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水稻Dwarf1移码突变的新突变体鉴定
被引量:
4
1
作者
陈华夏
周成博
邢永忠
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期397-403,共7页
从一批水稻品种"中花11"组织培养苗里分离到一个矮化突变株"C6PS",它的T2代群体株高呈现3:1分离。利用该群体矮化单株与"珍汕97"、"牡丹江8"构建2个F2群体F2(CZ)、F2(CM),两个群体中高株与矮...
从一批水稻品种"中花11"组织培养苗里分离到一个矮化突变株"C6PS",它的T2代群体株高呈现3:1分离。利用该群体矮化单株与"珍汕97"、"牡丹江8"构建2个F2群体F2(CZ)、F2(CM),两个群体中高株与矮株均呈现3:1分离,证明该性状变异为单基因控制。"C6PS"表现型与已经报道的Dwarf1隐性突变体"d1"相似,以D1附近标记RM430检测F2(CZ)群体基因型,结果显示群体表型与RM430基因型呈极显著相关(P=0.0001),将该基因初步定位于Dwarf1附近。对"C6PS"及"中花11"进行D1序列分析显示,突变株中D1基因在其第九个外显子与第九个内含子的剪接位点上发生6个碱基的缺失,根据缺失两侧序列设计C6PS-D1L/R标记,在T2代群体该标记与表型呈现共分离,表明"C6PS"是一种新的Dwarf1突变体。cDNA测序显示突变体d1基因转录产物发生26个碱基的缺失,导致移码产生终止突变,从而无法翻译出有功能的Gα蛋白,因此,它是一个Gα功能缺失突变体。叶倾斜度检测显示"C6PS"对油菜素内酯响应比野生型"中花11"弱。
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关键词
水稻
矮化突变株
Gα蛋白
终止突变
油菜素内酯
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职称材料
NMD逃逸机制及其在疾病治疗中的应用
被引量:
1
2
作者
程苗苗
曹延延
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期354-362,共9页
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)是指在病理或正常生理情况下mRNA上出现了提前终止密码子(premature termination codon, PTC),从而导致mRNA降解。它是一种广泛存在的mRNA质量监控机制。近年来,在多种疾病中发...
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)是指在病理或正常生理情况下mRNA上出现了提前终止密码子(premature termination codon, PTC),从而导致mRNA降解。它是一种广泛存在的mRNA质量监控机制。近年来,在多种疾病中发现某些PTC并未触发NMD,这种现象被称为NMD逃逸(NMD escape),然而其确切机制尚不十分清楚。目前公认的两个学说为:(1) PTC通读,即蛋白的翻译可以顺利通过PTC直至正常的终止密码子,产生全长蛋白;(2)翻译的重新启动,即蛋白翻译在PTC下游的潜在起始点重新开始直至终止密码子,产生N端截短蛋白。目前,通过利用PTC通读,越来越多的药物或小分子已被成功用于无义变异相关疾病的治疗。本文主要综述了NMD逃逸的机制及其在疾病治疗中的应用和进展,以期为进一步了解NMD逃逸及其相关应用概况提供参考。
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关键词
NMD逃逸
无义突变
提前终止密码子
PTC通读
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职称材料
tRNA抑制子对转录因子NKX2.5提前终止密码子的通读
被引量:
1
3
作者
欧阳平
刘远航
+6 位作者
黄志刚
齐小娟
倪倩
刘亚萍
宋仁生
李涛
吴柱国
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期367-373,共7页
人类NKX2.5基因(NK2 homeobox 5,NKX2.5)提前终止密码子(Premature termination codon,PTC)突变会引起房间隔缺损、房室传导阻滞等先天性心脏病。目前,已报道的NKX2.5 PTC突变有8个(E109X、Q149X、Q170X、Q187X、Q198X、Y256X、...
人类NKX2.5基因(NK2 homeobox 5,NKX2.5)提前终止密码子(Premature termination codon,PTC)突变会引起房间隔缺损、房室传导阻滞等先天性心脏病。目前,已报道的NKX2.5 PTC突变有8个(E109X、Q149X、Q170X、Q187X、Q198X、Y256X、Y259X和C264X)。为了检测tRNA抑制子是否对PTC突变诱导通读产生有功能的全长蛋白,文章将8个NKX2.5 PTC突变克隆到pcDNA3.1(-)载体,将NKX2.5全长和E109X、Q149X及C264X克隆到pEGFP-N1载体,形成NKX2.5-EGFP融合质粒。将NKX2.5-EGFP与对应的tRNA抑制子质粒分别或共转染后观察绿色荧光数量定性判断tRNA抑制子是否诱导通读。Western blotting检测通读后全长蛋白和截短蛋白表达并计算通读效率。Real-time PCR检测NKX2.5下游重要调控基因Cx43 mRNA的表达判断通读后蛋白功能。结果表明,文章成功构建了8个基于pcDNA3.1(-)的NKX2.5表达质粒、4个基于pEGFP-N1的质粒;tRNA抑制子tRNA am能有效通读Q149X、Q170X、Q187X和Q198X,且对后三者的通读效率均在50%以上;tRNA op能有效通读C264X,通读效率约50%左右;tRNA oc不能通读NKX2.5 PTC突变;各通读后样本Cx43 mRNA相对表达量增加7%~41.7%;tRNA am和tRNA op能有效通读NKX2.5 PTC突变,产生具有功能的全长蛋白,但tRNA抑制子对细胞的其他影响还不明确,有待于进一步观察。
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关键词
tRNA抑制子
NKX2.5
提前终止密码子
通读
先天性心脏病
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职称材料
题名
水稻Dwarf1移码突变的新突变体鉴定
被引量:
4
1
作者
陈华夏
周成博
邢永忠
机构
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期397-403,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30971749)
国家973项目(编号:2010CB125901)
转基因生物新品种培育重大专项(编号:2008ZX08009-001)资助
文摘
从一批水稻品种"中花11"组织培养苗里分离到一个矮化突变株"C6PS",它的T2代群体株高呈现3:1分离。利用该群体矮化单株与"珍汕97"、"牡丹江8"构建2个F2群体F2(CZ)、F2(CM),两个群体中高株与矮株均呈现3:1分离,证明该性状变异为单基因控制。"C6PS"表现型与已经报道的Dwarf1隐性突变体"d1"相似,以D1附近标记RM430检测F2(CZ)群体基因型,结果显示群体表型与RM430基因型呈极显著相关(P=0.0001),将该基因初步定位于Dwarf1附近。对"C6PS"及"中花11"进行D1序列分析显示,突变株中D1基因在其第九个外显子与第九个内含子的剪接位点上发生6个碱基的缺失,根据缺失两侧序列设计C6PS-D1L/R标记,在T2代群体该标记与表型呈现共分离,表明"C6PS"是一种新的Dwarf1突变体。cDNA测序显示突变体d1基因转录产物发生26个碱基的缺失,导致移码产生终止突变,从而无法翻译出有功能的Gα蛋白,因此,它是一个Gα功能缺失突变体。叶倾斜度检测显示"C6PS"对油菜素内酯响应比野生型"中花11"弱。
关键词
水稻
矮化突变株
Gα蛋白
终止突变
油菜素内酯
Keywords
rice
dwarf
mutant
Get
protein
premature
stop
Brassinolide
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
NMD逃逸机制及其在疾病治疗中的应用
被引量:
1
2
作者
程苗苗
曹延延
机构
首都儿科研究所遗传室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期354-362,共9页
基金
北京市自然科学基金项目(编号:5163028)
国家自然科学基金项目(编号:81500979)
+1 种基金
国家重点研发计划项目(编号:2016YFC0901505)
中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(编号:2016-I2M-1-008)资助。
文摘
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)是指在病理或正常生理情况下mRNA上出现了提前终止密码子(premature termination codon, PTC),从而导致mRNA降解。它是一种广泛存在的mRNA质量监控机制。近年来,在多种疾病中发现某些PTC并未触发NMD,这种现象被称为NMD逃逸(NMD escape),然而其确切机制尚不十分清楚。目前公认的两个学说为:(1) PTC通读,即蛋白的翻译可以顺利通过PTC直至正常的终止密码子,产生全长蛋白;(2)翻译的重新启动,即蛋白翻译在PTC下游的潜在起始点重新开始直至终止密码子,产生N端截短蛋白。目前,通过利用PTC通读,越来越多的药物或小分子已被成功用于无义变异相关疾病的治疗。本文主要综述了NMD逃逸的机制及其在疾病治疗中的应用和进展,以期为进一步了解NMD逃逸及其相关应用概况提供参考。
关键词
NMD逃逸
无义突变
提前终止密码子
PTC通读
Keywords
NMD
escape
nonsense
mutation
premature
stop
codon(PTC)
PTC
read-through
分类号
R363 [医药卫生—病理学]
下载PDF
职称材料
题名
tRNA抑制子对转录因子NKX2.5提前终止密码子的通读
被引量:
1
3
作者
欧阳平
刘远航
黄志刚
齐小娟
倪倩
刘亚萍
宋仁生
李涛
吴柱国
机构
广东医学院广东省医学分子诊断重点实验室
内蒙古呼和浩特市第一医院急诊科
广东医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室
广东医学院第二临床医学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期367-373,共7页
基金
国家青年基金项目(编号:81200082)
广东省医学科研基金项目(编号:B2012272)
广东医学院博士启动基金项目(编号:B2011019)资助
文摘
人类NKX2.5基因(NK2 homeobox 5,NKX2.5)提前终止密码子(Premature termination codon,PTC)突变会引起房间隔缺损、房室传导阻滞等先天性心脏病。目前,已报道的NKX2.5 PTC突变有8个(E109X、Q149X、Q170X、Q187X、Q198X、Y256X、Y259X和C264X)。为了检测tRNA抑制子是否对PTC突变诱导通读产生有功能的全长蛋白,文章将8个NKX2.5 PTC突变克隆到pcDNA3.1(-)载体,将NKX2.5全长和E109X、Q149X及C264X克隆到pEGFP-N1载体,形成NKX2.5-EGFP融合质粒。将NKX2.5-EGFP与对应的tRNA抑制子质粒分别或共转染后观察绿色荧光数量定性判断tRNA抑制子是否诱导通读。Western blotting检测通读后全长蛋白和截短蛋白表达并计算通读效率。Real-time PCR检测NKX2.5下游重要调控基因Cx43 mRNA的表达判断通读后蛋白功能。结果表明,文章成功构建了8个基于pcDNA3.1(-)的NKX2.5表达质粒、4个基于pEGFP-N1的质粒;tRNA抑制子tRNA am能有效通读Q149X、Q170X、Q187X和Q198X,且对后三者的通读效率均在50%以上;tRNA op能有效通读C264X,通读效率约50%左右;tRNA oc不能通读NKX2.5 PTC突变;各通读后样本Cx43 mRNA相对表达量增加7%~41.7%;tRNA am和tRNA op能有效通读NKX2.5 PTC突变,产生具有功能的全长蛋白,但tRNA抑制子对细胞的其他影响还不明确,有待于进一步观察。
关键词
tRNA抑制子
NKX2.5
提前终止密码子
通读
先天性心脏病
Keywords
tRNA
suppressors
NKX2.5
premature
stop
codon
(PTC)
readthrough
congenital
heart
disease
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻Dwarf1移码突变的新突变体鉴定
陈华夏
周成博
邢永忠
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
下载PDF
职称材料
2
NMD逃逸机制及其在疾病治疗中的应用
程苗苗
曹延延
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
下载PDF
职称材料
3
tRNA抑制子对转录因子NKX2.5提前终止密码子的通读
欧阳平
刘远航
黄志刚
齐小娟
倪倩
刘亚萍
宋仁生
李涛
吴柱国
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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职称材料
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