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不同品质粗饲料日粮对瘤胃发酵及主要纤维分解菌的影响 被引量:28
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作者 刘大程 卢德勋 +2 位作者 侯先志 高民 孙海洲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期1199-1206,共8页
【目的】研究不同品质粗饲料组成的混合日粮对绵羊瘤胃发酵功能和3种主要纤维分解菌的影响。【方法】以粗饲料分级指数GI为指标对粗饲料品质进行调配,在精粗比为2﹕8条件下配制3种混合日粮,其中含高GI粗饲料日粮组(H组,GI值=2.89)、含... 【目的】研究不同品质粗饲料组成的混合日粮对绵羊瘤胃发酵功能和3种主要纤维分解菌的影响。【方法】以粗饲料分级指数GI为指标对粗饲料品质进行调配,在精粗比为2﹕8条件下配制3种混合日粮,其中含高GI粗饲料日粮组(H组,GI值=2.89)、含中GI粗饲料日粮组(M组,GI值=1.73)和含低GI粗饲料日粮组(L组,GI值=0.65)。利用16SrRNA特异性寡核苷酸探针杂交法测定3种纤维分解菌的数量变化。【结果】三组试验动物瘤胃液pH维持在正常范围,各组间差异不显著(P>0.05),但H组pH变化更为平缓。随着GI指数的升高,瘤胃液NH3-N浓度呈升高势态,H组显著高于L组(P<0.05),乙酸浓度有降低的趋势,而丙酸浓度则有上升的趋势,乙酸/丙酸出现降低趋势,各试验组TVFA浓度的平均值差异不显著(P>0.05)。黄化瘤胃球菌在绵羊瘤胃中相对含量的总平均值为1.18%,白色瘤胃球菌的相对含量为2.44%,琥珀酸拟杆菌的含量为10.07%。【结论】不同品质粗饲料日粮显著影响绵羊瘤胃产琥珀酸丝状杆菌的数量,随着粗饲料品质的升高,该菌的数量有增加的趋势;不同品质粗饲料日粮改变了瘤胃的发酵方式和发酵功能。 展开更多
关键词 粗饲料品质 瘤胃发酵 寡核苷酸探针 纤维分解菌 瘤胃细菌
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荧光原位杂交在环境微生物学中的应用及进展 被引量:21
2
作者 邢德峰 任南琪 李建政 《环境科学研究》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第3期55-58,共4页
荧光原位杂交技术广泛用于分析复杂环境的微生物群落构成,可以在自然生境中监测和鉴定微生物,并能对未被培养的微生物进行检测。rRNA为靶序列寡核苷酸或PNA探针的荧光原位杂交能提供微生物的形态学、数量、空间分布等信息,现已成为环境... 荧光原位杂交技术广泛用于分析复杂环境的微生物群落构成,可以在自然生境中监测和鉴定微生物,并能对未被培养的微生物进行检测。rRNA为靶序列寡核苷酸或PNA探针的荧光原位杂交能提供微生物的形态学、数量、空间分布等信息,现已成为环境科学研究领域中的热点技术。对荧光原位杂交技术的发展和在环境微生物学中的应用进行了综述,探讨了该技术的应用和发展前景。 展开更多
关键词 荧光原位杂交 16SrBNA 寡核苷酸探针 PNA 环境微生物 微生物生态学
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荧光原位杂交(FISH)技术在厌氧颗粒污泥研究中的应用 被引量:13
3
作者 左剑恶 杨洋 +1 位作者 沈平 顾夏声 《中国沼气》 2004年第1期3-6,共4页
本文介绍了荧光原位杂交(FISH)技术的基本原理和操作步骤,重点介绍和讨论了FISH技术在厌氧颗粒污泥研究中的应用现状,并对该技术在国内的应用前景进行了展望。
关键词 厌氧颗粒污泥 荧光原位杂交技术 FISH 技术原理 微生物组成 空间分布 菌种 寡核苷酸探针 有机工业 废水处理
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PCR结合寡核苷酸探针杂交检测临床常见真菌的实验研究 被引量:9
4
作者 黄媛 牟兆钦 +1 位作者 陈建魁 尹秀云 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期345-348,共4页
目的 建立PCR结合生物素标记的寡核苷酸探针斑点杂交技术 ,鉴定临床常见的真菌。方法 首先用真菌通用引物扩增白念珠菌、热带念珠菌、假热带念珠菌、近平滑念珠菌、光滑念珠菌、解脂念珠菌、克鲁斯念珠菌、季也蒙念珠菌、黄曲霉、烟... 目的 建立PCR结合生物素标记的寡核苷酸探针斑点杂交技术 ,鉴定临床常见的真菌。方法 首先用真菌通用引物扩增白念珠菌、热带念珠菌、假热带念珠菌、近平滑念珠菌、光滑念珠菌、解脂念珠菌、克鲁斯念珠菌、季也蒙念珠菌、黄曲霉、烟曲霉的核糖体大亚单位基因的保守区序列 ,然后用生物素标记的种特异性寡核苷酸探针与扩增产物杂交。并将此方法用于临床标本和临床分离菌株的检测。结果 通用引物可以扩增上述 11种临床常见真菌的DNA ,扩增片段长度在 2 6 0bp左右。9种特异性探针分别与 11种真菌标准菌株的PCR扩增产物杂交 ,结果表明每种探针都具有高度特异性。斑点杂交法和Southern杂交法检测敏感性相同 ,为 10 0fg ;琼脂糖凝胶电泳法检测敏感性为 1pg。通过 6 9例临床标本和 31例临床分离菌株的检测 ,PCR 杂交法的结果和真菌培养法的结果基本一致。结论 PCR结合生物素标记的寡核苷酸探针杂交技术可将 9种临床常见真菌鉴定到种 ,方法快速、敏感、特异。 展开更多
关键词 真菌 聚合酶链反应 寡核苷酸探针 生物素 检测 实验研究
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检测石蜡切片中鸭病毒性肠炎病毒间接原位PCR方法的建立 被引量:8
5
作者 程安春 廖永洪 +4 位作者 朱德康 汪铭书 罗启慧 贾仁勇 陈孝跃 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期4365-4371,共7页
【目的】建立能对石蜡切片中鸭病毒性肠炎病毒(DEV)核酸进行定位的原位PCR方法,为鸭病毒性肠炎(DVE)存档蜡块的回顾性诊断、致病机理研究等提供有效的实验手段。【方法】据DEV的UL30-UL31基因序列设计PCR引物和寡核苷酸探针,以DEV感染... 【目的】建立能对石蜡切片中鸭病毒性肠炎病毒(DEV)核酸进行定位的原位PCR方法,为鸭病毒性肠炎(DVE)存档蜡块的回顾性诊断、致病机理研究等提供有效的实验手段。【方法】据DEV的UL30-UL31基因序列设计PCR引物和寡核苷酸探针,以DEV感染死亡鸭肝脏组织石蜡标本制作切片,经蛋白酶K消化、原位PCR扩增和生物素标记的寡核苷酸探针原位杂交,建立了检测石蜡标本中DEV的间接原位PCR方法并应用于人工感染DEV不同时间的鸭肝脏、DVE发病鸭的存档蜡块和临床病料检测。【结果】间接原位PCR对DVE死亡鸭肝脏的石蜡标本检测结果为阳性,而鸭病毒性肝炎、鸭疫里默氏杆菌病、鸭多杀性巴氏杆菌病、鸭沙门氏菌病和鸭大肠杆菌病死亡鸭肝脏的石蜡标本检测结果为阴性;间接原位PCR对人工感染DEV后2、4、6、12、24、48和72 h不同时间的鸭肝脏检测结果均为阳性,阳性细胞有肝细胞、窦皮细胞和枯否氏细胞,阳性信号多出现于坏死细胞的碎片中或细胞坏死后形成的空泡内及空泡边缘;对存档蜡块、临床病料的检测与病毒分离鉴定吻合率为100%。【结论】本研究建立的间接原位PCR方法具有直观、敏感、特异性强的优点,在显示核酸阳性信号的同时,还能判别含有靶序列的细胞类型以及组织细胞的形态结构特征与病理变化。可用于DVE的诊断、分子流行病学调查、存档蜡块的回顾性诊断和致病机理的研究。 展开更多
关键词 鸭病毒性肠炎病毒 原位PCR 寡核苷酸探针 石蜡标本 检测
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寡核苷酸探针原位检测石蜡切片中PRRSV核酸 被引量:6
6
作者 李雪梅 程安春 +4 位作者 汪铭书 刘伍梅 张平英 豆文波 陈希文 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期350-353,共4页
根据G enB ank收录的美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332株ORF 6和ORF 7基因序列,用O ligo软件设计并合成大小为37 bp的寡核苷酸探针,经生物素标记后,成功建立了原位检测石蜡组织切片中PRRSV核酸的方法。该探针能检测到56... 根据G enB ank收录的美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332株ORF 6和ORF 7基因序列,用O ligo软件设计并合成大小为37 bp的寡核苷酸探针,经生物素标记后,成功建立了原位检测石蜡组织切片中PRRSV核酸的方法。该探针能检测到56 pg PRRSV核酸的RT-PCR产物DNA,能特异检测出PRRSV核酸及其PCR产物,而对猪瘟病毒(HCV)、猪细小病毒(PPV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪乙脑病毒(JEV)的核酸呈阴性反应。应用该方法检测PRRSV SC-1株人工感染的28日龄仔猪,在感染后7 d即可在肺脏、肾脏、扁桃体、胸腺、肺门淋巴结、十二指肠和大脑检测到PRRSV核酸。该法可用于仔猪PRRSV感染的诊断和组织中核酸的定位及分布研究,也可用于甲醛固定组织的回顾性诊断。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 寡核苷酸探针 原位杂交 检测
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猪圆环病毒检测与分型寡核苷酸芯片的建立及应用 被引量:8
7
作者 姜永厚 商晗武 +5 位作者 陈伟杰 徐辉 丁先锋 赵灵燕 方立 黄怡君 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1174-1180,共7页
本研究应用寡聚核苷酸基因杂交技术建立了一种快速可靠的检测猪圆环病毒(PCV)基因型的方法。在PCV保守序列复制酶基因内设计了2对特异性引物,在此物之间设计了2种基因型特异的核苷酸探针(22~30mer)。通过PCR扩增Cy5标记的DNA片段与固... 本研究应用寡聚核苷酸基因杂交技术建立了一种快速可靠的检测猪圆环病毒(PCV)基因型的方法。在PCV保守序列复制酶基因内设计了2对特异性引物,在此物之间设计了2种基因型特异的核苷酸探针(22~30mer)。通过PCR扩增Cy5标记的DNA片段与固定在玻片表面的探针杂交进行PCV基因分型。该技术结合了PCR方法的高度敏感性和DNA-DNA杂交技术的选择特异性。利用该方法对58例临床样品进行了检测鉴定。结果显示,该技术能准确鉴别PCV病毒基因型。且其灵敏度是凝胶电泳的5倍。试验结果表明寡核苷酸基因芯片技术可有效地应用于PCV临床诊断和分子流行病学调查。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 基因芯片 断奶仔猪多系统衰竭综合症 寡聚核苷酸探针 检测
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寡核苷酸探针进行DNA指纹分析在法医学上应用的评价 被引量:6
8
作者 蓝翎 张小为 +2 位作者 段秉章 霍振义 史秀芬 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1993年第5期404-410,共7页
本文用自制的寡核苷酸探针(CAC)_5/(GTG)_5,对与法医学应用有关的问题进行了研究。从室温下放置三年的血痕得到不完全的DNA指纹图;从同一个体不同组织的DNA得到完全一致的结果;从混合斑中分离出精子DNA进行DNA指纹检验,并与同一供体的血... 本文用自制的寡核苷酸探针(CAC)_5/(GTG)_5,对与法医学应用有关的问题进行了研究。从室温下放置三年的血痕得到不完全的DNA指纹图;从同一个体不同组织的DNA得到完全一致的结果;从混合斑中分离出精子DNA进行DNA指纹检验,并与同一供体的血液DNA指纹图进行比较;还用仅有0.25μg的DNA获得了可分辨的DNA指纹图。此外,用限制性内切酶HaeⅢ代替HinfⅠ酶切人的基因组DNA,也获得了高度多态性的杂交图谱。结果表明,(CAC)_5/(GTG)_5是一种具有实用价值的DNA指纹探针。 展开更多
关键词 寡核苷酸 探针 法医学 DNA 肤纹
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β地中海贫血[-28(A→G)·CD17(A→T)/N]双重突变杂合子的基因鉴定及家系分析 被引量:6
9
作者 余伍忠 李厚钧 +6 位作者 仇东辉 颉元文 张宇红 田瑞君 周常文 孙玉琴 罗书练 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第10期535-537,共3页
目的:报道β地中海贫血(β地贫)[-28(A→G)·CD17(A→T)/N]双重突变杂合子的基因鉴定及家系分析结果。方法:采用聚合酶链反应结合等位基因特异的寡核苷酸探针杂交(PCR/ASO)技术。结果:对4例先证... 目的:报道β地中海贫血(β地贫)[-28(A→G)·CD17(A→T)/N]双重突变杂合子的基因鉴定及家系分析结果。方法:采用聚合酶链反应结合等位基因特异的寡核苷酸探针杂交(PCR/ASO)技术。结果:对4例先证者及其家系成员计35人进行基因鉴定,共检出22人同时携带有β地贫-28(A→G)和CD17(A→T)的突变基因,结合临床体征、血液及生化指标、家系调查资料综合分析,确定他们是β地贫[-28(A→G)·CD17(A→T)/N]双重突变杂合子,为同一条染色体上基因的双重点突变。结论:[-28(A→G)·CD17(A→T)/N]双重突变杂合子是一种新的β地贫类型,这种β地贫的发现,为认识我国地贫的高度异质性积累了资料。 展开更多
关键词 地中海贫血 杂合子 聚合酶链反应 基因鉴定
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自组装DNA吸附取向的表面增强拉曼光谱法研究 被引量:1
10
作者 董丽琴 周剑章 +2 位作者 吴玲玲 董平 林仲华 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第12期2303-2308,共6页
对金基体上自组装寡聚核苷酸探针杂交前后进行电化学非现场及现场表面增强拉曼光谱 ( SERS)研究 .非现场 SERS研究表明 ,杂交形成的 ds DNA在基体表面以 A型和 B型两种构象同时存在 ,杂交过程可能伴随 DNA链在基体表面吸附取向的变化 .... 对金基体上自组装寡聚核苷酸探针杂交前后进行电化学非现场及现场表面增强拉曼光谱 ( SERS)研究 .非现场 SERS研究表明 ,杂交形成的 ds DNA在基体表面以 A型和 B型两种构象同时存在 ,杂交过程可能伴随 DNA链在基体表面吸附取向的变化 .根据现场 SERS研究结果可知 ,ss DNA及 ds DNA的大多数SERS谱带强度随电极电位正移而降低 ,尤其是归属于碱基 A的两种面外振动模式 ,谱带变化更为明显 .利用 SERS表面选择定则判断出随着电极电位由负向正变化 ,ss DNA及 ds DNA螺旋吸附取向由垂直吸附向平躺吸附于金基体表面变化 . 展开更多
关键词 自组装 DNA 寡聚核苷酸探针 杂交 表面增强拉曼光谱 吸附取向 基因芯片 构象
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登革病毒cDNA的生物信息学分析及其Oligo探针设计 被引量:4
11
作者 肖维威 马文丽 +2 位作者 马晓冬 毛向明 郑文岭 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第9期905-907,共3页
目的设计登革病毒诊断芯片的Oligo探针。方法利用BLAST软件对4型登革病毒的cDNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;然后用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针。结果获得48条70-mer Oligo探针,用于打印... 目的设计登革病毒诊断芯片的Oligo探针。方法利用BLAST软件对4型登革病毒的cDNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;然后用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针。结果获得48条70-mer Oligo探针,用于打印成DNA芯片,进行登革病毒的检测。结论利用BLAST系统和生物学软件Oligo6.0设计登革病毒诊断芯片的探针,是一种简便可行、有效的方法。 展开更多
关键词 登革病毒 CDNA 生物信息学 O1igo探针 生物芯片 BLAST软件
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膜芯片技术检测泌尿生殖道沙眼衣原体、淋病奈瑟菌和3种支原体的方法学研究 被引量:7
12
作者 向华国 熊礼宽 +2 位作者 刘小立 苏放明 涂植光 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期758-761,共4页
目的建立和评价一个新的多重PCR-反向线点杂交技术(RLB)快速同时检测泌尿生殖道沙眼衣原体(Ct)、淋病奈瑟菌(Ng)和3种支原体感染的方法。方法分别选择Ct隐蔽质粒和Ng 16S rRNA基因设计两对特异性引物,以支原体内转录间隔序列(ITS)设计... 目的建立和评价一个新的多重PCR-反向线点杂交技术(RLB)快速同时检测泌尿生殖道沙眼衣原体(Ct)、淋病奈瑟菌(Ng)和3种支原体感染的方法。方法分别选择Ct隐蔽质粒和Ng 16S rRNA基因设计两对特异性引物,以支原体内转录间隔序列(ITS)设计一对支原体属通用引物,生物素标记下游引物。构建三重PCR同时扩增Ct、Ng、解脲脲原体(Uu)、微小脲原体(Up)、人型支原体(Mh)等菌DNA,然后与固定在尼龙膜上的各特异性寡核苷酸探针杂交。并对142份经荧光定量PCR(FQ-PCR)检测Ct和Ng的性病高危人群标本,以及45份经支原体液体培养法鉴定的标本进行检测。结果多重PCR可同时扩增Ct、Ng、Uu、Up和Mh标准菌株DNA,其PCR产物的片段长度为208~408 bp。97份FQ-PCR Ct阳性标本中有93份经多重PCR-RLB检测为Ct阳性,45份FQ-PCR Ct阴性标本中35份多重PCR-RL8阴性。41份EQ-PCR Ng阳性标本中34份多重PCR-RLB Ng阳性,101份FQ-PCR Ng阴性标本中98份多重PCR-RLB阴性。其中36份经多重PCR-RLB检测为混合感染。32份支原体液体培养阳性标本中28份多重PCR-RLB阳性,13份支原体培养阴性标本经多重PCR-RLB检测均为阴性。结论多重PCR-RLB可快速同时检测Ct、Ng、Uu、Up和Mh,为性传播疾病的临床诊断提供了一种可靠的方法。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 核酸杂交 沙眼衣原体 淋病奈瑟菌 支原体 寡核苷酸探针
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应用微阵列芯片检测与2型糖尿病相关的单核苷酸多态性 被引量:5
13
作者 陈琰 刘桂锋 +2 位作者 刘霞 张桂珍 王振新 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期1078-1083,共6页
基于三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片的荧光检测法,研制了一种用于筛选能检测2型糖尿病的特定寡核苷酸探针.使用第4代(G4)聚(酰胺-胺)(PAMAM)树枝状大分子修饰的载玻片为基底,以氨基修饰的寡核苷酸为固定探针构建3D寡核苷酸微阵列芯片.采用... 基于三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片的荧光检测法,研制了一种用于筛选能检测2型糖尿病的特定寡核苷酸探针.使用第4代(G4)聚(酰胺-胺)(PAMAM)树枝状大分子修饰的载玻片为基底,以氨基修饰的寡核苷酸为固定探针构建3D寡核苷酸微阵列芯片.采用荧光化合物Cy5修饰的寡核苷酸为检测探针获得荧光信号.以2型糖尿病易感基因TCF7L2的rs7903146位点为研究对象,通过对含有16种(8对)寡核苷酸的寡核苷酸文库的筛选,获得了1对能用于2型糖尿病检测的寡核苷酸探针.通过单核苷酸多态性和等位基因分析证明,该寡核苷酸探针对靶标寡核苷酸检测具有高特异性,并能准确检测低至2%的等位基因频率. 展开更多
关键词 寡核苷酸微阵列 2型糖尿病 等位基因频率 核苷酸探针
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rRNA-targeted寡核苷酸探针识别活性污泥微生物群落结构与功能研究进展 被引量:2
14
作者 徐军 邱星辉 +5 位作者 曹宏 许木启 杨敏 何风琴 周可新 阚振荣 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期2484-2491,共8页
活性污泥中微生物群落内部关系非常复杂 ,及时对活性污泥中优势菌群和群落内部关系进行监测是污水处理中采取正确措施的关键。历史研究表明传统培养方法经常导致活性污泥优势菌群检测的失败 ,而r RNA- targeted寡核苷酸探针作为一种快... 活性污泥中微生物群落内部关系非常复杂 ,及时对活性污泥中优势菌群和群落内部关系进行监测是污水处理中采取正确措施的关键。历史研究表明传统培养方法经常导致活性污泥优势菌群检测的失败 ,而r RNA- targeted寡核苷酸探针作为一种快速原位监测活性污泥微生物群落结构和功能的新工具被引入 ,使我们对参与污水净化的微生物群落结构和优势菌群能有较全面的了解。就该方法在识别除磷污泥、脱氮污泥、污泥泡沫和膨胀污泥中微生物群落结构和功能的典型应用进行综述 ,分析了该方法存在的优点和缺点 ,并对目前已建立且应用于活性污泥微生物检测的 r RNA- 展开更多
关键词 RRNA 寡核苷酸探针 杂交 微生物生态 活性污泥
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单分子荧光原位杂交(smFISH)技术及应用
15
作者 芮涵 孙正龙 关淼 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1239-1255,共17页
单分子荧光原位杂交(single-molecule fluorescence in situ hybridization,smFISH)技术是一种通过用偶联荧光基团的寡核苷酸探针,对固定细胞或组织中单个mRNA分子进行成像的方法。smFISH可对RNA进行定位、定量,以此对目标转录本进行实... 单分子荧光原位杂交(single-molecule fluorescence in situ hybridization,smFISH)技术是一种通过用偶联荧光基团的寡核苷酸探针,对固定细胞或组织中单个mRNA分子进行成像的方法。smFISH可对RNA进行定位、定量,以此对目标转录本进行实时研究。sm FISH适用于细胞、组织切片等多种类型生物样本。近年来,多种基于基础smFISH的改进技术被发明,进一步促进了该技术的实际应用。smFISH良好的RNA单分子可视化能力,使得其在发育生物学、神经生物学及肿瘤生物学等基础生物学科中得到了广泛的应用。本文综述了smFISH技术基本原理、smFISH技术的局限性、smFISH衍生技术方法、smFISH在不同生物学科中的应用进展,并对smFISH技术的发展前景做出展望。 展开更多
关键词 单分子荧光原位杂交 寡核苷酸探针 RNA 成像
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运用压电石英晶体生物传感器检测产气荚膜梭菌α毒素的实验研究 被引量:6
16
作者 赵渝徽 陈鸣 +4 位作者 黄庆 姚春艳 闫慧慧 匡红 府伟灵 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期320-323,共4页
目的研究运用压电石英晶体生物传感器对产气荚膜梭菌α毒素(CPα)进行检测的方法和反应条件。方法按照碱基配对的原则,设计特异的产气荚膜梭菌α毒素基因寡核苷酸探针并利用巯基自组装技术固定在石英晶体上,运用压电石英晶体生物传感器... 目的研究运用压电石英晶体生物传感器对产气荚膜梭菌α毒素(CPα)进行检测的方法和反应条件。方法按照碱基配对的原则,设计特异的产气荚膜梭菌α毒素基因寡核苷酸探针并利用巯基自组装技术固定在石英晶体上,运用压电石英晶体生物传感器的"质量效应"对聚合酶链反应(PCR)扩增得到的产气荚膜梭菌α毒素靶基因进行杂交检测,并探讨不同pH值和不同离子强度的缓冲液对检测的影响。结果压电石英晶体生物传感器成功检测出产气荚膜梭菌α毒素;pH7.6的缓冲液和0.64mol/L的NaCl溶液最适合于检测。结论压电石英晶体生物传感器能够有效地检测产气荚膜梭菌α毒素,有望对临床上开展毒素诊断提供一种新的手段。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌α毒素 基因 压电石英晶体生物传感器 寡核苷酸探针
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利用rpoB基因芯片技术进行快速分枝杆菌菌种鉴定 被引量:6
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作者 李洪敏 樊博 +2 位作者 王巍 李国利 苗青 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期20-24,共5页
利用rpoB基因芯片技术快速进行分枝杆菌菌种鉴定。以分枝杆菌rpoB基因编码序列为靶基因,用基因芯片技术检测21种分枝杆菌标准株;8种其它细菌标准株;126株临床分离株。分枝杆菌与其它细菌标准株经PCR扩增后,分枝杆菌标准株均扩增出360 bp... 利用rpoB基因芯片技术快速进行分枝杆菌菌种鉴定。以分枝杆菌rpoB基因编码序列为靶基因,用基因芯片技术检测21种分枝杆菌标准株;8种其它细菌标准株;126株临床分离株。分枝杆菌与其它细菌标准株经PCR扩增后,分枝杆菌标准株均扩增出360 bp DNA片段,在其它细菌中,除甲型溶血性链球菌和假白喉棒状杆菌出现同样片段外,其它细菌均未见扩增。21种寡核苷酸探针除海分枝杆菌与偶然分枝杆菌的探针有交叉杂交外,其余均为特异性杂交。对126株临床分离株进行鉴定,89株为结核分枝杆菌,占70.6%(89/126),非结核分枝杆菌(NTM)占9.2%(9/98)。应用rpoB基因芯片技术鉴定分枝杆菌菌种,是一种快速、准确的方法,具有较高的临床应用价值。 展开更多
关键词 分枝杆菌 rpoB基因芯片 寡核苷酸探针 核酸杂交
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寡核苷酸芯片制备及其杂交条件的优化 被引量:5
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作者 鲁艳芹 韩金祥 +1 位作者 陈士俊 黄海燕 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期92-96,共5页
探讨了2种不同硅烷化试剂3-氨基丙基三甲氧基硅烷、三甲氧基丙基二乙烯基三胺及其不同处理时间对寡核苷酸探针固定效率的影响.结果表明3%的3-氨基丙基三甲氧基硅烷的95%丙酮溶液处理2h,然后用5%戊二醛溶液处理1 h,可以获得很好的杂... 探讨了2种不同硅烷化试剂3-氨基丙基三甲氧基硅烷、三甲氧基丙基二乙烯基三胺及其不同处理时间对寡核苷酸探针固定效率的影响.结果表明3%的3-氨基丙基三甲氧基硅烷的95%丙酮溶液处理2h,然后用5%戊二醛溶液处理1 h,可以获得很好的杂交信号.对比polyT15空间子,含有相同寡核苷酸序列的PEG6、PEG12空间子能使杂交信号增强6、8倍.在以pH值9-11的碳酸盐缓冲液为点样液时,杂交信号随着pH值的逐渐升高而略有下降.寡核苷酸探针的浓度和荧光标记样品的浓度影响杂交结果,当寡核苷酸探针的浓度为25μmol、所用长度为110bp的荧光标记的PCR产物为2μL,经杂交液6×SSEPT稀释至10μL时,可以获得很好的杂交信号. 展开更多
关键词 硅烷化 空间子 寡核苷酸探针 杂交
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细菌种特异性的16SrDNA寡核苷酸探针数据库的初步构建 被引量:4
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作者 蔡正求 宋未 东秀珠 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2004年第S1期110-115,共6页
核酸二级数据库是生物信息学研究的重要领域 ,对生命科学的研究和发展起重要作用 .目前 ,国际核酸序列公共数据库中存在大量的细菌 16SrDNA序列 ,本文利用这些已知细菌的 16SrDNA序列 ,设计了细菌种特异性的寡核苷酸探针 ,将其结果存入... 核酸二级数据库是生物信息学研究的重要领域 ,对生命科学的研究和发展起重要作用 .目前 ,国际核酸序列公共数据库中存在大量的细菌 16SrDNA序列 ,本文利用这些已知细菌的 16SrDNA序列 ,设计了细菌种特异性的寡核苷酸探针 ,将其结果存入二级数据库 ,以计算机网络为载体 ,开发了界面友好的通过WWW浏览器实现对数据库查询的系统 ,其查询结果形象直观 ,为设计细菌的种特异性寡核苷酸探针提供了参考和帮助 ,从而可加速对细菌分类及鉴定的进程 . 展开更多
关键词 细菌 种特异性 16SrDNA 寡核苷酸探针 二级数据库
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植物寡核苷酸荧光原位杂交技术方法 被引量:1
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作者 张凡凡 邢新滢 +2 位作者 石文清 沈懿 程祝宽 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期274-284,共11页
寡核苷酸荧光原位杂交技术是一种整合了生物信息学分析、DNA高通量合成以及荧光原位杂交实验的新兴技术。该技术适用于任何具有参考基因组的植物物种,并可根据研究需求设计靶向某个染色体区域、整条染色体或一组染色体的寡核苷酸探针,... 寡核苷酸荧光原位杂交技术是一种整合了生物信息学分析、DNA高通量合成以及荧光原位杂交实验的新兴技术。该技术适用于任何具有参考基因组的植物物种,并可根据研究需求设计靶向某个染色体区域、整条染色体或一组染色体的寡核苷酸探针,目前已成功应用于数种植物的核型分析、染色体变异、种群演化、同源染色体配对、单倍型分析和异源多倍体识别等研究。该文详述了植物寡核苷酸探针的设计、扩增和标记、染色体制备以及荧光原位杂交的具体操作流程,以期促进寡核苷酸荧光原位杂交技术在细胞遗传学研究中的应用。 展开更多
关键词 荧光原位杂交 寡核苷酸探针 染色体 植物
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