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2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究
被引量:
1
1
作者
王良喜
丁国富
+2 位作者
鲁永玲
罗平
周红
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第11期1095-1098,共4页
目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序...
目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12DNA和ECDNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸(12-ODN)。结果确定了19种Adv2、5DNA特征性的CpG基序,Adv2、5DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条。结论504条12-ODN可能是Adv2、5DNA的CpG-NODN。
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关键词
DNA
细菌
DNA
腺病毒
cpg
基序
抑制性
cpg
寡核苷酸
计算生物学
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职称材料
题名
2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究
被引量:
1
1
作者
王良喜
丁国富
鲁永玲
罗平
周红
机构
第三军医大学基础部药理学教研室
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第11期1095-1098,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(30271512)
文摘
目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12DNA和ECDNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸(12-ODN)。结果确定了19种Adv2、5DNA特征性的CpG基序,Adv2、5DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条。结论504条12-ODN可能是Adv2、5DNA的CpG-NODN。
关键词
DNA
细菌
DNA
腺病毒
cpg
基序
抑制性
cpg
寡核苷酸
计算生物学
Keywords
DNA,
bacterial
DNA,
adenoviral
cpg
motif
neutralizing
cpg
oligodeoxynucleotide
computational
biology
分类号
R342.38 [医药卫生—基础医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究
王良喜
丁国富
鲁永玲
罗平
周红
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
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职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
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