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广州城市人工水系统中军团菌的发生和分布 被引量:18
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作者 施海琼 黄炯威 +4 位作者 吴夏飞 林尤海 徐润林 周世宁 陆勇军 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2003年第6期635-638,共4页
综合运用平板分离法、半巢式PCR和EnviroAmpPCR反向杂交检测试剂盒 ,对广州市部分人工水系统中条件致病菌军团菌属细菌进行分离和检测 .结果表明 ,虽然阳性率随着采样时间和地点的不同而有所差异 ,但总体来说 ,广州市人工水系统中存在... 综合运用平板分离法、半巢式PCR和EnviroAmpPCR反向杂交检测试剂盒 ,对广州市部分人工水系统中条件致病菌军团菌属细菌进行分离和检测 .结果表明 ,虽然阳性率随着采样时间和地点的不同而有所差异 ,但总体来说 ,广州市人工水系统中存在较高程度的军团菌的污染 ,中央空调冷却塔水中军团菌阳性率平均为 84 % ,个别路段甚至达到了 10 0 % ,自来水池中则达到了 35 % ,但在后者的水样中没有检测到最常见的致病菌嗜肺军团菌 .对各种培养方法的优劣及军团菌的季节性发生和分布进行了初步讨论 .图 2表 2参 展开更多
关键词 军团菌 中央空调冷却塔水 自来水 半巢式pcr
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利用半套式PCR扩增16S rRNA基因检测牛和猪附红细胞体 被引量:6
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作者 刘文强 胡敬东 +4 位作者 梁成彪 栾婧婧 赵宏坤 高运东 仲跻峰 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期262-264,共3页
根据GenBank收录的猪和牛附红细胞体16SrRNA基因序列设计1对通用引物,在其上游引物内侧又设计1条分别针对猪和牛附红细胞体的特异性引物。以这4条引物对出现附红细胞体病典型症状及疑似症状的猪和牛的血样DNA进行半套式-PCR扩增。结果显... 根据GenBank收录的猪和牛附红细胞体16SrRNA基因序列设计1对通用引物,在其上游引物内侧又设计1条分别针对猪和牛附红细胞体的特异性引物。以这4条引物对出现附红细胞体病典型症状及疑似症状的猪和牛的血样DNA进行半套式-PCR扩增。结果显示,该反应阳性率为58.3%,低于临床解剖和镜检结果。对该基因的序列测定结果进行分析,表明不同动物附红细胞体的16SrRNA基因同源性在80%以上。从该基因来看,附红细胞体与立克次氏体没有同源性,而与肺炎支原体和穿透支原体亲缘关系较近。 展开更多
关键词 附红细胞体 16S RRNA 半套式pcr
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三种分子生物学方法检测牡蛎中诺如病毒的比较研究 被引量:5
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作者 李丹 唐庆娟 +3 位作者 李兆杰 王玉明 薛勇 薛长湖 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第12期246-250,共5页
采用RT-PCR、RT-半巢式PCR(seminested PCR)和RT-环介导等温扩增(LAMP)三种分子生物学方法分别检测了牡蛎中经粪便污染的诺如病毒。三种方法所采用的特异性引物均针对诺如病毒高度保守的N/S结构域。结果显示:一步法RT-PCR较两步法结果... 采用RT-PCR、RT-半巢式PCR(seminested PCR)和RT-环介导等温扩增(LAMP)三种分子生物学方法分别检测了牡蛎中经粪便污染的诺如病毒。三种方法所采用的特异性引物均针对诺如病毒高度保守的N/S结构域。结果显示:一步法RT-PCR较两步法结果理想但仍不能有效去除食品中的PCR反应抑制物。RT-半巢式PCR和RT-LAMP的特异性和敏感性都远远优于RT-PCR,但是RT-半巢式PCR操作繁琐费时。RT-LAMP扩增程序简单、反应时间短,且不需要精密的温度循环装置,在产物中加入SYBR Green Ⅰ染料后可用肉眼直接判断反应结果。因此,RT-LAMP有望发展成为快速检测牡蛎中诺如病毒的有效手段。 展开更多
关键词 诺如病毒 牡蛎 检测 RT-pcr RT-半巢式pcr RT-LAMP
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半巢式PCR和PCR-RFLP法诊断耐青霉素肺炎链球菌的比较 被引量:1
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作者 丁晶晶 张德平 +1 位作者 邵海枫 施毅 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期81-83,共3页
目的评价半巢式PCR和PCR-RFLP法用于诊断肺炎链球菌青霉素耐药性的价值。方法收集130株肺炎链球菌临床分离株和50株健康人定植株,琼脂稀释法测定青霉素最低抑菌浓度(MIC),半巢式PCR、PCR-RFLP法测定对青霉素耐药性。结果健康人定植株均... 目的评价半巢式PCR和PCR-RFLP法用于诊断肺炎链球菌青霉素耐药性的价值。方法收集130株肺炎链球菌临床分离株和50株健康人定植株,琼脂稀释法测定青霉素最低抑菌浓度(MIC),半巢式PCR、PCR-RFLP法测定对青霉素耐药性。结果健康人定植株均对青霉素敏感,临床分离株青霉素敏感率、中介率、耐药率分别为25.4%、23.1%和51.5%;当MIC为0.25~0.5μg/ml时,半巢式PCR法检测青霉素耐药性的敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为86.7%、98.6%、86.7%和98.6%;当MIC≥1μg/ml时,对应值分别为96.2%、97.6%、97.4%和96.4%。而PCR-RFLP法诊断中介株的敏感性仅34.2%;诊断耐药株的阳性预测值仅67.5%。结论半巢式PCR法优于PCR-RFLP法,可用于对耐青霉素肺炎链球菌的快速检测;PCR-RFLP敏感性不高,可用于分子流行病学分析。 展开更多
关键词 肺炎链球菌 青霉素 耐药性 半巢式pcr pcr-RFLP
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风疹病毒气溶胶的逆转录-半套式PCR检测 被引量:2
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作者 汪晓辉 杨瑞馥 +3 位作者 张朝隆 张松乐 陈梅玲 车凤翔 《中国公共卫生学报》 1996年第1期10-13,共4页
将已知浓度的风疹病毒液通过TK发生器进行气溶胶发生于气溶胶转鼓中,搅匀后用AGI-10和Casella采样器进行气溶胶采样,采样样品以不同浓度稀释后分别进行RT-SN-PCR和细胞培养。敏感性试验结果表明100TCI... 将已知浓度的风疹病毒液通过TK发生器进行气溶胶发生于气溶胶转鼓中,搅匀后用AGI-10和Casella采样器进行气溶胶采样,采样样品以不同浓度稀释后分别进行RT-SN-PCR和细胞培养。敏感性试验结果表明100TCID(50)的RV病毒仍可被RT-SN-PCR检测到,扩增片段为293hP,经HincⅡ酶切成121和172hP的酶切片段与理论设计吻合。相应的Vero细胞培养结果均为阴性。通过气溶胶耐喷和耐压试验证明RV在空气采样过程中因高压冲击衰亡。PCR检测微生物核酸,可不过多地考虑其生物衰亡,只要靶基因存在即有检测的可能性。 展开更多
关键词 风疹病毒 气溶胶 逆转录-半套式pcr
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西部马脑炎病毒基因组序列的半套式RT-PCR检测
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作者 赵月峨 于曼 +4 位作者 邓永强 杨保安 吕富双 祝庆余 秦鄂德 《微生物学免疫学进展》 2003年第1期7-10,共4页
为进一步提高RT PCR检测西部马脑炎病毒 (WEE)病毒基因组方法的敏感性 ,采用半套式PCR扩增病毒基因组特异序列。首先采用逆转录法将病毒基因组RNA逆转录为cDNA ,然后以此cDNA为模板 ,进行扩增。对扩增后电泳检查无可见DNA条带的产物进... 为进一步提高RT PCR检测西部马脑炎病毒 (WEE)病毒基因组方法的敏感性 ,采用半套式PCR扩增病毒基因组特异序列。首先采用逆转录法将病毒基因组RNA逆转录为cDNA ,然后以此cDNA为模板 ,进行扩增。对扩增后电泳检查无可见DNA条带的产物进行半套式PCR ;与此同时对扩增的循环数、Mg++浓度和退火温度等条件进行了优化 ,以进一步提高扩增的特异性。结果第一轮PCR未扩出特异性片段的WEE病毒稀释度 ,其半套式扩增出特定大小的DNA产物 ;同时优化的条件提高了扩增产物的特异性。扩增产物约为 190bp的单一DNA片段 ,其大小与预期的相一致。结果表明采用半套式RT PCR方法检测WEE病毒的基因组序列的敏感性可提高 10 展开更多
关键词 西部马脑炎病毒 半套式RT-pcr 基因组序列
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