乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染作为严重影响人类健康的疾病之一,是导致慢性肝脏疾病、肝硬化和肝癌的主要元凶。HBV由于其自身复制的特殊性,具有高变异特性,据研究表明HBV基因变异是HBV持续感染的根本原因。为了了解HBV的基...乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染作为严重影响人类健康的疾病之一,是导致慢性肝脏疾病、肝硬化和肝癌的主要元凶。HBV由于其自身复制的特殊性,具有高变异特性,据研究表明HBV基因变异是HBV持续感染的根本原因。为了了解HBV的基因变异情况,检测HBV序列的SNP位点即单突变位点已广泛应用于大量的研究,所检测出的SNP位点对指导临床有重要意义。但是目前关于SNP位点检测的方法多因技术难度较高,费用大等不利因素而受到制约。因此,探讨一种基于计算机的SNP位点检测方法成为一种趋势。针对HBV序列的SNP位点的特点,提出了一种基于最优风险与预防模型的HBV序列的SNP位点检测方法。方法首次应用于HBV序列的SNP位点检测,实验结果表明:该方法不仅有效地检测出HBV序列的X基因片段和前C区基因片段中已经报道的位点,而且还发现了一些新的SNP位点。与硬件检测SNP位点不同的是,所提出的计算机方法具有操作简单和费用低的优点,而且普通实验室和医疗机构均可以承受。展开更多
文摘乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染作为严重影响人类健康的疾病之一,是导致慢性肝脏疾病、肝硬化和肝癌的主要元凶。HBV由于其自身复制的特殊性,具有高变异特性,据研究表明HBV基因变异是HBV持续感染的根本原因。为了了解HBV的基因变异情况,检测HBV序列的SNP位点即单突变位点已广泛应用于大量的研究,所检测出的SNP位点对指导临床有重要意义。但是目前关于SNP位点检测的方法多因技术难度较高,费用大等不利因素而受到制约。因此,探讨一种基于计算机的SNP位点检测方法成为一种趋势。针对HBV序列的SNP位点的特点,提出了一种基于最优风险与预防模型的HBV序列的SNP位点检测方法。方法首次应用于HBV序列的SNP位点检测,实验结果表明:该方法不仅有效地检测出HBV序列的X基因片段和前C区基因片段中已经报道的位点,而且还发现了一些新的SNP位点。与硬件检测SNP位点不同的是,所提出的计算机方法具有操作简单和费用低的优点,而且普通实验室和医疗机构均可以承受。
