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基于HSMM和K-means的纳米孔多级事件检测
被引量：
2
1
作者
赖永杭
颜秉勇
王慧锋
《华东理工大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期220-226,共7页
提出了一种基于隐半马尔科夫模型(HSMM)和K-means的混合算法,用于对纳米孔数据中出现的多级事件进行分析。通过K-means对检测到的阻断事件进行分析,确定纳米孔信号中的电流幅值水平个数,将其作为HSMM模型的隐状态输入;然后采用HSMM识别...
提出了一种基于隐半马尔科夫模型(HSMM)和K-means的混合算法,用于对纳米孔数据中出现的多级事件进行分析。通过K-means对检测到的阻断事件进行分析,确定纳米孔信号中的电流幅值水平个数,将其作为HSMM模型的隐状态输入;然后采用HSMM识别多级事件内部的不同水平,确定各水平的幅值和持续时间。最后将算法与Opennanopore软件进行比较,对三级、四级事件进行处理。仿真结果发现:HSMM比Opennanopore软件的准确率高,能够准确对事件进行分级。
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关键词
纳米孔
HSMM
K-MEANS
多级事件
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职称材料
题名
基于HSMM和K-means的纳米孔多级事件检测
被引量：
2
1
作者
赖永杭
颜秉勇
王慧锋
机构
华东理工大学信息科学与工程学院
出处
《华东理工大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期220-226,共7页
基金
国家重大仪器专项(21327807)
文摘
提出了一种基于隐半马尔科夫模型(HSMM)和K-means的混合算法,用于对纳米孔数据中出现的多级事件进行分析。通过K-means对检测到的阻断事件进行分析,确定纳米孔信号中的电流幅值水平个数,将其作为HSMM模型的隐状态输入;然后采用HSMM识别多级事件内部的不同水平,确定各水平的幅值和持续时间。最后将算法与Opennanopore软件进行比较,对三级、四级事件进行处理。仿真结果发现:HSMM比Opennanopore软件的准确率高,能够准确对事件进行分级。
关键词
纳米孔
HSMM
K-MEANS
多级事件
Keywords
nanopore
HSMM
K
-m
e
a
n
s
multi
-
level
events
分类号
TH776 [机械工程—仪器科学与技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于HSMM和K-means的纳米孔多级事件检测
赖永杭
颜秉勇
王慧锋
《华东理工大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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