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HIV-1广谱中和活性感染者假病毒的中和表型分析
被引量:
2
1
作者
邹森
张岱
+5 位作者
胡园园
齐中伟
侯佳利
任莉
邵一鸣
洪坤学
《中国热带医学》
CAS
2017年第7期646-649,674,共5页
目的分析HIV-1广谱中和活性感染者基于膜蛋白基因(env)的假病毒对自体血浆和代表性广谱单克隆中和抗体(bm NAbs)的中和表型。方法单基因组扩增(SGA)广谱中和活性感染者第0月血浆的env基因并克隆至pc D-NA^(TM)3.1 Directional TOPO表达...
目的分析HIV-1广谱中和活性感染者基于膜蛋白基因(env)的假病毒对自体血浆和代表性广谱单克隆中和抗体(bm NAbs)的中和表型。方法单基因组扩增(SGA)广谱中和活性感染者第0月血浆的env基因并克隆至pc D-NA^(TM)3.1 Directional TOPO表达载体,将env表达质粒与HIV-1骨架质粒p SG3△env共转染293T/17细胞制备假病毒,用假病毒分别与自体连续时间点血浆和代表性bm NAbs进行中和实验分析中和表型。结果共获得11株功能性假病毒,假病毒对8个连续时间点自体血浆的中和敏感性呈现先升高(第0~15月),后下降(第16~32月),之后再上升(第33~45月)的波动。所有假病毒对10E8、PGT121和VRC01中和敏感(IC_(50)<6μg/m L);各有18.2%(2株)的假病毒对12A21和2G12高度敏感(IC_(50)<1μg/m L);所有病毒均对PGT135呈中和抗性。结论假病毒对当前时间点血浆的中和敏感性低,对之后时间点血浆中和敏感性增强,提示感染者体内病毒与中和抗体的动态进化过程。同一时间点假病毒对特定bm-NAbs的敏感性差异明显,提示感染者准种毒株间中和表型的复杂性。
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关键词
HIV-1
膜蛋白
假病毒
中和表型
原文传递
极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究
2
作者
李毅
李爽
+3 位作者
张晓玲
曾新
桑鹏
杨力权
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2022年第1期95-102,共8页
作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建...
作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建的方法构建了极端中和表型HIV毒株(中和抵抗毒株H061.14与中和敏感毒株R2)的gp120结构模型,在逐渐升高的温度梯度下进行了高温分子动力学模拟,以研究二者在结构稳定性、解折叠和构象柔性上的差异.结果表明,HIV中和表型与gp120的热力学性质呈正相关,与解折叠程度无必然关联.各温度下gp120的结构偏差、天然接触含量、构象群体分布,以及单残基柔性的比较清楚地说明,中和敏感比中和抵抗gp120表现出更大的结构偏差、更多的构象状态和更高的构象柔性,但两者具有相似的解折叠程度.由极端中和表型HIV包膜蛋白gp120显著不同的热力学性质可以推断,HIV很可能利用gp120的热力学性质来调节其构象,进而平衡病毒侵染和免疫逃避之间的矛盾.我们的研究不仅揭示了极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的在构象柔性和结构稳定性上的差异,同时还从高温解折叠热力学的角度明确了极端中和表型HIV背后的分子基础.
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关键词
HIV中和表型
HIV包膜蛋白
解折叠热力学
动态性
高温分子动力学模拟
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职称材料
题名
HIV-1广谱中和活性感染者假病毒的中和表型分析
被引量:
2
1
作者
邹森
张岱
胡园园
齐中伟
侯佳利
任莉
邵一鸣
洪坤学
机构
中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室
出处
《中国热带医学》
CAS
2017年第7期646-649,674,共5页
基金
政府间国际科技创新合作重点专项(No.2016YFE0107600)
国家自然科学基金(No.81172809)
文摘
目的分析HIV-1广谱中和活性感染者基于膜蛋白基因(env)的假病毒对自体血浆和代表性广谱单克隆中和抗体(bm NAbs)的中和表型。方法单基因组扩增(SGA)广谱中和活性感染者第0月血浆的env基因并克隆至pc D-NA^(TM)3.1 Directional TOPO表达载体,将env表达质粒与HIV-1骨架质粒p SG3△env共转染293T/17细胞制备假病毒,用假病毒分别与自体连续时间点血浆和代表性bm NAbs进行中和实验分析中和表型。结果共获得11株功能性假病毒,假病毒对8个连续时间点自体血浆的中和敏感性呈现先升高(第0~15月),后下降(第16~32月),之后再上升(第33~45月)的波动。所有假病毒对10E8、PGT121和VRC01中和敏感(IC_(50)<6μg/m L);各有18.2%(2株)的假病毒对12A21和2G12高度敏感(IC_(50)<1μg/m L);所有病毒均对PGT135呈中和抗性。结论假病毒对当前时间点血浆的中和敏感性低,对之后时间点血浆中和敏感性增强,提示感染者体内病毒与中和抗体的动态进化过程。同一时间点假病毒对特定bm-NAbs的敏感性差异明显,提示感染者准种毒株间中和表型的复杂性。
关键词
HIV-1
膜蛋白
假病毒
中和表型
Keywords
HIV-1
envelope
pseudoviruses
neutralization
phenotype
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究
2
作者
李毅
李爽
张晓玲
曾新
桑鹏
杨力权
机构
大理大学数学与计算机学院
大理大学农学与生物科学学院
出处
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2022年第1期95-102,共8页
基金
国家自然科学基金(62003068,31960198)
云南省基础研究计划(2019FB021,2019FD014,2019FH001-103,2018FH001-062)。
文摘
作为HIV侵染细胞的蛋白质机器,包膜蛋白gp120利用序列变异和结构柔性等策略逃避宿主免疫识别,是病毒呈现出不同中和表型的主要原因.尽管HIV中和表型的分子机制已被初步探索,但其热力学相关的分子基础仍待进一步阐明.本研究利用同源模建的方法构建了极端中和表型HIV毒株(中和抵抗毒株H061.14与中和敏感毒株R2)的gp120结构模型,在逐渐升高的温度梯度下进行了高温分子动力学模拟,以研究二者在结构稳定性、解折叠和构象柔性上的差异.结果表明,HIV中和表型与gp120的热力学性质呈正相关,与解折叠程度无必然关联.各温度下gp120的结构偏差、天然接触含量、构象群体分布,以及单残基柔性的比较清楚地说明,中和敏感比中和抵抗gp120表现出更大的结构偏差、更多的构象状态和更高的构象柔性,但两者具有相似的解折叠程度.由极端中和表型HIV包膜蛋白gp120显著不同的热力学性质可以推断,HIV很可能利用gp120的热力学性质来调节其构象,进而平衡病毒侵染和免疫逃避之间的矛盾.我们的研究不仅揭示了极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的在构象柔性和结构稳定性上的差异,同时还从高温解折叠热力学的角度明确了极端中和表型HIV背后的分子基础.
关键词
HIV中和表型
HIV包膜蛋白
解折叠热力学
动态性
高温分子动力学模拟
Keywords
HIV
neutralization
phenotype
HIV
envelope
glycoprotein
Unfolding
thermodynamics
Flexibility
High
temperature
molecular
dynamics
simulation
分类号
O64 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HIV-1广谱中和活性感染者假病毒的中和表型分析
邹森
张岱
胡园园
齐中伟
侯佳利
任莉
邵一鸣
洪坤学
《中国热带医学》
CAS
2017
2
原文传递
2
极端中和表型HIV包膜蛋白gp120的高温分子动力学模拟研究
李毅
李爽
张晓玲
曾新
桑鹏
杨力权
《原子与分子物理学报》
CAS
北大核心
2022
0
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职称材料
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