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甘草鲨烯合酶基因多态性对其编码酶催化效率影响的研究 被引量：7
1
作者 刘颖 张宁 +3 位作者 王学勇 刘春生 陈宏昊 文浩 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第24期3777-3783,共7页
目的:分析甘草鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)基因多态性及其对编码酶催化效率的影响,为揭示优质甘草形成的分子机制奠定基础。方法:提取甘草总RNA;PCR扩增其SQS基因编码序列;测序后分析SQS序列的多态性;将具有明显差异的4个甘草SQS序... 目的:分析甘草鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)基因多态性及其对编码酶催化效率的影响,为揭示优质甘草形成的分子机制奠定基础。方法:提取甘草总RNA;PCR扩增其SQS基因编码序列;测序后分析SQS序列的多态性;将具有明显差异的4个甘草SQS序列(SQS1C,SQS1F,SQS2A,SQS2B)连入表达载体pET-32a(+),转化大肠杆菌BL21;IPTG诱导蛋白表达,纯化后用于体外酶促反应;GC-MS鉴定产物并比较相对含量。结果:甘草SQS1基因存在单核苷酸多态性(single nuclearpolymorphisms,SNPs)、插入与缺失多态性(InDel)、选择性剪接(AS)多态性;SQS2基因只存在SNPs。氨基酸序列分析显示,SQS1非保守替换占53.94%,结构域中有2个位点突变;SQS2非保守替换占60%,结构域中有1个位点突变。在4种编码酶的体外酶促反应中,利用GC-MS均能检测到产物生成;SQS1F编码酶积累鲨烯的能力高于其他序列。结论:甘草SQS基因具有丰富的多态性,其编码酶催化效率差异显著,这可能是优质甘草形成的分子基础。 展开更多
关键词 甘草 SQS 基因多态性 单核苷酸多态性 插入与缺失多态性 选择性剪接 原核表达 GC—MS 鲨烯
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荧光偏振技术分析全血XPD基因单核苷酸多态性的研究 被引量：3
2
作者 李丁 张菊 +5 位作者 颜真 张贺龙 郭宴海 刘文超 李小惠 李宏伟 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2010年第4期585-588,共4页
将荧光偏振与非对称基因扩增技术联用,建立了可用于检测全血XPD基因单核苷酸多态性的新方法。用不等量(1∶5)的XPD基因上、下游引物对含单核苷酸多态性位点的目的片段进行非对称扩增,再用两种单核苷酸多态性序列特异的荧光标记探针对扩... 将荧光偏振与非对称基因扩增技术联用,建立了可用于检测全血XPD基因单核苷酸多态性的新方法。用不等量(1∶5)的XPD基因上、下游引物对含单核苷酸多态性位点的目的片段进行非对称扩增,再用两种单核苷酸多态性序列特异的荧光标记探针对扩增产物进行检测。由于扩增得到的单链片段能够与各自不同的荧光标记探针特异结合,使荧光标记分子的分子量增加,偏振值(FP)增高。通过检测增高的FP值,可确定目的片段单核苷酸多态性。采用本方法对98例全血的XPD基因第751位密码子进行了单核苷酸多态性分析,并与传统的荧光偏振检测方法进行了比较,取得满意结果。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 XPD基因 荧光偏振检测
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维生素D受体基因多态性影响儿童流感临床结局的研究 被引量：1
3
作者 张玉凤 袁娟 +5 位作者 王军 徐鹏飞 刘瑞清 唐甜甜 陈媛 邓慧玲 《中国小儿急救医学》 CAS 2022年第4期277-281,共5页
目的探讨维生素D受体(VDR)基因单核苷酸多态性(SNP)与儿童流感易感性和病情严重程度的相关性。方法收集2019年2月至2021年2月西安市儿童医院及西安市中心医院收治的甲型流感患儿172例(研究组)和健康儿童88例(健康对照组)的外周静脉血,采... 目的探讨维生素D受体(VDR)基因单核苷酸多态性(SNP)与儿童流感易感性和病情严重程度的相关性。方法收集2019年2月至2021年2月西安市儿童医院及西安市中心医院收治的甲型流感患儿172例(研究组)和健康儿童88例(健康对照组)的外周静脉血,采用25-羟基维生素D(25-OH-D)试剂盒检测血清25-OH-D水平。根据临床表现将研究组分为轻症组、重症组和危重症组。选取VDR基因的4个候选位点ApaI、TaqI、FokI和BsmI,应用PCR-限制性片段长度多态性技术检测各组VDR基因的多态性并分析其与流感患儿临床结局之间的相关性。结果与健康对照组[(109.65±4.35)nmol/L]相比,研究组血清25-OH-D水平较低[轻症组(73.55±2.46)nmol/L,重症组(45.59±4.62)nmol/L,危重症组(33.65±3.87)nmol/L,P<0.05];研究组ApaI位点基因型AA、Aa及等位基因A(分别为51.74%、22.67%和63.08%)和FokI位点基因型FF、Ff及等位基因F(分别为41.86%、34.88%和59.30%)占比均显著高于健康对照组(依次分别为11.36%、14.77%、18.75%、10.23%、13.64%和17.05%)(P<0.05)。重症组ApaI位点等位基因A和基因型AA、Aa(分别为63.70%、43.84%和28.76%)的占比显著高于轻症组(分别为47.37%、35.09%和24.56%)(P<0.05);危重症组ApaI位点等位基因A和基因型AA、Aa(分别为92.86%、88.10%和49.52%)占比显著高于重症组(P<0.05)。血清25-OH-D<50 nmol/L(OR=5.087,95%CI 3.114-5.648)、ApaI位点基因型AA(OR=4.011,95%CI 1.217-18.624)和Aa(OR=3.839,95%CI 2.483-1.456)、FokI位点基因型FF(OR=4.112,95%CI 3.215-20.775)和Ff(OR=4.591,95%CI 0.032-10.936)是儿童流感发病的危险因素。结论血清25-OH-D缺乏与儿童流感的发生有关,VDR基因ApaI位点基因型AA、Aa和FokI位点基因型FF、Ff可增加儿童流感易感风险,ApaI位点等位基因A及基因型AA、Aa与流感的病情严重性有关。 展开更多
关键词 维生素D受体 单核苷酸多态性 儿童 流感
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