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玉米杂交种DNA指纹图谱及其在亲子鉴定中的应用 被引量:60
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作者 李晓辉 李新海 +4 位作者 高文伟 田清震 李明顺 马凤鸣 张世煌 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期386-391,共6页
采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术... 采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术和单籽粒DNA快速提取方法,DNA指纹数据库和判别标准可有效地用于玉米杂交种的亲子鉴定。 展开更多
关键词 玉米 SSR标记 DNA指纹 亲子鉴定
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应用RAPD分子标记分析“晚绿”品种的杂交亲本 被引量:47
2
作者 梁月荣 田中淳一 武田善行 《茶叶科学》 CAS CSCD 2000年第1期22-26,共5页
应用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对茶树无性系品种“晚绿”进行亲子关系分析。所用 10 8条随机引物中的 93条引物对日本静冈和枕畸两地取样的 6个无性系茶树品种的 8份材料的基因组DNA分别扩增出 1- 8条谱带 ,平均每条引物 3 5条。其... 应用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术对茶树无性系品种“晚绿”进行亲子关系分析。所用 10 8条随机引物中的 93条引物对日本静冈和枕畸两地取样的 6个无性系茶树品种的 8份材料的基因组DNA分别扩增出 1- 8条谱带 ,平均每条引物 3 5条。其中 19条引物扩增出“晚绿”与其母本“数北”不同的RAPD分子标记 30个。从中选择 6条引物对 8份供试材料的基因组DNA鉴定表明 ,其中 4个RAPD分子标记显示出“晚绿”品种特异性 ,说明包括“静在 16”在内的 4个供试品种都不是“晚绿”的真正父本。本文还证明 。 展开更多
关键词 茶树 RAPD 亲子鉴定
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云南大叶茶与汝城白毛茶杂交后代的RAPD亲子鉴定 被引量:28
3
作者 黎星辉 施兆鹏 +3 位作者 刘春林 罗军武 沈程文 龚志华 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期99-102,共4页
应用随机扩增多态性DNA (RAPD)分子标记技术 ,对云南大叶茶 (C .sinensis)与汝城白毛茶 (C .ptilophylla)进行人工杂交所获得的F1代植株进行了亲子鉴定。结果表明 ,13个随机引物在第 1个杂交后代( 1F1)中共扩增出 80条RAPD谱带 ,其中 7... 应用随机扩增多态性DNA (RAPD)分子标记技术 ,对云南大叶茶 (C .sinensis)与汝城白毛茶 (C .ptilophylla)进行人工杂交所获得的F1代植株进行了亲子鉴定。结果表明 ,13个随机引物在第 1个杂交后代( 1F1)中共扩增出 80条RAPD谱带 ,其中 79条能在双亲中检出 ,另 1条为 1F1自身的特异带 ,卡平方检验表明在 1F1中扩增出的谱带数与亲本中各对应位点所显示的谱带数之间没有显著差异 ;在第 2个杂交后代( 2F1)中共扩增出 75条谱带 ,在第 3个杂交后代 ( 3F1)中共扩增出 77条谱带 ,均能在双亲中检出 ;结果说明这 展开更多
关键词 RADP 亲子鉴定 人工杂交 F1代植株 云南大叶茶 汝城白毛茶
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利用微卫星DNA技术进行绵羊亲子鉴定 被引量:19
4
作者 孙业良 谢庄 +3 位作者 刘国庆 任航行 王刚 代蓉 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期301-305,共5页
利用9个微卫星DNA对9头陶赛特羊DNA进行扩增,每3对微卫星DNA扩增产物混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测。采用已确定母女关系的2头陶赛特羊和7个嫌疑父亲的耳组织为样本,对1头母本已知的陶赛特羊在嫌疑父本中找出父本,并计算父权概... 利用9个微卫星DNA对9头陶赛特羊DNA进行扩增,每3对微卫星DNA扩增产物混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测。采用已确定母女关系的2头陶赛特羊和7个嫌疑父亲的耳组织为样本,对1头母本已知的陶赛特羊在嫌疑父本中找出父本,并计算父权概率为99.997%。 展开更多
关键词 微卫星DNA 绵羊 亲子鉴定
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大菱鲆亲子鉴定的微卫星多重PCR技术建立及应用 被引量:29
5
作者 苗贵东 杜民 +3 位作者 杨景峰 徐营 樊廷俊 陈松林 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期97-106,共10页
用8个微卫星标记组合建立了2个微卫星多重PCR体系,对大菱鲆7个人工选育家系进行了系谱认证、亲子鉴定和遗传多样性研究。2个多重PCR体系中8个微卫星位点共检测到等位基因49个,每个位点等位基因数为3~8个。根据已知亲本及子代基因型,成... 用8个微卫星标记组合建立了2个微卫星多重PCR体系,对大菱鲆7个人工选育家系进行了系谱认证、亲子鉴定和遗传多样性研究。2个多重PCR体系中8个微卫星位点共检测到等位基因49个,每个位点等位基因数为3~8个。根据已知亲本及子代基因型,成功推断出了3个缺失亲本的基因型。在双亲未知的情况下2个多重PCR的8个微卫星位点累积排除概率是96.58%,已知1个亲本时累积排除率为99.71%,亲子鉴定准确率为96.42%。采用70个个体进行双盲验证,利用UPGMA法对7个家系的70个体进行了聚类分析,同一家系95.71%的个体聚类分析结果与系谱来源一致。Cervus 2.0软件亲子鉴定结果表明亲子鉴定准确率为92.86%。2个多重PCR体系的建立为大菱鲆不同家系混养后的亲子鉴定、系谱分析和分子辅助家系管理提供了技术手段。 展开更多
关键词 大菱鲆 微卫星 多重PCR 亲子鉴定 系谱认证
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云南大理茶与福鼎大白茶种间杂交幼胚的组织培养及亲子鉴定 被引量:27
6
作者 刘本英 周健 +5 位作者 许玫 唐一春 王丽鸳 成浩 张小飞 王平盛 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期735-740,共6页
为解决茶树种间杂交不亲和及F1代生长发育困难等问题,在云南大理茶[Camellia taliensis(W.W.Smish)Melchior]与福鼎大白茶(C.sinensis‘Fuding Dabaicha’)间进行了种间杂交试验,随机选取9个F1代杂种幼胚进行了组织培养,其余杂种田间播... 为解决茶树种间杂交不亲和及F1代生长发育困难等问题,在云南大理茶[Camellia taliensis(W.W.Smish)Melchior]与福鼎大白茶(C.sinensis‘Fuding Dabaicha’)间进行了种间杂交试验,随机选取9个F1代杂种幼胚进行了组织培养,其余杂种田间播种,获得福鼎大白茶(♀)×云南大理茶(♂)杂交组合的3个幼胚组培苗株系,而播种的萌芽率为零。应用简单重复区间序列(ISSR)分子标记技术对F1代组培苗进行了亲子鉴定,其中15个随机引物在第1株杂交后代(F1-1)中共扩增出283条ISSR谱带,包括能在双亲中检出的275条和F1-1自身的特异带8条。在第2株杂交后代(F1-2)中有282条谱带能在双亲中检出,在第3株杂交后代(F1-3)中有288条谱带能在双亲中检出。卡平方检验表明,在F1-1、F1-2及F1-3中扩增出的谱带数与亲本中各对应位点所显示的谱带数之间没有显著差异。ISSR鉴定结果证实了杂种的真实性。 展开更多
关键词 云南大理茶 福鼎大白茶 种间杂交 幼胚组培 亲子鉴定
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RAPD分子标记技术在茶树亲子鉴定中的应用 被引量:16
7
作者 罗军武 施兆鹏 +3 位作者 李家贤 沈程文 黄意欢 龚志华 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期502-505,共4页
为给茶树种质资源的鉴定、品种鉴定、亲子鉴定提供科学方法 ,通过对 3个人工杂交组合的亲本及 F1 代进行 RAPD分析 .结果显示 :双亲的 RAPD谱带能在其 F1 代中表现出来 ,表现率分别为 94.90 % ,97.92 % ,98.64 % ,说明 3个杂交单株是其... 为给茶树种质资源的鉴定、品种鉴定、亲子鉴定提供科学方法 ,通过对 3个人工杂交组合的亲本及 F1 代进行 RAPD分析 .结果显示 :双亲的 RAPD谱带能在其 F1 代中表现出来 ,表现率分别为 94.90 % ,97.92 % ,98.64 % ,说明 3个杂交单株是其亲本的真正后代 ,这也表明 RAPD技术在亲子鉴定中具有很强的适用性 .同时从 3个杂交组合的 RAPD分析结果可以看出 ,双亲的 RAPD谱带在 F1 代出现分离现象 。 展开更多
关键词 RAPD分子标记技术 应用 茶树 亲子鉴定
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应用6个STR基因座进行奶牛亲子鉴定 被引量:13
8
作者 贾名威 杨利国 +2 位作者 管峰 陆汉希 金穗华 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期74-77,共4页
运用PCR技术用BM 2 1 1 3、BM 1 86 2、BMc 70 1、BM 2 934、TGLA 1 2 2、BM 72 0共 6个STR (短串联重复序列 )基因座对 7头奶牛DNA进行扩增 ,扩增产物分两组混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测 ,扩增片段互不干扰。采用已确定母女... 运用PCR技术用BM 2 1 1 3、BM 1 86 2、BMc 70 1、BM 2 934、TGLA 1 2 2、BM 72 0共 6个STR (短串联重复序列 )基因座对 7头奶牛DNA进行扩增 ,扩增产物分两组混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测 ,扩增片段互不干扰。采用已确定母女关系的 2头奶牛血液样本和 5个嫌疑父亲的精液样本 ,对一头母本已知的奶牛在嫌疑父本中找出父本 ,并计算父权概率为 99 993%。结果证明 。 展开更多
关键词 奶牛 亲子鉴定 STR基因座 PCR技术
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微卫星三重PCR基因扫描技术在中国明对虾家系标识中的应用 被引量:16
9
作者 孔杰 高焕 +5 位作者 于飞 罗坤 王伟继 孟宪红 刘萍 张天时 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期59-66,共8页
在开发中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)微卫星引物的基础上,利用3对微卫星引物,克隆编号分别为H081、RS0683和RS1101,构建中国明对虾的三重PCR稳定扩增体系。在此基础上,进一步利用荧光标记引物的基因扫描技术(Genescan)对利用精... 在开发中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)微卫星引物的基础上,利用3对微卫星引物,克隆编号分别为H081、RS0683和RS1101,构建中国明对虾的三重PCR稳定扩增体系。在此基础上,进一步利用荧光标记引物的基因扫描技术(Genescan)对利用精荚移植技术建立的中国明对虾7个半同胞家系和16个全同胞家系进行识别研究。结果表明,该项技术可以准确地把7个半同胞家系的子代个体间、16个全同胞家系的子代个体间以及总的31个全同胞家系的子代个体间区别开,且能准确把这些家系产生的任意子代个体定位到各个家系。该技术可以满足大批量家系材料样本的分析,具有较好的应用价值。[中国水产科学,2007,14(1):59-66] 展开更多
关键词 微卫星 三重PCR 基因扫描 中国明对虾 家系识别
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利用10个STR-DNA的多态性进行警犬亲子鉴定 被引量:11
10
作者 叶俊华 麻俊武 +4 位作者 杨前勇 马长书 郭源梅 徐黎 黄路生 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期110-113,共4页
采用多重PCR和四色荧光 ( 5′FAM、JOE、NED和ROX)自动化检测技术调查中国警犬种犬PEZ1、FHC2054、FHC2010、PEZ5、PEZ20、PEZ12、PEZ3、PEZ6、PEZ8和FHC2079等 10个STR基因座多态性,并计算该10个基因座的等位基因频率(P)、杂合度(H)、... 采用多重PCR和四色荧光 ( 5′FAM、JOE、NED和ROX)自动化检测技术调查中国警犬种犬PEZ1、FHC2054、FHC2010、PEZ5、PEZ20、PEZ12、PEZ3、PEZ6、PEZ8和FHC2079等 10个STR基因座多态性,并计算该10个基因座的等位基因频率(P)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和非父排除率(PE)。实验警犬为 7个品种269头种犬。结果显示该 10个STR位点的非父排除率 (PE)为 99. 728 7%、个体识别力 (DP)为 99. 999 1%。共调查了 7个品种的 11个家系 48头犬的 10个STR基因座上的基因型,建立了警犬STR-DNA亲子鉴定方法。 展开更多
关键词 STR-DNA 警犬 亲子鉴定
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凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)微卫星多重PCR体系的建立及其在家系亲权鉴定中的应用 被引量:16
11
作者 李东宇 孔杰 +4 位作者 孟宪红 栾生 罗坤 卢霞 曹宝祥 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第3期58-67,共10页
为了在遗传分析研究中提高效率并节约成本,本研究从已报道的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)微卫星位点中选取多态性较高的位点,基于各位点的扩增片段大小及退火温度等因素进行微卫星位点的组合。通过不断优化位点组合、反应体系及反... 为了在遗传分析研究中提高效率并节约成本,本研究从已报道的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)微卫星位点中选取多态性较高的位点,基于各位点的扩增片段大小及退火温度等因素进行微卫星位点的组合。通过不断优化位点组合、反应体系及反应程序,成功建立了1个五重、2个四重和1个三重PCR反应体系,并将其应用于11个凡纳滨对虾家系的亲权鉴定。结果显示,四组多重PCR体系中的16个微卫星位点在11个凡纳滨对虾家系中的平均等位基因数(Na)为6,平均多态信息含量(PIC)为0.5813,平均观测杂合度(Ho)为0.513,平均期望杂合度(He)为0.636。利用Cervus3.0软件,对已知系谱关系的11个凡纳滨对虾家系进行亲权分析,其第一亲本累积排除率(CE-1P)、第二亲本累积排除率(CE-2P)和双亲累积排除率(CE-PP)分别为0.99525487、0.99990862和0.99999986。进一步分析表明,当同时使用四组多重PCR体系进行亲权分析时,其模拟配对率和亲权鉴定准确率均为100%,全同胞和半同胞家系鉴别效果良好,表现出准确的鉴别能力。本研究所建立的四组凡纳滨对虾微卫星多重PCR体系均可为后续的凡纳滨对虾遗传多样性分析和亲权鉴定提供高效、准确的检测手段。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 微卫星多重PCR 亲权鉴定
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利用微卫星DNA标记进行黄牛的亲子鉴定 被引量:13
12
作者 钱林东 张自芳 +3 位作者 田应华 袁峰 钱坤 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期69-74,共6页
亲子鉴定在畜牧业生产中具有重要实际应用价值,常见其用于建立准确的系谱档案和家畜归属的诉讼案件。其中标准的三联体(即在母子关系是已知的情况下,鉴定假设父亲与子畜是否有亲生关系)和单亲[即父子(女)或母子(女)亲生关系的确定]两种... 亲子鉴定在畜牧业生产中具有重要实际应用价值,常见其用于建立准确的系谱档案和家畜归属的诉讼案件。其中标准的三联体(即在母子关系是已知的情况下,鉴定假设父亲与子畜是否有亲生关系)和单亲[即父子(女)或母子(女)亲生关系的确定]两种情况下的亲子鉴定在畜牧生产中具有普遍意义。以云南文山黄牛为试验材料,采用10对常染色体微卫星DNA标记对这两种情况下的亲子关系进行了检测分析。结果表明,常染色体微卫星DNA标记在标准的三联体和单亲两种情况下都能用来进行亲子鉴定,结果较准确,但标准三联体情况下的亲子鉴定更准确。确定的不同模式下亲子鉴定的方法,可为家养动物亲子鉴定标准方法和流程的建立提供依据。 展开更多
关键词 DNA标记 微卫星DNA 亲子鉴定
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多倍体中华鲟微卫星亲子鉴定体系的建立 被引量:12
13
作者 辛苗苗 张书环 +4 位作者 汪登强 汪珂 张磊 霍来江 危起伟 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2015年第4期3-9,共7页
应用荧光引物和自动测序技术,检测了10个自主研发的微卫星分子标记在68个中华鲟( Acipenser sinensis)个体中的遗传多态性。结果表明,10个微卫星标记共检测到124个等位基因,等位基因数为7~22,期望杂合度为0.73026~0.87395, Sha... 应用荧光引物和自动测序技术,检测了10个自主研发的微卫星分子标记在68个中华鲟( Acipenser sinensis)个体中的遗传多态性。结果表明,10个微卫星标记共检测到124个等位基因,等位基因数为7~22,期望杂合度为0.73026~0.87395, Shannon-Wiener多样性指数为1.56161~2.21960。基于亲子鉴定排除率不低于0.99的标准,最终确定Asi-75067、 Asi-67648、 Asi-67123、 Asi-73843、 Asi-72040、 Asi-70421和Asi-56700等7个微卫星标记为中华鲟亲子鉴定的核心体系,其单亲、父权和双亲的累积排除率分别为99.12%、99.95%和99.99%。该微卫星标记组合为中华鲟准确高效经济的亲子鉴定体系建立提供了科学依据。 展开更多
关键词 微卫星 中华鲟( ACIPENSER sinensis) 亲子鉴定 多倍体 累积排除率
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一种基于高密度遗传标记的亲子鉴定方法及其应用 被引量:11
14
作者 张哲 罗元宇 +6 位作者 李晴晴 贺金龙 高宁 张豪 丁向东 张勤 李加琪 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期835-841,共7页
系谱是人类遗传及动植物育种研究与实践的重要信息来源之一。系谱记录错误是育种生产中普遍存在的一种记录错误,影响基因定位、遗传值及表型值预测等相关研究结果的可靠性。现有的方法软件可以利用遗传标记信息对疑似亲子进行亲子鉴定,... 系谱是人类遗传及动植物育种研究与实践的重要信息来源之一。系谱记录错误是育种生产中普遍存在的一种记录错误,影响基因定位、遗传值及表型值预测等相关研究结果的可靠性。现有的方法软件可以利用遗传标记信息对疑似亲子进行亲子鉴定,但这些软件方法操作复杂,限制标记数量,如Cervus。针对当前高密度SNP标记在人类及动植物研究中广泛应用的现状,文章提出了一种基于全基因组高密度SNP数据的亲子鉴定新方法,命名为EasyPC。对EasyPC及Cervus的运行效率进行了对比,并用中国荷斯坦牛(n=2180)和杜洛克猪(n=191)的全基因组SNP芯片数据对EasyPC进行了验证。结果表明:EasyPC运行效率高于Cervus,牛和猪群体系谱错误率分别为20%和6%,与相关研究报道相符。通过使用全基因组SNP标记对群体孟德尔错误率的经验分布进行分析,该方法不仅可以简单、快速、准确地判别系谱的正确性,而且还可以对错误系谱进行校正。EasyPC为解决全基因组研究中基因型及系谱数据前处理过程中的系谱校正问题提供了一种新的途径。 展开更多
关键词 亲子鉴定 系谱校正 遗传标记 孟德尔错误 动物育种
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Identification of the Parentage of Corn Variety Using SSR Markers 被引量:11
15
作者 沈童伟 陆徐忠 +2 位作者 刘勋辉 李莉 杨剑波 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第4期55-60,共6页
[Objective] The study was to explore the molecular interpretation standards on parentage in the seeds of corn variety. [Method] With 16 hybrids and their parents and 202 inbred elites as materials for screening primer... [Objective] The study was to explore the molecular interpretation standards on parentage in the seeds of corn variety. [Method] With 16 hybrids and their parents and 202 inbred elites as materials for screening primers, the artificial groups of two standard diad and two standard triad were respectively established as the verification materials. Genomic DNA of seedlings was extracted by using CTAB method. 137 pairs of SSR primers were selected for SSR amplification and product detection, which was used for the parentage identification of maize varieties. [ Result] Twenty pairs of corn primers with high polymorphism information content ( PIC value), clearly amplified bands and good reproducibility were screened from 137 pairs of corn SSR primers tested. The identification results of using SSR molecular were consistent with the actual situation. [ Conclusion] It is feasible to identify the parentage of maize variety using SSR markers. 展开更多
关键词 MAIZE SSR marker Corn primer parentage identification
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SSR标记鉴定玉米品种亲子关系的研究 被引量:10
16
作者 沈童伟 陆徐忠 +2 位作者 刘勋辉 李莉 杨剑波 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第25期12347-12350,12360,共5页
[目的]探讨杂交玉米品种亲子关系的分子检测判读标准。[方法]以16个玉米杂交种及其双亲和202个骨干自交系为引物筛选材料,分别构建2个二联体亲子鉴定盲样和2个三联体亲子鉴定盲样,用CTAB法提取幼苗叶片DNA,选137对SSR引物进行玉米品种... [目的]探讨杂交玉米品种亲子关系的分子检测判读标准。[方法]以16个玉米杂交种及其双亲和202个骨干自交系为引物筛选材料,分别构建2个二联体亲子鉴定盲样和2个三联体亲子鉴定盲样,用CTAB法提取幼苗叶片DNA,选137对SSR引物进行玉米品种的亲子检测。[结果]从137对SSR引物中筛选出了多态性信息含量(PIC值)高、扩增条带清晰和重复性好的20对核心引物。SSR分子检测结果与实际情况一致。[结论]利用SSR标记技术鉴定玉米品种亲子关系的方法是可行的。 展开更多
关键词 玉米 SSR标记 核心引物 亲子鉴定
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草鱼的微卫星亲权鉴定 被引量:8
17
作者 任昆 白俊杰 +2 位作者 樊佳佳 全迎春 于凌云 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1367-1371,共5页
【目的】从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础。【方法】利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F0)及其子代(F1)的基因型,以Cervus3.0软件进行亲... 【目的】从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础。【方法】利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F0)及其子代(F1)的基因型,以Cervus3.0软件进行亲权鉴定,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、多态信息含量(PIC)、观测杂合度(H0)和期望杂合度(He)等;最后通过模拟分析和试验验证,评估8个微卫星位点最多可鉴定的亲本数及其与鉴定率、置信度之间的关系。【结果】8个微卫星位点中,当两个亲本基因型未知时,单个亲本排除率(E-1P)介于0.342-0.668,平均值为0.520;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)介于0.521-0.802,平均值为0.681;一对亲本组合的亲权排除率(E-PP)介于0.711-0.937,平均值为0.847。以95%置信水平和100%鉴定率为标准,模拟分析及试验验证结果表明,所选择的8个微卫星位点最多可以鉴定598个已知性别的亲本或431个未知性别的亲本。【结论】所选的H118、H137、H165、H148、4703、C2489、H57、H81等8对微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取草鱼系谱信息。 展开更多
关键词 草鱼 微卫星标记 亲权鉴定 系谱信息 置信度 亲权排除率 鉴别准确率
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应用ISSR标记对茶树新品种佛香茶亲本的鉴定 被引量:9
18
作者 汪云刚 孙雪梅 +7 位作者 李友勇 蒋会兵 宋维希 刘本英 张艳梅 马玲 矣兵 段志芬 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期149-154,共6页
为了明确佛香茶新品种的亲本来源,应用ISSR标记技术对佛香茶及其拟似亲本共15份材料进行亲缘关系分析。18个引物共扩增出235个位点,其中198个位点呈现多态性,多态性为84.25%,表明15个品种间遗传基础较窄。品种间相似系数变幅为0.580~0.8... 为了明确佛香茶新品种的亲本来源,应用ISSR标记技术对佛香茶及其拟似亲本共15份材料进行亲缘关系分析。18个引物共扩增出235个位点,其中198个位点呈现多态性,多态性为84.25%,表明15个品种间遗传基础较窄。品种间相似系数变幅为0.580~0.860,平均0.724。相似系数分析表明,佛香1号、云抗10号和福鼎大白茶的相似系数比较一致;佛香2号、佛香4号、云抗14号、福鼎大白茶的相似系数较一致;而佛香3号、佛香5号、长叶白毫、福鼎大白茶的相似系数基本一致。UPGMA聚类则将佛香茶与云抗10号、长叶白毫、云抗14号、福鼎大白茶聚在一起。主成分分析显示,佛香1号与云抗10号距离较近;佛香2号、佛香4号、云抗14号之间距离较近;佛香3号、佛香5号、长叶白毫之间距离较近;而福鼎大白茶则处于中心位置,表明福鼎大白茶为佛香茶亲本之一。ISSR标记分析结果明确了佛香茶的亲本来源:佛香1号的亲本是云抗10号与福鼎大白茶;佛香2号、佛香4号的亲本是云抗14号与福鼎大白茶;佛香3号、佛香5号的亲本是长叶白毫与福鼎大白茶。 展开更多
关键词 佛香茶 ISSR 亲本 鉴定
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基于粪便DNA的小麂亲权鉴定和婚配制研究 被引量:9
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作者 任鹏 龚堃 +3 位作者 鲍毅新 黄相相 周晓 韩金巧 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第20期6933-6944,共12页
2014年4月至2015年1月,在古田山国家级自然保护区内共收集634份粪便样本,2份肌肉样本。通过严格筛选,最终获得390份可用于PCR扩增的样本。用多态性较高的8个微卫星位点进行基因型分型,共识别出177个小麂个体。SRY基因性别鉴定显示研究... 2014年4月至2015年1月,在古田山国家级自然保护区内共收集634份粪便样本,2份肌肉样本。通过严格筛选,最终获得390份可用于PCR扩增的样本。用多态性较高的8个微卫星位点进行基因型分型,共识别出177个小麂个体。SRY基因性别鉴定显示研究样本中雄性84只,雌性93只。所使用的8个微卫星位点在177个样本中,平均等位基因数(A)为11,平均观测杂合度(Ho)在0.960—1.000之间,平均值为0.9685,平均期望杂合度(He)在0.799—0.887之间,平均值为0.8429,多态信息含量(PIC)在0.766—0.872之间,平均多态信息含量为0.8214,基因杂合度水平较高,为遗传多样性丰富的种群。采用Cervus3.0进行亲权分析,当置信度为95%和80%时,8个微卫星位点的鉴定率均达到100%。共鉴定出父-母-子24对,母-子23对,父-子19对,涉及到104只个体。根据亲缘关系分析小麂的婚配制,结果发现小麂的婚配制属于1雄多雌,但并不是目前所知的亚型,而可能是一种被称作"检查策略"的一雄多雌制。 展开更多
关键词 小麂 亲权鉴定 遗传多样性 婚配制
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黄河鲤全同胞家系的微卫星标记亲子鉴定 被引量:9
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作者 王新华 俞小牧 +1 位作者 冯建新 童金苟 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1023-1031,共9页
本研究利用11个高度多态的微卫星标记对26个黄河鲤(Cyprinus carpio haematoperus)全同胞家系中的417尾体重较大的正常体色个体(黄河鲤较大个体)和52尾红色个体(红鲤表型个体)进行了亲子鉴定。11个微卫星座位的平均等位基因数、平均观... 本研究利用11个高度多态的微卫星标记对26个黄河鲤(Cyprinus carpio haematoperus)全同胞家系中的417尾体重较大的正常体色个体(黄河鲤较大个体)和52尾红色个体(红鲤表型个体)进行了亲子鉴定。11个微卫星座位的平均等位基因数、平均观测杂合度(H_o)、平均期望杂合度(H_e)和平均多态信息含量(PIC)分别为8.2、0.792、0.792和0.76。当双亲未知且置信度为95%时,11个座位的累积排除概率达99.79%。除29尾黄河鲤较大个体以外,388尾黄河鲤较大个体和52尾红鲤表型个体准确地找到了其父母本,实际鉴定率为93.82%。通过对子代数目超过20尾的7个黄河鲤家系生长性状的比较分析,本研究成功鉴定出子代生长性状优良的黄河鲤亲本组合及其家系,同时也鉴定出包含隐性红色基因的黄河鲤杂合亲本,为进一步选育表型和体色纯正且生长快速的黄河鲤新品种提供了理论依据和技术手段。 展开更多
关键词 黄河鲤 亲子鉴定 微卫星 鉴定率
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