报道的其他地区育龄汉族妇女进行分析比较。结果长春市汉族妇女MTHFR C677T基因型分布与乌鲁木齐、银川、淄博、新乡、镇江、眉山、荆州、九江、湘潭、昆明、惠州、南宁及琼海汉族妇女比较,差异均有统计学意义(均P<0.05);MTHFR A1298C位点基因型分布与淄博、镇江、眉山、荆州、九江、湘潭、昆明、惠州、南宁及琼海汉族妇女比较,差异均有统计学意义(均P<0.05);MTRR A66G位点基因型分布与琼海汉族妇女比较,差异有统计学意义(P<0.05);MTHFR C677T和A1298C两位点间存在完全连锁不平衡现象(D’=0.988,r^2=0.198)。结论长春市汉族妇女MTHFR和MTRR基因多态性频率不同于其他地区,具有地域特异性。 展开更多
关键词 5 10-亚甲基四氢叶酸还原酶 甲硫氨酸合成酶还原酶 单核苷酸多态性
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