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马氏珠母贝4种壳色选育系F_3的生长特性和遗传多样性比较
被引量:
14
1
作者
陈静
刘志刚
+2 位作者
孙小真
王辉
杜晓东
《上海海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期588-595,共8页
以随机扩增多态性DNA(RAPD)分析为实验手段,结合形态学特征统计,对经过3代壳色及生长速度群体选育的马氏珠母贝(Pinctada martensiiDunker)黑、白、红、黄4种壳色选育系的生长及遗传多样性进行研究,为进一步选育提供理论依据。结果显示...
以随机扩增多态性DNA(RAPD)分析为实验手段,结合形态学特征统计,对经过3代壳色及生长速度群体选育的马氏珠母贝(Pinctada martensiiDunker)黑、白、红、黄4种壳色选育系的生长及遗传多样性进行研究,为进一步选育提供理论依据。结果显示:马氏珠母贝4种壳色F3选育系的壳色纯化率分别达到黑壳色95.83%、白壳色88.33%、红壳色100%、黄壳色95.0%;各选育系的生长速度均大于普通养殖群体,系间的生长速度也存在显著差异。4种壳色选育系平均多态性位点比率(P)分别为82.51%,81.93%,75.30%,77.03%;平均Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.233 6,0.213 4,0.196 5,0.201 9;平均Shannon信息指数(Hi)分别为0.351 6,0.323 0,0.279 9,0.305 9;各系间的遗传分化系数(Gst)为0.214 3~0.318 6,遗传距离(Dxy)分别为黑白0.113 5,白黄0.130 3,黑黄0.134 9,白红0.154 6,红黄0.158 4,黑红0.196 8;聚类分析表明各选育系间的亲缘关系由近及远顺次为黑壳色、白壳色、黄壳色和红壳色。研究表明4种壳色选育系均具有较高的遗传多样性,选育系间遗传分化明显。研究结果为4种壳色马氏珠母贝的定向选育奠定了理论基础。
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关键词
马氏珠母贝
壳色选育系
纯化率
生长速度
遗传多样性
随机扩增多态性DNA
原文传递
马氏珠母贝4种壳色选育系RAPD反应体系优化
被引量:
1
2
作者
陈静
刘志刚
+2 位作者
王伟
刘铀
杨焕章
《现代农业科学》
2009年第3期1-4,17,共5页
旨在筛选出马氏珠母贝RAPD反应的最佳体系,为不同壳色马氏珠母贝种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究奠定基础。试验以4种壳色马氏珠母贝为材料,采用SDS法进行闭壳肌的总DNA提取并对影响RAPD扩增效果的因素进行优化。通过单因素优化筛...
旨在筛选出马氏珠母贝RAPD反应的最佳体系,为不同壳色马氏珠母贝种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究奠定基础。试验以4种壳色马氏珠母贝为材料,采用SDS法进行闭壳肌的总DNA提取并对影响RAPD扩增效果的因素进行优化。通过单因素优化筛选出最佳的25μL反应体系:10×Taqbuffer2.5μL,DNA2.0ng/μL,Mg2+3.0mmol/L,引物0.25μmol/L,0.2mmol/LdNTP,Taq酶1.0U;反应程序:94℃预变性5min,然后进行40个循环:94℃变性45s,39℃退火60s,72℃延伸90s,最后72℃延伸10min,4℃终止反应。结果发现,采用SDS法所提取马氏珠母贝的DNA达到RAPD反应的要求,筛选体系扩增出清晰稳定的多态性条带,可用于对马氏珠母贝遗传育种方面的研究。
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关键词
马氏珠母贝
壳色选育系
RAPD
反应体系
优化
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职称材料
马氏珠母贝4个壳色选育系F_1遗传结构的AFLP分析
被引量:
8
3
作者
代悦
喻子牛
+3 位作者
赵晓霞
王庆恒
杜晓东
吴燕忠
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期252-258,共7页
本研究从湛江流沙港马氏珠母贝养殖群体中挑选不同壳色个体为亲本,共构建了黑(BS)、红(RS)、黄(YS)和白壳色(WS)4个壳色选系F1,然后分别在4个壳色选育系F1中随机取样,利用3对AFLP引物分析其遗传结构与遗传分化。结果表明,每对引物的扩...
本研究从湛江流沙港马氏珠母贝养殖群体中挑选不同壳色个体为亲本,共构建了黑(BS)、红(RS)、黄(YS)和白壳色(WS)4个壳色选系F1,然后分别在4个壳色选育系F1中随机取样,利用3对AFLP引物分析其遗传结构与遗传分化。结果表明,每对引物的扩增位点数在104~109之间,共得到331个扩增位点;BS、RS、YS和WS壳色选系F1的多态位点比例分别为49.2%、49.5%、51.6%和63.4%,Shannon's多样性指数分别为0.1884、0.1886、0.1896和0.1954,4个壳色选育系F1的遗传分化系数(Fst)为0.1972。本研究说明经过一代壳色纯化4个壳色选育系F1出现显著遗传分化,也为马氏珠母贝壳色系选育或选育系间杂交提供了参考依据。
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关键词
马氏珠母贝
壳色选系
AFLP分子标记
遗传结构
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职称材料
题名
马氏珠母贝4种壳色选育系F_3的生长特性和遗传多样性比较
被引量:
14
1
作者
陈静
刘志刚
孙小真
王辉
杜晓东
机构
广东海洋大学水产学院
湛江银浪海洋生物技术有限公司
出处
《上海海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期588-595,共8页
基金
国家科技支撑计划项目(2007BAD29B01)
广东省重大科技兴渔项目(B200208B01)
文摘
以随机扩增多态性DNA(RAPD)分析为实验手段,结合形态学特征统计,对经过3代壳色及生长速度群体选育的马氏珠母贝(Pinctada martensiiDunker)黑、白、红、黄4种壳色选育系的生长及遗传多样性进行研究,为进一步选育提供理论依据。结果显示:马氏珠母贝4种壳色F3选育系的壳色纯化率分别达到黑壳色95.83%、白壳色88.33%、红壳色100%、黄壳色95.0%;各选育系的生长速度均大于普通养殖群体,系间的生长速度也存在显著差异。4种壳色选育系平均多态性位点比率(P)分别为82.51%,81.93%,75.30%,77.03%;平均Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.233 6,0.213 4,0.196 5,0.201 9;平均Shannon信息指数(Hi)分别为0.351 6,0.323 0,0.279 9,0.305 9;各系间的遗传分化系数(Gst)为0.214 3~0.318 6,遗传距离(Dxy)分别为黑白0.113 5,白黄0.130 3,黑黄0.134 9,白红0.154 6,红黄0.158 4,黑红0.196 8;聚类分析表明各选育系间的亲缘关系由近及远顺次为黑壳色、白壳色、黄壳色和红壳色。研究表明4种壳色选育系均具有较高的遗传多样性,选育系间遗传分化明显。研究结果为4种壳色马氏珠母贝的定向选育奠定了理论基础。
关键词
马氏珠母贝
壳色选育系
纯化率
生长速度
遗传多样性
随机扩增多态性DNA
Keywords
Pinctada
martensii
shell
color
selected
lines
purification
rate
growth
rate
genetic
diversity
random
amplified
polymorphic
DNA
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
马氏珠母贝4种壳色选育系RAPD反应体系优化
被引量:
1
2
作者
陈静
刘志刚
王伟
刘铀
杨焕章
机构
广东海洋大学水产学院
广东海洋大学农学院
出处
《现代农业科学》
2009年第3期1-4,17,共5页
基金
农业部公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-047)
国家支撑计划项目(2007BAD29B01)
文摘
旨在筛选出马氏珠母贝RAPD反应的最佳体系,为不同壳色马氏珠母贝种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究奠定基础。试验以4种壳色马氏珠母贝为材料,采用SDS法进行闭壳肌的总DNA提取并对影响RAPD扩增效果的因素进行优化。通过单因素优化筛选出最佳的25μL反应体系:10×Taqbuffer2.5μL,DNA2.0ng/μL,Mg2+3.0mmol/L,引物0.25μmol/L,0.2mmol/LdNTP,Taq酶1.0U;反应程序:94℃预变性5min,然后进行40个循环:94℃变性45s,39℃退火60s,72℃延伸90s,最后72℃延伸10min,4℃终止反应。结果发现,采用SDS法所提取马氏珠母贝的DNA达到RAPD反应的要求,筛选体系扩增出清晰稳定的多态性条带,可用于对马氏珠母贝遗传育种方面的研究。
关键词
马氏珠母贝
壳色选育系
RAPD
反应体系
优化
Keywords
Pinctada
martensii
shell
color
selected
lines
RAPD
reaction
system
optimization
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
马氏珠母贝4个壳色选育系F_1遗传结构的AFLP分析
被引量:
8
3
作者
代悦
喻子牛
赵晓霞
王庆恒
杜晓东
吴燕忠
机构
广东海洋大学水产学院
中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期252-258,共7页
基金
国家科技支撑计划(2007BAD29B01)
农业部公益性行业科研专项经费(nyhyzx07-047)
广东海洋与渔业局重大科技兴海(渔)项目(A200708C01)共同资助
文摘
本研究从湛江流沙港马氏珠母贝养殖群体中挑选不同壳色个体为亲本,共构建了黑(BS)、红(RS)、黄(YS)和白壳色(WS)4个壳色选系F1,然后分别在4个壳色选育系F1中随机取样,利用3对AFLP引物分析其遗传结构与遗传分化。结果表明,每对引物的扩增位点数在104~109之间,共得到331个扩增位点;BS、RS、YS和WS壳色选系F1的多态位点比例分别为49.2%、49.5%、51.6%和63.4%,Shannon's多样性指数分别为0.1884、0.1886、0.1896和0.1954,4个壳色选育系F1的遗传分化系数(Fst)为0.1972。本研究说明经过一代壳色纯化4个壳色选育系F1出现显著遗传分化,也为马氏珠母贝壳色系选育或选育系间杂交提供了参考依据。
关键词
马氏珠母贝
壳色选系
AFLP分子标记
遗传结构
Keywords
Pinctada
martensii,
shell
color
select
ive
lines
,
AFLP
molecular,
marker,
Genetic
structure
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马氏珠母贝4种壳色选育系F_3的生长特性和遗传多样性比较
陈静
刘志刚
孙小真
王辉
杜晓东
《上海海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
14
原文传递
2
马氏珠母贝4种壳色选育系RAPD反应体系优化
陈静
刘志刚
王伟
刘铀
杨焕章
《现代农业科学》
2009
1
下载PDF
职称材料
3
马氏珠母贝4个壳色选育系F_1遗传结构的AFLP分析
代悦
喻子牛
赵晓霞
王庆恒
杜晓东
吴燕忠
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
8
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职称材料
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