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2株云南H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因序列分析 被引量：7
1
作者 李佳佳 李素华 +4 位作者 宋建领 黄景军 缪渊 陈曦 季佳 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第3期873-883,共11页
在2019年1月-2019年6月对云南出现呼吸道疫病的57个鸡场进行H9亚型禽流感检测的基础上,选取石林和楚雄2个H9亚型禽流感阳性样品进行病毒分离。从分离的H9N2亚型禽流感病毒感染鸡胚尿囊液中提取总RNA,采用特异性引物经反转录PCR分别扩增H... 在2019年1月-2019年6月对云南出现呼吸道疫病的57个鸡场进行H9亚型禽流感检测的基础上,选取石林和楚雄2个H9亚型禽流感阳性样品进行病毒分离。从分离的H9N2亚型禽流感病毒感染鸡胚尿囊液中提取总RNA,采用特异性引物经反转录PCR分别扩增HA和NA基因,PCR产物纯化后进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明,云南2株H9N2毒株HA基因核苷酸序列同源性为94.2%,NA基因核苷酸序列同源性为93.6%,系统进化分析表明云南H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因均属于欧亚谱系中的类ADKHKY28097分支(Y280-like),ACKYN12019和ACKYN72019 HA基因之间的同源性为94.3%,与参考毒株ACKJX2448的同源性最高,为95.6%~98.5%,与中国流行的H9N2代表株和疫苗株同源性较低。HA蛋白333-340位裂解位点为PSRSSR↓GLF,具有低致病性禽流感病毒分子特征,受体结合位点均发生E198T和Q234L的突变,具有人样受体结合特征,在29、141、298、305、313、492位氨基酸有6个糖基化位点。ACKYN12019和ACKYN72019 NA基因同源性为93.6%,与Y280-like代表毒株的同源性分别为97.1%~97.5%和93.7%~94.6%,NA蛋白缺失63、64、65位氨基酸,在44、69、86、146、200、234位氨基酸处存在6个潜在的糖基化位点,NA蛋白红细胞结合(HB)位点分析发现,368-369、399-403、432位氨基酸处存在变异。研究结果显示,H9N2亚型禽流感病毒一直处于不断的变异之中,故应加强其监测与防控。 展开更多
关键词 H9N2禽流感病毒 血凝素(HA)基因 神经氨酸酶(na)基因 分子特征
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2011—2018年青岛市B型流感病毒基因进化分析 被引量：5
2
作者 赵丹 孙睿 +3 位作者 苏志磊 史晓燕 汪照国 高汝钦 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期410-416,共7页
目的了解2011—2018年青岛市人群B型流感病毒(IBV)流行株基因进化变异趋势。方法2011—2018年间青岛市流感样病例标本12 236份,提取病毒RNA,采用IAV/IBV多重荧光RT-PCR方法鉴定流感病毒及型别,使用B/Victoria系和B/Yamagata系分型核酸... 目的了解2011—2018年青岛市人群B型流感病毒(IBV)流行株基因进化变异趋势。方法2011—2018年间青岛市流感样病例标本12 236份,提取病毒RNA,采用IAV/IBV多重荧光RT-PCR方法鉴定流感病毒及型别,使用B/Victoria系和B/Yamagata系分型核酸检测试剂盒检测IBV两个谱系;选取IBV 182株,RT-PCR扩增血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因,并进行序列测定,进行系统发育分析及氨基酸位点变异分析。结果2011—2018年青岛市几乎每年都会检出IBV,阳性率(4.99 %)仅比IAV(6.21 %)略低。B/Victoria和B/Yamagata分别出现了2个(2011—2012年,2015—2016年)和3个显著流行年份(2013—2014年,2014—2015年,2017—2018年)。感染人群以10岁以下儿童为主,两系具有相似的年龄特征。基于HA进化,B/Victoria系分离株分属于Vic-1A和Vic-1B,B/Yamagata系分离株分属于Yam-2和Yam-3。B/Yamagata在HA上的氨基酸变异位点多于B/Victoria,表现出更大的遗传多样性。B/Yamagata系在抗原决定簇上已发生了12个氨基酸位点变异,在受体结合位点上发生了2个氨基酸位点变异;B/Victoria系则分别已发生7个和3个氨基酸位点变异。青岛市IBV基因重配频繁,系内重配26株,多发生在B/Victoria系内;系间重配23株,多发生在HA-B/Yamagata与NA-B/Victoria之间。发现了1株可能的NA抑制剂耐药株。结论IBV在季节性流感中的地位不容忽视。氨基酸替换、插入-缺失和基因片段重配是IBV自然进化的主要策略。流感监测十分重要,流感疫苗株需要及时更新。 展开更多
关键词 B型流感病毒 HA基因 na基因 基因进化分析
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甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因进化分析 被引量：4
3
作者 刘倜 林艺 +5 位作者 王爽 张圣洋 尹玉岩 李忠 王显军 毕振强 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期20-22,共3页
目的探讨2009年山东省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶（neuram inidase,NA）基因的进化及NA基因编码蛋白抗原性、酶活性位点、糖基化位点变异情况。方法对山东省分离的20株甲型H1N1流感病毒的NA基因序列,用MEGA 4.0软件进行基因进化分析和... 目的探讨2009年山东省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶（neuram inidase,NA）基因的进化及NA基因编码蛋白抗原性、酶活性位点、糖基化位点变异情况。方法对山东省分离的20株甲型H1N1流感病毒的NA基因序列,用MEGA 4.0软件进行基因进化分析和氨基酸序列分析。结果山东省2009年9月-2010年1月分离的20株甲型H1N1流感病毒NA基因的同源性均〉99.2%,其中有4株的同源性为100%;与疫苗株[A-Californ ia-07-2009（H1N1）]、国内推荐株[A-S ichuan-SWL1-2009（H1N1）]的同源性分别为99.1%~99.5%和99.1%~99.6%;有13个神经氨酸酶基因的氨基酸发生了替换,为21、23、25、42、43、60、76、94、106、122、248、307和351位;未发生神经氨酸酶蛋白275位H-Y的替换。结论山东省分离的甲型H1N1流感病毒NA基因高度保守,潜在抗原位点氨基酸分布相同;所有毒株的酶活性中心位点以及糖基化位点均高度保守;所有测定样本均未发生对达菲类药物的耐药性突变。 展开更多
关键词 甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶(na) 高度保守
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流感疫苗株H3N2(NYMCX-223A)主要抗原基因特征与传代稳定性 被引量：1
4
作者 程鹏飞 刘朝阳 闫现伟 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2014年第2期151-155,共5页
目的分析2013年流感疫苗生产用甲型H3N2(NYMCX-223A)毒株主要抗原血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征,并检测该疫苗株主种子批、工作种子批及疫苗病毒收获液的传代稳定性。方法对制备的H3N2疫苗株的主种... 目的分析2013年流感疫苗生产用甲型H3N2(NYMCX-223A)毒株主要抗原血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征,并检测该疫苗株主种子批、工作种子批及疫苗病毒收获液的传代稳定性。方法对制备的H3N2疫苗株的主种子批、工作种子批及疫苗病毒收获液进行全面的生物学特性检测;采用RT-PCR法从主种子批、工作种子批及疫苗病毒收获液中扩增HA及NA基因片段,并进行全基因序列测定及分析;应用MEGA 5.05软件对7株不同年份的H3N2亚型疫苗株的HA氨基酸序列进行比对,绘制基因种系发生树。结果 H3N2疫苗株的主种子批、工作种子批抗原性与2013年度WHO推荐毒株相一致,其他生物学特性均符合《中国药典》三部(2010版)标准;主要抗原HA基因序列长度为1 701 bp,编码566个氨基酸;NA基因序列长度为1 410 bp,编码469个氨基酸,各代次流感病毒HA和NA基因核苷酸和氨基酸序列均一致,与GenBank公布的序列完全一致,同源性为100%。2013年与2012年H3N2疫苗株HA氨基酸序列相比,同源性为97.5%。2013年与2012年H3N2疫苗株具有较远的进化距离,与同源性结果相对应。结论 2013年甲型H3N2(NYMCX-223A)流感疫苗株主要抗原基因传代稳定,一般生物学特性符合《中国药典》三部(2010版)要求。2013年与2012年H3N2疫苗株序列差异较大。 展开更多
关键词 流感病毒A型 H3N2亚型 血凝素 神经氨酸酶 基因特征 稳定性
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