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8q24 rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性的Meta分析 被引量:3
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作者 余洋 熊飞 +3 位作者 董自强 陈晓波 张路生 董传江 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2018年第3期159-162,共4页
目的探讨8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性的相关性。方法检索PubMed、Highwire、Cochrane library、Embase、维普、万方医学网、中国知网和中国生物医学文献数据库中所有关于8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性的文献,2... 目的探讨8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性的相关性。方法检索PubMed、Highwire、Cochrane library、Embase、维普、万方医学网、中国知网和中国生物医学文献数据库中所有关于8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性的文献,2位研究者根据纳入及排除标准独立对文献进行筛选、资料提取和质量评价后,对纳入数据进行Meta分析。结果共纳入相关文献16篇,包括21项研究,涉及13 925例病例和13 398例对照。Meta分析结果,超显性遗传模型(GG+TT vs GT:OR=1.02,95%CI:0.97~1.07,P=0.48)显示8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性无统计学相关;显性遗传模型(GG vs GT+TT:OR=1.26,95%CI:1.19~1.33,P<0.001)、隐性遗传模型(GG+GT vs TT:OR=1.26,95%CI:1.15~1.38,P<0.001)与纯合子对比模型(GG vs TT:OR=1.46,95%CI:1.31~1.62,P<0.001)显示8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性的相关性有统计学意义。结论 8q24rs6983267基因多态性与前列腺癌易感性呈正相关。 展开更多
关键词 8q24 rs6983267 基因多态性 前列腺肿瘤 肿瘤易感性
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rs6983267和rs1447295与北京地区前列腺癌的关联研究 被引量:1
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作者 蒲连美 刘铭 +3 位作者 史晓红 魏东 王建业 杨泽 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2012年第11期804-808,共5页
目的:探讨染色体8q24两个单核苷酸多态性位点(SNPs)rs6983267和rs1447295,与北京地区前列腺癌(PCa)的相关性。方法:采用病例-对照研究,入选了154例PCa患者和138名正常对照者,检测2个SNPs在病例组和对照组间的等位基因及基因型的分布情况... 目的:探讨染色体8q24两个单核苷酸多态性位点(SNPs)rs6983267和rs1447295,与北京地区前列腺癌(PCa)的相关性。方法:采用病例-对照研究,入选了154例PCa患者和138名正常对照者,检测2个SNPs在病例组和对照组间的等位基因及基因型的分布情况,并分析危险基因型的累积效应。结果:rs6983267有TT、GT及GG 3种基因型,在病例组的分布分别为33.1%、46.4%及20.5%,在对照组的分布分别为32.6%、48.5%及18.9%;rs1447295也有AA、AC及CC 3种基因型,在病例组的分布分别为3.3%、38.2%及58.6%,在对照组的分布分别为1.5%、32.1%及66.4%。2个SNPs的风险等位基因和基因型频率在病例组和对照组间的分布差异无统计学意义,P>0.05。与不具有风险基因型的个体相比,具有1个和同时具有2个风险基因型的个体PCa的发病风险虽然分别提高了1.231和1.571倍,但差异无统计学意义,P>0.05。结论:SNPs rs6983267和rs1447295可能与北京地区PCa的易感性无关。 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 rs6983267 rs1447295 单核苷酸多态性 疾病遗传易感性
原文传递
应用液滴数字PCR技术检测rs6983267三种多态性位点 被引量:2
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作者 沈阳丽 孙浩 +6 位作者 蔡文臣 张品正 王旭莹 尚雨寒 石璐 辛倩倩 郭志义 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1160-1165,共6页
核苷酸的多态性检测在临床以及基础生命科学研究中占据着重要地位.目前基于PCR的探针法应用最为广泛.由于在核苷酸上微小差异,探针的设计往往带有交叉活性反应,这阻碍了qPCR方法的推广.数字PCR(dPCR)是近年来已成功实现商业化的基于单... 核苷酸的多态性检测在临床以及基础生命科学研究中占据着重要地位.目前基于PCR的探针法应用最为广泛.由于在核苷酸上微小差异,探针的设计往往带有交叉活性反应,这阻碍了qPCR方法的推广.数字PCR(dPCR)是近年来已成功实现商业化的基于单分子分析的核酸检测技术.通过对条件的优化,dPCR可以消除探针的交叉活性,不过目前商业化的dPCR一般只有2个通道,对于同时检测3个多态性需要更加细致的优化.本研究以rs6983267位点的CCAT2基因3种多态性检测为例,利用探针的交叉活性反应检测其3个多态性位点.检测涉及到3个探针:2个针对多态性位点,另1个位于多态性位点外侧作为参照探针.结果表明,成功地区分了3个包含多态性位点基因片段的簇.在本研究中交叉活性反应可以为dPCR留出白空间,利于多样品的检测. 展开更多
关键词 数字PCR 核酸多态性 交叉活性探针 rs6983267
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SNP位点rs6983267相关非编码RNAG/U对结肠癌细胞转移活性的影响 被引量:2
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作者 蔡文臣 郝小惠 +3 位作者 沈阳丽 孟晨雪 田洁 郭志义 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第45期9-11,共3页
目的探讨染色体8q24区域中单核苷酸多态性(SNP)位点rs6983267相关非编码RNA G/U对结肠癌细胞转移活性的影响。方法运用生物信息学方法分析SNP rs6983267位点的非编码RNA;收集KM12C和KM12SM细胞,提取细胞总RNA,逆转录和PCR扩增,片段回收... 目的探讨染色体8q24区域中单核苷酸多态性(SNP)位点rs6983267相关非编码RNA G/U对结肠癌细胞转移活性的影响。方法运用生物信息学方法分析SNP rs6983267位点的非编码RNA;收集KM12C和KM12SM细胞,提取细胞总RNA,逆转录和PCR扩增,片段回收后用Tsp45Ⅰ进行酶切,对酶切(酶切组)和不做酶切(对照组)的模板做PCR扩增分析。通过限制性内切酶-PCR方法检测两组SNP rs6983267位点的非编码RNA G/U相对表达量;KM12C和KM12SM细胞分别进行p GL3-Gs-LUC(p GL3-Gs-LUC组)、p GL3-Ts-LUC(p GL3-Ts-LUC组)和p GL3-Basic-LUC质粒转染,应用双荧光素酶报告基因方法检测两组KM12C和KM12SM细胞中rs6983267非编码RNA启动子活性。结果 ENCODE数据库显示,染色体8q24区域SNP rs6983267位点附近存在非编码基因。KM12C细胞中酶切组、对照组SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U为0.80±0.10、5.60±1.30,KM12SM细胞中分别为0.71±0.09、1.43±0.11。与对照组比较,KM12C细胞中酶切组SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U差异无统计学意义(P﹥0.05),KM12SM细胞中升高(P<0.05)。KM12C细胞中,p GL3-Gs-LUC组、p GL3-TsLUC组rs6983267位点相关G型与T型非编码RNA启动子相对活性分别为0.81±0.14、0.82±0.25,KM12SM细胞中分别为1.00±0.26、1.85±0.58。在KM12SM细胞中,两组比较,P<0.05;在KM12C细胞中,两组比较,P﹥0.05。结论 SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U可能与结肠癌细胞的转移活性相关。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 肿瘤转移 单核苷酸多态性 rs6983267 非编码基因
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