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题名甲型流感病毒H5N1的siRNA设计
被引量：2
- 1
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作者
郭骁才
郭红霞
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机构
中国科学院成都生物研究所
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出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
2004年第1期133-138,共6页
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文摘
选用了甲型流感病毒 10个毒株 (全序列 )和一个 2 0 0 4年越南毒株 (部分序列 ) ,采用自己编写的计算机程序sRNAFinder,对每个毒株的 6个RNA片段的 6个编码序列进行了siRNA设计 .结合系统发育重建方法 ,利用sRNAFind er的共有序列分析功能 ,对得到的 6 10 1个siRNA分子进行了计算机筛选 .结果表明 ,设计的siRNA的分子 ,针对np和pb1应该是最有效的 ,而针对ha和na的siRNA分子设计 ,需要疾病流行期毒株的最新测序数据 ;从ns1的数据不能获得很保守的、可作为预防或治疗药物的siRNA分子 .图 1表 4参
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关键词
甲型流感病毒
SIRNA
系统发育重建
计算机筛选
禽流感
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Keywords
influenza A virus
H5N1 subtype
siRNA
srnafinder program
phylogenetic reconstruction
computer screening
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分类号
R346
[医药卫生—基础医学]
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题名冠状病毒的siRNA设计
被引量：2
- 2
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作者
郭骁才
郭红霞
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机构
中国科学院成都生物研究所
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出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
2003年第5期534-541,共8页
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文摘
用自己编写的siRNA查找设计的程序sRNAFinder,对来自GenBank的 7个冠状病毒全基因组序列进行了siRNA的查找 ,并分析了各自的分布情况 .结果表明 ,ORF1ab、S、E、M和N这 5个主要基因中 ,候选siRNA占全基因组中所有候选siRNA的比例达到 90 %以上 .根据基因组结构特征 ,对SARS -CoV进行的siRNA分布分析表明 ,在全部 4 4 9个候选siRNA中 ,有 4 4 3个分布于orf1ab中 ,与基于RNAi原理的抗病毒药物设计思想相吻合 .表 8参
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关键词
冠状病毒
SIRNA设计
生物信息学
SARS
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Keywords
RNAi
siRNA
bioinformatics
srnafinder program
coronavirus
SARS-CoV
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分类号
R346
[医药卫生—基础医学]
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