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2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究 被引量:1
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作者 王良喜 丁国富 +2 位作者 鲁永玲 罗平 周红 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1095-1098,共4页
目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序... 目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5DNA)与Adv12DNA及大肠杆菌DNA(ECDNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5DNA中能够拮抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12DNA和ECDNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12DNA和ECDNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸(12-ODN)。结果确定了19种Adv2、5DNA特征性的CpG基序,Adv2、5DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条。结论504条12-ODN可能是Adv2、5DNA的CpG-NODN。 展开更多
关键词 DNA 细菌 DNA 腺病毒 cpg基序 抑制性cpg寡核苷酸 计算生物学
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