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新疆8个绵羊品种遗传多样性和系统发生关系的微卫星分析 被引量:72
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作者 贾斌 陈杰 +3 位作者 赵茹茜 雒秋江 剡根强 陈杰 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第9期847-854,共8页
为分析新疆北疆地区主要绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系 ,利用 10个微卫星标记 ,采用PCR扩增 ,12 %非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、Sanguinetti银染法显色 ,对新疆北疆地区 8个品种、 1个杂交一代绵羊群体遗传多样性进行了检测 ,统计... 为分析新疆北疆地区主要绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系 ,利用 10个微卫星标记 ,采用PCR扩增 ,12 %非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、Sanguinetti银染法显色 ,对新疆北疆地区 8个品种、 1个杂交一代绵羊群体遗传多样性进行了检测 ,统计了各群体的等位基因组成、平均有效等位基因数 (E)和平均基因纯合率 ,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度 (h)、多态信息含量 (PIC)和群体间的遗传距离。利用分子进化遗传分析软件 ,采用邻结法构建系统发生树 ;同时根据等位基因频率 ,利用PHYLIP (3 6 )分析软件 ,采用最大似然法构建系统发生树 ,应用自举检验估计系统树中结点的自引导值 ,并进行了系统发生分析。结果表明 :10个微卫星位点在 9个绵羊群体中的多态信息含量除BMI82 4、MAF6 5为低、中度多态外 ,其余 8个微卫星均为高度多态 ,可作为有效的遗传标记用于各绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系的分析 ;所有绵羊群体的平均PIC(0 5 6 31)、h (0 5 72 1)和E (2 9)均低于国外其他品种的绵羊 ,其基因多态性和遗传多样性相对贫乏 ;新疆本地土种阿勒泰羊、哈萨克羊和巴什拜羊与国外引进绵羊品种及混有外血的本地培育品种遗传距离较远 ,他们聚为不同的两类 ,各绵羊品种的分子系统发生关系与其来源、育成史? 展开更多
关键词 绵羊 微卫星 遗传多样性 系统发生
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10种披碱草属植物的RAPD分析及其系统学意义 被引量:67
2
作者 周永红 郑有良 +2 位作者 杨俊良 颜济 贾继增 《植物分类学报》 CSCD 1999年第5期425-432,共8页
利用随机扩增多态性DNA(RAPD) 技术分析了10 种披碱草属植物,即:Elymussibiricus L., E.caninus(L.) L., E.lanceolatus (Scribner et Smith) Goul... 利用随机扩增多态性DNA(RAPD) 技术分析了10 种披碱草属植物,即:Elymussibiricus L., E.caninus(L.) L., E.lanceolatus (Scribner et Smith) Gould , E. nutans Griseb , E. dahuricus Turcz.,E. tangutorum (Nevski) Hand .Mazz., E. brachyaristatus ALve, E.submuticus(Keng) Kengf., E.cylidricus (Franch) Honda 和E. excelsus Turcz.。对34 个OPRON 公司十聚体随机引物进行多态性筛选,25 个(75 .53 % ) 能产生多态性。16 个引物产生的136 个DNA 片断,用于计算种间Nei 氏遗传相似性系数分析,在NTSYS程序中利用UPGMA 构建系统发育树状图。分析结果表明:(1) 四倍体和六倍体物种各自聚为一支,它们之间的亲缘关系较远;(2) E. sibiricus 和E. caninus 亲缘关系较近,支持把Roegneria caninus (L.) Nevski 归入Elymus;(3) E. 展开更多
关键词 披碱草属 RAPD分析 亲缘关系 染色体组 形态学
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11种金花茶植物的RAPD分析及其系统学意义 被引量:47
3
作者 施苏华 唐绍清 +2 位作者 陈月琴 屈良鹄 张宏达 《植物分类学报》 CSCD 1998年第4期317-322,共6页
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了11种金花茶植物,即:龙州金花茶CamelialongzhouensisJ.Y.Luo,弄岗金花茶C.longgangensisC.F.LiangetS.L.Mo,大样金... 利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了11种金花茶植物,即:龙州金花茶CamelialongzhouensisJ.Y.Luo,弄岗金花茶C.longgangensisC.F.LiangetS.L.Mo,大样金花茶C.grandis(C.F.LiangetS.L.Mo)H.T.ChangetS.Y.Liang,扶绥金花茶C.fusuiensisS.Y.LiangetX.J.Dong,中东金花茶C.achrysanthaH.T.ChangetS.Y.Liang,小花金花茶C.micranthaS.Y.LiangetY.C.Zhong,薄叶金花茶C.chrysanthoidesH.T.Chang,毛籽金花茶C.ptilospermaS.Y.LiangetQ.D.Chen,陇瑞金花茶C.longruiensisS.Y.LiangetX.J.Dong,凹脉金花茶C.impresinervisH.T.ChangetS.Y.Liang和夏石金花茶C.xiashiensisS.Y.LiangetC.Z.Deng。选用14个引物(10bp)扩增出201个DNA片段,用于种间遗传相似性分析,构建系统发育树图。分析结果表? 展开更多
关键词 金花茶植物 RAPD 系统发育关系
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药用植物亲缘学 被引量:63
4
作者 陈四保 彭勇 +1 位作者 陈士林 肖培根 《世界科学技术-中医药现代化》 2005年第6期97-103,共7页
药用植物亲缘学(Pharmaphylogeny)是研究药用植物的植物亲缘关系-化学成分-疗效(药理活性及传统疗效)间的相关性的一门新兴的边缘学科,它的特点是多学科相互交叉、相互渗透,其研究对象涉及多学科领域。该学科的建立对于开发药用植物资... 药用植物亲缘学(Pharmaphylogeny)是研究药用植物的植物亲缘关系-化学成分-疗效(药理活性及传统疗效)间的相关性的一门新兴的边缘学科,它的特点是多学科相互交叉、相互渗透,其研究对象涉及多学科领域。该学科的建立对于开发药用植物资源具有重要指导意义。本文围绕药用植物亲缘学的概念、形成背景、研究范围和关键技术以及对中药资源利用的意义进行阐述。 展开更多
关键词 药用植物亲缘学 中药资源 植物亲缘关系 化学成分 疗效
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梨属种质资源的RAPD分析 被引量:40
5
作者 曲柏宏 金香兰 +2 位作者 陈艳秋 刘洪章 王丕武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期460-462,共3页
对梨属 4 0个品种及类型进行了RAPD扩增 ,根据相似系数进行UPGMA法聚类 ,将起源于欧洲的西洋梨与起源于中国的 3个种明显区分开 ,起源于中国的 3个种虽未完全各自聚类 ,但各材料间都有不同的遗传距离 。
关键词 梨属 RAPD 品种鉴定 亲缘关系 种质资源
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九种李属植物的RAPD亲缘关系分析 被引量:39
6
作者 阮颖 周朴华 刘春林 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期218-223,共6页
以李属植物 9个种的 2 0个材料为研究对象 ,用RAPD技术对其进行亲缘关系分析。在建立适合李属植物的PCR RAPD反应体系的基础上 ,从 45个随机引物 ( 1 0mer)中筛选出 2 4个 ,对所有供试材料进行扩增 ,共获得 2 4张DNA指纹图谱 ,3 2 6条DN... 以李属植物 9个种的 2 0个材料为研究对象 ,用RAPD技术对其进行亲缘关系分析。在建立适合李属植物的PCR RAPD反应体系的基础上 ,从 45个随机引物 ( 1 0mer)中筛选出 2 4个 ,对所有供试材料进行扩增 ,共获得 2 4张DNA指纹图谱 ,3 2 6条DNA谱带 ,其中有 3 1 1条为多态带。建立了基于RAPD的李属植物亲缘关系树形图 ,树形图的聚类结果与经典的李属植物的起源、分布和分类基本一致。另外 ,根据聚类结果 ,作者认为 :1 )乌苏里李是中国李的一个变种而非一独立的种 ;2 )杏李是一李杏杂种且与杏有较近的亲缘关系 ;3 )从分子水平证明了欧洲李 (PrunusdomesticaL.)是由樱桃李 (P .cerasiferaEhrh.)和黑刺李 (P .spinosaL .)自然杂交形成的后代。 展开更多
关键词 李属植物 RAPD 亲缘关系分析 欧洲李 樱桃李 自然杂交
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5个泥蚶群体遗传多样性的RAPD分析 被引量:51
7
作者 李太武 李成华 +1 位作者 宋林生 苏秀榕 《生物多样性》 CAS CSCD 2003年第2期118-124,共7页
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术 ,对 5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的 2 0个随机引物中共检测到 15 4个扩增片段 ,长度在 30 0bp~ 2 30 0bp之间 ,每个个体扩增条带在 1~ 11条不等。利用Popgen3.2和PHILIP统计软件 ,获... 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术 ,对 5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的 2 0个随机引物中共检测到 15 4个扩增片段 ,长度在 30 0bp~ 2 30 0bp之间 ,每个个体扩增条带在 1~ 11条不等。利用Popgen3.2和PHILIP统计软件 ,获得实验数据 ,确立了 5个群体间的亲缘关系。结果表明 :( 1)泥蚶的 5个地理群体分化不明显 ,没有形成不同的地理种群 ;( 2 )聚类分析显示 ,韩国群体与浙江群体亲缘关系最近 ,然后依次为山东群体和福建群体 ;( 3) 5个群体无论是在多态位点比例还是在平均遗传杂合度上都处于较高水平 ,说明泥蚶当前种质资源状况良好 ,遗传多样性水平较高 ,泥蚶养殖有很好的发展前景 ;( 4)与韩国野生群体相比 ,其他 4个泥蚶群体在多态位点比例和遗传平均杂合度上都有不同程度的降低 ,表明人为等因素已经开始影响到泥蚶的种质资源状况。因此 ,为持续发展泥蚶养殖业 ,必须加强保护泥蚶现有的种质资源并制定相应的渔业管理措施。 展开更多
关键词 泥蚶 RAPD 遗传多样性 亲缘关系
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红豆杉科植物RAPD分析及其系统学意义 被引量:32
8
作者 王艇 苏应娟 +1 位作者 黄超 朱建明 《西北植物学报》 CAS CSCD 2000年第2期243-249,共7页
利用随机扩增多态性 DNA ( RAPD)技术分析了红豆杉科 ( Taxaceae)红豆杉属( Taxus)、白豆杉属 ( Pseudotaxus)、穗花杉属 ( Amentotaxus)和榧树属 ( Torreya)的 6种植物 :红豆杉 ( Taxus chinensis( Pilger) Rehd)、南方红豆杉 ( Taxus ... 利用随机扩增多态性 DNA ( RAPD)技术分析了红豆杉科 ( Taxaceae)红豆杉属( Taxus)、白豆杉属 ( Pseudotaxus)、穗花杉属 ( Amentotaxus)和榧树属 ( Torreya)的 6种植物 :红豆杉 ( Taxus chinensis( Pilger) Rehd)、南方红豆杉 ( Taxus chinensis var.mairei( Lemee etLevl.) Cheng et Maire Yew )、白豆杉 ( Pseudotaxus chienii ( Cheng) Cheng )、穗花杉( Amentotaxus argotaenia( Hance) Pilger)、云南穗花杉 ( Amentotaxus yunnanensis Cheng etL.K.Fu)和云南榧树 ( Torreya yunnanensis)。经筛选 4组 80个引物 ,其中 1 4个引物的谱带清晰呈多态性。采用 UPGMA法对求出的遗传距离进行聚类分析 ,得到的结果显示 :( 1 )支持红豆杉属 ( Taxus)内南方红豆杉 ( Taxus chinensis var.mairei)作为变种的处理方式。 ( 2 )同意穗花杉属 ( Amentotaxus)置于红豆杉科的观点 ,不支持另立穗花杉属独立成科的处理方式。 ( 3)白豆杉应为红豆杉科内一个属白豆杉属 ( Pseudotaxus)。支持榧树族仅包括榧树属的观点。 展开更多
关键词 红豆杉科 RAPD 系统发育 亲缘关系
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采用SSR和RAPD标记研究黄瓜属(葫芦科)的系统发育关系 被引量:36
9
作者 陈劲枫 庄飞云 +2 位作者 逯明辉 钱春桃 任刚 《植物分类学报》 CSCD 北大核心 2003年第5期427-435,共9页
野黄瓜Cucumishystrix ( 2n =2 4 )是在亚洲发现的第一个染色体基数为 1 2的黄瓜属物种。这一发现对现行的以染色体基数和地理分布为基础的黄瓜属分类系统提出了质疑。采用SSR和RAPD两种分子标记对黄瓜属 2 2份不同类型材料的亲缘关系... 野黄瓜Cucumishystrix ( 2n =2 4 )是在亚洲发现的第一个染色体基数为 1 2的黄瓜属物种。这一发现对现行的以染色体基数和地理分布为基础的黄瓜属分类系统提出了质疑。采用SSR和RAPD两种分子标记对黄瓜属 2 2份不同类型材料的亲缘关系进行了研究。结果表明 ,野黄瓜C .hystrix与黄瓜C .sativusvar.sativus( 2n =1 4)间的遗传距离 (SSR :0 .5 9,RAPD :0 .5 7)小于其与甜瓜C .melovar.melo( 2n =2 4 )间的距离 (SSR :0 .87,RAPD :0 .70 )。SSR计算的各物种间遗传距离值高于RAPD的结果 ,线性方程为y=0 .85 9x + 0 .1 41 ,但两者相关性较好 ,r=0 .94。综合 1 0 9个SSR位点和 398个RAPD条带对 2 2份材料进行聚类分析 ,共分为两群 :CS群 (黄瓜、西南野黄瓜C .sativusvar.hardwickii、C .hytivus及野黄瓜C .hystrix)和CM群 (甜瓜、菜瓜C .melovar.conomon、野生小甜瓜C .melossp.agrestis及非洲角黄瓜C .metuliferus)。 展开更多
关键词 SSR RAPD 黄瓜属 葫芦科 系统发育 染色体 亲缘关系
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用SSR标记研究柑橘属及其近缘属植物的亲缘关系(英文) 被引量:32
10
作者 庞晓明 胡春根 邓秀新 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期81-87,共7页
用SSR标记分析了 2 9份柑橘属及近缘属植物的亲缘关系。 7对SSR引物在 2 9个样品中扩增得到 114个等位基因 ,平均每个位点有 16 3个等位基因。计算匹配系数后用邻接法进行聚类 ,结果表明 ,澳洲指橘与柑橘属的亲缘关系很近 ;SSR位点的高... 用SSR标记分析了 2 9份柑橘属及近缘属植物的亲缘关系。 7对SSR引物在 2 9个样品中扩增得到 114个等位基因 ,平均每个位点有 16 3个等位基因。计算匹配系数后用邻接法进行聚类 ,结果表明 ,澳洲指橘与柑橘属的亲缘关系很近 ;SSR位点的高纯合频率支持富民枳种的地位 ;枳与柑橘属的关系较远 ,枳不大可能是从柑橘属衍生而来 ;Swingle的亚属的划分以及田中的原生柑橘类和后生柑橘类的划分界线都不清晰 ;现代栽培柑橘的起源与大翼橙关系密切 ;柑橘属的枸橼、柚和宽皮橘都能很好地分离 ,支持其为现代栽培柑橘的 3个基本种的观点。 展开更多
关键词 SSR标记 柑橘属 近缘属植物 亲缘关系 富民枳 澳洲指橘属
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沙枣叶绿体全基因组序列及其使用密码子偏性分析 被引量:47
11
作者 王婧 王天翼 +2 位作者 王罗云 张建国 曾艳飞 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1559-1572,共14页
该研究以2株野生沙枣(Elaeagnus angustifolia Linn.)嫩枝经温室水培后的嫩叶为材料,采用CTAB法分别提取总DNA,并利用第二代测序技术进行总DNA从头测序,组装后得到2株沙枣叶绿体基因组全序列,并详细分析了其蛋白质编码基因密码子使用的... 该研究以2株野生沙枣(Elaeagnus angustifolia Linn.)嫩枝经温室水培后的嫩叶为材料,采用CTAB法分别提取总DNA,并利用第二代测序技术进行总DNA从头测序,组装后得到2株沙枣叶绿体基因组全序列,并详细分析了其蛋白质编码基因密码子使用的偏好性及其原因,为沙枣叶绿体基因工程和分子系统进化等研究奠定基础。结果显示:(1)组装得到沙枣叶绿体基因组序列全长150546 bp,由长度为81113 bp的长单拷贝(LSC)区域和25494 bp的短单拷贝(SSC)区域,以及1对分隔开它们的长18445 bp的反向重复序列(IRS)组成;注释共得到132个基因,包括86个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因。(2)沙枣叶绿体基因组蛋白编码基因密码子的第三位碱基GC含量(GC 3)为28.47%,明显低于整个叶绿体基因组GC含量(37%),也低于第一位(GC 1)和第二位(GC 2)碱基的GC含量,说明密码子对AT碱基结尾有偏好性;其中,UCU、CCU、UGU、GCU、CUU、GAU、UCA和UAA为最优密码子。(3)同义密码子相对使用频率(RSCU)分析发现,影响密码子使用模式的因素并不单一,密码子的偏好性受到突变、选择及其他因素的共同影响,并且自然选择表达引起的序列差异比突变对密码子偏好性的影响要显著;中性绘图分析、有效密码子数(ENC-plot)分析和奇偶偏好性(PR2-plot)分析表明,沙枣叶绿体基因组使用密码子的偏性受选择的影响更大。(4)通过最大似然法、最大简约法和贝叶斯方法对胡颓子科6个物种和1个枣的叶绿体基因序列构建系统发育树,与它们使用密码子偏性聚类的结果一致,表明叶绿体基因组使用密码子偏性与物种的亲缘关系相关。 展开更多
关键词 沙枣 叶绿体基因组 密码子使用偏性 最优密码子 系统发育关系
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百合遗传多样性及亲缘关系的RAPD分析 被引量:35
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作者 左志锐 穆鼎 +1 位作者 高俊平 刘春 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期468-472,共5页
对百合野生种及栽培品种共60份材料进行了RAPD分析,22条随机引物共扩增出224条带,其中163条为多态性带,多态率为72.77%。UPGMA分类结果将60份百合材料分为两大类群,第1类群为铁炮与亚洲百合杂交系(L/A)、野生种、亚洲系百合(A)、喇叭百... 对百合野生种及栽培品种共60份材料进行了RAPD分析,22条随机引物共扩增出224条带,其中163条为多态性带,多态率为72.77%。UPGMA分类结果将60份百合材料分为两大类群,第1类群为铁炮与亚洲百合杂交系(L/A)、野生种、亚洲系百合(A)、喇叭百合杂交系(T)及东方与喇叭百合杂交系(O/T)的聚合,这一类群在阈值0.668处又被分为两个亚类群;第2类群为1份野生种(L.speciosum)及铁炮系百合(L)和东方系百合(O)的聚合,其中东方系百合在阈值0.746处又被分为两个亚类群。根据此分类结果,进行了类群间亲缘关系及品种起源形成分析,60份百合材料被划分为14个群组。经统计分析,各群组之间的遗传相似系数与遗传距离的变化呈现相反的趋势。 展开更多
关键词 百合 遗传多样性 亲缘关系 RAPD
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用RAPD标记研究对虾属六个种间的亲缘关系 被引量:30
13
作者 宋林生 相建海 +3 位作者 李晨曦 周令华 刘瑞玉 樊拥军 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1998年第3期353-359,共7页
用RAPD技术对对虾属中六种对虾基因组DNA的多态性进行研究。在事先优化的反应条件下用20个随机引物扩增,共得到364条清晰稳定的多态性片段,片段长度在230~2800bp之间。统计这些片段,根据扩增片段的共享度计算... 用RAPD技术对对虾属中六种对虾基因组DNA的多态性进行研究。在事先优化的反应条件下用20个随机引物扩增,共得到364条清晰稳定的多态性片段,片段长度在230~2800bp之间。统计这些片段,根据扩增片段的共享度计算出相对遗传距离指数,然后用UPGMA和NJ等聚类方法对其进行分析,构建系统树,确定了它们相互间的亲缘关系。从聚类分析的结果可以看到,外部形态比较相似的种类在基因组DNA上表现出较大的相似性,反之则较小。 展开更多
关键词 RAPD 对虾属 亲缘关系 种间关系
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我国部分地区H9亚型禽流感病毒血凝素基因序列比较与遗传发生关系分析 被引量:35
14
作者 刘红旗 程坚 +3 位作者 彭大新 贾立军 张如宽 刘秀梵 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期288-297,共10页
为从分子水平掌握我国H9亚型AIV的遗传变异情况和流行规律 ,本研究汇集近年来从我国 1 2个省、市、自治区的发病鸡群中分离到的 2 3株H9亚型禽流感病毒 ,通过RT -PCR方法和核苷酸序列测定获得了 2 3个毒株的HA基因cDNA核苷酸序列。核苷... 为从分子水平掌握我国H9亚型AIV的遗传变异情况和流行规律 ,本研究汇集近年来从我国 1 2个省、市、自治区的发病鸡群中分离到的 2 3株H9亚型禽流感病毒 ,通过RT -PCR方法和核苷酸序列测定获得了 2 3个毒株的HA基因cDNA核苷酸序列。核苷酸和推导的氨基酸序列同源性比较结果表明 ,这些毒株HA基因的核苷酸序列同源性为 94.1 %~1 0 0 % ,氨基酸序列同源性为 95 .4%~ 1 0 0 % ;将这 2 3个毒株和来自亚洲及世界其它地区的另外 3 1株的HA基因cDNA序列同源性进行比较发现 ,分离自香港的HK1 70 4 99株与日本的 2个毒株关系较近 ;氨基酸序列分析发现 ,CKGS1 99、CKTJ1 96、CKTJ2 96、CKSH3 0 0和CKBJ1 97五个毒株各发生了一个潜在的糖基化位点的丢失。 5 4株H9亚型AIVHA基因 5 5bp~ 1 1 5 2bp的氨基酸序列分析发现 ,裂解位点尽管有 1 0种基序 ,但本研究中的 2 3株和近年来从我国大陆和香港地区的分离的毒株则均为RSSR↓GLF ;构成受体结合位点的 1 91位氨基酸有一个规律 ,即所有中国大陆毒株与部分香港毒株都为N ,其它毒株均为H ,1 41aa~ 1 43aa处的糖基化位点有与 1 91aa类似的规律 ,即 :凡是 1 91aa为N的毒株 ,该处均为NVS(CKBJ1 94除外 ) ,凡是1 91aa为H的毒株 ,则该处均为NVT ;遗传发生关系分析 ,中国大陆? 展开更多
关键词 H9亚型禽流感病毒 血凝素基因 遗传发生关系 同源性 序列分析 中国
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李种质资源ISSR鉴定及亲缘关系分析 被引量:36
15
作者 王进 何桥 +4 位作者 欧毅 梁国鲁 何波 郭启高 向素琼 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期182-187,共6页
为了更好的利用目前收集得到的李资源,对重庆地方李品系和国内外引进的李品种共40份资源进行了ISSR分析。从100条引物中筛选出13条多态性引物,共扩增得到134条带,多态性条带109条,多态性百分率为81.3%,其中9条特征性谱带可用于品种鉴定... 为了更好的利用目前收集得到的李资源,对重庆地方李品系和国内外引进的李品种共40份资源进行了ISSR分析。从100条引物中筛选出13条多态性引物,共扩增得到134条带,多态性条带109条,多态性百分率为81.3%,其中9条特征性谱带可用于品种鉴定和系谱分析的参考性标记。此外,13条引物可将40份材料完全区分开来,图谱分析表明不存在同物异名现象。UPGMA聚类分析将供试品种分成2组,进一步可细分为4个亚组;主坐标分析将其分成6类,其中奉节李、脆红李和万盛鸡血李分别单独成类。2种分析方法所得的结果均与按原产地划分的结果不完全相符,奉节李、脆红李和万盛鸡血李与其余品种(品系)的亲缘关系较远。来自江苏的早黄李与日本和美国李品种间的亲缘关系相对较近,初步推测国外中国李可能来源于我国华东地区。 展开更多
关键词 ISSR 种质资源 亲缘关系 品种鉴定
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部分中国原产甜柿种质的分子系统学研究 被引量:30
16
作者 罗正荣 李发芳 蔡礼鸿 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期297-301,共5页
采用25 个随机引物对中日两国原产完全甜柿种质的RAPD 分析结果表明: (1)供试中国甜柿和日本甜柿是相对独立分化的两个居群, 中国甜柿的遗传多样性更为丰富; (2)在供试中国甜柿中, ‘罗田甜柿’的5 个单株间的遗传组... 采用25 个随机引物对中日两国原产完全甜柿种质的RAPD 分析结果表明: (1)供试中国甜柿和日本甜柿是相对独立分化的两个居群, 中国甜柿的遗传多样性更为丰富; (2)在供试中国甜柿中, ‘罗田甜柿’的5 个单株间的遗传组成的差异较小, 但与其它湖北甜柿和湘西甜柿间的差异较大; (3) ‘铜盆柿’与湖北甜柿间的相似指数较高, 说明二者有某种亲缘关系; (4) 湘西甜柿与供试日本甜柿间的亲缘关系较近, 说明其可能来自日本或是与日本甜柿的起源有关。 展开更多
关键词 甜柿 日本 RAPD分析 亲缘关系
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亚洲淡水和陆生龟鳖类12S rRNA基因片段的序列分析和系统发生研究 被引量:28
17
作者 吴平 周开亚 杨群 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1999年第3期260-267,共8页
对亚洲产淡水和陆生龟鳖类4科23个种进行了DNA序列水平的分子系统学研究,用PCR技术扩增约400bp的线粒体12SrRNA基因片段并进行了序列分析,合并从GenBank中检索到的其它龟鳖类的序列数据,在基于二级结构的对位排列基础上用邻结法进行... 对亚洲产淡水和陆生龟鳖类4科23个种进行了DNA序列水平的分子系统学研究,用PCR技术扩增约400bp的线粒体12SrRNA基因片段并进行了序列分析,合并从GenBank中检索到的其它龟鳖类的序列数据,在基于二级结构的对位排列基础上用邻结法进行了系统发生研究。结果表明,潮龟科与陆龟科的亲缘关系比龟科与陆龟科的近;支持将平胸龟属归为鳄龟科的1个属;潮龟科是并系起源的,从12SrRNA基因序列得到的系统发生关系不支持根据形态学和染色体性状对潮龟科的分亚科和分组。根据12SrRNA基因片段的序列差异和化石记录的分歧时间计算得到的颠换积累速率,支持龟鳖类mtDNA慢速率进化理论。 展开更多
关键词 亚洲淡水龟鳖 陆生龟鳖 系统发生 12SrRNA 基因
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基于COⅠ基因部分序列对尾凤蝶属(鳞翅目,凤蝶科)四种蝴蝶分子系统关系及相关问题的探讨 被引量:34
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作者 诸立新 吴孝兵 晏鹏 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2006年第1期25-30,共6页
为了探讨中国尾凤蝶属的系统发生关系,对中国产4种尾凤蝶属蝴蝶的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因的部分序列进行了分析。在获得的636bp的序列中,有59个变异位点,47个简约信息位点;A、T、G、C碱基的平均含量分别为29.5%、40.8%、13.9%及15.... 为了探讨中国尾凤蝶属的系统发生关系,对中国产4种尾凤蝶属蝴蝶的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因的部分序列进行了分析。在获得的636bp的序列中,有59个变异位点,47个简约信息位点;A、T、G、C碱基的平均含量分别为29.5%、40.8%、13.9%及15.8%;表现出明显的A+T含量(70.3%)偏异。采用NJ、MP、ML法构建了分子系统树,结果表明尾凤蝶属二尾种组与多尾凤蝶亲缘关系较近,而三尾凤蝶较早分化出来。同时结果表明丽斑尾凤蝶和二尾凤蝶的COⅠ基因没有序列差异。对这2个物种3个个体的COⅡ基因进行了测序,结果也没有序列的差异,表明丽斑尾凤蝶和二尾凤蝶可能是同物异名。而三尾凤蝶的遗传多样性较为贫乏。 展开更多
关键词 鳞翅目 凤蝶科 尾凤蝶属 COⅠ基因 系统发生 遗传多样性.
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从Cyt b基因序列探讨鹿亚科动物的系统发生关系 被引量:31
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作者 刘向华 王义权 +1 位作者 刘忠权 周开亚 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期27-33,共7页
鹿亚科共有 4个属 ,各属间和属内特别是鹿属内的系统进化关系存在疑义。根据Cytb基因序列分析 ,探讨了鹿亚科及中国鹿属、马鹿亚种的进化关系。结果分析表明 :现行分类系统中 ,斑鹿属可能并非单系发生 ,暗示应将豚鹿并入鹿属 ;麋鹿属与... 鹿亚科共有 4个属 ,各属间和属内特别是鹿属内的系统进化关系存在疑义。根据Cytb基因序列分析 ,探讨了鹿亚科及中国鹿属、马鹿亚种的进化关系。结果分析表明 :现行分类系统中 ,斑鹿属可能并非单系发生 ,暗示应将豚鹿并入鹿属 ;麋鹿属与鹿属有较近的进化关系 ,也应并入鹿属 ;鹿属的进化地位有待进一步研究 ;归并后的鹿属为单系发生。中国马鹿各亚种在系统发生上是一单系群 ,其中马鹿天山亚种和阿尔泰亚种聚为最原始的一支。 展开更多
关键词 CYT B基因序列 鹿亚科动物 系统发生关系 进化关系
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中国蝮属蛇类的RAPD分析 被引量:34
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作者 沈曦 周开亚 王义权 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 1999年第1期40-48,共9页
用 RAPD技术研究了我国 5种蝮属蛇类 (中介蝮、蛇岛蝮、短尾蝮、高原蝮、乌苏里蝮 )的系统发生关系。研究中使用了 33个蝮蛇标本和 2个草原蝰标本 ,用 1 1个引物对样品分别作 RAPD扩增 ,获得 72个扩增片段。以 UPGMA法聚类 ,推测系统发... 用 RAPD技术研究了我国 5种蝮属蛇类 (中介蝮、蛇岛蝮、短尾蝮、高原蝮、乌苏里蝮 )的系统发生关系。研究中使用了 33个蝮蛇标本和 2个草原蝰标本 ,用 1 1个引物对样品分别作 RAPD扩增 ,获得 72个扩增片段。以 UPGMA法聚类 ,推测系统发生关系。上述每一种均各自先聚为一类。中介蝮有较大的种下分化。中介蝮的甘肃标本、宁夏标本、指名亚种及黑眉亚种间有一定的遗传距离。蛇岛蝮与中介蝮各亚种 (种群 )间的遗传距离更大。短尾蝮的江、浙、皖标本间的关系接近而它们与陕西标本间的关系较远。甘肃和陕西高海拔地区的蝮蛇标本可能同属于高原蝮。乌苏里蝮是中国蝮属蛇类最基部的分支。 展开更多
关键词 蝮蛇 基因组DNA RAPD 系统发生关系
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