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白边大叶蝉线粒体基因组测序与分析 被引量：4
1
作者 俞鹏飞 吴国火 韩宝瑜 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期874-881,共8页
采用引物步移法测得白边大叶蝉Kolla paulula(Walker)线粒体基因组90%左右的序列,并分析了该叶蝉的线粒体基因组特征。基于23个物种(半翅目)的蛋白编码基因序列,以最大似然法和贝叶斯法构建了头喙亚目系统发育树。已测得序列长度为13 57... 采用引物步移法测得白边大叶蝉Kolla paulula(Walker)线粒体基因组90%左右的序列,并分析了该叶蝉的线粒体基因组特征。基于23个物种(半翅目)的蛋白编码基因序列,以最大似然法和贝叶斯法构建了头喙亚目系统发育树。已测得序列长度为13 579 bp(AT:73.33%),其中包含了13个蛋白编码基因、21个t RNA基因和1个r RNA基因。除了ND5基因使用GTT作为起始密码子外,其他所有蛋白编码基因均使用ATN作为起始密码子;除了CO II使用不完整的T作为终止密码子,其他所有蛋白编码基因均使用TAA或TAG作为终止密码子。21个t RNA基因中,除了t RNASer(AGN)缺失1个稳定的茎环结构外,其他所有t RNA基因均能形成典型的三叶草二级结构。系统发育分析结果表明,进化树明显可以被分为沫蝉总科+(角蝉总科+蜡蝉总科);白边大叶蝉属于角蝉总科的叶蝉科,白边大叶蝉线粒体基因组特征与其他叶蝉科昆虫相同。 展开更多
关键词 白边大叶蝉 引物步移法 线粒体基因组 系统发育
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基于寡核苷酸芯片的引物连接法的研究
2
作者 章承芝 张红发 +5 位作者 李瑶 曹慧敏 韩志勇 裘敏燕 谢毅 毛裕民 《复旦学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期608-613,620,共7页
为了更好地将寡核苷酸芯片应用于单个核苷酸差异的检测,以HBV质粒为模板,探索了基于寡核苷酸芯片的引物延伸法.对主要反应体系和条件进行了优化:将杂交和连接的过程合并,创立了一步法,反应条件为30℃1h;在体系中加入了TritonX 100(φ=0.... 为了更好地将寡核苷酸芯片应用于单个核苷酸差异的检测,以HBV质粒为模板,探索了基于寡核苷酸芯片的引物延伸法.对主要反应体系和条件进行了优化:将杂交和连接的过程合并,创立了一步法,反应条件为30℃1h;在体系中加入了TritonX 100(φ=0.0067%),大大降低了背景信号.另外,将引物连接一步法应用于ABO血型分型,证明了其准确、有效,能够应用于分析单个核苷酸的差异情况. 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 引物连接法 引物连接一步法
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