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基于COLLATE融合多图谱的心脏电影MRI右心室分割 被引量:7
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作者 王丽嘉 苏新宇 +2 位作者 李亚 胡立伟 聂生东 《波谱学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期407-416,共10页
右心室分割对肺动脉高压等疾病的心功能分析具有重要的临床意义.然而,右心室心肌薄、易变且不规则,其传统的医学图像分割方法仍然未能取得突破性进展.本文提出基于COLLATE(Consensus Level, Labeler Accuracy and Truth Estimation)的... 右心室分割对肺动脉高压等疾病的心功能分析具有重要的临床意义.然而,右心室心肌薄、易变且不规则,其传统的医学图像分割方法仍然未能取得突破性进展.本文提出基于COLLATE(Consensus Level, Labeler Accuracy and Truth Estimation)的多图谱分割方法,首先以归一化互信息为相似测度对目标图像和图谱集进行B样条配准以获取粗分割结果;然后利用COLLATE对粗分割结果进行融合;最后采用基于形状约束的区域生长算法修正出现错误的数据.10例临床心脏磁共振短轴电影图像被用于算法验证.本文还将使用基于COLLATE的多图谱分割方法得到的结果与深度学习算法及手动分割进行了比较.结果显示与深度学习算法比较,使用本文算法得到的射血分数(Ejection Fraction, EF)与手动分割更加一致和相关,表明该算法的分割结果有望辅助临床心脏功能诊断. 展开更多
关键词 右心室 心脏磁共振电影成像 多图谱分割 COLLATE融合
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Multi-Atlas Based Methods in Brain MR Image Segmentation 被引量:1
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作者 孙亮 张丽 张道强 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 2019年第2期110-119,共10页
Brain region-of-interesting (ROI) segmentation is an important prerequisite step for many computeraid brain disease analyses.However,the human brain has the complicated anatomical structure.Meanwhile,the brain MR imag... Brain region-of-interesting (ROI) segmentation is an important prerequisite step for many computeraid brain disease analyses.However,the human brain has the complicated anatomical structure.Meanwhile,the brain MR images often suffer from the low intensity contrast around the boundary of ROIs,large inter-subject variance and large inner-subject variance.To address these issues,many multi-atlas based segmentation methods are proposed for brain ROI segmentation in the last decade.In this paper,multi-atlas based methods for brain MR image segmentation were reviewed regarding several registration toolboxes which are widely used in the multi-atlas methods,conventional methods for label fusion,datasets that have been used for evaluating the multiatlas methods,as well as the applications of multi-atlas based segmentation in clinical researches.We propose that incorporating the anatomical prior into the end-to-end deep learning architectures for brain ROI segmentation is an important direction in the future. 展开更多
关键词 multi-atlas BRAIN segmentation MAGNETIC RESONANCE
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基于多图谱配准的三维胰腺CT图像分割 被引量:2
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作者 李进 王远军 《光学技术》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期350-356,共7页
胰腺的自动分割一直是医学图像分割中一项具有挑战性的问题。胰腺是一个具有高度解剖变异性的器官,目前的多图谱分割方法很难对胰腺的边缘产生精确的分割。针对这一问题,采用了基于多图谱配准的分割算法对胰腺进行分割,优化了一种局部... 胰腺的自动分割一直是医学图像分割中一项具有挑战性的问题。胰腺是一个具有高度解剖变异性的器官,目前的多图谱分割方法很难对胰腺的边缘产生精确的分割。针对这一问题,采用了基于多图谱配准的分割算法对胰腺进行分割,优化了一种局部动态阈值的后处理方法。在标签融合阶段,采用概率阈值融合算法、Majority voting(MV)算法、STAPLE算法和SIMPLE算法四种标签融合算法进行对比。在后处理阶段,采用局部动态阈值处理方法,首先通过初步分割结果对目标图像提取目标区域,然后自动确定阈值实现该区域的二值化,最终与初步分割结果取交集作为最终分割结果。采用留一交叉验证策略对80例NIH胰腺CT图像和22例来自上海本地医院的胰腺CT图像进行分割,最终得到的DSC分别为79.98%和81.30%。实验结果表明,所提方法实现了对胰腺的有效分割。 展开更多
关键词 多图谱 配准 胰腺分割 标签融合 局部动态阈值
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基于ITK多图谱配准的脑部皮质下核团的分割研究 被引量:2
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作者 聂秀玲 刘任远 +3 位作者 陆加明 张冰 孙钰 万遂人 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期529-535,共7页
大量研究表明,阿尔茨海默症(AD)的病变与大脑皮质下核团的萎缩息息相关,某些核团的萎缩(如海马)可能成为AD疾病早期诊断的标志,而皮质下核团的分割是研究核团萎缩模式的重要前提。基于AD患者和正常人各30例3DT1W-MR图像,先结合直方图分... 大量研究表明,阿尔茨海默症(AD)的病变与大脑皮质下核团的萎缩息息相关,某些核团的萎缩(如海马)可能成为AD疾病早期诊断的标志,而皮质下核团的分割是研究核团萎缩模式的重要前提。基于AD患者和正常人各30例3DT1W-MR图像,先结合直方图分析和三维形态学分析方法对图像进行脑组织提取,后采用ITK配准算法将10个脑图谱图像经两阶段分别配准到提取脑组织后的图像空间。第一阶段实现基于均方差的仿射配准,第二阶段实现基于互信息的B样条形变配准,两阶段的配准均采用线性插值法和梯度下降的优化搜索方法。最后采用STAPLE融合算法,对配准后得到的10个目标图像进行图像融合,得到最终的分割结果。结果表明:除尾状核外,分割得到的其余6对核团的体积与常用的FSL-FIRST算法的分割结果无统计学差别(P>0.05);AD患者的右侧伏核和双侧海马发生萎缩(P<0.05)。因此,基于ITK配准框架的多图谱配准分割方法能有效分割MR图像上边界不明确的皮质下核团。 展开更多
关键词 皮质下核团 多图谱分割 图像配准 ITK
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多项式展开配准的多图谱大脑磁共振图像分割 被引量:2
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作者 蔡文琴 王远军 《光学技术》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期734-740,共7页
全脑区的自动分割对于大脑疾病的诊断和治疗具有重要的临床意义。为了提高分割准确率,提出了一种多项式展开配准的多图谱分割算法。利用线性多项式展开模型,结合仿射变换和非刚体变换将待分割的目标图像与图谱图像进行逐一的配准来获取... 全脑区的自动分割对于大脑疾病的诊断和治疗具有重要的临床意义。为了提高分割准确率,提出了一种多项式展开配准的多图谱分割算法。利用线性多项式展开模型,结合仿射变换和非刚体变换将待分割的目标图像与图谱图像进行逐一的配准来获取位移场;利用归一化互信息计算二者的相似度,筛选出与目标图像相似度较高的图谱,并对图谱的标记图像进行位移场映射,得到粗分割结果;采用全局加权投票法将粗分割结果进行融合,得到最终的细分割结果。选取了35例来自MICCAI 2012 Multi-Atlas Labeling挑战和10例来自上海交通大学医学院附属第九人民医院的磁共振T1加权图像对该方法进行验证,最终全脑区的DSC值分别为0.7585和0.7351。实验结果表明,算法具有较高的大脑分割精确度和鲁棒性,有望辅助临床进行大脑相关疾病的诊断和治疗。 展开更多
关键词 磁共振成像 多图谱分割 全脑区 多项式展开配准
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基于心脏电影磁共振图像的一种新的右心室多图谱分割方法 被引量:2
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作者 苏新宇 王丽嘉 朱艳春 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第19期44-54,共11页
基于心脏电影磁共振图像的右心室(RV)分割,对心脏疾病的诊疗及预后有着十分重要的意义.右心室结构复杂,传统图像分割方法始终未能达到较高的精度.多图谱方法通过配准和融合来实现RV 分割,是近几年RV 分割中的主要方法之一.本文提出一种... 基于心脏电影磁共振图像的右心室(RV)分割,对心脏疾病的诊疗及预后有着十分重要的意义.右心室结构复杂,传统图像分割方法始终未能达到较高的精度.多图谱方法通过配准和融合来实现RV 分割,是近几年RV 分割中的主要方法之一.本文提出一种新的右心室多图谱分割方法,能够实现RV 的全自动准分割.本文首先采用自适应仿射传播算法获取一系列图谱集,并基于豪斯多夫距离和归一化互信息选择与目标图像最相似的图谱集;然后,依次采用多分辨率的仿射变换和Diffeomorphic demons 算法将目标图像配准到最相似图谱集,并将配准得到的形变场应用于标记图像获得粗分割结果;最后,本文采用COLLATE 算法融合粗分割结果得到RV 轮廓. 30 例心脏电影磁共振数据被用于回顾性分析.本文算法与放射专家手工分割的RV 相比, Dice 指标和豪斯多夫距离的平均值分别为0.84, 11.46 mm;舒张末期容积,收缩末期容积,射血分数的相关系数和偏差均值分别是0.94, 0.90, 0.86;2.5113,–3.4783, 0.0341.与卷积神经网络相比,本文算法在收缩末期的分割精度更接近手动分割结果.实验结果表明,该方法从有效的图谱选择和基于多分辨率的Diffeomorphic demons 算法的多级配准提高了右心室分割的精度,有望应用于临床辅助诊断. 展开更多
关键词 心脏磁共振图像 右心室 多图谱分割 微分同胚demons
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多图谱与联合标签融合策略相结合的主动脉CT图像分割 被引量:1
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作者 徐云龙 郑元杰 +3 位作者 邓翔 李宁 汤煜春 尹义龙 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2018年第2期280-287,共8页
主动脉图像自动分割技术在主动脉疾病的早期诊断、风险评估及手术治疗中发挥重要作用。本文采用了基于多图谱的医学图像分割技术,并将之与联合标签融合(Joint label fusion,JLF)策略相结合应用于3D主动脉CT图像的自动分割问题中。联合... 主动脉图像自动分割技术在主动脉疾病的早期诊断、风险评估及手术治疗中发挥重要作用。本文采用了基于多图谱的医学图像分割技术,并将之与联合标签融合(Joint label fusion,JLF)策略相结合应用于3D主动脉CT图像的自动分割问题中。联合标签融合策略考虑了各个图谱之间的相互关系,能够有效抑制图谱间冗余信息的干扰,进而提高标签融合精度。本文提出了一种图谱更新算法以应对图谱数量不足的问题,在提高分割精度的同时,保持了较低的计算复杂度。在15例主动脉CT图像数据上的分割结果表明,本文方法能有效地对3D主动脉图像进行分割,与3种基于传统融合方式的图谱分割法相比,本文方法具有更高的分割精度。 展开更多
关键词 多图谱分割 联合标签融合策略 3D主动脉CT图像 图谱更新
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基于多图谱标签融合的脑MRI图像分割 被引量:1
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作者 梁艳 《浙江科技学院学报》 CAS 2016年第5期373-378,共6页
针对图谱标签融合问题,提出了一种基于SVM的多尺度图像块表示的标签融合方法。该方法将MRI图像中的每个体素用其邻域的一个多尺度图像块来表示,对待分割目标图像中每个体素(目标块),在图谱图像相应位置提取若干与该体素对应的图像块(图... 针对图谱标签融合问题,提出了一种基于SVM的多尺度图像块表示的标签融合方法。该方法将MRI图像中的每个体素用其邻域的一个多尺度图像块来表示,对待分割目标图像中每个体素(目标块),在图谱图像相应位置提取若干与该体素对应的图像块(图谱块),通过计算图谱块与目标块之间的相似性,排除一些不相似图谱块的干扰;运用SVM对剩下由图谱块和与之对应的标签组成的样本进行学习训练,再运用训练得到的模型对目标块中心点的标签值进行预测,从而获得待分割目标图像的分割结果。通过对比不同标签融合方法对IBSR数据库脑部组织的分割,验证了所提出方法的有效性。 展开更多
关键词 多图谱 标签融合 支持向量积 图像块 多尺度 图像分割
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改进多图谱配准的三维医学图像分割算法
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作者 郭姝琪 马瑜 +1 位作者 李光昊 王仕儒 《无线电工程》 北大核心 2023年第6期1251-1261,共11页
为提高海马体分割精度与时间效率,在多图谱分割(Multi-Atlas Segmentation,MAS)脑部图像的配准阶段提出可变形配准网络EDUNet。针对浮动图像与固定图像,进行数据预处理,使其受到外界的影响最小,在配准阶段,用ANTs代替传统“粗”配准,利... 为提高海马体分割精度与时间效率,在多图谱分割(Multi-Atlas Segmentation,MAS)脑部图像的配准阶段提出可变形配准网络EDUNet。针对浮动图像与固定图像,进行数据预处理,使其受到外界的影响最小,在配准阶段,用ANTs代替传统“粗”配准,利用卷积神经网络(Convolutional Newral Nerwork,CNN)改进“精”配准,对配准场进行估计,并引入注意力机制及空洞卷积模块。注意力机制用于自动学习和优化注意力特征,加强特征表达能力;空洞卷积扩大感受野,获取多尺度信息;配准中使用端到端网络,减少配准时间、提高配准效率。算法在OASIS数据集与LBPA40数据集进行了验证,配准精度可达0.7863,使用基于局部二元模式的特征提取方法进行标签融合后,最终分割精度较其他方法提升3%~10%,验证了算法的有效性和准确性。 展开更多
关键词 多图谱分割 图像配准 注意力机制 配准场估计 空洞卷积
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对称归一化配准的多图谱大脑扩散张量图像分割 被引量:1
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作者 蔡文琴 王远军 《上海理工大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期177-184,共8页
基于磁共振T1成像的全脑区分割方法及其在临床上的应用已经有较为广泛的研究,磁共振扩散张量成像凭借其在脑白质神经纤维束成像上的优势,近年来围绕扩散张量成像的理论和应用研究发展很快,针对扩散张量成像的脑区分割研究就成为一个必... 基于磁共振T1成像的全脑区分割方法及其在临床上的应用已经有较为广泛的研究,磁共振扩散张量成像凭借其在脑白质神经纤维束成像上的优势,近年来围绕扩散张量成像的理论和应用研究发展很快,针对扩散张量成像的脑区分割研究就成为一个必须要解决的问题。图像配准是精确实现脑区分割的重要技术步骤,传统的配准方法未考虑到图像的形变大小对配准精度的影响,最新的对称配准策略是解决这一问题的最好选择。因此,考虑到扩散张量图像的分辨率低的特点,以及对称配准的技术先进性,提出了一种自动方法进行了扩散张量图像的全脑分区,并利用统计学SPSS软件对阿尔茨海默症(AD)患者与正常对照组(NC)数据进行了比较研究,验证了所提出的脑区分割方法的准确性。 展开更多
关键词 扩散张量成像 多图谱分割 全脑区 对称图像归一化配准
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基于加权相似性度量的脑MR图像特定组织分割 被引量:4
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作者 刘宏 王捷 +4 位作者 宋恩民 许向阳 覃媛媛 李峻 汤翔宇 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2014年第6期1241-1250,共10页
基于多图谱的分割方法能有效解决脑MR图像中特定对象如海马体、杏仁核等组织的自动精确分割问题.为加快处理速度,该方法需要从大型图谱数据集中挑选与目标分割图像比较近似的若干图谱作为分割参考.传统的多图谱分割方法在选择图谱时通... 基于多图谱的分割方法能有效解决脑MR图像中特定对象如海马体、杏仁核等组织的自动精确分割问题.为加快处理速度,该方法需要从大型图谱数据集中挑选与目标分割图像比较近似的若干图谱作为分割参考.传统的多图谱分割方法在选择图谱时通常只依据图谱图像与目标图像在灰度上的相似性,没有考虑到两者在分割对象局部形态上的相似性,使得所选择的图谱对分割的参考价值难以保证.针对这一问题,文中提出一种图谱图像与目标图像的以分割对象为中心的加权相似性度量方法,首先通过将图谱图像向目标图像作全局配准得到分割对象在目标图像中的估计位置,然后根据分割对象在两幅图像间的局部扭曲形变来度量它们的相似性.文中将这种加权相似度应用到多图谱分割方法中,在图谱选择时只挑选与目标图像具有较高加权相似度的部分图谱,在融合分割标记时将加权相似度作为权重.对IBSR脑MR图像中豆状核壳核组织的分割实验结果表明,基于该加权相似性度量的多图谱分割方法可以得到较高的分割精度. 展开更多
关键词 脑MR图像 多图谱分割 图谱选择 标记融合 图像配准 加权相似度
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低分辨率医学图像的多图谱分割方法
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作者 贺光华 祝汉灿 梁克维 《高校应用数学学报(A辑)》 CSCD 北大核心 2017年第3期371-378,共8页
基于多图谱的图像分割方法因其分割精度高和鲁棒性强,在医学图像分割领域被广泛研究,主要包含图像配准和标签融合两个步骤.目前对多图谱分割方法的研究通常都是在图谱图像和待分割目标图像具有相同分辨率的情况下展开的.然而,由于受图... 基于多图谱的图像分割方法因其分割精度高和鲁棒性强,在医学图像分割领域被广泛研究,主要包含图像配准和标签融合两个步骤.目前对多图谱分割方法的研究通常都是在图谱图像和待分割目标图像具有相同分辨率的情况下展开的.然而,由于受图像采集时间,采集设备等影响,临床实践中采集的影像大多是低分辨率数据,使得目前在影像研究中广泛使用的方法无法有效应用于临床实践.因此,针对这一问题,我们结合图像超分辨率恢复方法,提出了精确鲁棒的低分辨率医学图像的多图谱分割方法,实验结果显示提出的方法显著地提高了多图谱分割方法的分割精度. 展开更多
关键词 低分辨率图像 图像配准 多图谱图像分割 图像超分辨率恢复
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基于图像相似度的多权重图谱DTI自动分割算法研究 被引量:4
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作者 李国琴 王瑾 +3 位作者 谭艳丽 焦冬莉 薄晓宁 刘继军 《电子测量技术》 2020年第6期116-122,共7页
扩散张量磁共振成像(DT-MRI,简称DTI)是一种能够对脑组织中复杂的白质纤维束进行观察和追踪的一种特殊形式。而针对DTI对噪声和灰度敏感,传统的分割方法难以对脑组织进行精确分割的特点,设计了一种基于图像相似度的多权重图谱DTI自动分... 扩散张量磁共振成像(DT-MRI,简称DTI)是一种能够对脑组织中复杂的白质纤维束进行观察和追踪的一种特殊形式。而针对DTI对噪声和灰度敏感,传统的分割方法难以对脑组织进行精确分割的特点,设计了一种基于图像相似度的多权重图谱DTI自动分割算法(MAPS)。MAPS是在MAIS的基础上通过分割图像的自相似性及引导滤波进行优化的方法。结果为MAPS分割的重叠率要优于MAIS大约6%,并且MAPS的分割结果比MAIS在三维效果上更接近专家的手动分割结果(即金标准),结果表明MAPS相较于MAIS有着更精确的分割效果及更优异的性能。 展开更多
关键词 扩散张量磁共振图像 相似度 多图谱 多权重 自动分割
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