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利用最大似然法进行水稻产量性状基因的分子作图 被引量:12
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作者 徐云碧 申宗坦 +1 位作者 陈英 朱立煌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1995年第1期46-52,共7页
本研究根据对估计标记-数量性状基因座位(QTL)之间重组率的两种分析方法(矩量法和最大似然法)、两种方差模型(QTL基因型之间的方差同质和异质模型)的分析,揭示了LOD值在标记-QTL连锁检测上所得结果的相关性高于重... 本研究根据对估计标记-数量性状基因座位(QTL)之间重组率的两种分析方法(矩量法和最大似然法)、两种方差模型(QTL基因型之间的方差同质和异质模型)的分析,揭示了LOD值在标记-QTL连锁检测上所得结果的相关性高于重组率估计值的相关性。采用最大似然法和异质方差模型,估计了水稻产量构成有关的QTL与分布于11对染色体上的51个限制性片段长度多态性(RFLP)标记之间的重组率,并对似然比(以LOD值表示)进行X ̄2检验,发现7个存在显著连锁关系的标记-性状组合,其平均重组率为10.0%。这些标记分布于第1、5、6、8和11等5对染色体上,涉及7个RFLP标记和3个产量构成性状,即每穗颖花数(RG573、RZ617、RG103)、单株穗数(RG64B)和每穗实粒数(RG101、RG244、RG653)。 展开更多
关键词 水稻 DNA RFLP 产量性状 最大似然法 基因
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水稻种子蛋白质含量遗传研究进展 被引量:11
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作者 彭波 孙艳芳 +8 位作者 庞瑞华 孔冬艳 宋晓华 李慧龙 李金涛 周棋赢 段斌 柳琳 宋世枝 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期401-407,共7页
水稻(Oryza sativa L.)种子中的蛋白质含量是决定稻米营养品质的一个关键因素,增加稻米中的蛋白质含量对其品质改良具有十分重要的意义。文章综述了水稻种子蛋白质的组成、蛋白质含量的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)定位... 水稻(Oryza sativa L.)种子中的蛋白质含量是决定稻米营养品质的一个关键因素,增加稻米中的蛋白质含量对其品质改良具有十分重要的意义。文章综述了水稻种子蛋白质的组成、蛋白质含量的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)定位、相关基因分离克隆及其基因表达调控等方面的研究进展,针对目前对水稻种子蛋白质含量相关基因功能和遗传调控规律尚不清楚的问题,提出采用基因聚合或利用分子标记辅助选择育种提高水稻种子蛋白质含量的策略,为水稻和其他重要作物品质的遗传改良提供参考和借鉴。 展开更多
关键词 水稻 种子 蛋白质含量 qtl定位 基因克隆 遗传改良
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Breeding for low cadmium accumulation cereals 被引量:8
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作者 Qin CHEN Fei-bo WU 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2020年第6期442-459,共18页
Cadmium(Cd) is an element that is nonessential and extremely toxic to both plants and human beings. Soil contaminated with Cd has adverse impacts on crop yields and threatens human health via the food chain. Cultivati... Cadmium(Cd) is an element that is nonessential and extremely toxic to both plants and human beings. Soil contaminated with Cd has adverse impacts on crop yields and threatens human health via the food chain. Cultivation of low-Cd cultivars has been of particular interest and is one of the most cost-effective and promising approaches to minimize human dietary intake of Cd. Low-Cd crop cultivars should meet particular criteria, including acceptable yield and quality, and their edible parts should have Cd concentrations below maximum permissible concentrations for safe consumption, even when grown in Cd-contaminated soil. Several low-Cd cereal cultivars and genotypes have been developed worldwide through cultivar screening and conventional breeding. Molecular markers are powerful in facilitating the selection of low-Cd cereal cultivars. Modern molecular breeding technologies may have great potential in breeding programs for the development of low-Cd cultivars, especially when coupled with conventional breeding. In this review, we provide a synthesis of low-Cd cereal breeding. 展开更多
关键词 CEREALS Low Cd accumulation Gene/quantitative trait locus(qtl)mapping BREEDING
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水稻蒸煮品质相关QTL定位及候选基因分析 被引量:3
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作者 乐巧娜 黄梓雯 +5 位作者 戴若惠 李三峰 李梦佳 方媛 王跃星 饶玉春 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期122-136,共15页
挖掘与稻米蒸煮品质相关的数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL),分析候选基因,并通过遗传育种手段改良稻米蒸煮品质相关性状,可有效提升稻米的口感。以籼稻华占(Huazhan,HZ)、粳稻热研2号(Nekken2)及由其构建的120个重组自交... 挖掘与稻米蒸煮品质相关的数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL),分析候选基因,并通过遗传育种手段改良稻米蒸煮品质相关性状,可有效提升稻米的口感。以籼稻华占(Huazhan,HZ)、粳稻热研2号(Nekken2)及由其构建的120个重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体为实验材料,测定成熟期稻米的糊化温度(gelatinization temperature,GT)、胶稠度(gel consistency,GC)和直链淀粉含量(amylose content,AC)。结合高密度分子遗传图谱进行QTL定位,共检测到26个与稻米蒸煮品质相关的QTLs(糊化温度相关位点1个、胶稠度相关位点13个、直链淀粉含量相关位点12个),其中最高奇数的可能性(likelihood of odd,LOD)值达30.24。通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析定位区间内候选基因的表达量,发现6个基因在双亲间的表达量差异显著,推测LOC_Os04g20270和LOC_Os11g40100的高表达可能会极大地提高稻米的胶稠度,而LOC_Os01g04920和LOC_Os02g17500的高表达以及LOC_Os03g02650和LOC_Os05g25840的低表达有助于降低直链淀粉含量。这些结果为培育优质水稻新品种奠定了分子基础,并为揭示稻米蒸煮品质的分子调控机制提供了重要的遗传资源。 展开更多
关键词 水稻 蒸煮品质 数量性状基因座(qtl)分析 候选基因
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玉米雌穗性状遗传分析与形成机制 被引量:7
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作者 殷芳冰 王成 +2 位作者 龙艳 董振营 万向元 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期30-46,共17页
雌穗是玉米重要的生殖器官,雌穗发育决定成熟果穗大小及单穗粒重,进而直接影响玉米产量。雌穗性状主要包括穗长、穗粗、穗行数、行粒数、穗重、单穗粒重等,均为多基因控制的数量遗传性状,且其遗传结构各不相同。解析雌穗性状的遗传基础... 雌穗是玉米重要的生殖器官,雌穗发育决定成熟果穗大小及单穗粒重,进而直接影响玉米产量。雌穗性状主要包括穗长、穗粗、穗行数、行粒数、穗重、单穗粒重等,均为多基因控制的数量遗传性状,且其遗传结构各不相同。解析雌穗性状的遗传基础,优化雌穗结构,是玉米增产的重要途径。前人通过数量性状位点(quantitative trait locus mapping,QTL)定位和全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)等方法,已经鉴定出较多雌穗性状相关的遗传位点,但是目前已鉴定功能的基因较少,所建立的遗传位点一致性图谱并不完整,因此难以全面揭示雌穗性状遗传结构。通过综合前人雌穗性状遗传定位进展,现将已鉴定QTL位点和显著关联SNP整合至玉米B73参考基因组V4版本,并鉴定出雌穗性状定位热点区间,对深入解析雌穗性状遗传结构、指导雌穗性状基因克隆和理解雌穗发育分子机制均具有重要意义。 展开更多
关键词 雌穗性状 qtl定位 全基因组关联分析 遗传结构 基因
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利用籼粳交BIL群体定位水稻谷粒长宽比QTL 被引量:2
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作者 马孟莉 江玲 +3 位作者 刘艳红 雷恩 李春燕 卢丙越 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2015年第2期236-240,共5页
本研究以122个南粳35/N22//南粳35构建的回交重组自交系(BIL)群体为材料,通过两年重复试验,利用Win QTLcart2.5和QTLNetwork2.0软件对控制水稻谷粒长宽比的数量性状基因位点(QTL)进行定位分析。利用Win QTLcart2.5共检测到5个控制... 本研究以122个南粳35/N22//南粳35构建的回交重组自交系(BIL)群体为材料,通过两年重复试验,利用Win QTLcart2.5和QTLNetwork2.0软件对控制水稻谷粒长宽比的数量性状基因位点(QTL)进行定位分析。利用Win QTLcart2.5共检测到5个控制谷粒长宽比的QTLs,分别位于第1、4、5、7和12染色体上,单个QTL对表型的贡献率为8.80%~18.83%。利用QTLNetwork2.0共检测到4个QTLs,贡献率为7.36%~16.05%,除q LWR-1未被检测到外,其余QTLs与Win QTLcart2.5检测结果吻合,除q LWR-4外,谷粒长宽比增效基因均来自长粒型水稻品种N22;此外还检测到3对上位性QTLs,贡献率为1.12%~4.97%。 展开更多
关键词 水稻 谷粒长宽比 qtl定位
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利用染色体片段置换系定位水稻抗纹枯病QTLs 被引量:2
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作者 林静 张所兵 +2 位作者 张云辉 汪迎节 方先文 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第4期691-695,共5页
为检测水稻纹枯病抗性基因位点,本研究采用牙签接种法对籼稻9311 和粳稻日本晴以及由它们构建的119 个染色体片段置换系进行纹枯病抗性鉴定,并使用该群体的分子连锁图谱进行数量性状座位(QTL)分析。共检测到3 个纹枯病相关QTLs(qsb8-... 为检测水稻纹枯病抗性基因位点,本研究采用牙签接种法对籼稻9311 和粳稻日本晴以及由它们构建的119 个染色体片段置换系进行纹枯病抗性鉴定,并使用该群体的分子连锁图谱进行数量性状座位(QTL)分析。共检测到3 个纹枯病相关QTLs(qsb8-1、qsb8-2 和qsb8-3),分别位于第8 染色体相邻标记RM3262、RM5485 和RM3496 附近,所在遗传区间分别为81. 7 -91.7 cM、91. 7-108.1 cM 和108. 1-119.6 cM。qsb8-2 的加性效应为负值,表明感病亲本携带的该片段可以增强纹枯病抗性;qsb8-1 和qsb8-3 的加性效应为正值,表明感病亲本携带的该片段减弱了纹枯病抗性。 展开更多
关键词 水稻 纹枯病抗性 染色体片段置换系 数量性状基因定位
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作物杂种优势相关基因挖掘及QTL定位研究进展
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作者 姜楠 韩博文 +2 位作者 林春晶 吴松权 张春宝 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第8期1762-1771,共10页
杂种优势利用是提升作物产量、抗逆性和品质的重要手段之一,目前杂种优势已被广泛应用于杂交育种研究中。随着分子生物学、基因工程、高通量测序技术等的高速发展,研究人员在不同层面不断探索作物杂种优势的遗传基础,杂种优势数量性状... 杂种优势利用是提升作物产量、抗逆性和品质的重要手段之一,目前杂种优势已被广泛应用于杂交育种研究中。随着分子生物学、基因工程、高通量测序技术等的高速发展,研究人员在不同层面不断探索作物杂种优势的遗传基础,杂种优势数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)定位与相关基因挖掘研究是其中的重要方面,对解析杂种优势分子机理具有重要的理论意义。本文对玉米、水稻、大豆等主要农作物中已定位的株型、粒质量及产量等杂种优势相关QTL或克隆基因的类型、功能及分子机理进行阐述和总结,以期通过结合现代分子生物学技术与高通量组学数据分析技术,深度解析作物杂种优势遗传基础,为推动杂种优势高效利用提供参考。 展开更多
关键词 作物 杂种优势 基因克隆 qtl定位
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紫薇遗传图谱构建及株型性状的QTL定位
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作者 姜聖姬 王淑安 +4 位作者 张恩亮 李林芳 高露璐 杨如同 王鹏 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第9期1818-1826,共9页
紫薇是中国重要的木本观花植物,株型是其重要的观赏性状,但是目前尚未见关于其株型数量性状基因座(QTL)定位的研究。以紫薇金幌、堇秀构建的181个F_(1)代分离群体为研究材料,构建1张由36个连锁群组成的包含429个SSR标记位点的遗传连锁图... 紫薇是中国重要的木本观花植物,株型是其重要的观赏性状,但是目前尚未见关于其株型数量性状基因座(QTL)定位的研究。以紫薇金幌、堇秀构建的181个F_(1)代分离群体为研究材料,构建1张由36个连锁群组成的包含429个SSR标记位点的遗传连锁图谱,总遗传距离为1998.81 cM,位点间平均距离为4.63 cM;LG1连锁群的遗传距离最大,为177.60 cM,LG27连锁群覆盖的遗传距离最小,为19.32 cM。基于区间作图法共检测到7个株型的QTL位点,其中控制株高的QTL位点有4个,解释4.32%~56.93%的表型变异;控制地径的QTL位点有2个,分别解释56.43%和59.02%的表型变异;控制分枝数的QTL位点有1个,解释54.60%的表型变异。本研究率先构建了基于功能分子标记的紫薇种内遗传连锁图谱,并定位了7个紫薇株型的QTL位点,可以解释4.32%~59.02%的表型变异。研究结果可为紫薇基因定位、基因克隆及分子标记辅助选择奠定基础。 展开更多
关键词 紫薇 简单重复序列(SSR)标记 遗传图谱 株型 数量性状座(qtl)定位
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利用染色体片段代换系定位水稻主效抽穗期QTL 被引量:9
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作者 邵迪 李秋萍 +1 位作者 吴比 邢永忠 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期344-347,共4页
从日本晴/明恢63染色体片段代换系中筛选到1个抽穗期分离家系BC3F2,调查该家系327个单株,发现单株抽穗期呈明显双峰分布,晚抽穗和早抽穗单株比例符合3∶1的分离比,表明抽穗期受1个主效QTLqHd-3控制.利用极端集团混合法筛选到标记RM416在... 从日本晴/明恢63染色体片段代换系中筛选到1个抽穗期分离家系BC3F2,调查该家系327个单株,发现单株抽穗期呈明显双峰分布,晚抽穗和早抽穗单株比例符合3∶1的分离比,表明抽穗期受1个主效QTLqHd-3控制.利用极端集团混合法筛选到标记RM416在2个DNA混合池中有多态性,单因子方差分析证明了标记RM416和qHd-3连锁.在引物RM416附近20cM继续筛选多态性标记,对BC3F2群体进行基因型分析,构建局部连锁图.通过QTL分析,qHd-3被定位在IDL01—RM5995,与2个标记的遗传距离分别为5.3cM和1.5cM,它可以解释表型变异的62.9%.在同一区间内还检测到控制每穗颖花数微效QTLqSpp-3和分蘖数微效QTLqTn-3. 展开更多
关键词 水稻 双峰分布 抽穗期 极端集团混合法 数量性状座位(qtl)定位
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烤烟6个农艺性状的QTL定位(英文) 被引量:14
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作者 童治军 焦芳婵 +7 位作者 吴兴富 王丰青 陈学军 李绪英 高玉龙 张谊寒 肖炳光 吴为人 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1407-1415,共9页
由于烟草的分子标记开发和遗传图谱构建十分困难,迄今烟草中有关数量性状基因座(QTL)的定位研究仍非常有限。本研究利用一个由207个株系组成的烤烟DH群体及基于该群体所构建的含有24个连锁群、611个SSR标记,总长为1882.1cM的遗传图谱... 由于烟草的分子标记开发和遗传图谱构建十分困难,迄今烟草中有关数量性状基因座(QTL)的定位研究仍非常有限。本研究利用一个由207个株系组成的烤烟DH群体及基于该群体所构建的含有24个连锁群、611个SSR标记,总长为1882.1cM的遗传图谱,采用复合区间作图方法,对株高(PH)、茎围(SG)、节距(IL)、叶片数(LN)、最大腰叶长(LWL)和最大腰叶宽(WWL)6个与叶片产量有关的农艺性状进行QTL定位分析。共检测到69个QTL,大部分QTL的效应值较小,仅有4个具有较大的效应值,可解释大约15%~20%的表型变异。6个性状之间大多彼此相关。与此相符,在基因组中发现存在许多小区域,每个区域包含2个或2个以上紧密连锁的不同性状的QTL。 展开更多
关键词 烤烟 数量性状基因座 遗传作图 加倍单倍体 产量
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