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结合近邻传播聚类的选择性集成分类方法 被引量：12
1
作者 孟军 张晶 +2 位作者 姜丁菱 何馨宇 李丽双 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2018年第5期986-993,共8页
从海量的基因微阵列数据中提取出有价值的信息是生物信息学的研究热点.基因微阵列数据具有高维度、小样本和高冗余的特性.因此,提出一种基于相交邻域粗糙集的基因选择方法,挑选出关键基因用于对微阵列数据进行分类.首先利用pathway知识... 从海量的基因微阵列数据中提取出有价值的信息是生物信息学的研究热点.基因微阵列数据具有高维度、小样本和高冗余的特性.因此,提出一种基于相交邻域粗糙集的基因选择方法,挑选出关键基因用于对微阵列数据进行分类.首先利用pathway知识进行基因初步选择,每个pathway单元对应一个基因子集,然后采用基于粗糙集的属性约简方法筛选出无冗余的关键基因.由于pathway知识单元的数量较多,对应生成大量的基分类器,为了进一步提高基分类器之间的差异性和集成的效率,对基分类器进行选择是十分必要的.近邻传播聚类不需要提前设定聚簇数量和起始点并且可以更快速、精确地进行聚类.因此,使用近邻传播聚类方法对基分类器进行分组,产生差异性较大的聚簇,再从每个簇中选择一个分类器构建集成分类器.在拟南芥的生物和非生物胁迫响应相关的微阵列数据集上的实验结果表明:在准确率方面,提出的方法与现有的集成方法相比最多可以提高12%. 展开更多
关键词 选择性集成 近邻传播 通路 相交邻域 基因微阵列数据
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桂枝茯苓丸对宫颈癌细胞生物学行为的影响及作用机制 被引量：5
2
作者 杨广 罗利平 《四川中医》 2021年第4期54-57,共4页
目的:探究桂枝茯苓丸对宫颈癌Hela细胞生物学行为的影响及其作用机制。方法:通过MTT检测不同浓度(200、400mg/ml)桂枝茯苓丸处理宫颈癌Hela细胞24、48h后对其增殖的影响;克隆形成实验检测不同浓度(200、400mg/ml)桂枝茯苓丸对宫颈癌Hel... 目的:探究桂枝茯苓丸对宫颈癌Hela细胞生物学行为的影响及其作用机制。方法:通过MTT检测不同浓度(200、400mg/ml)桂枝茯苓丸处理宫颈癌Hela细胞24、48h后对其增殖的影响;克隆形成实验检测不同浓度(200、400mg/ml)桂枝茯苓丸对宫颈癌Hela细胞克隆形成的影响;Transwell法检测桂枝茯苓丸对Hela细胞侵袭与迁移的影响;通过western blot检测PTEN和p-AKT等通路蛋白在Hela细胞中的表达水平,探究桂枝茯苓丸对Hela细胞可能存在的作用机制。结果:桂枝茯苓丸可显著抑制Hela细胞的增殖,且呈一定的时间和浓度依赖性;200和400mg/ml的桂枝茯苓丸均可显著降低Hela细胞的克隆形成、抑制其侵袭和迁移,且呈剂量依赖性。使用400mg/ml的桂枝茯苓丸处理Hela细胞48h,发现桂枝茯苓丸能够上调PTEN蛋白的表达,同时下调p-AKT蛋白的表达,进而抑制宫颈癌细胞恶性表型。结论:桂枝茯苓丸可通过上调PTEN蛋白的表达抑制AKT途径中AKT蛋白的磷酸化,进而抑制Hela细胞的增殖、克隆形成以及迁移侵袭等恶性细胞行为。 展开更多
关键词 桂枝茯苓丸 宫颈癌 细胞增殖 侵袭与迁移 AKT通路
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听觉系统传输通路综合检测平台的研制 被引量：4
3
作者 宫琴 朱仁骏 +1 位作者 陈曦 胡艳茹 《仪器仪表学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第11期2609-2614,共6页
听觉系统传输通路是由听觉外周、听神经和听觉中枢组成。为了全面、客观、无创、及时地提取听觉系统传输通路的综合信息,本研究首次研发了听觉系统传输通路的听力指标综合检测平台,实现了在相同刺激声作用下,同时获取听觉外周的耳声发射... 听觉系统传输通路是由听觉外周、听神经和听觉中枢组成。为了全面、客观、无创、及时地提取听觉系统传输通路的综合信息,本研究首次研发了听觉系统传输通路的听力指标综合检测平台,实现了在相同刺激声作用下,同时获取听觉外周的耳声发射(OAEs)信号和听觉中枢的听觉诱发电位(AEPs)信号,并进一步从同一刺激声作用下的OAEs和AEPs信号中提取出了特征向量,以表征整个听觉系统的功能状况及通路间的关系。为解答一系列相关的疑难科学问题和临床应用提供了综合、全面的分析研究平台和临床应用基础。 展开更多
关键词 听觉系统 传输通路 耳声发射 听觉诱发电位 综合检测平台
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夏季青藏高原大气热源准双周振荡及其传播途径 被引量：3
4
作者 钟珊珊 贾巧 +1 位作者 王美蓉 赵丹 《大气科学学报》 CSCD 北大核心 2020年第3期495-505,共11页
采用1979—2017年NCEP/NCAR逐日再分析资料估算大气热源,研究夏季青藏高原大气热源准双周振荡(Quasi-BiWeekly Oscillation,QBWO)的特征及传播途径。结果表明:青藏高原及其周边的大气热源QBWO的前两个主模态,即荷载中心在高原东南部的... 采用1979—2017年NCEP/NCAR逐日再分析资料估算大气热源,研究夏季青藏高原大气热源准双周振荡(Quasi-BiWeekly Oscillation,QBWO)的特征及传播途径。结果表明:青藏高原及其周边的大气热源QBWO的前两个主模态,即荷载中心在高原东南部的全区一致型和高原东南-西北反位相变化的偶极型,呈现了高原夏季大气热源QBWO自东向西传播过程中所处的两种不同状态。这主要是由于在中纬度地区对流层中上层,低频大气环流的活动表现为大的异常气旋和反气旋环流从我国东北经青藏高原至西亚的自东向西的传播,当移近高原时迅速增强,当西移离开高原时明显减弱。在此过程中,青藏高原及其周边、孟加拉湾以及印度半岛等地区的降水都发生了异常变化。 展开更多
关键词 青藏高原 大气热源 准双周振荡 传播途径
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基于双层生物分子网络的致病基因预测 被引量：1
5
作者 王路宽 吴舜尧 《青岛大学学报（自然科学版）》 CAS 2022年第1期48-52,共5页
基于“致病基因邻居倾向于引起相似疾病”和“必需基因和致病基因关联较少”的假设,融合蛋白质相互作用和代谢通路,构建双层生物分子网络,提出一种基于双层生物分子网络双流量网络传播的致病基因排序方法。为致病基因和必需基因分配正... 基于“致病基因邻居倾向于引起相似疾病”和“必需基因和致病基因关联较少”的假设,融合蛋白质相互作用和代谢通路,构建双层生物分子网络,提出一种基于双层生物分子网络双流量网络传播的致病基因排序方法。为致病基因和必需基因分配正流量和负流量,挖掘与已知致病基因相似的潜在致病基因。实验结果表明,本方法与基于经典假设的单层网络方法相比,在富集分数1和富集分数2分别提高11.66和13.66。 展开更多
关键词 致病基因预测 网络传播 蛋白质相互作用 代谢通路
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一种新颖的深度因果图建模及其故障诊断方法 被引量：8
6
作者 唐鹏 彭开香 董洁 《自动化学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1616-1624,共9页
为了实现复杂工业过程故障检测和诊断一体化建模,提出了一种新颖的深度因果图建模方法.首先,利用循环神经网络建立深度因果图模型,将Group Lasso稀疏惩罚项引入到模型训练中,自动地检测过程变量间的因果关系.其次,利用模型学习到的条件... 为了实现复杂工业过程故障检测和诊断一体化建模,提出了一种新颖的深度因果图建模方法.首先,利用循环神经网络建立深度因果图模型,将Group Lasso稀疏惩罚项引入到模型训练中,自动地检测过程变量间的因果关系.其次,利用模型学习到的条件概率预测模型对每个变量建立监测指标,并融合得到综合指标进行整体工业过程故障检测.一旦检测到故障,对故障样本构建变量贡献度指标,隔离故障相关变量,并通过深度因果图模型的局部因果有向图诊断故障根源,辨识故障传播路径.最后,通过田纳西-伊斯曼过程进行仿真验证,实验结果验证了所提方法的有效性. 展开更多
关键词 深度因果图模型 故障检测 根源诊断 传播路径辨识 Group Lasso
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金线莲不同繁殖途径比较 被引量：1
7
作者 郑枫 黎倩芸 +2 位作者 叶志聪 曾宋君 吴坤林 《安徽农业科学》 CAS 2018年第26期94-97,共4页
[目的]筛选出高效的金线莲种苗工厂化繁殖技术体系。[方法]分别以野生金线莲种子进行非共生萌发和以茎段为外植体进行无性克隆2种途径繁育种苗。[结果]2种繁殖途径在诱导初始条件、增殖方式、增殖系数、继代周期、根的诱导分化及移栽等... [目的]筛选出高效的金线莲种苗工厂化繁殖技术体系。[方法]分别以野生金线莲种子进行非共生萌发和以茎段为外植体进行无性克隆2种途径繁育种苗。[结果]2种繁殖途径在诱导初始条件、增殖方式、增殖系数、继代周期、根的诱导分化及移栽等方面均存在差异。[结论]金线莲以无性克隆繁殖途径为宜,建立的繁育体系具有经济、高效、稳定等优点,该研究可为规模化育苗提供理论和技术参考。 展开更多
关键词 金线莲 繁殖途径 组织培养
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细胞源与鸡胚源传染性支气管炎病毒激活JAK⁃STAT信号通路的差异性研究
8
作者 楚红燕 宫晓倩 +5 位作者 翁文莲 王欢 方守国 丁铲 廖瑛 陈丽颖 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1167-1174,共8页
鸡传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Virus,IBV)对鸡的呼吸道、肾脏和输卵管等器官造成严重损伤,主要引起鸡产蛋率下降和雏鸡死亡。目前通过鸡胚传代获得IBV疫苗株和流行毒株。IBV Beaudette株是目前实验室研究的经典毒株,已... 鸡传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Virus,IBV)对鸡的呼吸道、肾脏和输卵管等器官造成严重损伤,主要引起鸡产蛋率下降和雏鸡死亡。目前通过鸡胚传代获得IBV疫苗株和流行毒株。IBV Beaudette株是目前实验室研究的经典毒株,已经适应人源和猴源细胞,可利用Vero细胞进行制备。有研究表明,IBV感染延迟干扰素的表达,并对JAK⁃STAT信号通路具有拮抗作用。本研究中发现,通过Vero细胞制备的IBV Beaudette株,在感染早期激活STAT1,通过鸡胚制备的IBV Beaudette,则不能有效激活STAT1。进一步研究发现,鸡胚传代的IBV QX株和新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)亦不能有效刺激JAK⁃STAT信号通路。两种制备病毒的方式分别得到不同的试验结果,推测是由于在病毒感染条件下,Vero细胞分泌到培养液中的细胞因子所致。进一步研究揭示,病毒感染条件下,细胞分泌的因子,瞬时激活了STAT1。本研究对于病毒的制备方式对天然免疫信号通路的影响,具有一定的参考和借鉴作用。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 鸡胚制备病毒 Vero细胞制备病毒 细胞上清 细胞因子 JAK⁃STAT信号通路
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