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DGGE和SSCP解析蔬菜类废物好氧降解过程细菌群落结构及演替的比较
被引量:
7
1
作者
叶凝芳
吕凡
+1 位作者
何品晶
邵立明
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期1132-1137,共6页
针对细菌群落的16S rDNA V3区,采用2种DNA指纹图谱技术变性梯度凝胶电泳(DGGE)和单链构象多态性(SSCP),分析蔬菜类废物中温好氧降解过程中的细菌群落,比较2种技术对微生物群落结构和动态变化的解析水平。结果表明,指纹图谱显示细菌群落...
针对细菌群落的16S rDNA V3区,采用2种DNA指纹图谱技术变性梯度凝胶电泳(DGGE)和单链构象多态性(SSCP),分析蔬菜类废物中温好氧降解过程中的细菌群落,比较2种技术对微生物群落结构和动态变化的解析水平。结果表明,指纹图谱显示细菌群落结构在中温好氧降解过程中有显著变化,随降解时间的延长总体呈现从简单到复杂的趋势;主成分分析对指纹图谱的解析结果表明,细菌群落结构的演替与好氧降解过程不同阶段生物质组成具有相关性。DGGE和SSCP两者提供的关于细菌群落结构及演替信息相似,但对演替过程的描述存在细微差异。DGGE较SSCP对细菌群落结构的微小变化更为敏感。
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关键词
16SrDNA
PCR
变性梯度凝胶电泳
单链构象多态性
堆肥
好氧降解
生物质组成
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职称材料
题名
DGGE和SSCP解析蔬菜类废物好氧降解过程细菌群落结构及演替的比较
被引量:
7
1
作者
叶凝芳
吕凡
何品晶
邵立明
机构
同济大学污染控制与资源化研究国家重点实验室
出处
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第3期1132-1137,共6页
基金
国家"十.五"863计划课题(2002AA601012
2004AA601090)
+1 种基金
2004年度中法先进研究计划(PRAE04-03)
上海市国际科技合作基金项目(06SR07105)
文摘
针对细菌群落的16S rDNA V3区,采用2种DNA指纹图谱技术变性梯度凝胶电泳(DGGE)和单链构象多态性(SSCP),分析蔬菜类废物中温好氧降解过程中的细菌群落,比较2种技术对微生物群落结构和动态变化的解析水平。结果表明,指纹图谱显示细菌群落结构在中温好氧降解过程中有显著变化,随降解时间的延长总体呈现从简单到复杂的趋势;主成分分析对指纹图谱的解析结果表明,细菌群落结构的演替与好氧降解过程不同阶段生物质组成具有相关性。DGGE和SSCP两者提供的关于细菌群落结构及演替信息相似,但对演替过程的描述存在细微差异。DGGE较SSCP对细菌群落结构的微小变化更为敏感。
关键词
16SrDNA
PCR
变性梯度凝胶电泳
单链构象多态性
堆肥
好氧降解
生物质组成
Keywords
16S
rDNA
PCR
denaturing
gradient
gel
electrophoresis
singe
-
strand
conformation
polymorphism
composting
aerobic
degradation
biomass
composition
分类号
Q93-31 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DGGE和SSCP解析蔬菜类废物好氧降解过程细菌群落结构及演替的比较
叶凝芳
吕凡
何品晶
邵立明
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
7
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