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暂态混沌神经网络在蛋白质关联图预测中应用研究
被引量:
2
1
作者
刘桂霞
吕晓枫
+1 位作者
徐春艳
周春光
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2008年第7期1291-1295,共5页
蛋白质结构预测是生物信息学的一个主要研究方向,而蛋白质关联图预测是其中的一个重要内容.针对蛋白质关联图预测问题,提出一种暂态混沌神经网络实现方法,所提出的方法具有暂态混沌特性和平稳收敛特性,能有效避免传统Hopfield神经网络...
蛋白质结构预测是生物信息学的一个主要研究方向,而蛋白质关联图预测是其中的一个重要内容.针对蛋白质关联图预测问题,提出一种暂态混沌神经网络实现方法,所提出的方法具有暂态混沌特性和平稳收敛特性,能有效避免传统Hopfield神经网络极易陷入局部极值的缺陷.它通过短暂的倒分叉过程,能很快进入稳定收敛状态.仿真结果表明:暂态混沌神经网络解决蛋白质关联图预测问题时,总能收敛到全局最优或几乎接近全局最优,同时具有更高的搜索效率.这种方法预测精度达到0.27,比随机预测器高9倍.
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关键词
蛋白质关联图
人工神经网络
暂态混沌神经网络
疏水性
二级结构
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职称材料
吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌cstⅡ基因序列对比研究
被引量:
1
2
作者
孙世超
白欣立
+4 位作者
陈娟
王莹
邢丛丛
付金生
李震中
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期554-559,共6页
目的研究华北地区3株吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barre syndrome,GBS)相关空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的cstⅡ基因序列并寻找GBS相关及GBS无关的两类空肠弯曲菌菌株间可能与GBS致病性相关的基因突变位点和蛋白高级...
目的研究华北地区3株吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barre syndrome,GBS)相关空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的cstⅡ基因序列并寻找GBS相关及GBS无关的两类空肠弯曲菌菌株间可能与GBS致病性相关的基因突变位点和蛋白高级结构变化,分析菌株间遗传进化关系。方法选取分离自GBS患者粪便并经动物模型证实为致GBS的3株空肠弯曲菌菌株进行培养并提取基因组DNA测序,与GenBank中GBS无关空肠弯曲菌基因序列进行配对对比,寻找两类菌株间可能导致空肠弯曲菌致病能力差异的cstⅡ基因碱基突变位点及蛋白高级结构改变,观察这种变化是否为GBS相关菌株的共性,并构建遗传进化树。结果与GBS无关菌株相比,3株致GBS菌株cstⅡ基因的氨基酸序列二级结构的第7个0L螺旋的165—180区段均被打开形成了折叠或转角,该变化在其他GBS相关菌株的二级结构变化中同样得到体现。实验中75%的GBS相关菌株cstⅡ基因为双功能,25%GBS相关菌株及所有GBS无关菌株cstⅡ基因为单功能。LL株与实验中涉及的GBS相关菌株在进化上高度类聚。结论双功能cstⅡ可能与空肠弯曲菌的致GBS特性相关。LL株cstⅡ基因在一定程度上反映了亚洲地区的GBS相关菌株cstⅡ基因的序列特征,为进一步探索GBS发病的地域性特点并对GBS菌株进行监测提供了资料。
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关键词
吉兰-巴雷综合征
空肠弯曲菌
cstⅡ基因
序列分析
二级结构
原文传递
浅谈一种开口外爬架技术在高层建筑施工中的应用
被引量:
1
3
作者
邵一凯
《城市建筑》
2014年第4期84-84,共1页
本文主要介绍了一种开口外爬架技术,总结了一种开口外爬架的搭设原理以及在二次结构施工中的技术优势、适用范围等,对今后类似工程特别是高层建筑外爬架开口提供了一定的技术借鉴。
关键词
开口外爬架
高层建筑
二次结构
技术优势
适用范围
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职称材料
题名
暂态混沌神经网络在蛋白质关联图预测中应用研究
被引量:
2
1
作者
刘桂霞
吕晓枫
徐春艳
周春光
机构
吉林大学计算机科学与技术学院
吉林大学计算中心
北华大学计算机科学与技术学院
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2008年第7期1291-1295,共5页
基金
国家自然科学基金重点项目(60433020)资助
国家自然科学基金项目(60175024,60773095)资助
文摘
蛋白质结构预测是生物信息学的一个主要研究方向,而蛋白质关联图预测是其中的一个重要内容.针对蛋白质关联图预测问题,提出一种暂态混沌神经网络实现方法,所提出的方法具有暂态混沌特性和平稳收敛特性,能有效避免传统Hopfield神经网络极易陷入局部极值的缺陷.它通过短暂的倒分叉过程,能很快进入稳定收敛状态.仿真结果表明:暂态混沌神经网络解决蛋白质关联图预测问题时,总能收敛到全局最优或几乎接近全局最优,同时具有更高的搜索效率.这种方法预测精度达到0.27,比随机预测器高9倍.
关键词
蛋白质关联图
人工神经网络
暂态混沌神经网络
疏水性
二级结构
Keywords
prediction
of
protein
contact
maps
artificial
neural
network
transiently
chaotic
neural
network
hydrophobicity
sec
-
ondary
structure
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌cstⅡ基因序列对比研究
被引量:
1
2
作者
孙世超
白欣立
陈娟
王莹
邢丛丛
付金生
李震中
机构
河北医科大学第二医院神经内科
出处
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期554-559,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81072481)
国家863计划(2006AA02A237)
文摘
目的研究华北地区3株吉兰-巴雷综合征(Guillain-Barre syndrome,GBS)相关空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的cstⅡ基因序列并寻找GBS相关及GBS无关的两类空肠弯曲菌菌株间可能与GBS致病性相关的基因突变位点和蛋白高级结构变化,分析菌株间遗传进化关系。方法选取分离自GBS患者粪便并经动物模型证实为致GBS的3株空肠弯曲菌菌株进行培养并提取基因组DNA测序,与GenBank中GBS无关空肠弯曲菌基因序列进行配对对比,寻找两类菌株间可能导致空肠弯曲菌致病能力差异的cstⅡ基因碱基突变位点及蛋白高级结构改变,观察这种变化是否为GBS相关菌株的共性,并构建遗传进化树。结果与GBS无关菌株相比,3株致GBS菌株cstⅡ基因的氨基酸序列二级结构的第7个0L螺旋的165—180区段均被打开形成了折叠或转角,该变化在其他GBS相关菌株的二级结构变化中同样得到体现。实验中75%的GBS相关菌株cstⅡ基因为双功能,25%GBS相关菌株及所有GBS无关菌株cstⅡ基因为单功能。LL株与实验中涉及的GBS相关菌株在进化上高度类聚。结论双功能cstⅡ可能与空肠弯曲菌的致GBS特性相关。LL株cstⅡ基因在一定程度上反映了亚洲地区的GBS相关菌株cstⅡ基因的序列特征,为进一步探索GBS发病的地域性特点并对GBS菌株进行监测提供了资料。
关键词
吉兰-巴雷综合征
空肠弯曲菌
cstⅡ基因
序列分析
二级结构
Keywords
Guil^ain-Barr6
syndrome
Campylobacter
jejuni
cst
11
gene
Sequence
analysis
sec
-
ondary
structure
分类号
R745.43 [医药卫生—神经病学与精神病学]
原文传递
题名
浅谈一种开口外爬架技术在高层建筑施工中的应用
被引量:
1
3
作者
邵一凯
机构
中国建筑第四工程局有限公司华南分公司
出处
《城市建筑》
2014年第4期84-84,共1页
文摘
本文主要介绍了一种开口外爬架技术,总结了一种开口外爬架的搭设原理以及在二次结构施工中的技术优势、适用范围等,对今后类似工程特别是高层建筑外爬架开口提供了一定的技术借鉴。
关键词
开口外爬架
高层建筑
二次结构
技术优势
适用范围
Keywords
opening
up
climb
frame
high-rise
buildings
sec
-
ondary
structure
technical
advantages
application
scope
分类号
TU974 [建筑科学—建筑技术科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
暂态混沌神经网络在蛋白质关联图预测中应用研究
刘桂霞
吕晓枫
徐春艳
周春光
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2008
2
下载PDF
职称材料
2
吉兰-巴雷综合征相关空肠弯曲菌cstⅡ基因序列对比研究
孙世超
白欣立
陈娟
王莹
邢丛丛
付金生
李震中
《中华微生物学和免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
原文传递
3
浅谈一种开口外爬架技术在高层建筑施工中的应用
邵一凯
《城市建筑》
2014
1
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职称材料
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