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利用高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃纤毛虫种群结构 被引量：4
1
作者 刘旗 陈芸 +4 位作者 邓俊良 任志华 杨颜铱 高爽 陈憧 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1574-1581,共8页
本试验旨在应用高通量测序技术研究川中黑山羊瘤胃纤毛虫种群结构。选取3只4月龄川中黑山羊[体重(15.53±0.21)kg],正常饲喂20 d后采集瘤胃液(A)样品,间隔40 d后再次采集瘤胃液(F)样品,提取样品总DNA后,扩增真核生物18S rRNA V4区,... 本试验旨在应用高通量测序技术研究川中黑山羊瘤胃纤毛虫种群结构。选取3只4月龄川中黑山羊[体重(15.53±0.21)kg],正常饲喂20 d后采集瘤胃液(A)样品,间隔40 d后再次采集瘤胃液(F)样品,提取样品总DNA后,扩增真核生物18S rRNA V4区,扩增产物使用Illumina MiSeq平台测序。结果表明:1)共获得高质量有效序列242 321条,聚类后得1 650个操作分类单位(OTU)。2)A样品、F样品在alpha多样性Chao、ACE、Shannon和Simpson指数上,差异不显著(P>0.05)。3)在纲水平分类上,2个时间点样品相对丰度最高的均为纤毛门,侧口纲(A样品为46.0%、F样品为44.7%),2个样品的相对丰度差异不显著(P>0.05)。4)在科水平分类上,A样品优势科为头毛科(31.8%),其次为均毛科(14.2%);F样品优势科为头毛科(42.8%);并且F样品头毛科相对丰度显著高于A样品(P<0.05),A样品均毛科相对丰度显著高于F样品(P<0.05)。5)在属水平分类上,A样品与F样品相对丰度最高的属均为多加多泡双毛属(A样品为20.9%、F样品为25.4%),无显著差异(P>0.05);存在显著性差异的属是均毛属、头毛属、腹甲双毛属、刺甲双毛属相对丰度,其中A样品均毛属(14.1%vs.1.9%)、腹甲双毛属相对丰度(2.8%vs.1.5%)显著高于F样品(P<0.05),而头毛属(6.7%vs.12.5%)、刺甲双毛属相对丰度(0.3%vs.2.5%)显著低于F样品(P<0.05)。本试验结果表明,幼龄川中黑山羊瘤胃液纤毛虫相对丰度最高的种属为多加多泡双毛属,瘤胃中还有许多未被分类鉴定且相对丰度较高的真核生物。 展开更多
关键词 川中黑山羊 瘤胃纤毛虫 种群结构 多样性 MiSeq测序
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黄牛食前食后瘤胃纤毛虫及瘤胃液pH值的调查 被引量：1
2
作者 韩盛兰 刘云鹏 +1 位作者 邵文爱 高贵娥 《山西农业大学学报》 CAS 1992年第3期212-214,共3页
在饲料种类、饲喂方法、日粮总量等不变情况下,对31头黄牛食前食后的瘤胃液 PH 值及纤毛虫数作了调查。结果:食后(上午)瘤胃液 pH 值较食前(下午)低0.2;纤毛虫少,7.42万/ml.一天内瘤液 pH 值平均为6.8,纤毛虫平均为23.
关键词 黄牛 纤毛虫 瘤胃液 PH值
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