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MLMT与MLST在新生隐球菌基因分型中的应用研究
1
作者 朱键 曹佳非 +2 位作者 康颖倩 三上襄 Wieland Meyer 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第1期84-89,共6页
目的 探讨多位点微卫星灶分型(MLMT)和多位点序列分型(MLST)在新生隐球菌(C.neoformans)基因分型中的应用。方法 提取22株来源于国内及日本已明确为新生隐球菌的菌株DNA,经MLMT及MLST相应位点的引物进行扩增、测序;计算各微卫星灶(CNG1... 目的 探讨多位点微卫星灶分型(MLMT)和多位点序列分型(MLST)在新生隐球菌(C.neoformans)基因分型中的应用。方法 提取22株来源于国内及日本已明确为新生隐球菌的菌株DNA,经MLMT及MLST相应位点的引物进行扩增、测序;计算各微卫星灶(CNG1、CNG2及CNG3)序列中简单重复序列的重复数,确定菌株MLMT的基因型;将本研究菌株的MLST中各位点序列和网上数据库相应序列进行对比,获取该菌株的MLST基因型;比较两种方法在分型中分辨能力。结果 在22株菌中,有16株的基因型为MLMT17/MLST5(16/22,72.73%),MLMT将所有菌株分为7型,而MLST分为4型;根据MLST分型,MLMT17、16、34及39的菌株为MLST5;MLMT2、14、29相对应MLST66、32及31;两种方法的分型分辨能力比较,差异无统计学意义(P=0.488)。结论 MLMT-17/MLST 5是我国和日本的新生隐球菌常见基因型,包含CNG1、CNG2及CNG3位点的MLMT可作为MLST的替代或补充。 展开更多
关键词 新生隐球菌 多位点微卫星灶分型 多位点序列分型
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新生隐球菌格鲁比变种临床株与环境株微卫星基因型的小鼠毒力实验研究 被引量：5
2
作者 康颖倩 赵亮 +6 位作者 王梅竹 张金娟 贺娟 陈玉如 王丹霓 朱键 三上襄 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期577-581,共5页
目的了解巴西新生隐球菌格鲁比变种（C.neoformans var．grubii）多位点微卫星定型（ multilocus microsatllite typing, MLMT）在临床和环境中的分布特点，探讨不同微卫星型的新生隐球菌格鲁比变种临床株和环境株的毒力差异。方法根据... 目的了解巴西新生隐球菌格鲁比变种（C.neoformans var．grubii）多位点微卫星定型（ multilocus microsatllite typing, MLMT）在临床和环境中的分布特点，探讨不同微卫星型的新生隐球菌格鲁比变种临床株和环境株的毒力差异。方法根据多位点微卫星分型技术对分离自巴西的40株（17株临床株和23株环境株）新生隐球菌格鲁比变种进行分型，筛选出临床株及环境株中分布占优势的菌株，应用小鼠毒力试验分别对其进行毒力检测，通过发病情况及病理切片比较毒力差异。结果40株格鲁比变种共鉴定出11种微卫星型，临床株中的优势菌株为MLMT-13型，共9株，占临床株的52．9％（9／17），环境株中的优势菌株为MLMT－36型，共10株，占环境株的43．5％（10／23）；小鼠毒力试验结果显示MLMT－13型感染小鼠后发病率为100％，而MLMT－36型发病率为7．5％，且病理结果也存在明显差异。结论格鲁比变种在从环境迁徙到宿主的过程中，毒力随环境的变化发生了改变，该变化也可在其微卫星重复序列上体现出来。该实验证明新生隐球菌格鲁比变种的分布及来源与微卫星型之间存在相关性，临床株MLMT-13型和环境株MLMT－36型之间存在着显著毒力差异。 展开更多
关键词 新生隐球菌格鲁比变种 多位点微卫星分型 小鼠毒力试验
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中国南方地区马尔尼菲青霉分子流行病学初步研究 被引量：3
3
作者 赵亮 唐秀文 +6 位作者 王梅竹 曹煜 牟丽丽 金方 李小玲 陈玉如 康颖倩 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期36-39,11,共5页
目的分离及鉴定贵州、广西、广东各地临床分离的马尔尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM),通过微卫星基因多态性分析进行分子流行病学初步研究。方法从贵州、广西、广东地区临床病人标本中分离马尔尼菲青霉,通过形态学及ITS序列进行鉴定... 目的分离及鉴定贵州、广西、广东各地临床分离的马尔尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM),通过微卫星基因多态性分析进行分子流行病学初步研究。方法从贵州、广西、广东地区临床病人标本中分离马尔尼菲青霉,通过形态学及ITS序列进行鉴定,运用多位点微卫星分型法(multilocus microsatellite typing,MLMT)和SPSS18.0软件对分离的马尔尼菲青霉进行基因多态性及其相关性分析。结果贵州、广西和广东共收集鉴定马尔尼菲青霉临床株50株,3个微卫星位点PMMI、PMMII、PMMIII分别检测到29、9和8种等位基因,50株菌共分为47个微卫星型(PMMT);聚类分析将贵州及广西、广东地区马尔尼菲青霉分为6大类(Cluster1-Cluster 6)。结论贵州、广西、广东地区的马尔尼菲青霉具有较高的基因多态性,我国南方地区相邻省份马尔尼菲青霉的种群基因结构与地域分布之间存在着一定的相关性。 展开更多
关键词 马尔尼菲青霉菌 多位点微卫星基因分型 分子流行病学
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云南省部分地区鸽粪中新型隐球菌格鲁比变种微卫星分型分析 被引量：2
4
作者 陶星辰 程攀 苏鸿雁 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第2期107-109,共3页
目的对云南部分地区鸽粪分离株新型隐球菌进行多位点微卫星位点(multilocus microsatellite typing,MLMT)分型,了解其种群分布特征。方法对分离自云南省部分地区鸽粪中的152株新型隐球菌提取DNA,分别以CNG1、CNG2、CNG3为引物进行PCR扩... 目的对云南部分地区鸽粪分离株新型隐球菌进行多位点微卫星位点(multilocus microsatellite typing,MLMT)分型,了解其种群分布特征。方法对分离自云南省部分地区鸽粪中的152株新型隐球菌提取DNA,分别以CNG1、CNG2、CNG3为引物进行PCR扩增并测序,计算每一菌株CNG1中TA、CNG2中GA以及CNG3中CAT的重复数,结合不同基序重复数进行MLMT分型。结果采用MLMT法将大理、昭通、曲靖和临沧地区鸽粪分离株新型隐球菌格鲁比变种分为6个基因型,其中MLMT-17型占91.45%,为主要基因型;MLMT-26、29、34、39、40型分别占0.66%、1.97%、0.66%、0.66%和4.60%。结论 MLMT-17是云南省部分地区鸽粪新型隐球菌格鲁比变种中最常见的基因型。 展开更多
关键词 新型隐球菌格鲁比变种 鸽粪 多位点微卫星灶分型
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中国和巴西临床新生隐球菌格鲁比变种菌株的种群和基因型比较分析 被引量：1
5
作者 朱键 刘莹 +1 位作者 大楠悦子 三上襄 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期206-209,共4页
目的了解新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii)临床菌株在国内和巴西多位点微卫星位点定型(multilocus microsatellite typing MLMT)的种群分布特征,探讨并分析两国新生隐球菌格鲁比变种MLMT基因型差异。方法对已... 目的了解新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii)临床菌株在国内和巴西多位点微卫星位点定型(multilocus microsatellite typing MLMT)的种群分布特征,探讨并分析两国新生隐球菌格鲁比变种MLMT基因型差异。方法对已鉴定的69株新生隐球菌格鲁比变种进行DNA提取,采用3个微卫星位点(CNG1、CNG2、CNG3)的正反序列引物对相应的微卫星位点基因片段进行扩增后测序;测序后计算出每一菌株位点基序重复数(CNG1对应TA重复,CNG2对应GA重复,CNG3对应CAT重复);结合不同基序重复数判定各菌株的基因型。应用SPSS 11.5统计软件进行统计学分析。结果在33株被MLMT基因分型的国内新生隐球菌grubii变种菌株中有5种基因型被鉴定,其中29株为MLMT-17,占87.88%;而在36株巴西临床菌株中有10种基因型被鉴定,其中19株为MLMT-13,占52.78%。结论两国间新生隐球菌格鲁比变种临床菌株的主要基因型分布存在显著差异。巴西临床菌株的基因型分布表现为多样性。 展开更多
关键词 新生隐球菌变种格鲁比 临床菌株 多位点微卫星灶分型
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