期刊文献+
共找到105篇文章
< 1 2 6 >
每页显示 20 50 100
基于术前PIV、NLR和CEA水平对胃癌根治术后预后列线图预测模型的构建及评价 被引量:5
1
作者 陆通 房钰 +3 位作者 刘浩楠 屈鹏飞 韩正祥 吴克俭 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第10期1869-1875,共7页
目的:基于术前泛免疫炎症(PIV)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)以及癌胚抗原(CEA)水平探讨胃癌根治术后预后的影响因素并建立列线图预后预测模型。方法:回顾性分析2016年03月至2019年11月在徐州医科大学附属医院普外科行胃癌根治术的38... 目的:基于术前泛免疫炎症(PIV)、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)以及癌胚抗原(CEA)水平探讨胃癌根治术后预后的影响因素并建立列线图预后预测模型。方法:回顾性分析2016年03月至2019年11月在徐州医科大学附属医院普外科行胃癌根治术的384例胃癌患者的临床病理资料,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析术前PIV、NLR、CEA水平预测总生存期(OS)的最佳截断值,并根据PIV的最佳截断值进行分组。采用χ^(2)检验分析不同PIV水平与患者临床病理特征的关系。使用Kaplan-Meier法和Log-rank检验分析不同临床病理特征对患者OS的影响,多因素Cox回归分析患者预后的独立影响因素。使用R4.1.1软件绘制胃癌根治术后患者1、3、5年OS的列线图预测模型,并评价预测模型的效能,然后使用X-tile软件根据列线图风险得分将该模型分层进一步探讨该模型的临床应用价值。结果:ROC曲线分析结果显示,PIV、NLR、CEA曲线下面积(AUC)分别为0.627、0.584、0.590,最佳截断值分别为236.8、1.98、4.93 ng/mL。PIV与年龄、肿瘤最大直径、肿瘤浸润深度、淋巴结转移、TNM分期、神经或脉管侵犯、术前NLR水平相关(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,年龄、肿瘤浸润深度、神经或脉管侵犯、PIV、NLR、CEA为胃癌根治术后患者1、3、5年OS的独立影响因素(P<0.05)。构建包含以上独立危险因素的列线图预测模型,模型内部验证一致性指数(C指数)分别为0.797、0.805、0.780,校正曲线提示该模型区分度良好,低风险患者的OS明显优于中、高风险组(P<0.001)。结论:PIV、NLR、CEA对于胃癌预后有较好的预测价值,基于PIV、NLR、CEA水平及胃癌相关病理资料构建的列线图模型对于临床有较高的指导意义。 展开更多
关键词 胃癌 PIV 列线图 预后模型
下载PDF
基于刀盘扭转能量的土压平衡盾构刀具磨损分析 被引量:9
2
作者 荣雪宁 卢浩 +3 位作者 王明洋 文祝 戎晓力 王振 《上海交通大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第8期965-970,共6页
在卵石和中风化泥岩中掘进时,土压平衡盾构面临严重的刀具磨损.为合理组织换刀工作,需预计刀具的磨损情况.通过分析成都地铁20个盾构区间的部分掘进数据,以刀盘扭转能量作为刀具磨损模型的输入参数,对换刀数目与刀盘扭转能量的关系进行... 在卵石和中风化泥岩中掘进时,土压平衡盾构面临严重的刀具磨损.为合理组织换刀工作,需预计刀具的磨损情况.通过分析成都地铁20个盾构区间的部分掘进数据,以刀盘扭转能量作为刀具磨损模型的输入参数,对换刀数目与刀盘扭转能量的关系进行了拟合.在此基础上,增加泡沫添加剂体积,建立双参数预测模型,进一步优化刀具磨损的预测精度.结果表明:换刀数目与刀盘扭转能量正相关,与泡沫添加剂体积负相关;换刀数目与双参数间的回归关系具有统计显著性;卵石和中风化泥岩地层中的换刀数目都较好地符合双参数预测模型但不同地层中的拟合参数有所差异.双参数刀具磨损模型的预测精度显著优于基于掘进距离的单参数模型和JTS模型. 展开更多
关键词 土压平衡盾构 刀具 磨损 施工参数 预测模型
下载PDF
首发缺血性卒中患者短期预后评价模型 被引量:8
3
作者 潘双杰 何远宏 王楠 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第19期3238-3241,共4页
目的:探索首发缺血性卒中患者急性期神经功能缺损程度的影响因素,建立短期预后评价模型。方法:选择2014年9月至2015年12月在郑州大学第五附属医院住院的89例首发急性脑梗死患者,采用统一设计的问卷收集基本资料,美国国立卫生院神经功能... 目的:探索首发缺血性卒中患者急性期神经功能缺损程度的影响因素,建立短期预后评价模型。方法:选择2014年9月至2015年12月在郑州大学第五附属医院住院的89例首发急性脑梗死患者,采用统一设计的问卷收集基本资料,美国国立卫生院神经功能缺损评分量表(NIHSS)评价神经功能缺损程度,改良Rankin量表(m RS)评价3个月后预后。结果 :轻、中、重3组在年龄等传统危险因素方面无差异;WBC等6种血液学指标与NIHSS评分(P<0.05)及预后评分(P<0.05)均相关;D-二聚体等6种血液学指标及基线NIHSS评分对预后有显著影响(OR=1.800、0.976、1.112、1.327、5.564、6.456、1.227);ROC曲线下面积为0.976,模型预测价值较好。结论:传统危险因素无差异的不同神经缺损程度的缺血性卒中患者中,D-二聚体等6种血液学指标及NIHSS评分对预后有显著影响,模型能较为准确地预测缺血性脑卒中的短期预后情况。 展开更多
关键词 缺血性卒中 神经功能缺损 预后模型
下载PDF
免疫细胞浸润在非小细胞肺癌诊断与预后中的应用 被引量:7
4
作者 万辉辉 刘振浩 +4 位作者 澹小秀 王广志 徐勇 谢鹭 林勇 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期740-749,共10页
免疫细胞浸润对癌症的诊断与预后有着重要意义。文中收集TCGA数据库已收录的非小细胞肺癌肿瘤与正常组织基因表达数据,利用CIBERSORT工具得到22种免疫细胞占比来评估免疫细胞浸润情况。以22种免疫细胞占比为特征,用机器学习方法构建了... 免疫细胞浸润对癌症的诊断与预后有着重要意义。文中收集TCGA数据库已收录的非小细胞肺癌肿瘤与正常组织基因表达数据,利用CIBERSORT工具得到22种免疫细胞占比来评估免疫细胞浸润情况。以22种免疫细胞占比为特征,用机器学习方法构建了非小细胞肺癌肿瘤与正常组织的分类模型,其中随机森林方法构建的模型分类效果AUC=0.987、敏感性0.98及特异性0.84。并且用随机森林方法构建的肺腺癌和肺鳞癌肿瘤组织分类模型效果AUC=0.827、敏感性0.75及特异性0.77。用LASSO回归筛选22种免疫细胞特征,保留8种强相关特征组成的免疫细胞评分结合临床特征构建了非小细胞肺癌预后模型。经评估及验证,预后模型C-index=0.71并且3年和5年的校准曲线拟合良好,可以对预后风险度进行准确预测。本研究基于免疫细胞浸润所构建的分类模型与预后模型,旨在对非小细胞肺癌的诊断与预后研究提供新的策略。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 免疫细胞浸润 机器学习 随机森林 分类模型 LASSO回归 预后模型
原文传递
谷胱甘肽过氧化物酶在胶质瘤患者中的表达及对生存预后的影响 被引量:5
5
作者 任晓梅 张立 +7 位作者 辛宝 钱文文 夏曾润 祁蒙 杜小平 史传道 刘启玲 张荣强 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期276-285,共10页
目的探讨谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)在胶质瘤组织表达变化与生存预后的关系,构建和评价GPX对胶质瘤患者生存预后的列线图预测模型。方法从肿瘤基因图谱计划数据库中下载胶质瘤患者数据集,获取663例患者的临床参数信息及其GPX表达水平,其... 目的探讨谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)在胶质瘤组织表达变化与生存预后的关系,构建和评价GPX对胶质瘤患者生存预后的列线图预测模型。方法从肿瘤基因图谱计划数据库中下载胶质瘤患者数据集,获取663例患者的临床参数信息及其GPX表达水平,其中胶质母细胞瘤(GBM)153例、低级别胶质瘤(LGG)510例,分析GPX表达与患者生存之间的关系,利用单因素和多因素Cox风险回归模型筛选变量,并使用最小绝对收缩选择算子(Lasso)回归进行再次筛选验证,基于筛查结果构建列线图模型,采用一致性指数评价预测模型的区分度,校准曲线评价模型的校准度。结果与对照组相比,GPX1、GPX3、GPX4、GPX7、GPX8的表达在胶质瘤患者中显著升高(P均<0.001),且除GPX3外,GBM患者的表达显著高于LGG患者(P均<0.001);Kaplan-Meier分析显示,GPX1(P=0.013)和GPX4(P=0.040)高表达的GBM患者无进展生存期显著缩短,GPX1、GPX7和GPX8高表达的LGG患者总生存率、疾病特异性生存期和无进展生存期显著缩短(P均<0.001);单因素和多因素Cox及Lasso回归筛选出GPX7和GPX8为影响LGG患者预后的关键因素;利用该结果构建列线图显示,最终进入模型的危险因素为GPX7,一致性指数为0.843(95%CI=0.809~0.853),校准曲线显示预测值与实际值具有较好的一致性。结论GPX7是影响LGG患者预后的独立危险因素,利用其构建的列线图模型可以较好地预测LGG患者的生存率。 展开更多
关键词 胶质瘤 谷胱甘肽过氧化物酶 预后模型
下载PDF
基于支持向量机的风力发电机组故障诊断预警模型
6
作者 吉思良 张峰 +2 位作者 孙海星 王家宝 孙也棋 《电工技术》 2024年第6期66-68,74,共4页
当前的风力发电机组故障诊断预警模型设置的矩阵一般为单元式的,预警的范围受到限制,导致预警响应时间延长,为此提出对基于支持向量机的风力发电机组故障诊断预警模型的设计与验证分析。根据当前的测定需求及标准,提取故障诊断预警特征... 当前的风力发电机组故障诊断预警模型设置的矩阵一般为单元式的,预警的范围受到限制,导致预警响应时间延长,为此提出对基于支持向量机的风力发电机组故障诊断预警模型的设计与验证分析。根据当前的测定需求及标准,提取故障诊断预警特征量,采用多目标的方式,打破预警范围的限制,设计多目标诊断预警矩阵,以此为基础,构建支持向量机故障诊断预警结构,采用阶次分析实现故障诊断预警处理。测试结果表明:对比传统机器学习风力发电机组故障诊断预警模型测试组、传统MSK-CNN和多源机电信息融合风力发电机组故障诊断预警模型测试组,此次所设计的支持向量机风力发电机组故障诊断预警模型测试组最终得出的预警响应时间被较好地控制在0.25 s以下,说明在支持向量机的辅助下,所设计模型对故障诊断预警的效率较高,针对性更强,具有实际的应用价值。 展开更多
关键词 支持向量机 风力发电 发电机组 故障诊断 预警模型 诊断识别
下载PDF
多免疫基因预后模型在评估结直肠癌生存和预后中的作用:基于TCGA数据库的研究 被引量:2
7
作者 郝博 董锐 +3 位作者 邱权威 王逸童 左芦根 刘牧林 《蚌埠医学院学报》 CAS 2023年第1期87-94,共8页
目的:通过生物信息学方法筛选与结直肠癌预后相关的免疫基因并构建多免疫基因预后模型,以期为结直肠癌生存和预后的评估提供重要的临床资料,并为肿瘤免疫在结直肠癌中的研究提供思路。方法:从TCGA数据库下载结直肠癌基因表达数据和临床... 目的:通过生物信息学方法筛选与结直肠癌预后相关的免疫基因并构建多免疫基因预后模型,以期为结直肠癌生存和预后的评估提供重要的临床资料,并为肿瘤免疫在结直肠癌中的研究提供思路。方法:从TCGA数据库下载结直肠癌基因表达数据和临床病理数据,对其进行差异分析后获得差异表达的基因;从ImmPort免疫基因数据库下载免疫基因,与结直肠癌差异基因取交集后获得差异表达的免疫基因;进一步对差异免疫基因进行生存分析获得结直肠癌预后相关基因,以此构建多免疫基因预后模型(预后模型);然后,通过生存分析预后模型风险评分对结直肠癌生存的影响,利用ROC分析以及绘制风险曲线验证预后模型风险评分在评估结直肠癌预后中的准确性;通过独立预后分析预后模型风险评分是否可作为评估病人预后的独立风险因子;最后,分析免疫基因与转录因子及免疫细胞的相关性。结果:免疫基因预后模型风险评分高风险组预后较差(P<0.01);预后模型风险评分能对结直肠病人预后进行准确分组,并且在对结直肠预后的分析中具有较高的准确性(AUC=0.861);免疫基因与转录因子以及免疫细胞之间存在一定的相关性。结论:预后模型能准确评估病人预后,并且高风险组病人的生存期显著低于低风险组;免疫基因可能通过调节转录因子以及免疫细胞的产生进而调节肿瘤的恶性进展,该研究阐明了免疫因素对结直肠癌预后的影响,为结直肠癌在免疫方向的研究提供了参考。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 预后模型 免疫基因 转录因子 免疫细胞
下载PDF
基于HNRNPA2B1及其调控miRNAs构建肺腺癌TP53突变人群的预后模型
8
作者 彭宝相 王云 徐从娥 《青岛大学学报(医学版)》 CAS 2024年第2期227-232,共6页
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库多组学数据构建肺腺癌TP53突变人群的预后模型,探讨核内不均一核糖核蛋白A2/B1(HNRNPA2B1)与肺腺癌TP53突变之间的相关性。方法通过生物信息学方法搜集TCGA和基因表达数据库(GEO)中的突变数据,分析T... 目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库多组学数据构建肺腺癌TP53突变人群的预后模型,探讨核内不均一核糖核蛋白A2/B1(HNRNPA2B1)与肺腺癌TP53突变之间的相关性。方法通过生物信息学方法搜集TCGA和基因表达数据库(GEO)中的突变数据,分析TP53突变对肺腺癌病人HNRNPA2B1表达及预后的影响;将病人随机分为训练集和验证集(7∶3),筛选潜在的受HNRNPA2B1调控的miRNAs构建模型、绘制ROC曲线,并通过列线图可视化。结果HNRNPA2B1在TP53突变肺腺癌中显著高表达(P<0.001),且高表达病人预后不良(P=0.031)。筛选出9个受HNRNPA2B1调控且与预后相关的miRNAs构建预后模型,结果表明列线图对预后模型具有较好的区分度和准确度(χ^(2)=9.443,P=0.306)。结论HNRNPA2B1与肺腺癌TP53突变存在正相关,基于HNRNPA2B1调控的miRNAs可建立预测TP53突变肺腺癌病人预后的良好模型。 展开更多
关键词 肺腺癌 基因 p53 核不均一核糖核蛋白A-B组 微RNAS 预后模型
下载PDF
基于TGF-β相关基因构建并验证子宫内膜癌风险预后模型
9
作者 申智慧 王志启 +4 位作者 李赫 李立伟 翟茁钰 王建六 杨潇 《现代妇产科进展》 2024年第6期401-409,共9页
目的:探索基于TGF-β相关基因的子宫内膜癌(EC)预后模型,用于精准评估EC患者的预后。方法:从TCGA数据库下载EC患者的基因表达谱数据和临床资料。筛选EC和正常组织差异表达的TGF-β相关基因。采用单因素回归分析筛选EC预后相关基因。将T... 目的:探索基于TGF-β相关基因的子宫内膜癌(EC)预后模型,用于精准评估EC患者的预后。方法:从TCGA数据库下载EC患者的基因表达谱数据和临床资料。筛选EC和正常组织差异表达的TGF-β相关基因。采用单因素回归分析筛选EC预后相关基因。将TCGA整体人群按1∶1分成训练集和验证集。对训练集人群进行多因素Cox回归分析构建风险预后模型,利用生存分析、ROC曲线等在验证集和整个队列中验证预后模型的预测准确性。分析临床特征与模型之间的相关性,并基于TGF-β相关基因预后模型和独立预后的临床特征因素建立Nomogram图。在体外验证BMPR1B对EC生物学功能的影响。结果:构建并验证了6个TGF-β相关基因(PPP2R1B、GDF7、E2F5、BMPR1B、GDF6、TNF)的EC预后模型。K-M曲线分析提示,高风险评分患者较低风险评分患者预后更差。ROC曲线分析提示,该预后模型对于预测患者1、3、5年生存率具有较好的准确性。GESA富集分析显示,与低风险患者相比,高风险患者在细胞周期、DNA复制等方面作用显著。基于TGF-β相关基因和临床特征因素构建了Nomogram图,校准曲线评估其预测准确性较好。敲低BMPR1B表达可显著抑制EC的增殖、迁移和侵袭。结论:本研究构建并验证了一种基于TGF-β相关基因的EC患者预后模型,该模型可用于准确预测EC患者的预后,并基于独立预后因素构建Nomogram图,有助于协助临床医生准确判断患者预后并做出最佳临床决策。BMPR1B是EC的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 TGF-Β 预后模型 风险评分 NOMOGRAM
下载PDF
基于TCGA数据库的宫颈癌免疫基因预后模型构建及预后标志物鉴定
10
作者 林丽娜 何中慧 陈军莹 《现代妇产科进展》 2024年第6期417-426,共10页
目的:构建基于免疫相关基因的宫颈癌预后模型,寻找宫颈癌预后相关的分子标志物。方法:利用TCGA数据库中宫颈癌的转录组信息及临床数据,运用生物信息学方法分析在宫颈癌中差异表达的免疫相关基因,筛选出与患者生存相关的免疫基因,KEGG进... 目的:构建基于免疫相关基因的宫颈癌预后模型,寻找宫颈癌预后相关的分子标志物。方法:利用TCGA数据库中宫颈癌的转录组信息及临床数据,运用生物信息学方法分析在宫颈癌中差异表达的免疫相关基因,筛选出与患者生存相关的免疫基因,KEGG进行富集分析。逐步回归分析构建可作为预后评估的风险评分模型并评价其预测能力。通过Cox回归进行独立预后分析,同时鉴定出与临床参数相关的免疫预后基因,分析它们与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的相关性。结果:在宫颈癌及正常组织中共筛选出5565个差异表达基因,其中免疫相关基因339个,Cox分析显示有24个基因与患者预后相关,经逐步回归分析最终确定12个免疫相关基因(TNF、TFRC、APOBEC3H、CSK、OLR1、PTPN6、SBDS、AGT、TGFA、IL17RD、NRP1、ZAP70)并构建风险评分模型。生存分析显示,高风险组患者的总生存期明显低于低风险组(P<0.01)。ROC曲线下面积为0.75。患者的风险评分与临床分期密切相关(P<0.01),但与年龄、肿瘤分级无相关性(P>0.05)。相关性分析筛选出2个与预后显著相关的免疫基因(OLR1和ZAP70)。OLR1和ZAP70基因表达量与肿瘤微环境中的CD8+T细胞、CD4+T细胞、NKT细胞、树突状细胞、辅助性T细胞等具有高度正相关。结论:宫颈癌中有多个免疫相关基因异常表达,且与患者预后紧密相关,基于免疫基因构建的风险评分模型可有效预测患者预后,为宫颈癌的免疫治疗提供潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 宫颈癌 免疫基因 预后模型 预后标志物
下载PDF
基于TCGA数据库肺腺癌自噬相关基因预后模型的建立与验证
11
作者 吴双丽 吴铁成 +3 位作者 喻光 徐敬宣 李保健 邢龙 《现代医药卫生》 2024年第10期1621-1626,共6页
目的探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型。方法肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模型并验证,进一步... 目的探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型。方法肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模型并验证,进一步构建列线图及校准曲线探究模型在临床中的应用价值。对差异表达ARGs进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析。对获得的具有预后意义的差异表达ARGs进行Lasso回归分析并构建肺腺癌预后模型。绘制Kaplan-Meier生存曲线。结果共获得31个差异表达ARGs,筛选得到10个具有预后意义的差异表达ARGs。高风险组患者与较差的总生存期明显相关,差异有统计学意义(P<0.05)。T分期、N分期、风险评分为肺腺癌患者的独立预后因素。校准曲线和列线图全局一致性为0.710,说明模型预测结果与实际情况具有较高的符合度。结论基于差异表达ARGs构建的风险模型可作为肺腺癌患者的一种预后特征或可为肺腺癌患者的个体化治疗提供参考依据。 展开更多
关键词 肺腺癌 自噬相关基因 预后模型 癌症基因组图谱数据库 计算生物学
下载PDF
丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)家族相关基因在结肠腺癌中预后模型的建立及应用
12
作者 闫学新 汪大伟 +4 位作者 栾郑豪 汪桐 宋佳 尚策 梁德森 《生物信息学》 2024年第1期37-46,共10页
应用生物信息学方法,构建结肠腺癌(COAD)丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)家族相关基因预后模型。从TCGA数据库和GEO数据库下载结肠腺癌(COAD)转录组和临床数据,根据数据中SERPINs家族基因的表达量对COAD患者进行一致性聚类分析;将数据随机... 应用生物信息学方法,构建结肠腺癌(COAD)丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)家族相关基因预后模型。从TCGA数据库和GEO数据库下载结肠腺癌(COAD)转录组和临床数据,根据数据中SERPINs家族基因的表达量对COAD患者进行一致性聚类分析;将数据随机均分为训练集(Train)组和验证集(Test)组,基于两个亚型的差异基因,利用Train组进行COX回归和Lasso回归构建预后模型,根据模型风险评分中位值将样本分为高、低风险两组,绘制高低风险组患者生存曲线;通过ROC曲线评价模型预测能力;利用Test组数据验证模型;构建列线图,评估患者生存率模型预测值与实际值的一致性;并利用利用ESTIMATE算法和CIBERSORT算法评估风险评分和肿瘤微环境(TME)以及免疫浸润的相关性。通过34个SERPIN基因确定了两个亚型,基于2个亚型筛选出了436个预后相关分型差异基因,通过Lasso回归确定出了11个预后相关基因参与风险模型的构建,根据模型评分区分的高低风险组具有明显的生存差异,列线图可以准确预测1、3和5年生存率。肿瘤微环境分析和免疫浸润分析显示高风险评分组患者免疫活性差。SERPIN家族相关基因构建的风险评分模型能够预测COAD的预后,有利于进一步指导临床对COAD的诊治,提高患者生存率。 展开更多
关键词 丝氨酸蛋白酶抑制剂 结肠腺癌 预后模型 免疫浸润
下载PDF
ER/PR^+和HER2^-型乳腺癌患者免疫组化指标的列线图预后模型 被引量:6
13
作者 吴莹 洪晏 +2 位作者 谢轶群 李曦洲 刘洋 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期934-939,共6页
目的:探讨改良雌激素受体(estrogen receptor,ER)/孕激素受体(progesterone receptor,PR)阳性(^+)及人类表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)阴性(-)(ER/PR^+、HER2-)型乳腺癌患者的传统预后模型,满足目... 目的:探讨改良雌激素受体(estrogen receptor,ER)/孕激素受体(progesterone receptor,PR)阳性(^+)及人类表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)阴性(-)(ER/PR^+、HER2-)型乳腺癌患者的传统预后模型,满足目前的临床实际需求。方法:选取了2009年1月至2009年12月上海市黄浦区中心医院乳腺外科收治的335例ER/PR^+、HER2-型乳腺癌患者。将97个变量纳入模型,采用SCAD变量选择的方法,在充分考虑协变量是否存在对数线性关系、非对数线性关系(分段线性关系)临界值的合理确定、共线问题后,构建一个新的ER/PR^+、HER2-型乳腺癌患者传统免疫组化指标的Cox回归预后模型,并进一步建立其列线图模型;在此基础上建立了术后1、3和5年生存概率的列线图;并通过比较模型的区分度(discrimination)和校准度(calibration)来评价模型的预测能力。结果:通过乳腺癌预后建立Cox回归模型结果显示,患者的预后与组织级别、淋巴结转移、Ki67、PR和年龄等因素有关;其中组织级别和淋巴结转移对风险比的影响呈对数线性关系,Ki67、PR和年龄对风险比的影响呈非对数线性关系,其合理临界值分别为Ki67(60%)、PR(20%)和年龄(55岁)。该模型术后1、3和5年的ROC曲线下面积(AUC值)均高于0.85,说明该Cox回归模型具有较高的区分度。该模型Gr?nnesby-Borgan拟合优度检验统计量值为1.37、对应的P值为0.5,说明该Cox回归模型有较好的校准度。结论:通过改良ER/PR^+和HER2-型乳腺癌患者的传统预后模型,建立患者术后1、3和5年生存概率的列线图,能准确、直观、有效地预测患者的生存概率,对乳腺癌患者临床治疗有较好的指导意义。 展开更多
关键词 乳腺癌 雌激素受体 孕激素受体 人类表皮生长因子受体2 传统免疫组化指标 列线图 预后模型
下载PDF
Luminal B型乳腺癌预后相关基因模型的建立与临床应用
14
作者 邓青 李志华 +3 位作者 涂剑宏 黄达 陈露 张雨露 《社区医学杂志》 CAS 2024年第1期16-23,共8页
目的基于Luminal B型乳腺癌的预后高度差异性建立预后风险评分模型,指导并预测Luminal B型乳腺癌患者预后生存能力。方法选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中194例Luminal B型乳腺癌数据集和119例癌旁正常乳腺组织进行差异基因表达分析。... 目的基于Luminal B型乳腺癌的预后高度差异性建立预后风险评分模型,指导并预测Luminal B型乳腺癌患者预后生存能力。方法选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中194例Luminal B型乳腺癌数据集和119例癌旁正常乳腺组织进行差异基因表达分析。结合生物信息学方法,通过差异基因表达分析得到与预后相关的基因组,利用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回归分析构建预后模型,即对该基因组在正常乳腺组织与乳腺癌组织的差异表达构建与预后相关的风险模型,并对模型的临床应用进行验证。同时探讨该风险模型可能触发的分子机制。免疫组织化学法检测2015-01-01-2022-12-31南昌市人民医院乳腺中心64例三阳性乳腺癌组织相关基因的表达。结果利用LASSO Cox回归分析构建预后模型,当纳入11个基因时风险效能最高,数据集验证其95%置信区间差异有统计学意义,其1、3和5年的受试者工作特征(ROC)曲线下面积分别为0.975、0.829和0.885,且高危组预后较差,差异有统计学意义,均P<0.05。单因素Cox回归分析结果发现,风险评分与预后相关,HR=5.72,95%CI为3.34~9.81,P<0.001;多因素Cox回归分析结果显示,风险评分(HR=8.91,95%CI为4.23~18.72,P<0.001)和年龄(HR=1.03,95%CI为1.00~1.06,P=0.047)与预后相关。列线图直观有效地展示了不同变量对预后结局的影响,以及纳入与预后相关的因素构建列线图模型,评估列线图模型的C-index值结果显示,模型C-index值为0.84,95%CI为0.75~0.92,P<0.001;富集通路分析结果显示,高风险组显著富集在可变剪接氨酰-tRNA合成等通路,低风险组富集在细胞因子-细胞因子受体、原发性免疫缺陷和趋化因子受体等信号通路;肿瘤微环境与风险评估相关性显示,大部分免疫细胞在低风险组中得分高。免疫组织化学检测结果显示,ERCC6L、COL11A1、NEURL1、CXCL9、ROPN1、PPP1R16B和PIGR在� 展开更多
关键词 乳腺癌 Luminal B型 分子分型 预后模型
原文传递
基于生物信息学分析泛凋亡基因对胃癌预后及肿瘤免疫微环境的影响
15
作者 魏相相 魏秋亚 +3 位作者 张栋岩 雍桃 邓成伍 王琛 《兰州大学学报(医学版)》 2024年第2期39-47,54,共10页
目的探讨泛凋亡相关基因对胃癌患者预后及免疫微环境的预测价值。方法基于TCGA、GEO数据库中胃癌患者PANoptosis差异基因表达谱,对胃癌患者进行聚类分析并构建预测模型,分析不同胃癌患者PANoptosis亚型及高、低风险组间肿瘤免疫微环境... 目的探讨泛凋亡相关基因对胃癌患者预后及免疫微环境的预测价值。方法基于TCGA、GEO数据库中胃癌患者PANoptosis差异基因表达谱,对胃癌患者进行聚类分析并构建预测模型,分析不同胃癌患者PANoptosis亚型及高、低风险组间肿瘤免疫微环境差异。结果胃癌患者可分为两个PANoptosis分子亚型,亚型间患者的临床特征、预后、信号通路和肿瘤微环境有显著差异。根据PANoptosis相关基因在胃癌组织中的表达水平,经Lasso回归分析、多因素Cox回归分析,鉴定出6个关键基因(IRF2、AKT3、UNC5B、CYCS、CASP5、TICAM1)用于构建风险评分体系。多组学分析发现,风险评分与微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷和肿瘤干细胞指数呈负相关关系。基于PANoptosis风险评分和临床病理因素构建诺莫图,预测胃癌患者1、3、5年生存率的受试者操作特征曲线下面积值分别为0.702、0.736、0.744。实时定量聚合酶链式反应实验证实风险基因CYCS、CASP5、TICAM1在胃癌细胞系中高表达(P<0.01)。结论基于胃癌PANoptosis相关基因构建的预后模型有望成为独立预测胃癌患者预后的指标。 展开更多
关键词 胃癌 泛凋亡 分子亚型 预测模型 免疫微环境 生物信息学
下载PDF
山东沂沭断裂带中段地质特征及金矿预测模型 被引量:6
16
作者 郝兴中 吴立新 +3 位作者 李现超 李英平 郭瑞朋 智云宝 《地质学刊》 CAS 2014年第3期392-398,共7页
在系统收集资料的基础上,通过阐述沂沭断裂带中段的区域地质特征、地球物理、地球化学等特征,深入剖析了龙泉站金矿区的控矿地质要素。区内金矿体以脉状、透镜状产于沂水—汤头断裂下盘,赋矿岩石为黄铁矿化糜棱岩质碎裂岩、黄铁矿化花... 在系统收集资料的基础上,通过阐述沂沭断裂带中段的区域地质特征、地球物理、地球化学等特征,深入剖析了龙泉站金矿区的控矿地质要素。区内金矿体以脉状、透镜状产于沂水—汤头断裂下盘,赋矿岩石为黄铁矿化糜棱岩质碎裂岩、黄铁矿化花岗质碎裂岩。总结了矿区的成矿规律和找矿标志,从地质环境、矿床特征、地球化学特征和地球物理特征等方面建立了沂沭断裂带中段地区的找矿预测模型,为今后进一步在该区开展金矿找矿工作提供了依据和找矿方向。 展开更多
关键词 沂沭断裂带 沂水—汤头断裂 找矿标志 金矿 预测模型 山东单县
下载PDF
基于TCGA数据库的肾透明细胞癌线粒体自噬基因预后模型构建及预后标志物鉴定
17
作者 丛晗 王淳合 何朝辉 《农垦医学》 2024年第2期97-105,共9页
目的:构建基于TCGA数据库的肾透明细胞癌线粒体自噬基因预后模型,寻找肾透明细胞癌的预后标志物。方法:利用TCGA-KIRC数据集,对线粒体自噬基因进行差异表达分析及单因素Cox分析;在训练集内应用多因素Cox回归模型构建预后风险评估模型;... 目的:构建基于TCGA数据库的肾透明细胞癌线粒体自噬基因预后模型,寻找肾透明细胞癌的预后标志物。方法:利用TCGA-KIRC数据集,对线粒体自噬基因进行差异表达分析及单因素Cox分析;在训练集内应用多因素Cox回归模型构建预后风险评估模型;在验证集及完整集中对其预测效果进行评价;对构成该模型的基因进行鉴定。结果:筛选出3个线粒体自噬基因(E2F1、TRAF2和BNIP3)构建风险模型,生存分析结果显示与低风险组相比,高风险组患者的生存期更短且ROC曲线下面积大于0.68(P<0.01);E2F1在肾透明细胞癌中高表达并与预后不良有关。结论:基于线粒体自噬基因构建的肾透明细胞癌预后风险模型可有效预测患者预后;E2F1具有作为预后标记物的潜力。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 线粒体自噬 预后模型 预后标记物
下载PDF
基于mRNA组学构建弥漫大B细胞淋巴瘤预后模型
18
作者 王玉波 马东慎 +2 位作者 骆丹 范美婷 刘慧 《徐州医科大学学报》 CAS 2024年第3期195-201,共7页
目的 根据mRNA组学数据筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因并建立预后模型。方法 从TCGA数据库下载NCICCR-DLBCL数据集中234例DLBCL患者mRNA组学数据和预后数据作为训练集,从GEO数据库下载GSE87371数据集中223例DLBCL患者相应数... 目的 根据mRNA组学数据筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因并建立预后模型。方法 从TCGA数据库下载NCICCR-DLBCL数据集中234例DLBCL患者mRNA组学数据和预后数据作为训练集,从GEO数据库下载GSE87371数据集中223例DLBCL患者相应数据作为验证集,通过Cox回归分析、Kaplan-Meier分析和LASSO分析建立预后模型,结合生存曲线和ROC曲线验证模型的准确性。采用免疫组化法验证117例DLBCL组织中CD70蛋白的表达及其与预后的关系。结果 构建包含14个独立预后预测mRNA(ANO3、ZNF93、RAD9B、PROC、ZSCAN20、RBBP9、SLC18B1、CXorf21、MUC12、CYP2U1、VSIG4、CCDC178、CD70、GHRH)的预后模型。高风险组生存时间显著短于低风险组(P<0.000 1),ROC 1年、3年和5年生存率曲线下面积分别为0.92、0.90和0.91。CD70阳性组与阴性组的Kaplan-Meier生存曲线差异有统计学意义(P=0.009 4),阳性组生存时间较短。结论 成功建立了基于mRNA表达的DLBCL预后预测模型,为mRNA转录组学在DLBCL预后预测中的实际应用提供了可行性方案,并在临床样本中证实CD70高表达与DLBCL预后密切相关,可作为临床预后评价的指标之一。 展开更多
关键词 MRNA CD70 弥漫大B细胞淋巴瘤 TCGA数据库 预后模型 生存分析
下载PDF
多发性骨髓瘤铁死亡相关组学分析及预后模型的建立 被引量:2
19
作者 王紫宁 陈浩然 +1 位作者 张钧栋 卢学春 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期411-419,共9页
目的:通过TCGA及FerrDb数据库探讨铁死亡相关基因在多发性骨髓瘤(MM)中的作用,并构建MM相关铁死亡基因预后模型。方法:利用包含764例MM患者临床信息及基因表达谱数据的TCGA数据库与包括铁死亡相关基因的FerrDb数据库,通过wilcox.test函... 目的:通过TCGA及FerrDb数据库探讨铁死亡相关基因在多发性骨髓瘤(MM)中的作用,并构建MM相关铁死亡基因预后模型。方法:利用包含764例MM患者临床信息及基因表达谱数据的TCGA数据库与包括铁死亡相关基因的FerrDb数据库,通过wilcox.test函数筛选其中的差异表达铁死亡相关基因。应用Lasso回归建立铁死亡相关基因预后模型,并绘制Kaplan-Meier生存曲线。使用COX回归分析筛选独立预后因素。筛选不同风险患者组间的差异基因,并通过富集分析探究MM铁死亡与预后相关的组学机制。结果:通过对764例MM患者骨髓样本及4例正常人骨髓样本进行差异分析,共筛选出铁死亡相关差异基因36个,其中上调基因12个,下调基因24个。使用Lasso回归筛选出6个预后相关基因(GCLM、GLS2、SLC7A11、AIFM2、ACO1、G6PD)并建立了MM铁死亡相关基因预后模型;Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,不同风险患者组间生存率具有显著统计学差异(P<0.01)。单因素COX回归分析结果显示,年龄、性别、ISS分期和风险评分与MM患者总生存期(OS)显著相关(P<0.05);多因素COX回归分析表明,年龄、ISS分期和风险评分是MM患者OS的独立预后指标(P<0.05)。GO与KEGG富集分析显示,铁死亡相关基因可能通过中性粒细胞的趋化与迁移、细胞因子活性及调控、细胞组分、抗原加工提呈、补体及凝血级联反应、造血祖细胞谱系等影响患者预后。结论:铁死亡相关基因在MM发病过程中变化显著,铁死亡相关基因预后模型可用于预测MM患者的生存情况,但铁死亡的潜在功能机制有待进一步临床研究证实。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 铁死亡 预后模型
下载PDF
基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因构建预测肝癌患者预后模型及相关功能和潜在药物研究
20
作者 谭天华 许静涌 宋京海 《临床误诊误治》 CAS 2024年第11期25-33,共9页
目的探讨基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因构建预测肝癌患者预后模型的可行性,并进行相关性分析及药物敏感性差异分析。方法从癌症基因组图谱数据库中获取大规模的肝癌患者数据,包括转录组数据、临床特征数据和突变数据。通过整合... 目的探讨基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因构建预测肝癌患者预后模型的可行性,并进行相关性分析及药物敏感性差异分析。方法从癌症基因组图谱数据库中获取大规模的肝癌患者数据,包括转录组数据、临床特征数据和突变数据。通过整合这些数据,构建一个预后模型,并选择与免疫检查点基因相关的基底膜基因作为独立预后蛋白。通过独立预后分析验证模型的独立性。另外行免疫相关性分析,评估高风险组和低风险组患者之间的差异基因和免疫相关功能。最后进行药物敏感性分析,评估不同风险组患者对常用药物的敏感性差异。结果根据多变量Cox回归分析得出预后模型公式:风险评分=(1.25968690844101×ADAMTS5表达)+(0.332985729856301×CTSA表达)+(-0.31683170952125×FBLN5表达)+(0.346521502281786×P3H1表达)。免疫相关性分析揭示了高风险组和低风险组患者之间的差异基因和免疫相关功能,差异基因包括Cytolytic_activity、Type_Ⅰ_IFN_Reponse、Type_Ⅱ_IFN_Reponse和MHC_class_Ⅰ。单因素预后分析,风险评分的HR和95%CI分别为1.201和1.132,1.274(P<0.01);多因素预后分析,风险评分的HR和95%CI分别为1.174和1.102,1.251(P<0.01)。受试者工作特征曲线显示,1、3和5年曲线下面积均大于0.5。一致性指数(C-index)曲线显示所构建的模型C-index值最大。药物敏感性分析发现高风险组和低风险组患者在Cyclopamine、Epothilone B、Foretinib、Imatinib、Midostaurin、Obatoclax Mesylate、Paclitaxel、Pyrimethamine、Sorafenib、Thapsigargin、Tipifarnib和Vinorelbine等的敏感性上存在显著差异。结论基于与免疫检查点基因相关的基底膜基因的预后模型对肝癌预后有潜在预测价值,其免疫相关性分析和药物敏感性分析可提供肝癌免疫状态和个体化治疗信息,可为肝癌的预后评估和治疗决策提供新的工具和指导,有助于改善患者的生存率和生活质量。 展开更多
关键词 肝肿瘤 预后模型 免疫检查点 基底膜基因 免疫功能 相关性 药物筛选
下载PDF
上一页 1 2 6 下一页 到第
使用帮助 返回顶部