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西农萨能奶山羊INSIG-1编码区的克隆、序列特征分析和组织表达 被引量:8
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作者 王慧 罗军 +4 位作者 胡仕良 席利萌 张犁苹 李芳 孙雨婷 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2013年第8期24-30,共7页
【目的】克隆西农萨能奶山羊胰岛素诱导基因1(INSIG-1)编码区,并对其进行序列特征分析和组织表达规律研究。【方法】提取西农萨能奶山羊总RNA,反转录cDNA后进行PCR反应,对克隆得到的INSIG-1序列进行生物信息学分析。用实时荧光定量PCR(R... 【目的】克隆西农萨能奶山羊胰岛素诱导基因1(INSIG-1)编码区,并对其进行序列特征分析和组织表达规律研究。【方法】提取西农萨能奶山羊总RNA,反转录cDNA后进行PCR反应,对克隆得到的INSIG-1序列进行生物信息学分析。用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测INSIG-1在皮下脂肪、胸部肌肉、乳腺、肝脏、肾脏、心脏、肺、脾脏、瘤胃、小肠10个组织中的表达情况。【结果】获得西农萨能奶山羊INSIG-1基因1 014bp序列(Gen-Bank登录号JQ665439),其中编码区序列长度为831bp,编码276个氨基酸。西农萨能奶山羊INSIG-1编码区与牛(GenBank登录号NM_001077909)的亲缘关系最近,相似性达97%,编码氨基酸序列的相似性达90%,而与小鼠(GenBank登录号NM_025836)的亲缘关系较远。预测INSIG-1蛋白质分子量为29.70ku,理论等电点为8.99;IN-SIG-1蛋白质具有5个跨膜螺旋结构,且有较强的疏水性,不含信号肽。RT-qPCR检测结果表明,在西农萨能奶山羊10个组织中INSIG-1均有表达,其中在肝脏中的相对表达量最高,皮下脂肪、胸部肌肉、肺次之,在心脏中的相对表达量最低。【结论】克隆得到了西农萨能奶山羊的INSIG-1基因,并探明了其组织表达规律。 展开更多
关键词 西农萨能奶山羊 胰岛素诱导基因1 实时荧光定量PCR 序列分析 组织表达
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孤北~桩海地区古近系沙河街组层序划分及特征研究 被引量:3
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作者 林会喜 谭先锋 +3 位作者 孟万兵 林小兵 张小兵 聂永生 《物探化探计算技术》 CAS CSCD 2009年第3期283-288,178,共6页
以孤北~桩海地区古近系沙河街组为研究对象,通过大量的地震剖面解释,测井资料分析和钻井岩芯观察,在研究区沙河街组岩石学特征分析的基础上,详细研究了层序划分及层序特征。共划分出了SQ1、SQ2、SQ3三个长期旋回,S1~S2上、S2下~S3上... 以孤北~桩海地区古近系沙河街组为研究对象,通过大量的地震剖面解释,测井资料分析和钻井岩芯观察,在研究区沙河街组岩石学特征分析的基础上,详细研究了层序划分及层序特征。共划分出了SQ1、SQ2、SQ3三个长期旋回,S1~S2上、S2下~S3上、S3中、S3下、S4上、S4下六个中期旋回。深入讨论了各层序在地震剖面,钻井剖面及测井曲线上的特征,并详细论述了各层序的发育特征。 展开更多
关键词 孤北~桩海 沙河街组 岩石学特征 层序划分 层序特征
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斑马鱼g型溶菌酶基因序列分析及其原核表达 被引量:3
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作者 陈华 林晨韬 +1 位作者 陈曦 葛均青 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期229-237,共9页
【目的】实现斑马鱼g型溶菌酶在大肠杆菌中表达,以获得高纯度且具溶菌活性的融合蛋白,为探究g型溶菌酶在斑马鱼抗菌过程中的作用机制及其开发利用打下基础。【方法】通过ClustalW、ExPASy、SignalP-5.0 Server及PSIPRED等在线软件对斑马... 【目的】实现斑马鱼g型溶菌酶在大肠杆菌中表达,以获得高纯度且具溶菌活性的融合蛋白,为探究g型溶菌酶在斑马鱼抗菌过程中的作用机制及其开发利用打下基础。【方法】通过ClustalW、ExPASy、SignalP-5.0 Server及PSIPRED等在线软件对斑马鱼g型溶菌酶进行生物信息分析,经密码子优化后合成斑马鱼g型溶菌酶基因,亚克隆至pET-28a(+)表达载体并转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,以IPTG进行诱导表达,并通过非干扰型蛋白浓度测定试剂盒和溶菌酶测定试剂盒(比浊法)测定其浓度及溶菌活性。【结果】从GenBank检索获得的斑马鱼溶菌酶基因g1(NM_001002706.1)和g2(XM_002664371.5)分别命名为Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2。Zeb-Lys-g1基因开放阅读框(ORF)长591 bp,共编码196个氨基酸残基,其编码蛋白分子量约21.6 kD;Zeb-Lys-g2的ORF长576 bp,共编码191个氨基酸残基,其编码蛋白分子量约21.1 kD;2种斑马鱼g型溶菌酶序列中均含有2个半胱氨酸残基及3个保守的催化残基位点(Glu、Asp和Asp)。Zeb-Lys-g1的N端含有17个氨基酸的信号肽,而Zeb-Lys-g2不存在典型的信号肽结构,但其三级结构均具有多个α-螺旋结构。在基于溶菌酶序列相似性构建的系统发育进化树中,Zeb-Lys-g1序列与金鱼g型溶菌酶序列的亲缘关系最近,而Zeb-Lys-g2序列与鲈形目和鲽形目鱼类的g型溶菌酶序列亲缘关系较近。将合成的斑马鱼g型溶菌酶基因(Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2)亚克隆至pET-28a(+)表达载体并转化BL21(DE3)感受态细胞,20℃下经IPTG(终浓度0.5 mmol/L)诱导16 h,可获得融合蛋白Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2,纯化后的浓度分别为1.01和1.66 mg/mL,对应的溶菌活性分别为689.68和44.39 U/mg。【结论】鱼类g型溶菌酶的基因变异较保守,经密码子优化及全基因合成方式合成的斑马鱼g型溶菌酶基因Zeb-Lys-g1和Zeb-Lys-g2可通过原核表达获得高纯度、高溶菌活性的融合蛋白,为探究斑马鱼溶菌酶的抗� 展开更多
关键词 斑马鱼 g型溶菌酶 序列特征 原核表达 溶菌活性
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宝鸡地区汉坦病毒基因分型及序列特征研究 被引量:2
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作者 孙彦峰 胡侃 +1 位作者 武永平 田辉 《职业与健康》 CAS 2016年第8期1049-1052,共4页
目的分析宝鸡地区的汉坦病毒基因序列特征。方法收集肾综合征出血热患者血清及汉坦病毒宿主动物鼠肺标本,通过荧光PCR方法进行基因分型,采用RT-PCR对目的基因进行扩增并测序,与汉坦病毒分型菌株进行序列比对及种系发生树分析。结果宝鸡... 目的分析宝鸡地区的汉坦病毒基因序列特征。方法收集肾综合征出血热患者血清及汉坦病毒宿主动物鼠肺标本,通过荧光PCR方法进行基因分型,采用RT-PCR对目的基因进行扩增并测序,与汉坦病毒分型菌株进行序列比对及种系发生树分析。结果宝鸡地区汉坦病毒分型检测结果均为汉滩型(HTN),未检测到汉城型(SEO);序列分析显示,获得的11株序列与宁夏分离株Niongxia-A及陕西分离株A16同源性为94.3%~97.0%,同属于汉滩型H9亚型;1株序列与其他11株序列同源性仅为76.5%~77.4%,进一步序列比对显示与Nc167毒株同源性较高。结论宝鸡地区汉坦病毒基因型为汉滩型H9亚型;检测到1株与大别山病毒(DBSV)高度同源,不排除存在其他汉坦病毒型别的可能。 展开更多
关键词 汉坦病毒 基因分型 序列特征
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糜子Ty 1-copia型反转录转座子基因的序列特征及表达分析 被引量:1
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作者 何杰丽 薛延桃 +5 位作者 王瑞云 陈国荣 陈凌 王海岗 杨美红 乔治军 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第6期22-28,共7页
[目的]发掘抗旱相关基因,明晰其编码蛋白的理化特征,为糜子育种提供基因元件。[方法]利用生物信息学软件、数据库和在线程序,对糜子Ty1-copia型反转录转座子编码蛋白进行生物信息学分析,同时对该基因进行qRTPCR表达特性分析。[结果]Ty1-... [目的]发掘抗旱相关基因,明晰其编码蛋白的理化特征,为糜子育种提供基因元件。[方法]利用生物信息学软件、数据库和在线程序,对糜子Ty1-copia型反转录转座子编码蛋白进行生物信息学分析,同时对该基因进行qRTPCR表达特性分析。[结果]Ty1-copia基因编码蛋白分子式为C483H758N122O135S7,分子量为10 658.49Da,呈弱碱性,是不稳定的疏水蛋白;该蛋白为非分泌型蛋白、无跨膜结构,既不存在于叶绿体上也不存在于线粒体上;二级结构包括4个α螺旋,4个β折叠;三级结构包括1个螺旋结构和2个折叠结构;含4个保守结构域;系统进化树和多重序列比对结果显示糜子保守性较低,与水稻类和毛竹的同源性为64%。实时定量PCR检测结果表明,Ty1-copia表达水平在干旱胁迫处理不同时间点存在显著差异,3h时表达量最高,为对照的2.02倍;8h时该基因呈下调表达,表达量低于对照。[结论]Ty1-copia基因可以由干旱胁迫诱导。 展开更多
关键词 糜子 Ty1-copia 序列特征 基因表达
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北祁连西段志留系层序地层学特征 被引量:2
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作者 徐卫东 周学武 +1 位作者 李俊建 岳世东 《地质调查与研究》 2006年第2期92-97,共6页
甘肃省北祁连西段志留纪地层为一套形成于残留盆地的碎屑岩堆积,其岩石地层包括肮脏沟组,泉脑沟山组,旱峡组,分别相当于年代地层单位的下志留统、中志留统和上志留统。通过对其沉积环境、层序地层学特征及其变化研究认为该区地层包括低... 甘肃省北祁连西段志留纪地层为一套形成于残留盆地的碎屑岩堆积,其岩石地层包括肮脏沟组,泉脑沟山组,旱峡组,分别相当于年代地层单位的下志留统、中志留统和上志留统。通过对其沉积环境、层序地层学特征及其变化研究认为该区地层包括低水位体系域(水位扇、低水位进积楔)、海侵体系域和高水位体系域沉积,其沉积环境由深海扇(近源浊积盆地、远源浊积盆地)渐变为陆棚直至潮坪,为一个完整的海浸海退旋回,基本上是一套完整的Ⅰ型层序。 展开更多
关键词 北祁连 志留系 层序地层学特征
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浅谈如何查询与输入不认识的汉字
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作者 叶冠卿 王欣 蒋决根 《办公自动化(综合月刊)》 2008年第4期36-38,共3页
本文简述了对于不认识的汉字如何进行查询与输入,并讨论了汉字国际化的一些问题。作者对解决汉字问题作了一些初步尝试,建立了一种全新的网络在线"字海",用以更方便、快捷地查询、输入不认识的汉字。
关键词 汉字输入 字海 两分查字法 汉字全集 汉字序列
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连铸机油缸成套密封件国产化 被引量:2
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作者 李放明 《润滑与密封》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期66-68,共3页
本文论述了冶金行业中连铸机油缸密封件国产化的一些技术参数 ,同时也介绍了洪格尔型组合密封及夹布V型圈组合密封的使用特点。
关键词 连铸机 油缸 密封件 国产化
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基于内码替换的汉字笔划排序系统的设计与实现
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作者 白振田 衡中青 《新世纪图书馆》 2006年第4期47-48,75,共3页
论文在先期自动汉字笔划属性采集排序基础上,采用汉字等价置换方法,利用内码提取函数进行地址计算,设计实现了一个汉字笔划排序系统。论文对该笔划排序系统的设计思路、算法实现步骤等进行了详细讨论并对该排序系统的使用进行了有关说... 论文在先期自动汉字笔划属性采集排序基础上,采用汉字等价置换方法,利用内码提取函数进行地址计算,设计实现了一个汉字笔划排序系统。论文对该笔划排序系统的设计思路、算法实现步骤等进行了详细讨论并对该排序系统的使用进行了有关说明和评价。 展开更多
关键词 汉字笔划排序系统 内码替换 算法复杂度 设计思路
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