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猪流行性腹泻病毒CH/S株N蛋白基因的遗传变异及其原核表达 被引量:32
1
作者 陈建飞 冯力 +3 位作者 时洪艳 孙东波 白兴华 佟有恩 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期856-860,895,共6页
应用RT-PCR和nested-PCR方法扩增得到含猪流行性腹泻病毒CH/S株N蛋白基因的目的片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析。CH/S株N蛋白基因含有一个长1326bp的ORF,编码由441个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失。CH/S与CV777... 应用RT-PCR和nested-PCR方法扩增得到含猪流行性腹泻病毒CH/S株N蛋白基因的目的片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析。CH/S株N蛋白基因含有一个长1326bp的ORF,编码由441个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失。CH/S与CV777、Chinju99、JS-2004-2和LJB/03N蛋白基因ORF的序列同源性分别为97.1%、96.8%、96.7%和96.5%;推导的氨基酸序列的同源性分别为97.7%、97.1%、97.1%和96.8%。以阳性质粒为模板,用分别含有BamHⅠ和XhoⅠ酶切位点的上、下游引物扩增得到ORF,其PCR产物经BamHⅠ和XhoⅠ双酶切后定向克隆到pET-30a载体,构建的重组质粒命名为pET-30a-PN;将pET-30a-PN转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,在IPTG诱导下进行表达;SDS-PAGE结果表明表达出与预期大小相符的约54.4Ku的重组蛋白,重组蛋白以包涵体形式存在;薄层扫描结果表明表达产物占菌体总蛋白的30.5%;Western blot分析表明表达的重组蛋白能与抗PEDV高免血清反应,说明该重组蛋白具有免疫学活性。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 N蛋白基因 序列同源性 重组蛋白 免疫学活性
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身份研究的会话分析路径 被引量:12
2
作者 吴亚欣 《外国语》 CSSCI 北大核心 2021年第3期49-59,共11页
会话分析是以自然发生的言谈应对为研究材料,发掘社会成员执行社会行为所用会话常规的一种定性研究方法。会话分析视角下的身份是与交际事件相关的情境身份,具有指示性;它通过会话常规触发和实现,并影响会话的序列结构。运用会话分析方... 会话分析是以自然发生的言谈应对为研究材料,发掘社会成员执行社会行为所用会话常规的一种定性研究方法。会话分析视角下的身份是与交际事件相关的情境身份,具有指示性;它通过会话常规触发和实现,并影响会话的序列结构。运用会话分析方法研究身份首先要从语料中识别反复出现在某一序列位置的会话常规,然后分析与该会话常规相关的情境身份以及该情境身份对会话发展路径的影响,并总结出该会话常规在会话结构层面展现的规律,最后通过反例分析从交际参与者的角度证明该规律的确存在。 展开更多
关键词 会话分析 会话常规 社会行为 序列结构 话轮设计 情境身份
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22株猪瘟病毒E2基因部分编码序列的序列分析 被引量:9
3
作者 赵耘 王在时 +2 位作者 王琴 李博 丘惠深 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期42-48,共7页
利用RT PCR方法获得了 1 3株猪瘟病毒分离株、石门系强毒、中国C株及法国温度敏感株Thiverval株的E2基因部分编码序列的扩增片段 ,并对其进行了测序 ,得到了 2 5 1bp的E2基因部分编码序列。利用DNAStar软件对其中 2 2 4bp的片段进行了... 利用RT PCR方法获得了 1 3株猪瘟病毒分离株、石门系强毒、中国C株及法国温度敏感株Thiverval株的E2基因部分编码序列的扩增片段 ,并对其进行了测序 ,得到了 2 5 1bp的E2基因部分编码序列。利用DNAStar软件对其中 2 2 4bp的片段进行了序列分析 ,并与已发表的Alfort、Brescia等毒株进行比较 ,结果 1 3株猪瘟分离株所测片段均为猪瘟病毒E2基因的序列 ,与石门系强毒的序列相比所有毒株的碱基替换随机地分布于整个序列 ,无碱基缺失和碱基插入。其中变化较大的区域位于序列的 3′端。 2 2株HCVE2基因部分编码序列的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :78 1 %~ 1 0 0 %、 78 4%~ 1 0 0 % ,其中 1 3株猪瘟病毒流行毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :78 1 %~ 1 0 0 %、 78 4%~ 1 0 0 % ,4株 70~ 80年代分离的毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :79 0 %~ 88 3%、 81 1 %~87 8% ,9株 90年代分离的毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :80 8%~ 1 0 0 %、83 8%~ 1 0 0 % ; 展开更多
关键词 猪瘟病毒 序列分析 同源性 变异 E2基因
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少数民族流动人口的认同序列及其优化:基于两个案例的研究 被引量:9
4
作者 任勇 《政治学研究》 CSSCI 北大核心 2016年第3期91-104,128,共14页
认同构成了人类复杂社会组织和社会关系中的重要一环,并通过符号生产、记忆塑造或者意义重构来发挥作用,并且共同体中不同认同类型之间的互动中形成了认同序列的分布与组合,它会受到外部环境的影响而进行分化组合,出现由认同序列碰撞而... 认同构成了人类复杂社会组织和社会关系中的重要一环,并通过符号生产、记忆塑造或者意义重构来发挥作用,并且共同体中不同认同类型之间的互动中形成了认同序列的分布与组合,它会受到外部环境的影响而进行分化组合,出现由认同序列碰撞而产生的矛盾冲突。通过对少数民族流动人口具体案例研究,验证了认同序列与外部环境变化的理论假设,发现相关的关键性变量,可以通过公共服务、法治思维以及文化整合等措施实现少数民族流动人口的认同序列优化,提升城市治理的现代化水平,减少和避免不稳定要素,实现基层社会的有效治理。 展开更多
关键词 认同序列 国家认同 结构优化 城市治理 少数民族
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医患会话中医生身份构建的会话分析研究 被引量:9
5
作者 王尚法 徐婧华 《医学与哲学(A)》 北大核心 2017年第9期36-39,共4页
建议是十分常见的语言现象,在医患会话中尤为凸显。医生身份构建是交际互动中的涌现而不是事先指定的,身份需要会话双方或多方进行协商与共建。以医生的建议序列为切入点,从会话分析的角度,动态地研究医生在给予患者诊断建议的同时构建... 建议是十分常见的语言现象,在医患会话中尤为凸显。医生身份构建是交际互动中的涌现而不是事先指定的,身份需要会话双方或多方进行协商与共建。以医生的建议序列为切入点,从会话分析的角度,动态地研究医生在给予患者诊断建议的同时构建和调整不同的会话身份:专家身份、权威者身份、教育者身份、平等同伴身份或多重身份。旨在为医生更好地理解医患交际中身份构建的动态变化,有助于医生选择并调整合适的会话身份实现与患者之间的有效沟通,使医患关系和谐,成功应对日趋激烈的医患矛盾。 展开更多
关键词 医患会话 建议序列 身份构建 会话分析
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利用高通量测序分析侵染贵州火龙果的病毒 被引量:8
6
作者 郑乾明 王壮 +2 位作者 彭志军 马玉华 蔡永强 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期364-369,共6页
对疑似感染病毒的火龙果(Hylocereus undatus Britt.)进行高通量测序,分析病毒种类和相对含量,为火龙果病毒诊断和检测提供理论基础。测序reads经拼接和注释,共3 969条contig注释为病毒,包含44 354 147条reads。10条contig注释为CVX-NTU... 对疑似感染病毒的火龙果(Hylocereus undatus Britt.)进行高通量测序,分析病毒种类和相对含量,为火龙果病毒诊断和检测提供理论基础。测序reads经拼接和注释,共3 969条contig注释为病毒,包含44 354 147条reads。10条contig注释为CVX-NTU(JF937699),其含有的reads占所有病毒reads数量的85.18%;10条contig注释为ZyVX(AY366208),占所有病毒reads数量的4.97%;6条contig注释为SchVX(AY366207),占所有病毒reads数量的3.75%;6条contig注释为CVX(AF308158),占所有病毒reads数量的0.26%。拼接获得的CVX-NTU序列完全覆盖CVX-NTU(JF937699)基因组,核苷酸序列一致性为97%。编码的5个ORF核苷酸序列与CVX-NTU(JF937699)一致性为97%~98%,氨基酸序列一致性为97%~99%。拼接获得的CVX-NTU序列与CVX、ZyVX和SchVX的核苷酸序列一致性分别为78%、75%和70%。这是首次利用高通量测序检测火龙果病毒的报道。 展开更多
关键词 仙人掌科 基因组 核苷酸 序列一致性
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乡土传统再造中的仪式秩序与空间认同——对云南省石林县月湖村“祭山神”仪式的人类学分析 被引量:6
7
作者 肖青 李宇峰 《学术探索》 CSSCI 2012年第10期116-120,共5页
民族村寨文化的复兴重构是其发展变迁过程中的一种现代性适应。改革开放以来,月湖村"祭山神"仪式的复兴与再造,不仅是草根社会对民间信仰的象征性表达,同时也因当下村寨场域的特殊空间格局和维系社区现实生活秩序的结构性需求... 民族村寨文化的复兴重构是其发展变迁过程中的一种现代性适应。改革开放以来,月湖村"祭山神"仪式的复兴与再造,不仅是草根社会对民间信仰的象征性表达,同时也因当下村寨场域的特殊空间格局和维系社区现实生活秩序的结构性需求,而被赋予了新的地方性社会文化功能,成为文化主体对乡土社会空间的隐喻性建构和草根性认同。 展开更多
关键词 祭山神 乡土传统再造 仪式秩序 空间认同
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麻鸭和樱桃谷鸭的CD3ε、CD4、CD8α基因ORF克隆及序列分析 被引量:4
8
作者 李卫 白家媛 +5 位作者 许媛媛 谷长勤 张万坡 程国富 陈敏 胡薛英 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期4428-4434,共7页
【目的】分析比较中国部分品种鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列,为研究CD3ε链、CD4和CD8α链的结构和功能及其抗体的应用提供依据。【方法】利用RT-PCR,对麻鸭、樱桃谷鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列克隆测定,应用Clustal(X1.83)... 【目的】分析比较中国部分品种鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列,为研究CD3ε链、CD4和CD8α链的结构和功能及其抗体的应用提供依据。【方法】利用RT-PCR,对麻鸭、樱桃谷鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列克隆测定,应用Clustal(X1.83)和DNAstar生物学软件分别与GenBank上公布的北京鸭CD3ε(AF378704)、CD4(AF378701)和CD8α(AF378373)基因ORF序列进行序列分析。【结果】麻鸭、樱桃谷鸭、北京鸭CD3ε和CD4基因ORF序列及所编码的氨基酸同源性为99%;北京鸭和麻鸭CD8α基因ORF序列同源性为99%,与樱桃谷鸭的同源性为95%。麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序基因编码的氨基酸完全一致,与樱桃谷鸭的CD8α存在16处位点差异,其中胞外区有15个氨基酸的差异,使亲水性、抗原性以及此区域位于蛋白质表面的可能性都有明显差异。从遗传发生树得出樱桃谷鸭、北京鸭、麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列相互之间的遗传关系近;樱桃谷鸭、麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序列之间的遗传关系较远。【结论】樱桃谷鸭、北京鸭、麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列遗传变异性低,樱桃谷鸭与麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF之间具有较高遗传变异性。 展开更多
关键词 CD3ε CD4 CD8Α 序列分析 同源性
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侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析 被引量:4
9
作者 郑乾明 王小柯 +1 位作者 王壮 马玉华 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期219-225,共7页
通过高通量测序和RT-PCR扩增,克隆并分析蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)贵州分离物ZyVX-GZ基因组序列。对表现病毒病症状的红肉火龙果植株进行高通量测序,获得4条ZyVX相关contig。RT-PCR扩增并拼接获得ZyVX-GZ基因组,全长为6 567... 通过高通量测序和RT-PCR扩增,克隆并分析蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)贵州分离物ZyVX-GZ基因组序列。对表现病毒病症状的红肉火龙果植株进行高通量测序,获得4条ZyVX相关contig。RT-PCR扩增并拼接获得ZyVX-GZ基因组,全长为6 567 nt,5'-UTR和3'-UTR分别为60nt和70nt。含有5个ORF,分别编码复制酶蛋白、TGB1、TGB2、TGB3蛋白和外壳蛋白。ZyVX-GZ与P39和B1分离物基因组序列一致性均为91%。TGB1-3、外壳蛋白基因与大多数分离物核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为95%~99%和96%~100%;复制酶基因的核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为80%~89%和92%~97%。系统进化分析表明,ZyVX群体的遗传分化与寄主种类、地理分布不存在相关性。本研究结果丰富了ZyVX群体的基因组序列信息,为ZyVX的监测和防控提供了基础。 展开更多
关键词 复制酶 外壳蛋白 核苷酸 序列一致性
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药用野生稻GBSS基因的系统发育及组织特异性表达 被引量:4
10
作者 张霞 景翔 +1 位作者 周光才 包颖 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期343-349,共7页
淀粉作为主要的碳水化合物在储藏能量方面发挥至关重要的作用。颗粒结合型淀粉合酶(GBSS)与直链淀粉的合成息息相关。尽管该酶的编码基因已在许多栽培植物中被分离和确定,但有关它们在作物野生近缘种中的序列分歧和表达的研究却相对较... 淀粉作为主要的碳水化合物在储藏能量方面发挥至关重要的作用。颗粒结合型淀粉合酶(GBSS)与直链淀粉的合成息息相关。尽管该酶的编码基因已在许多栽培植物中被分离和确定,但有关它们在作物野生近缘种中的序列分歧和表达的研究却相对较少。该研究以药用野生稻(Oryza officinalis)为研究对象,定性和定量地分析了GBSS编码基因的序列特点、与其它植物同源基因的进化关系以及在叶和种子中的表达情况。系统发育分析表明,该酶在禾本科植物中分别由GBSSI和GBSSII基因编码。在药用野生稻中,这2种基因所编码蛋白的氨基酸序列一致性为62%,并且它们在不同器官内呈现时空分化表达,其中GBSSI在种子中超强表达, GBSSII则主要在叶片表达。 展开更多
关键词 药用野生稻 颗粒结合型淀粉合酶 序列一致度 表达分化 种子
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文南油田滚动勘探开发模式 被引量:4
11
作者 赵习森 黄金满 +2 位作者 刘海滨 张燕 林娟 《断块油气田》 CAS 2003年第2期32-34,共3页
文南油田是地质构造破碎 ,油层埋藏深 ,压力系数高 ,渗透率低 ,含油层系多的复杂断块油田。通过对复杂断块油田不同开发阶段的分析和效果的论证 ,建立了断块油田的滚动勘探开发模式。复杂断块油田的开发既需要开发理论指导 ,又具有它的... 文南油田是地质构造破碎 ,油层埋藏深 ,压力系数高 ,渗透率低 ,含油层系多的复杂断块油田。通过对复杂断块油田不同开发阶段的分析和效果的论证 ,建立了断块油田的滚动勘探开发模式。复杂断块油田的开发既需要开发理论指导 ,又具有它的特殊性。 展开更多
关键词 文南油田 滚动勘探 开发模式 复杂断块 地层层序 油田开发 断层 油气富集区
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Sequence Patterns of Identity Authentication Protocols 被引量:2
12
作者 陶宏才 何大可 《Journal of Southwest Jiaotong University(English Edition)》 2006年第3期205-211,共7页
From the viewpoint of protocol sequence, analyses are made of the sequence patterns of possible identity authentication protocol under two cases: with or without the trusted third party (TFP). Ten feasible sequence... From the viewpoint of protocol sequence, analyses are made of the sequence patterns of possible identity authentication protocol under two cases: with or without the trusted third party (TFP). Ten feasible sequence patterns of authentication protocol with TIP and 5 sequence patterns without TFP are gained. These gained sequence patterns meet the requirements for identity authentication, and basically cover almost all the authentication protocols with TFP and without TFP at present. All of the sequence patterns gained are classified into unilateral or bilateral authentication. Then, according to the sequence symmetry, several good sequence patterns with TFP are evaluated. The accompolished results can provide a reference to design of new identity authentication protocols. 展开更多
关键词 Authentication protocol identity authentication sequence pattern TTP
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大鼠卡氏肺孢子虫的三个基因序列分析 被引量:3
13
作者 叶彬 陈雅棠 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2001年第6期50-52,13,共4页
目的 分析我国大鼠源卡氏肺孢子虫的基因序列特征。方法 以Wistar大鼠建立肺孢子虫肺炎动物模型 ,收集鼠肺 ,抽提DNA ,以PCR方法扩增卡氏肺孢子虫的 5SrRNA基因、线粒体rRNA大亚基基因 (mtLSUrRNA)、胸腺嘧啶核苷酸合成酶基因 (TS)。... 目的 分析我国大鼠源卡氏肺孢子虫的基因序列特征。方法 以Wistar大鼠建立肺孢子虫肺炎动物模型 ,收集鼠肺 ,抽提DNA ,以PCR方法扩增卡氏肺孢子虫的 5SrRNA基因、线粒体rRNA大亚基基因 (mtLSUrRNA)、胸腺嘧啶核苷酸合成酶基因 (TS)。纯化扩增产物 ,直接测序。检索基因库 (GenBank) ,进行序列比较。结果 三个基因的PCR扩增呈阳性。感染Wistar大鼠的卡氏肺孢子虫 5SrRNA基因与gb|S78185 |S78185、gb|M 2 8193 |PMCRAA两个序列同源性分别为 93 .3 %和 91.7% ;mtLSUrRNA基因与 gb|U2 0 173 |PCU2 0 173、gb|U2 0 169|PCU2 0 169两个序列同源性分别为 76.2 %和 5 5 .2 % ;TS基因与 gb|M 2 5 4 15 |PMCTHYSY、gb|S775 10 |S775 10两个序列同源性均为 90 .9%。 展开更多
关键词 卡氏肺孢子虫 大鼠 序列 同源性 卡氏肺孢子虫病 基因序列
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基于动态规划的Needleman-Wunsch双序列比对算法的分析与研究 被引量:3
14
作者 甘秋云 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2021年第2期340-346,共7页
生物序列比对是生物信息学中最基础的研究课题之一。基于动态规划的Needleman-Wunsch双序列比对算法主要采用迭代算法及空位罚分规则对基因序列进行逐一比对,计算二者相似性得分,最后通过回溯分析得出序列之间的最佳比对。虽然该算法可... 生物序列比对是生物信息学中最基础的研究课题之一。基于动态规划的Needleman-Wunsch双序列比对算法主要采用迭代算法及空位罚分规则对基因序列进行逐一比对,计算二者相似性得分,最后通过回溯分析得出序列之间的最佳比对。虽然该算法可以得到最佳比对结果,但是时间复杂度和空间复杂度较高。首先对原算法进行分析,对计算得分和回溯进行改进。接着设计2次实验,以金黄色葡萄球菌和银葡萄球菌分别作为目标序列和待比对序列,分别生成序列长度范围相同和不同的5组数据进行实验测试。最后通过对新型冠状病毒和SARS病毒全序列进行比对,进一步验证了改进算法的有效性。实验结果表明,改进后的算法可以缩短序列比对时间,提高序列比对效率。 展开更多
关键词 序列比对 动态规划 相似性
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侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒和火龙果X病毒基因组序列差异和遗传变异 被引量:1
15
作者 郑乾明 王小柯 马玉华 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第5期1173-1177,共5页
【目的】分离侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)和火龙果X病毒(Pitaya virus X,PiVX)基因组序列,探讨其序列差异和遗传变异。【方法】利用RT-PCR筛选含有ZyVX和PiVX的火龙果样品,然后通过RNA-seq获得ZyVX和PiVX基... 【目的】分离侵染贵州火龙果的蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)和火龙果X病毒(Pitaya virus X,PiVX)基因组序列,探讨其序列差异和遗传变异。【方法】利用RT-PCR筛选含有ZyVX和PiVX的火龙果样品,然后通过RNA-seq获得ZyVX和PiVX基因组相关序列,进行序列组装、一致性比较、基因重组和系统进化分析。【结果】获得4条ZyVX贵州分离物和3条PiVX贵州分离物基因组近全长序列,长度分别为6570~6600和6649~6657 bp,分别覆盖参考基因组序列的99.2%~99.6%和99.3%~99.8%。4条ZyVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为96.7%~99.5%,与其他已报道分离物的序列一致性为91.4%~96.9%,其ORF编码的氨基酸序列一致性为93.8%~100%。3条PiVX贵州分离物之间基因组序列一致性为98.2%~98.5%,与其他已报道分离物序列一致性为98.0%~99.1%,其ORF编码的氨基酸序列一致性为97.8%~100%。ZyVX和PiVX贵州分离物基因重组分析表明未发现明显的重组事件,系统进化分析表明未发生明显的遗传分化。【结论】当前贵州ZyVX和PiVX群体的基因组序列一致性高,其变异均为单核苷酸变异,未发生基因重组和遗传分化。 展开更多
关键词 马铃薯X病毒属 氨基酸序列 序列一致性 遗传分化
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侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒基因组序列分离与变异分析 被引量:1
16
作者 郑乾明 柏自琴 +3 位作者 王小柯 林乾 王彬 马玉华 《贵州农业科学》 CAS 2022年第4期1-7,共7页
【目的】分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒(Cactus virus X,CVX)及其NTU株系的基因组序列遗传变异,为建立分子检测和防控体系奠定理论基础。【方法】对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析,分离病毒基因组序列并分析分子变... 【目的】分析侵染贵州火龙果的仙人掌X病毒(Cactus virus X,CVX)及其NTU株系的基因组序列遗传变异,为建立分子检测和防控体系奠定理论基础。【方法】对感染病毒的样品采用宏转录组测序和生物信息学分析,分离病毒基因组序列并分析分子变异和系统进化。【结果】获得4条CVX(CVX-LW、CVX-RF、CVX-ZNS和CVX-ZYP)和5条CVX-NTU(CVX-NTU-LW、CVX-NTU-RF、CVX-NTU-ZNF、CVX-NTU-ZNS和CVX-NTU-ZYP)贵州火龙果分离物近全长基因组序列,长度为6494~6603 bp,覆盖参考基因组96.2%~99.6%;CVX贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.3%~98.6%,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.1%~98.0%;CVX-NTU贵州分离物之间的基因组序列一致性为98.1%~98.8%,与已报道的其他分离物基因组序列一致性为97.6%~99.1%;CVX和CVX-NTU群体未出现明显的遗传分化。【结论】研究获得的CVX和CVX-NTU贵州火龙果分离物近全长基因组序列表现较高的一致性,未发生明显遗传变异。 展开更多
关键词 仙人掌X病毒 宏转录组测序 遗传变异 序列一致性
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三种细茎类石斛药材的分子生物学鉴别 被引量:2
17
作者 陆安静 曾瑶 +5 位作者 杜艺玫 秦琳 鲁艳柳 张倩茹 谭道鹏 何芋岐 《遵义医科大学学报》 2020年第4期452-456,共5页
目的针对目前细茎类石斛的植物分类较为困难,商品药材来源鉴别难度大,建立3种常用细茎类石斛的分子生物学鉴别方法。方法采用PCR扩增的方法对3种细茎类石斛样品进行ITS序列的扩增并经单向测序,进行聚类、亲缘关系分析。结果9个石斛样本... 目的针对目前细茎类石斛的植物分类较为困难,商品药材来源鉴别难度大,建立3种常用细茎类石斛的分子生物学鉴别方法。方法采用PCR扩增的方法对3种细茎类石斛样品进行ITS序列的扩增并经单向测序,进行聚类、亲缘关系分析。结果9个石斛样本明显分为三类,罗河石斛(1、2、3)聚为一类,铁皮石斛(4、5、6)聚为一类,细茎石斛(7、8、9)聚为一类。细茎石斛与铁皮石斛的亲缘关系较近,与罗河石斛的亲缘关系较远,罗河石斛与铁皮石斛的亲缘关系最远。结论以ITS序列为DNA条形码可以快速准确地鉴别3种细茎类石斛来源,为解决细茎类石斛的分类异议提供参考,并保障石斛药材的来源准确。 展开更多
关键词 石斛 ITS序列 DNA条形码 分子鉴别
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基于三分类的击键序列身份认证 被引量:1
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作者 傅博 王晅 马建峰 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2007年第1期139-142,共4页
针对基于统计学用户击键模式识别算法识别率较低的不足,提出了一种统计学三分类主机用户身份认证算法。该方法通过对当前注册用户的击键特征与由训练样本得到的标准击键特征进行比较,将当前注册用户划分为合法用户类、怀疑类与入侵类三... 针对基于统计学用户击键模式识别算法识别率较低的不足,提出了一种统计学三分类主机用户身份认证算法。该方法通过对当前注册用户的击键特征与由训练样本得到的标准击键特征进行比较,将当前注册用户划分为合法用户类、怀疑类与入侵类三类,对怀疑类采用二次识别机制。采用动态判别域值,引入了与系统安全性和友好性相关的可控参量k,由系统管理员根据实际确定。并对该算法性能进行了理论分析与实验测试,结果表明该算法在保持贝叶斯统计算法需要训练样本集规模较小、算法收敛速度快优点的基础上,识别精度高于贝叶斯统计算法,错误拒绝率(FRR)和错误通过率(FAR)分别为1.6%和1.5%。 展开更多
关键词 击键序列 贝叶斯模型 身份认证 怀疑域 正态分布 MAHALANOBIS距离
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cDNA sequence analysis of ribosomal protein S13 gene in Plutella xylostella (Lepidoptera: Plutellidae) 被引量:2
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作者 SHAO-LIWANG CHENG-FASHENG +1 位作者 CHUAN-LINGQIAO MIYATATADASHI 《Insect Science》 SCIE CAS CSCD 2005年第3期225-229,共5页
Ribosomal protein S 13 gene has been cloned and analyzed in many organisms,but there are few documents relating to insects. In this communication, the full-length cDNA sequence of ribosomal protein S 13 gene in the di... Ribosomal protein S 13 gene has been cloned and analyzed in many organisms,but there are few documents relating to insects. In this communication, the full-length cDNA sequence of ribosomal protein S 13 gene in the diamondback moth, Plutella xylostella(Lepidoptera: Plutellidae), was determined by using PCR amplification technique. The features of the ribosomal protein S 13 gene sequence were analyzed and the deduced amino acids sequence was compared with those from other insects. The results of multi-alignment of the amino acid sequences between the diamondback moth and other insect species revealed that this gene sequence is highly conserved in insects. Based on maximum likelihood method, a phylogenetic tree was constructed from 10 different species using PHYLIP software. It showed that nematode is one separate lineage and the five insect speciesbe long to another lineage, whereas those species higher than insects form the third one. The pattern of this phylogenetic tree evidently represented the evolution of different species. 展开更多
关键词 cDNA sequence identity analysis plutella xylostella ribosomal protein S13
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不同地区不同生境按蚊种群的分子鉴定及rDNA-ITS2序列分析 被引量:2
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作者 谭伟龙 赵彤言 +2 位作者 董言德 汪中明 李春晓 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2011年第2期84-89,共6页
对采自安徽、江苏、湖南、广西、云南及海南等地区的人房、牛棚、稻田、山区等不同生境的按蚊,按照文献合成引物,用PCR方法进行分子鉴定;并对各种群的ITS2序列测序后,与GenBank所得赫坎按蚊复合体近缘种群按蚊的ITS2序列进行比对分... 对采自安徽、江苏、湖南、广西、云南及海南等地区的人房、牛棚、稻田、山区等不同生境的按蚊,按照文献合成引物,用PCR方法进行分子鉴定;并对各种群的ITS2序列测序后,与GenBank所得赫坎按蚊复合体近缘种群按蚊的ITS2序列进行比对分析。结果显示,采集的不同地区不同生境的按蚊均为中华按蚊,此次采集没有采到嗜人按蚊;现场的中华按蚊与凉山按蚊、贵阳按蚊和昆明按蚊的同源性为80.6%~83.1%.与嗜人按蚊和雷氏按蚊的同源性为75.2%~76.2%,与最黑按蚊和带足按蚊的同源性稍低,为63.2%~64.6%。系统发育树显示:所有的序列样本形成了两个分支,来自现场的按蚊处在同一分支且差异小。 展开更多
关键词 按蚊 分子鉴定 RDNA-ITS2 序列分析 同源性
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