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珠三角及邻地鸭疫里默氏杆菌主要生物学特性的研究 被引量:25
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作者 张济培 张小峰 +2 位作者 陈建红 罗满林 司兴奎 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期100-103,共4页
为明确珠三角地区鸭疫里默氏杆菌(RA)的药物敏感性、血清型类型及其同源性,本研究对100株鸭源及鹅源RA进行分离与鉴定,并采用琼脂扩散试验进行血清型分类及其对12种药物的敏感性试验;选取10个代表株测定其对7日龄雏鸭的致病性及ompA基... 为明确珠三角地区鸭疫里默氏杆菌(RA)的药物敏感性、血清型类型及其同源性,本研究对100株鸭源及鹅源RA进行分离与鉴定,并采用琼脂扩散试验进行血清型分类及其对12种药物的敏感性试验;选取10个代表株测定其对7日龄雏鸭的致病性及ompA基因序列,比较相互间的同源性以及其它生物特性的关系。结果表明:分离株的生化特性基本一致,代表株对雏鸭具有强的致病性;所有菌株具有一重以上的耐药性,63株细菌具有双重或多重耐药性,97%的菌株对奥格门丁敏感,其它药物敏感度依次为壮观霉素、青霉素、环丙沙星、氨苄西林、链霉素、诺氟沙星、罗红霉素、磺胺甲噁唑、利福平和卡那霉素;93%的菌株对庆大霉素耐药,表明该地区RA对大部分常用药物产生一重或多重耐药;100株菌株分属于4种血清型,其中83株属于血清1型,属于其它3个血清型的菌株分别有10株、5株和2株,以第4种血清型致病性最强;10个代表株中9株的外膜蛋白基因序列同源性达96%以上,5株为100%,1株与其它株的同源性为90.1%~90.4%,表明10株菌的外膜蛋白基因序列的同源性较高,外膜蛋白基因与血清型和菌株的致病性无直接关系。 展开更多
关键词 鸭疫里默氏杆菌 血清型 耐药性 致病性 ompa基因
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广东连平县存在新的蜱传斑点热立克次体 被引量:9
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作者 张丽娟 张景山 +1 位作者 付秀萍 孪明春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期697-700,共4页
目的对采自广东省连平县的3种硬蜱进行蜱传斑点热立克次体检测分析。方法斑点热立克次体的ompA基因片段扩增并测定扩增片段的DNA序列。结果20只蜱分为17组,其中15组PCR检测阳性。对4个测序成功的标本进行聚类分析,证实其中3个序列单独... 目的对采自广东省连平县的3种硬蜱进行蜱传斑点热立克次体检测分析。方法斑点热立克次体的ompA基因片段扩增并测定扩增片段的DNA序列。结果20只蜱分为17组,其中15组PCR检测阳性。对4个测序成功的标本进行聚类分析,证实其中3个序列单独聚为一类,与引起Flinders岛蜱传斑点热的弗诺立克次体(R.honei)、非洲蜱咬热的非洲立克次体(R.africa)、未定名斑点热的斯洛伐克立克次体(R.slovaca)以及西伯利亚立克次体BJ-90株等亲缘关系较近,另一序列与我国长白山地区检测到的JL-02具有较高的同源性。结论本研究提示该地区除了已证实的西伯利亚斑点热外,还存在新的蜱传斑点热。 展开更多
关键词 蜱传疾病 斑点热群立克次体 ompa基因
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种特异性PCR快速检测奶粉中阪崎肠杆菌研究 被引量:8
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作者 叶应旺 吴清平 +2 位作者 郭伟鹏 张菊梅 董晓晖 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期1192-1197,共6页
阪崎肠杆菌是一种目前认为以奶粉为传播媒介的食源性条件致病菌,通过α-1,4-葡萄糖苷酶基因和ompA基因分别设计引物ESF-ESR和ESSF-ESSR,进行单重和双重PCR方法研究,结果显示所有阪崎肠杆菌菌株PCR扩增均为阳性,阴性对照均未扩增出目的片... 阪崎肠杆菌是一种目前认为以奶粉为传播媒介的食源性条件致病菌,通过α-1,4-葡萄糖苷酶基因和ompA基因分别设计引物ESF-ESR和ESSF-ESSR,进行单重和双重PCR方法研究,结果显示所有阪崎肠杆菌菌株PCR扩增均为阳性,阴性对照均未扩增出目的片段;纯菌单重PCR灵敏度分别为102cfu/mL和101cfu/mL,双重PCR灵敏度为103cfu/mL;在有或无其他细菌存在时,人工污染阪崎肠杆菌模拟样品单重PCR检测灵敏度分别为103cfu/mL和102cfu/mL,双重PCR检测灵敏度为104cfu/mL;实际样品检测显示PCR方法与传统方法具有很好的一致性。结果表明:该PCR方法具有很好的种特异性和灵敏度,能够克服奶粉中杂菌对快速检测阪崎肠杆菌造成的干扰,减少以保守序列来设计引物导致假阳性结果的出现,可以较好地应用于奶粉中阪崎肠杆菌的检测与鉴定。 展开更多
关键词 阪崎肠杆菌 α-1 4-葡萄糖苷酶基因 ompa基因 奶粉
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鸭致病性大肠杆菌外膜蛋白型研究 被引量:7
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作者 于学辉 程安春 +5 位作者 汪铭书 汤承 王远微 王英 岳华 张焕容 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期554-560,共7页
测定了从我国分离到的130株鸭病原性大肠杆菌外膜蛋白型(Outer membrane protein patterns,OMP型),其中O93、O92、O78和O76优势血清型53株,O46等30个其他血清型分离株77株,这些分离株共产生了4个OMP型,其中OMP-1型81株,占62.3%(81/13... 测定了从我国分离到的130株鸭病原性大肠杆菌外膜蛋白型(Outer membrane protein patterns,OMP型),其中O93、O92、O78和O76优势血清型53株,O46等30个其他血清型分离株77株,这些分离株共产生了4个OMP型,其中OMP-1型81株,占62.3%(81/130),覆盖O93、O92、O78和O76等29个血清型,占85.3%(29/34),为主要的OMP型;根据GenBank中大肠杆菌K-12外膜蛋白A基因(ompA)的核苷酸序列设计引物,从9株优势血清型和1株O46血清型的鸭大肠杆菌中分别扩增得到ompA基因,进行序列测定及分析,发现优势血清型9个菌株的ompA均由1 171个碱基组成,均只有1个大的开放阅读框(ORF),长1 053 bp,编码由350个氨基酸组成的前外膜蛋白A(pro-OmpA),前21个氨基酸残基组成信号肽,成熟的OmpA由329个氨基酸残基组成;O46菌株的ORF全长1 041 bp,在400-411 bp位缺失了12个碱基,成熟的OmpA由325个氨基酸残基组成;10个鸭致病性E.coli的ompA基因核苷酸序列高度同源,相似性达95.8%~100%。 展开更多
关键词 致病性大肠杆菌 外膜蛋白型 ompa基因 序列分析
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多杀性巴氏杆菌OmpA基因的原核表达及生物信息学分析 被引量:7
5
作者 郑义盈 李宝宝 +10 位作者 黄海峰 张振兴 章泸尹 张萌萌 安琪 王成强 陈杰 李彬 陈珍 杜丽 王凤阳 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第7期1926-1934,共9页
本试验旨在探究羊源多杀性巴氏杆菌OmpA基因的原核表达及其生物信息学特征。以羊源多杀性巴氏杆菌HN-01株基因组为模板,设计特异性引物扩增OmpA基因;构建pET-28a(+)-OmpA重组质粒后转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,将鉴定正确的重组菌... 本试验旨在探究羊源多杀性巴氏杆菌OmpA基因的原核表达及其生物信息学特征。以羊源多杀性巴氏杆菌HN-01株基因组为模板,设计特异性引物扩增OmpA基因;构建pET-28a(+)-OmpA重组质粒后转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,将鉴定正确的重组菌经IPTG诱导表达;通过SDS-PAGE及Western blotting分析表达蛋白的特征,并运用生物信息学工具对OmpA基因序列进行分析。结果显示,羊源多杀性巴氏杆菌OmpA基因大小约为1044bp,该基因序列与HN-06株的同源性达89.72%。通过诱导后发现,pET-28a(+)-OmpA重组菌最佳诱导条件为1mmol/LIPTG37℃诱导6h,表达的重组蛋白大小约为40ku,以包涵体的形式存在。Western blotting结果显示,约40ku的重组蛋白携带His标签。经生物信息学分析,OmpA分子式为C1684H2619N457O505S3,属碱性疏水蛋白,其多肽链的1-21位氨基酸为信号肽区域,并具有多种结构。综上所述,OmpA可能具有特殊结构,与众多外膜蛋白结构特点相似。本研究构建了多杀性巴氏杆菌OmpA基因原核表达系统,优化诱导条件后能稳定获得OmpA重组蛋白,为进一步探究巴氏杆菌的致病机理提供理论依据。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 ompa基因 原核表达
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黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的核酸检测与序列分析 被引量:7
6
作者 左双燕 唐琨 +3 位作者 郑元春 霍秋波 宋玉东 曾小敏 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期443-447,共5页
目的:了解黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的感染情况。方法:运用聚合酶链反应方法对黑龙江地区采集的啮齿动物标本扩增斑点热群立克次体外膜蛋白A(OmpA)基因。阳性标本送测序并应用Mega5.0软件进行序列分析。结果:共检测鼠标本... 目的:了解黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的感染情况。方法:运用聚合酶链反应方法对黑龙江地区采集的啮齿动物标本扩增斑点热群立克次体外膜蛋白A(OmpA)基因。阳性标本送测序并应用Mega5.0软件进行序列分析。结果:共检测鼠标本514份,斑点热群立克次体的阳性率为9.3%(95%CI:7.1%~12.2%),牡丹江、绥芬河、同江和东宁四个地区斑点热群立克次体的阳性率分别为12.4%(39/314),5.3%(3/57),2.0%(1/51),5.4%(5/92),地区间阳性率差异有统计学意义(P=O.023)。感染斑点热群立克次体的有仓鼠、大仓鼠、大林姬鼠、褐家鼠、黑线姬鼠、红背鼠平、鼠句黯、棕背鼠平、东方田鼠、明纹花松鼠10种,鼠种间阳性率差异有统计学意义(P=O.002);棕背肝的阳性率最高,为22.1%(21/95)。测序结果显示鼠感染的斑点热群立克次体基因型是黑龙江立克次体基因型和一种新的未定种基因型。结论:黑龙江地区存在鼠感染黑龙江立克次体,同时可能存在未定种的新的斑点热群立克次体。 展开更多
关键词 斑点热群立克次体 ompa基因 序列分析
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赖型钩端螺旋体OmpA膜蛋白Loa22基因的克隆分析及蛋白表达 被引量:6
7
作者 朱海龙 鲍朗 +2 位作者 张会东 王晓樱 李岩 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期294-297,共4页
目的分析赖型钩端螺旋体OmpA膜蛋白Loa22的结构特征,并对其进行克隆表达。方法分别以问号状赖型钩体017株、56601株及双曲状钩体PatocI株基因组为模板PCR扩增目的基因。构建Loa22基因与质粒pGEX-4T-1的重组原核表达质粒,克隆筛选并测序... 目的分析赖型钩端螺旋体OmpA膜蛋白Loa22的结构特征,并对其进行克隆表达。方法分别以问号状赖型钩体017株、56601株及双曲状钩体PatocI株基因组为模板PCR扩增目的基因。构建Loa22基因与质粒pGEX-4T-1的重组原核表达质粒,克隆筛选并测序。利用Bioedit、Dnaman、PSIPRED、NCBI及SignaIP等对其结构进行分析。最后在大肠杆菌JM109中诱导表达目的蛋白。结果不同毒力赖型钩体均能扩增出约600bp的片段,而PatocI株则未能扩增出目的片段;PCR、双酶切及测序证实pGEX-Loa22构建成功:分析显示不同赖型钩体的Loa22的同源性很高,C末端都具有同OmpA一致的保守序列及肽聚糖相关基序,都有信号肽序列;表达产物经SDS-PAGE检测证明是目的蛋白。结论赖型钩体具有编码OmpA膜蛋白的Loa22基因,可能与赖型钩体毒力和免疫原性存在某种相关性。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 ompa基因 克隆 表达
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鸭疫里氏杆菌OmpA基因真核表达载体构建及免疫效果初步评价 被引量:6
8
作者 余波 李婷 +4 位作者 徐景峨 张亚楠 姜玲玲 周思旋 卜仕金 《畜牧与兽医》 北大核心 2021年第3期84-88,共5页
为构建鸭疫里氏杆菌外膜蛋白A(OmpA)基因真核表达重组质粒,同时验证其在DF-1细胞中的表达和对雏鸭的免疫保护效果,以pVAX1为真核表达载体,构建真核表达质粒pVAX1-OmpA,通过质粒PCR、双酶切和测序进行鉴定,将鉴定后的阳性质粒pVAX1-OmpA... 为构建鸭疫里氏杆菌外膜蛋白A(OmpA)基因真核表达重组质粒,同时验证其在DF-1细胞中的表达和对雏鸭的免疫保护效果,以pVAX1为真核表达载体,构建真核表达质粒pVAX1-OmpA,通过质粒PCR、双酶切和测序进行鉴定,将鉴定后的阳性质粒pVAX1-OmpA转染至DF-1细胞,采用间接免疫荧光试验(IFA)和Western blot方法检测OmpA基因在DF-1细胞中的表达;将pVAX1-OmpA DNA免疫雏鸭,采集血清检测免疫抗体,并进行攻毒保护试验。结果,成功构建真核表达质粒pVAX1-OmpA,两种免疫学方法均检测到ompA蛋白的特异性表达,免疫雏鸭后14、28、35、49、63 d抗体水平与灭活疫苗组差异不显著,对雏鸭的免疫保护率达到100%。结果表明,pVAX1-OmpA重组质粒免疫雏鸭后能够诱导产生特异性的免疫抗体,能够产生较强的免疫保护效果,可作为新型DNA疫苗的候选。 展开更多
关键词 鸭疫里氏杆菌 ompa基因 真核表达 免疫保护效果 DNA疫苗
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甲型副伤寒杆菌ompA基因分布及重组表达产物的免疫学鉴定 被引量:6
9
作者 蒋锦琴 阮萍 +3 位作者 丁威 孙爱华 毛亚飞 严杰 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期1-5,共5页
目的构建甲型副伤寒杆菌ompA基因原核表达系统,确定其重组表达产物rOmpA免疫原性和保护作用,检测甲型副伤寒杆菌临床菌株ompA基因携带率。方法采用PCR从甲型副伤寒杆菌临床株JH01中扩增ompA基因,T-A克隆后测序并构建ompA基因原核表... 目的构建甲型副伤寒杆菌ompA基因原核表达系统,确定其重组表达产物rOmpA免疫原性和保护作用,检测甲型副伤寒杆菌临床菌株ompA基因携带率。方法采用PCR从甲型副伤寒杆菌临床株JH01中扩增ompA基因,T-A克隆后测序并构建ompA基因原核表达系统。采用SDS-PAGE和Bio—Rad凝胶图像分析系统检测rOmpA表达情况及其产量,采用免疫扩散法、微量肥达试验和Western blot鉴定其抗原性和免疫反应性。采用PCR检测98株甲型副伤寒杆菌临床菌株ompA基因携带率。采用小鼠感染模型,了解rOmpA对甲型副伤寒杆菌50001株感染的免疫保护作用。结果与报道的相关序列比较,所克隆的ompA基因核苷酸和氨基酸序列相似性均为100%。rOmpA表达量约为细菌总蛋白的65%。rOmpA能与其兔抗血清和甲型副伤寒杆菌全菌抗血清产生免疫反应(Western blot),并可在家兔中诱导产生抗体。94.9%(93/98)甲型副伤寒杆菌临床菌株含有ompA基因。100μg和200μg rOmpA对感染小鼠的免疫保护率分别为41.7%(5/12)和58.3%(7/12)。rOmpA免疫小鼠或保护试验存活小鼠血清对各副伤寒杆菌H抗原的凝集效价为1:5~1:40。结论ompA基因在甲型副伤寒杆菌临床菌株中分布广泛。rOmpA有良好的免疫原性和一定的免疫保护作用,可考虑为甲型副伤寒杆菌基因工程疫苗候选抗原。 展开更多
关键词 甲型副伤寒杆菌 ompa基因 重组表达 免疫原性 免疫保护性
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奶牛流产鹦鹉热衣原体ompA基因的克隆与原核表达 被引量:6
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作者 宋竹青 邱昌庆 +6 位作者 周继章 曹小安 蔺国珍 郑福英 宫晓炜 王光华 魏彦明 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期140-143,共4页
目的表达奶牛源鹦鹉热衣原体ompA基因,探索其作为诊断抗原的可能性。方法采用套式PCR方法扩增出了奶牛源鹦鹉热衣原体ompA基因完整片段,此扩增产物经过双酶切后克隆到表达载体pGEX-4T-1中,转化大肠杆菌BL21(DE3),经IPTG诱导表达后采用SD... 目的表达奶牛源鹦鹉热衣原体ompA基因,探索其作为诊断抗原的可能性。方法采用套式PCR方法扩增出了奶牛源鹦鹉热衣原体ompA基因完整片段,此扩增产物经过双酶切后克隆到表达载体pGEX-4T-1中,转化大肠杆菌BL21(DE3),经IPTG诱导表达后采用SDS-PAGE和Western-blot检测重组目的蛋白的表达结果。结果重组蛋白经奶牛衣原体阳性血清鉴定正确。结论ompA基因在原核表达系统中得到正确表达。 展开更多
关键词 鹦鹉热衣原体 ompa基因 克隆 原核表达 奶牛
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鸭疫里氏杆菌PCR方法初步建立及应用 被引量:6
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作者 孙 郭东春 +4 位作者 刘家森 姜骞 司昌德 林欢 曲连东 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第1期14-16,共3页
为了建立针对鸭疫里氏杆菌的病原学检测方法,试验根据已发表的鸭疫里氏杆菌的外膜蛋白A(OmpA)的基因序列(GenBank登录号为AF104937)设计1对引物,对7株不同血清型鸭疫里氏杆菌进行扩增并建立PCR方法。结果表明:均扩增出与预计大小一致的... 为了建立针对鸭疫里氏杆菌的病原学检测方法,试验根据已发表的鸭疫里氏杆菌的外膜蛋白A(OmpA)的基因序列(GenBank登录号为AF104937)设计1对引物,对7株不同血清型鸭疫里氏杆菌进行扩增并建立PCR方法。结果表明:均扩增出与预计大小一致的目的片段,PCR方法敏感性可达到8.6 pg;而多杀性巴氏杆菌、沙门菌、大肠杆菌和金色葡萄球菌均未扩增出预计大小的片段,说明该PCR方法具有良好的特异性。同时用建立的PCR方法对鸭疫里氏杆菌攻毒鸭病例和临床疑似病鸭的脏器分离菌进行扩增,均可扩增出目的条带,与细菌的分离结果相一致。 展开更多
关键词 鸭疫里氏杆菌 ompa PCR 诊断
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中哈边境艾比湖湿地游离蜱斑点热群立克次体的分子流行病学研究 被引量:7
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作者 徐军 王安东 +10 位作者 罗丹 徐新龙 戴莉 杨杰 徐建军 热依罕古丽 萨尼叶古丽 王丽娜 杜景云 李志远 王远志 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2016年第8期18-20,共3页
了解中哈边境新疆艾比湖湿地游离蜱中斑点热群立克次体的感染情况。利用斑点热群立克次体外膜蛋白A(ompA)基因对艾比湖湿地游离亚洲璃眼蜱、边缘革蜱、血红扇头蜱进行PCR检测,并对阳性样本进行测序和BLAST序列分析,并应用Mega5.0软件建... 了解中哈边境新疆艾比湖湿地游离蜱中斑点热群立克次体的感染情况。利用斑点热群立克次体外膜蛋白A(ompA)基因对艾比湖湿地游离亚洲璃眼蜱、边缘革蜱、血红扇头蜱进行PCR检测,并对阳性样本进行测序和BLAST序列分析,并应用Mega5.0软件建立分子系统进化树。结果中哈边境地区艾比湖湿地游离蜱斑点热群立克次体电泳阳性率36.84%(56/152),BLAST分析显示,艾比湖湿地游离蜱斑点热群立克次体基因型为Rickettsia raoultii,与从匈牙利患蜱传染的病人肿大淋巴结中分离获得的R.raoultii关系最近,处于同一分支(Gen Bank登录号为JQ798904)。结论是新疆艾比湖湿地游离蜱斑点热立克次体感染较为严重,存在立克次体自然疫源地,应尽快制定防制措施,以免危机动物及人类健康。 展开更多
关键词 斑点热立克次体 游离蜱 ompa基因 分子流行病学 艾比湖湿地 阿拉山口口岸 中哈边境
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牦牛源多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH和OmpA重组亚单位疫苗对小鼠的免疫效果 被引量:3
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作者 田亮 康立超 +2 位作者 赵文娟 薄新文 马勋 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期146-151,共6页
为分析牦牛源多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)外膜蛋白H(OmpH)和外膜蛋白A(Om-pA)的免疫效果,构建了牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH和OmpA的原核表达载体pET-28a-OmpH和pET-28a-OmpA,表达并纯化重组外膜蛋白H(rOmpH)和重组外膜蛋白A(r... 为分析牦牛源多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)外膜蛋白H(OmpH)和外膜蛋白A(Om-pA)的免疫效果,构建了牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH和OmpA的原核表达载体pET-28a-OmpH和pET-28a-OmpA,表达并纯化重组外膜蛋白H(rOmpH)和重组外膜蛋白A(rOmpA),制备相应的单价疫苗和二价疫苗(rOmpH-A)以及全菌灭活疫苗,以PBS作为对照,皮下免疫小鼠。首免后每周采血1次,用间接ELISA检测抗体动态变化,并于三免后第9天用2LD50的分离菌株进行攻毒,比较保护力。结果,各试验组均能产生特异性抗体,全菌灭活组和rOmpA组小鼠的存活率分别为80%、40%,而rOmpH组、rOmpH-A组小鼠全部死亡,rOmpH和rOmpH-A组仅推迟小鼠死亡的时间,说明保护力微弱,不能抵抗同源菌株的致死性攻击。结果表明,rOmpA蛋白具有保护力,而rOmpH不具有保护力。 展开更多
关键词 牦牛 多杀性巴氏杆菌 ompa基因 ompH基因 重组蛋白
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阪崎肠杆菌环介导等温扩增检测方法建立 被引量:5
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作者 范宏英 龙敏 +2 位作者 刘欢 罗军 龙北国 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期31-33,共3页
目的针对当前国内外传统检测方法缺点,建立阪崎肠杆菌快速检测法。方法根据阪崎肠杆菌外膜蛋白(OmpA)基因,设计4条特异性引物(内、外引物各2条),建立并优化环介导等温扩增(loop-mediated isotherm alamp lification,LAMP)检测体系及反... 目的针对当前国内外传统检测方法缺点,建立阪崎肠杆菌快速检测法。方法根据阪崎肠杆菌外膜蛋白(OmpA)基因,设计4条特异性引物(内、外引物各2条),建立并优化环介导等温扩增(loop-mediated isotherm alamp lification,LAMP)检测体系及反应条件,并进行LAMP反应的灵敏度、特异性实验及实际样品检测。结果 LAMP检测阪崎肠杆菌,优化后的条件选择为:Mg2+浓度6 mmol/L,dNTP浓度0.6 mmol/L,甜菜碱浓度0.8 mol/L,外引物与内引物的浓度比1∶4,扩增温度58℃60m in;细菌纯培养检测灵敏度为101cfu/mL;对11种细菌共26株菌进行LAMP扩增,仅8株阪崎肠杆菌得到阳性扩增结果,证明引物具有很高的特异性;对实际样品进行增菌检测,采用试剂盒提取DNA,从样品处理到报告结果,耗时26 h;并采用传统检测方法验证,正确性为100%。结论该方法检测阪岐肠杆菌特异性强、灵敏度高,并且操作简便、检测成本低、耗时短,有望成为快速检测阪岐肠杆菌的有效方法。 展开更多
关键词 阪岐肠杆菌 环介导等温扩增技术 外膜蛋白(ompa)基因 检测
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江苏地区两株鹅源鸭疫里氏杆菌的分离鉴定及其OmpA基因的进化分析 被引量:5
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作者 孙兴臣 熊晓妍 +6 位作者 李敏婕 陈海超 董斌 耿文学 杨伦 陈闻 许家荣 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期13-18,共6页
江苏省某种鹅场15日龄雏鹅疑似感染鸭疫里氏杆菌,无菌采取脑、心脏、肝和脾等病料,进行病原分离纯化,通过细菌生化试验、血清型鉴定及设计特异性扩增鸭疫里氏杆菌外膜蛋白A(OmpA)基因的引物,进行PCR扩增,从8份病料中分离到2株血清2型鸭... 江苏省某种鹅场15日龄雏鹅疑似感染鸭疫里氏杆菌,无菌采取脑、心脏、肝和脾等病料,进行病原分离纯化,通过细菌生化试验、血清型鉴定及设计特异性扩增鸭疫里氏杆菌外膜蛋白A(OmpA)基因的引物,进行PCR扩增,从8份病料中分离到2株血清2型鸭疫里氏杆菌。药物敏感性试验表明,2个分离株对红霉素和阿奇霉素的敏感性高于其他药物。对OmpA基因PCR产物进行基因序列测定,在NCBI上进行基因序列同源性比对,其基因序列与多株已发表的序列的同源性达到99%。进化分析表明,分离株均与D2、G2株具有很近的亲缘关系。 展开更多
关键词 鸭疫里氏杆菌 ompa基因 PCR 进化分析
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鸭疫里默氏菌OmpA与鸭IL-2融合基因的克隆与原核表达 被引量:2
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作者 高云航 刘佳丽 +3 位作者 王巍 李秋菊 张福君 马红霞 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2014年第8期42-46,共5页
以鸭疫里默氏菌吉林分离株JL-RA1OmpA基因(登录号HQ707077)和鸭DuIL-2成熟片段基因(登录号AY193713)为模板,分别设计带有linker的特异性引物,PCR扩增出序列大小为1182bp的OmpA-linker基因和序列大小为381bp的linkerDuIL-2成熟蛋白基因... 以鸭疫里默氏菌吉林分离株JL-RA1OmpA基因(登录号HQ707077)和鸭DuIL-2成熟片段基因(登录号AY193713)为模板,分别设计带有linker的特异性引物,PCR扩增出序列大小为1182bp的OmpA-linker基因和序列大小为381bp的linkerDuIL-2成熟蛋白基因。利用SOE-PCR技术,成功构建OmpA-DuIL-2融合基因,片段大小为1551bp。将其转入大肠杆菌表达载体pET-28a中,构建pET-OmpA-DuIL-2融合表达载体,转化至大肠杆菌Rosetta(DE3)中,IPTG诱导表达,经SDS-PAGE分析得到分子量大小约为61 kDa的融合蛋白,经Western-blot分析该融合基因同时具OmpA和DuIL-2的反应原性。 展开更多
关键词 鸭疫里默氏菌 ompa基因 DuIL-2基因 ompa-DuIL-2融合基因 原核表达
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创伤弧菌和副溶血弧菌双重LAMP检测方法的建立及初步应用 被引量:4
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作者 周顺 高志鑫 张敏 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1875-1881,共7页
为建立创伤弧菌和副溶血弧菌的双重环介导等温扩增(loop—mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,本试验以创伤弧菌metalloprotease基因和副溶血弧菌ompA基因为靶点设计LAMP扩增引物,并在内引物间添加不同的酶切位点,... 为建立创伤弧菌和副溶血弧菌的双重环介导等温扩增(loop—mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,本试验以创伤弧菌metalloprotease基因和副溶血弧菌ompA基因为靶点设计LAMP扩增引物,并在内引物间添加不同的酶切位点,通过对反应时间和温度的优化及酶切反应,成功建立了双重LAMP检测方法,并对其检测特异性、灵敏度和实际应用性进行了研究。结果显示,62℃反应45min时可同时检测到2种弧菌的存在,通过限制性内切酶酶切,可准确区分2种弧菌。该方法比普通PCR检测方法灵敏度高10^2~10^3倍。选择17株细菌菌株作为检测模板,发现除创伤弧菌和副溶血弧菌反应结果呈阳性外,其他均为阴性。以大菱鲆作为实验动物,检测双重LAMP技术的实际应用可能,该方法可准确检测并鉴定出组织和血液中感染的细菌种类,其灵敏度可达374~410CFU/g(mL)。SYBR Green Ⅰ是一种结合于DNA双链小沟中的荧光染料,反应产物加入该染料后,极易用肉眼判别。本试验成功建立了创伤弧菌和副溶血弧菌的双重LAMP检测方法,该方法可用于水产养殖中病原菌的早期诊断。 展开更多
关键词 创伤弧菌 metalloprotease基因 副溶血弧菌 ompa基因 双重LAMP
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食源性阪崎肠杆菌的双重PCR检测方法研究 被引量:4
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作者 黎明 阮佳 李永新 《中国卫生检验杂志》 CAS 北大核心 2013年第6期1473-1476,共4页
目的:建立食品中阪崎肠杆菌双重PCR检测方法。方法:以食品中污染的阪崎肠杆菌为研究对象,以其基因组16 S rRNA-23 S rRNA的内部转录间隔区(ITS)基因和外膜蛋白A(OmpA)基因为靶标选择引物,进行双重PCR扩增,产物用琼脂糖凝胶电泳检测。结... 目的:建立食品中阪崎肠杆菌双重PCR检测方法。方法:以食品中污染的阪崎肠杆菌为研究对象,以其基因组16 S rRNA-23 S rRNA的内部转录间隔区(ITS)基因和外膜蛋白A(OmpA)基因为靶标选择引物,进行双重PCR扩增,产物用琼脂糖凝胶电泳检测。结果:在优化的双重PCR条件下,阪崎肠杆菌的ITS基因和OmpA基因均可得到有效扩增,方法的灵敏度为1.6×102cfu/mL。所建立的方法用于实际食品样品检测,结果稳定。结论:本研究所建立的方法特异好、灵敏较高、分析周期短、结果准确,可用于食品中阪崎肠杆菌的日常检测。 展开更多
关键词 阪崎肠杆菌 双重PCR ITS基因 ompa基因 琼脂糖凝胶电泳
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鸭疫里默杆菌LAMP-LFD快速检测方法的建立与初步应用
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作者 龙宥茨 顾庆林 +4 位作者 鲜思美 周飘 梁倩 郑维豪 吴琴 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2050-2055,共6页
根据鸭疫里默杆菌(Riemerella anatipestfer,RA)ompA基因设计4条环介导等温扩增(LAMP)特异性引物和1条带有异硫氰酸荧光素(fluorescein isothiocyanate,FITC)标记的DNA探针,利用横向流动试纸条(LFD)检测扩增产物。通过对反应条件包括温... 根据鸭疫里默杆菌(Riemerella anatipestfer,RA)ompA基因设计4条环介导等温扩增(LAMP)特异性引物和1条带有异硫氰酸荧光素(fluorescein isothiocyanate,FITC)标记的DNA探针,利用横向流动试纸条(LFD)检测扩增产物。通过对反应条件包括温度、时间、内、外引物浓度比、Bst DNA 2.0聚合酶浓度、dNTPs浓度及Mg^(2+)浓度等优化后,建立了RA的LAMP-LFD检测方法。结果显示:在64℃下运用LAMP扩增核酸到结果判读只需33 min;LAMP-LFD可特异性检测鸭疫里默杆菌,巴氏杆菌核酸、大肠杆菌核酸、沙门菌核酸、葡萄球菌核酸、鸭瘟病毒均未检测出;LAMP-LFD对pMD19-T-ompA最低检测浓度为1.83×10^(0)copies/μL,其敏感度是PCR的1000倍。利用PCR和LAMP-LFD检测22份疑似RA临床样本,两者检出符合率为100%。研究建立的LAMP-LFD检测方法能快速、特异地检测RA,可作为早期诊断和检测RA的有效手段。 展开更多
关键词 鸭疫里默杆菌 环介导等温扩增 ompa基因 横向流动试纸条
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家畜衣原体ompA基因实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
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作者 王思月 王成宇 +6 位作者 曲磊 鞠安琪 朱日宁 魏天 肖丹 张芳毓 王永志 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期43-48,共6页
为快速检测家畜衣原体,选取家畜衣原体ompA基因的高度保守区域,设计了针对家畜衣原体的引物和探针,优化反应条件,建立家畜衣原体荧光定量PCR检测方法。结果显示:该方法的最低检测限为1.68×10^(1)copies/μL,在1.68×10^(2)~1.6... 为快速检测家畜衣原体,选取家畜衣原体ompA基因的高度保守区域,设计了针对家畜衣原体的引物和探针,优化反应条件,建立家畜衣原体荧光定量PCR检测方法。结果显示:该方法的最低检测限为1.68×10^(1)copies/μL,在1.68×10^(2)~1.68×10^(6)copies/μL范围内具有良好的线性关系;该方法可特异性检测家畜衣原体,与肺炎衣原体、沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体、流产衣原体4种4个菌株无交叉反应,表明特异性好;其批间重复试验和批内重复试验的变异系数分别为0.14%~0.51%、1.09%~1.49%,表明重复性良好。本方法可用于家畜衣原体的早期检测和流行病学调查。 展开更多
关键词 家畜衣原体 ompa基因 实时荧光定量PCR
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