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应用微卫星分型方法进行大熊猫父亲鉴定
被引量:
36
1
作者
张志和
沈富军
+3 位作者
孙姗
Victor A.David
张安居
Stephen J.O'Brien
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期504-510,共7页
选用18对大熊猫特异的微卫星引物对成都动物园、成都大熊猫繁育研究基地的大熊猫幼子及其母亲和可疑父亲DNA作了PCR扩增。扩增产物在ABI373测序仪上做基因扫描。应用Genotyper672软件处理分型数据,经Cervus2.0软件对亲子关系进行分析。...
选用18对大熊猫特异的微卫星引物对成都动物园、成都大熊猫繁育研究基地的大熊猫幼子及其母亲和可疑父亲DNA作了PCR扩增。扩增产物在ABI373测序仪上做基因扫描。应用Genotyper672软件处理分型数据,经Cervus2.0软件对亲子关系进行分析。结果表明,在母子关系确实的情况下,18个基因座联合的父亲鉴定排除概率E为0.999921,置信度为95%。而在母子关系不清的条件下,E=0.994109,但置信度低于80%。由于圈养大熊猫的母子关系都是确实的。因此,基因型分析的结果能有效确认出这些大熊猫之间的父子关系。但要准确鉴定出野生大熊猫的亲缘关系,我们还需更多的微卫星标记。
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关键词
微卫星
基因分型
大熊猫
亲子鉴定
下载PDF
职称材料
基于DNA分子标记的花粉流动态分析
被引量:
5
2
作者
周伟
王红
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期97-108,共12页
花粉介导的基因流是植物有性繁殖世代之间的桥梁,花粉散布属性是植物繁殖生态学、保护生物学和进化生物学研究关注的焦点。随着DNA分子技术的发展,花粉流分析所使用的分子标记(尤其是微卫星标记)逐步替代了早期物理标记,基于最大似然法...
花粉介导的基因流是植物有性繁殖世代之间的桥梁,花粉散布属性是植物繁殖生态学、保护生物学和进化生物学研究关注的焦点。随着DNA分子技术的发展,花粉流分析所使用的分子标记(尤其是微卫星标记)逐步替代了早期物理标记,基于最大似然法估计以及新兴的基于贝叶斯推断的父本指派算法的发展,能有效地估计花粉流散布的方向、距离和强度等重要特征。花粉散布曲线由单一参数向多参数模型发展,以更好地获得花粉散布特征的拟合效果,双组分的复合模型利用相互独立的参数空间使得散布曲线在长距离和短距离形状上呈现更大的可塑性。这些革新的技术和方法被成功应用于植物性别表型、隔离种群和杂交物种间花粉流分析,以探讨进化、生态和保护等多领域的基础理论问题。近年来,高通量测序技术的发展将进一步加快以分子标记为基础的花粉流动态分析在更广泛的植物类群中运用。
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关键词
分子标记
基因流
花粉散布
亲本分析
父本指派
散布曲线
高通量测序
原文传递
题名
应用微卫星分型方法进行大熊猫父亲鉴定
被引量:
36
1
作者
张志和
沈富军
孙姗
Victor A.David
张安居
Stephen J.O'Brien
机构
成都大熊猫繁育研究基地
美国国立癌症研究所基因组多样性实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期504-510,共7页
文摘
选用18对大熊猫特异的微卫星引物对成都动物园、成都大熊猫繁育研究基地的大熊猫幼子及其母亲和可疑父亲DNA作了PCR扩增。扩增产物在ABI373测序仪上做基因扫描。应用Genotyper672软件处理分型数据,经Cervus2.0软件对亲子关系进行分析。结果表明,在母子关系确实的情况下,18个基因座联合的父亲鉴定排除概率E为0.999921,置信度为95%。而在母子关系不清的条件下,E=0.994109,但置信度低于80%。由于圈养大熊猫的母子关系都是确实的。因此,基因型分析的结果能有效确认出这些大熊猫之间的父子关系。但要准确鉴定出野生大熊猫的亲缘关系,我们还需更多的微卫星标记。
关键词
微卫星
基因分型
大熊猫
亲子鉴定
Keywords
microsatellite
genotype
giant
panda
paternity
assignment
分类号
Q953 [生物学—动物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于DNA分子标记的花粉流动态分析
被引量:
5
2
作者
周伟
王红
机构
中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室
中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期97-108,共12页
基金
国家青年科学基金(31200289)
中国科学院重点部署项目(KSZD-EW-Z-011)
云南省应用基础研究计划项目(2012FB182)
文摘
花粉介导的基因流是植物有性繁殖世代之间的桥梁,花粉散布属性是植物繁殖生态学、保护生物学和进化生物学研究关注的焦点。随着DNA分子技术的发展,花粉流分析所使用的分子标记(尤其是微卫星标记)逐步替代了早期物理标记,基于最大似然法估计以及新兴的基于贝叶斯推断的父本指派算法的发展,能有效地估计花粉流散布的方向、距离和强度等重要特征。花粉散布曲线由单一参数向多参数模型发展,以更好地获得花粉散布特征的拟合效果,双组分的复合模型利用相互独立的参数空间使得散布曲线在长距离和短距离形状上呈现更大的可塑性。这些革新的技术和方法被成功应用于植物性别表型、隔离种群和杂交物种间花粉流分析,以探讨进化、生态和保护等多领域的基础理论问题。近年来,高通量测序技术的发展将进一步加快以分子标记为基础的花粉流动态分析在更广泛的植物类群中运用。
关键词
分子标记
基因流
花粉散布
亲本分析
父本指派
散布曲线
高通量测序
Keywords
molecular
marker,
gene
flow,
pollen
dispersal,
parentage
analysis,
paternity
assignment
,
dispersal
kernel,
next-generation
sequencing
分类号
Q948 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用微卫星分型方法进行大熊猫父亲鉴定
张志和
沈富军
孙姗
Victor A.David
张安居
Stephen J.O'Brien
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2003
36
下载PDF
职称材料
2
基于DNA分子标记的花粉流动态分析
周伟
王红
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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