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碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的分子特征 被引量:30
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作者 高倩倩 殷杏 +4 位作者 祝俊英 秦娟秀 黄芊 夏强 李敏 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期53-57,共5页
目的了解碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)耐药基因与毒力基因的分布及分子流行病学特征。方法收集2015年上海地区两所教学医院临床分离非重复的84株CRKP,采用纸片扩散法检测其对15种抗菌药物耐药表型,黏液丝试验检测高黏液表型,聚合... 目的了解碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)耐药基因与毒力基因的分布及分子流行病学特征。方法收集2015年上海地区两所教学医院临床分离非重复的84株CRKP,采用纸片扩散法检测其对15种抗菌药物耐药表型,黏液丝试验检测高黏液表型,聚合酶链反应(PCR)及测序分析常见的碳青霉烯类耐药基因(bla_(KPC-2)、bla_(NDM)、bla_(IMP)、bla_(OXA)、bla_(VIM))与毒力基因(rmpA、mrkD、entB、ybtS、magA、iutA、allS、kfu),多位点序列分型(MLST)方法进行克隆分型,eBURST软件对克隆分型结果进行种群结构分析。结果 84株CRKP除对环丙沙星及阿米卡星耐药率分别为77.4%(65株)和82.1%(69株)外,对其他抗菌药物耐药率高,均在90%以上,对亚胺培南、美罗培南、厄他培南耐药率均为100%。黏液丝试验阳性2株。PCR测序显示92.9%(78株)CRKP携带碳青霉烯类耐药基因,其中blaKPC-2的阳性率为90.5%(76株),分别检出1株bla_(NDM)、bla_(IMP)阳性菌株,未检出bla_(OXA)和bla_(VIM)。毒力基因mrkD、ybtS和entB分别为97.6%(82株)、92.9%(78株)和100%(84株),其他毒力基因阳性率较低。MLST分为8个ST型,以ST11为主,占71株(84.5%),ST15为4株,ST323为4株,2株高黏液表型克隆株均为ST11型。e BURST分析发现84株CRKP中有2个ST群。每个ST群分别包括2个ST型(ST11和ST1869,ST15和ST709)。其他4个ST型都是单个ST型,本研究中71株ST11、4株ST15、4株ST323和1株ST45分别属于CC258、CC15、CC163克隆复合体。结论 CRKP对临床常用抗菌药物呈高度耐药状态,肺炎克雷伯菌多重耐药或广泛耐药主要与菌株携带bla_(KPC-2)有关,CRKP中3种常见毒力基因mrkD、ybtS、entB阳性率高,ST11为该两所医院CRKP的主要ST型。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯酶 基因 多位点序型分型 eBURST软件
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耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌种群结构和耐药机制研究 被引量:23
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作者 陈东科 周海健 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第5期507-512,共6页
耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)是临床常见的耐药菌之一。本研究对88株全国49家医院收集的CRKP菌株进行碳青霉烯类耐药基因检测,其中65株(73.9%)检出bla_(KPC)类基因(64株检出bla_(K... 耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)是临床常见的耐药菌之一。本研究对88株全国49家医院收集的CRKP菌株进行碳青霉烯类耐药基因检测,其中65株(73.9%)检出bla_(KPC)类基因(64株检出bla_(KPC-2)、1株检出bla_(KPC-3))、9株(10.2%)检出bla_(NDM)类基因(均为bla_(NDM-1))、7株(8.0%)检出bla_(IMP)类基因(均为bla_(IMP-4))。通过多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)将88株CRKP分为25个MLST型,其中ST11型为优势型别,包含48株菌。88株CRKP通过脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分为79个PFGE型,呈现高度多态性。本研究揭示了我国blaKPC-2阳性CRKP菌株存在克隆化现象,存在ST11型流行克隆;而bla_(NDM-1)和bla_(IMP-4)阳性CRKP菌株分子型别多态性大,还没形成流行克隆。需要密切监测并采取措施控制携带blaKPC-2基因的ST11型CRKP的传播扩散。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌 耐药基因 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 种群结构
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云南省非O1/O139群霍乱弧菌分子特征分析 被引量:14
3
作者 廖凤 古文鹏 +1 位作者 徐闻 伏晓庆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期53-56,66,共5页
目的非O1/O139群霍乱弧菌能够引起人类急性腹泻性疾病,但与O1群和O139群相比,人们往往容易忽视其危害性。因此,我们对分离于云南省的31株非O1/O139群霍乱弧菌开展了分子特征分析。方法采用纸片法(K-B)开展抗生素敏感试验;多聚酶链反应(P... 目的非O1/O139群霍乱弧菌能够引起人类急性腹泻性疾病,但与O1群和O139群相比,人们往往容易忽视其危害性。因此,我们对分离于云南省的31株非O1/O139群霍乱弧菌开展了分子特征分析。方法采用纸片法(K-B)开展抗生素敏感试验;多聚酶链反应(PCR)扩增检测毒力基因;同时,我们对菌株进行了脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分析(MLST)分子分型研究。结果药敏实验结果显示,67.74%的菌株对利福平耐药,对萘啶酸和复方新诺明的耐药率为29.03%,所有的菌株对庆大霉素和环丙沙星敏感;PCR结果显示,所有菌株的ompW基因为阳性,87.10%的菌株hly基因为阳性,25.81%的菌株rstREl tor为阳性,16.13%的菌株rstRClassical和tcpAEl tor为阳性,而CT、rfbO1和rfbO139基因全为阴性;PFGE结果显示,31株非O1/O139群霍乱弧菌呈现出高度的离散趋势,几乎没有相同带型的菌株出现;在MLST结果分析中,发现了1个gyrB新的等位基因,mdh基因发现了4个新的等位基因,metE基因发现了6个新的等位基因,pntA中发现了2个新的等位基因,purM中发现了3个新等位基因,pyrC中发现了4个新等位基因。经过排列组合后,共发现了17个新的霍乱弧菌ST型别(ST273-ST289)。结论非O1/O139群霍乱弧菌呈现出高度的多样性特征,同时,云南省的非O1/O139群霍乱弧菌具有一定的地域特点,丰富了现有的霍乱弧菌分子分型数据库。 展开更多
关键词 非O1/O139群霍乱弧菌 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分析
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湖南省首例W135群流行性脑脊髓膜炎病例流行病学及病原学分析 被引量:13
4
作者 夏昕 戴德芳 +5 位作者 湛志飞 覃迪 张红 李放军 高立冬 邹明祥 《疾病监测》 CAS 2013年第9期714-716,共3页
目的了解湖南省首例W135群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例流行病学特征及W135群脑膜炎奈瑟菌的病原学特征。方法采集疑似病例的血液和脑脊液标本,采集健康人群咽拭子标本,进行脑膜炎奈瑟菌的培养、分离、鉴定,确定为脑膜炎奈瑟菌。对菌株... 目的了解湖南省首例W135群流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例流行病学特征及W135群脑膜炎奈瑟菌的病原学特征。方法采集疑似病例的血液和脑脊液标本,采集健康人群咽拭子标本,进行脑膜炎奈瑟菌的培养、分离、鉴定,确定为脑膜炎奈瑟菌。对菌株进行血清学分群和药敏试验;采用多位点序列分型(multi locus sequence typing,MLST)以及脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)方法对菌株进行分子分型。结果疑似病例脑脊液及血液中分离培养出W135群脑膜炎奈瑟菌,健康携带者带菌调查咽拭子中分离培养出2株W135群脑膜炎奈瑟菌,均为ST-11型菌株,属于ST-11/ET-37 complex高致病克隆系。3株W135群脑膜炎奈瑟菌对复方磺胺甲恶唑全部耐药。结论湖南省首例W135群流脑病例是由ST-11型脑膜炎奈瑟菌引起,健康人群中也出现ST-11型W135型脑膜炎奈瑟菌的携带,W135群流脑在湖南省存在潜在流行的趋势。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型
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深圳市南山区腹泻患者弯曲菌感染及病原学特征分析 被引量:13
5
作者 刘敏 鞠长燕 +4 位作者 马艳萍 段永翔 俞慕华 张茂俊 王国庆 《疾病监测》 CAS 2020年第1期16-20,共5页
目的获得本地区秋季腹泻患者弯曲菌的感染现状及病原学特征。方法收集深圳市南山区2018年9—11月腹泻患者的粪便标本,采用双孔滤膜法分离培养弯曲菌并应用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行菌种鉴定。应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点... 目的获得本地区秋季腹泻患者弯曲菌的感染现状及病原学特征。方法收集深圳市南山区2018年9—11月腹泻患者的粪便标本,采用双孔滤膜法分离培养弯曲菌并应用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行菌种鉴定。应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)对分离菌株进行分子分型,应用琼脂稀释法获得菌株对11种抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。根据菌株的序列分型(ST)结果,结合既往菌株分型数据进行本地区菌株的遗传聚类分析。结果共采集腹泻患者粪便标本150份,其中男性患者74例,女性患者76例,年龄在1~86岁之间。150份粪便标本中共分离到弯曲菌18株,检出率为12.00%(18/150)。菌种鉴定发现,空肠弯曲菌占77.78%(14/18),结肠弯曲菌占22.22%(4/18)。14株空肠弯曲菌可分为11种PFGE带型,8个ST型别,以ST9763最多(35.71%,5/14),是本研究新发现ST型别。14株空肠弯曲菌对四环素全部耐药,对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、庆大霉素、链霉素及克林霉素100.00%敏感。ST型别最小生成树聚类分析结果表明,不同宿主来源菌株没有显著聚集性,腹泻患者分离菌株分布在不同来源的组群中。结论采用双孔滤膜法提高了腹泻患者中弯曲菌的检出率。本地区弯曲菌的感染仍以空肠弯曲菌为主,分离菌株对四环素类、喹诺酮类抗生素呈现较高的耐药特征,分离的空肠弯曲菌ST呈弥散分布特点。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 双孔滤膜法 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 抗生素敏感性
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广东省2014年食源性副溶血弧菌病原学特征分析 被引量:12
6
作者 李柏生 谭海玲 +3 位作者 柯碧霞 何冬梅 柯昌文 张永慧 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1283-1287,共5页
目的 了解2014年广东省食源性副溶血弧菌分离株的血清型别、抗生素敏感性、毒力基因携带情况以及分子分型特征.方法 对60株副溶血弧菌分离株进行血清分型、抗生素敏感性试验及检测耐热直接溶血素基因(tdh)和耐热相关溶血素基因(trh)... 目的 了解2014年广东省食源性副溶血弧菌分离株的血清型别、抗生素敏感性、毒力基因携带情况以及分子分型特征.方法 对60株副溶血弧菌分离株进行血清分型、抗生素敏感性试验及检测耐热直接溶血素基因(tdh)和耐热相关溶血素基因(trh),并进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列(MLST)分型.结果 60株分离株可分为13个血清型,主要型别为O3:K6、O4:K8、O1:K36和O4:KUT;对氨苄西林、磺胺复合物和头孢噻吩的耐药率分别为100.0%、43.3%和28.3%,有56.7%(34/60)的菌株对2类及以上抗生素同时耐药,2株菌对3类抗生素同时耐受.毒力基因PCR检测发现,有63.3%(38/60)的分离株为tdh+ trh-菌株,仅1株为tdh+ trh+菌株.分子分型显示,经NotⅠ酶消化后,60株副溶血弧菌可产生48个PFGE谱型,可分为3个聚类(ClusterA、B和C).其中ClusterB的菌株主要分离自食源性疾病监测中心散发病例,血清型以O3:K6为主,PFGE谱型的相似度在62.6%~ 100.0%;ClusterC主要是由4株O4: K8型菌株组成,谱型相似度为56.7%~ 62.5%.60株菌MLST分型可分为26个ST型,其中33株菌为ST-3型,主要是O3:K6和O1:K36菌株;4株O4: K8菌株聚集成另一个不同于ST-3型的相对优势的菌群.结论 2014年广东省副溶血弧菌菌型多样性可能是疾病高发的原因之一,O4: K8型菌株的分子特征与其他优势血清型别明显不同,应高度警惕该型菌株引起暴发的可能. 展开更多
关键词 副溶血弧菌 病原学特征 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌基因分型研究 被引量:10
7
作者 李囡 范红 +5 位作者 陈慧莉 谢轶 陆小军 张磊 王军 应斌武 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第15期2122-2126,2130,共6页
目的了解本地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)流行株的来源和遗传背景。方法回顾分析华西医院127例MRSA感染者的病例资料,用SCCmec多重PCR技术、葡萄球菌A蛋白(spa)分型技术和多位点测序分型技术对其中10株MRSA临床分离株进行基因分型... 目的了解本地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)流行株的来源和遗传背景。方法回顾分析华西医院127例MRSA感染者的病例资料,用SCCmec多重PCR技术、葡萄球菌A蛋白(spa)分型技术和多位点测序分型技术对其中10株MRSA临床分离株进行基因分型,并检测其杀白细胞毒素基因。结果病例资料显示127株MRSA中3株为社区获得性MRSA(CA-MRSA),其余均为医院获得性MRSA(HA-MRSA)。进行分型研究的10株MRSA中,7株HA-MRSA为SCCmec Ⅲ-ST239-PVL(-),呈现高度的克隆一致性,spa分型进一步显示4株为t030,另外3株为t037;CA-MRSAs19165分型为ST8-t008,与USA300属同一克隆,并且携带SCCmecⅣa和PVL基因,符合USA300一般基因特征。另外2株CA-MRSAs35301、s29635均为SCCmecⅣa-ST59-t437,与我国其他地区的报道不同。结论该院分离的MRSA仍以医院获得性为主(124/127),HA-MRSA呈现高度的克隆一致性,并与我国的主要流行株为同一克隆;分离到与美国主要CA-MRSA流行株USA300相同克隆的菌株,另外分离到的CA-MRSAST59-t437克隆株在我国其他地区未有报道。MLST和spa分型技术是金黄色葡萄球菌分子流行病学研究的更为简便快速的方法。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 多住点测序分型 葡萄球菌A蛋白
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我国首例感染Y群脑膜炎奈瑟菌CC23病例的实验室分析 被引量:10
8
作者 张莉萍 叶雪仪 +3 位作者 熊慧璋 黄勇 叶雪芬 张巧利 《疾病监测》 CAS 2020年第7期664-667,共4页
目的对广东省首例Y群流行性脑脊髓膜炎病例及其密切接触者进行病原学及分子分型分析。方法对分离自患者及171例密切接触者咽拭子的菌株,进行生化、血清鉴定、荧光聚合酶链式反应(PCR)及多位点序列分型(MLST)检测。结果生化、血清鉴定以... 目的对广东省首例Y群流行性脑脊髓膜炎病例及其密切接触者进行病原学及分子分型分析。方法对分离自患者及171例密切接触者咽拭子的菌株,进行生化、血清鉴定、荧光聚合酶链式反应(PCR)及多位点序列分型(MLST)检测。结果生化、血清鉴定以及PCR检测结果均显示,该分离自患者的菌株为Y群脑膜炎奈瑟菌(Nm)菌株,MLST结果分析其属于ST-23克隆群(CC23),从171份密切接触者咽拭子中分离到1株Y群Nm,4株B群Nm。Y群Nm属于CC23,4株B群Nm中1株为ST-11110型,无克隆群归类,2株可能属于ST-4821克隆群,1株为ST-5664,属于ST-4821克隆群。结论该病例为广东省首例Y群流脑病例,也是我国首例由Y群CC23引起的流脑病例,提示今后需进一步加强Y群流脑的病原学监测。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 ST-23克隆群 多位点序列分型
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子特征研究 被引量:10
9
作者 王金波 李海英 +1 位作者 张亚妮 孙敏 《检验医学与临床》 CAS 2021年第12期1728-1732,1735,共6页
目的了解该地区2018年1月至2019年12月耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子分型特点、耐药基因和毒力基因的携带特征,为后续MRSA分子分型研究提供科学依据。方法采用布鲁克质谱鉴定系统对临床分离的MRSA进行细菌鉴定并行药敏试验,使用... 目的了解该地区2018年1月至2019年12月耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子分型特点、耐药基因和毒力基因的携带特征,为后续MRSA分子分型研究提供科学依据。方法采用布鲁克质谱鉴定系统对临床分离的MRSA进行细菌鉴定并行药敏试验,使用PCR技术对MRSA的管家基因、耐药基因和毒力基因进行检测并进行分组分析。采用WHONET5.0等软件对MRSA的临床分布等临床特点和药敏结果等进行统计分析。结果2018年1月至2019年12月临床分离的MRSA菌株共124株,其中来自于创面等分泌物标本50株,痰液、灌洗液标本27株,尿液等标本31株,胸腔积液等无菌体液标本7株,血液标本等9株。124株MRSA进行药敏结果分析,发现对青霉素G、苯唑西林、红霉素、克林霉素和四环素的耐药率均较高,对喹诺酮类抗菌药物的耐药性亦处在较高水平,但是对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁和奎奴普丁/达托霉素均100%敏感,有1株对呋喃妥因耐药。结论MRSA菌株对多种抗菌药物具有较高的耐药性,应加强MRSA预防观念的强化培训和监督院内感染措施的执行,以减少院内MRSA感染的发生。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药 多位点序列分型 毒力基因
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耐亚胺培南肺炎克雷伯菌分子流行病学及耐药传播机制研究 被引量:9
10
作者 王步补 阮战伟 +3 位作者 项小婵 洪亮 王晓峰 李强 《全科医学临床与教育》 2014年第1期18-22,共5页
目的探讨临床收集亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌的耐药分子机制和克隆流行情况。方法采用K-B纸片法进行药敏实验,多位点序列分型(MLST)进行临床菌株克隆分型,滤膜接合法进行质粒接合实验,PCR扩增筛选菌株的常见耐药基因和其周围序列结构。... 目的探讨临床收集亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌的耐药分子机制和克隆流行情况。方法采用K-B纸片法进行药敏实验,多位点序列分型(MLST)进行临床菌株克隆分型,滤膜接合法进行质粒接合实验,PCR扩增筛选菌株的常见耐药基因和其周围序列结构。结果亚胺培南耐药肺炎克雷伯菌对青霉素类、头孢菌素类、含抑制剂β-内酰胺类、氨基糖苷类等药物均显示出很强的多重耐药性,MLST分型显示耐药克隆具有明显的流行特征,13株携带blaKPC-2基因的流行克隆均为ST11型。这13株细菌亚胺培南耐药性均由可接合性质粒介导,并且同时介导和转移了编码CTX-M型、TEM型或DHA型的β-内酰胺酶基因。Tn4401-Tn3复合转座子或其变体2介导了blaKPC-2基因的转移。结论临床肺炎克雷伯菌亚胺培南耐药的主要原因是产KPC-2酶菌株的克隆播散,同时可接合质粒造成的耐药基因快速水平转移也起到了重要作用。 展开更多
关键词 亚胺培南耐药 多位点序列分型 质粒接合 KPC酶
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湖南省新发X群Y群流行性脑脊髓膜炎病例菌株的病原学特征分析 被引量:9
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作者 夏昕 方明礼 +3 位作者 覃迪 贺子翔 高立冬 湛志飞 《实用预防医学》 CAS 2021年第11期1295-1298,共4页
目的了解2019—2020年本省分离到的新发X群和Y群脑膜炎奈瑟菌病例菌株的药物敏感性及分子分型特征。方法从病人血液和脑脊液中分离到的脑膜炎奈瑟菌经生化鉴定后,进行血清学分群、药敏试验以及多位点序列分型分析。结果新发的X群、Y群... 目的了解2019—2020年本省分离到的新发X群和Y群脑膜炎奈瑟菌病例菌株的药物敏感性及分子分型特征。方法从病人血液和脑脊液中分离到的脑膜炎奈瑟菌经生化鉴定后,进行血清学分群、药敏试验以及多位点序列分型分析。结果新发的X群、Y群脑膜炎奈瑟菌药敏试验中对青霉素、氨苄青霉素、米诺环素、头孢曲松、头孢噻肟、氯霉素、阿奇霉素、美罗培南和利福平全部敏感;对复方磺胺甲噁唑耐药;与B群菌株的药物敏感性比较具有对青霉素、氨苄青霉素以及氟喹诺酮类抗菌药物更高的敏感性,多位点序列分型结果显示X菌株为ST-5克隆群,两株Y群菌株为ST-23克隆群。结论 X群有可能是从A群菌株荚膜转换而来,Y群菌株与国际高致病流行ST克隆群一致,二者均有可能成为新的流脑流行群并引起暴发疫情,需引起重视。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟球菌 药物敏感性 多位点序列分型
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江苏省首例人感染ST1型猪链球菌的快速检测及分子特征分析 被引量:9
12
作者 谈忠鸣 姜仁杰 +4 位作者 周伟忠 顾玲 鲍倡俊 汤奋扬 朱叶飞 《江苏预防医学》 CAS 2015年第1期19-22,共4页
目的对2014年江苏省一起疑似人感染猪链球菌病的病原菌进行实验室快速检测并分析其分子特征。方法采用实时荧光PCR方法对病人标本中提取的DNA进行猪链球菌血清2型特异基因检测,运用PCR方法进行猪链球菌毒力基因鉴定及多位点序列分析。... 目的对2014年江苏省一起疑似人感染猪链球菌病的病原菌进行实验室快速检测并分析其分子特征。方法采用实时荧光PCR方法对病人标本中提取的DNA进行猪链球菌血清2型特异基因检测,运用PCR方法进行猪链球菌毒力基因鉴定及多位点序列分析。结果病人标本中检测到猪链球菌种特异基因(16srRNA)和血清2型荚膜多糖编码基因(cps-2J),5种毒力基因(mrp,sly,ef,gapdh,fbps)全部阳性,多位点序列分析结果为ST1型。结论该病例的病原菌为携带5种毒力基因的ST1型猪链球菌血清2型菌株,该型别在江苏省尚属首次报道。 展开更多
关键词 猪链球菌血清2型 毒力基因 多位点序列分析
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副溶血性弧菌多位点序列分型方法的建立与应用 被引量:8
13
作者 闫鹏 高红 +3 位作者 林文凭 周伟艳 沈玄艺 徐景野 《中国预防医学杂志》 CAS 2016年第2期103-107,共5页
目的应用多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)技术对副溶血性弧菌进行基因分型,探讨菌株间的内在联系与同源性,分析其优势型。方法收集2006-2012年,宁波市食物中毒和散发腹泻患者副溶血性弧菌48株,用生化鉴定确定其表型;... 目的应用多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)技术对副溶血性弧菌进行基因分型,探讨菌株间的内在联系与同源性,分析其优势型。方法收集2006-2012年,宁波市食物中毒和散发腹泻患者副溶血性弧菌48株,用生化鉴定确定其表型;用MLST方法对菌株进行基因分型。结果 48株副溶血性弧菌分出9个ST型和1个未定型,其中ST3 32株(66.67%);ST265 5株(10.42%);ST1203株(6.25%);ST8 2株(4.17%);ST262 1株(2.08%);ST199 1株(2.08%);ST332 1株(2.08%);ST527 1株(2.08%);ST189 1株(2.08%);未定型1株(2.08%)。1株副溶血性弧菌的等位基因分别为dnaE234、gyrB4、recA162、dtdS222、pntA、pyrC184和tnaA79,与MLST数据库中无匹配,为1个国内新的副溶血性弧菌ST型(ST262)。结论宁波市副溶血性弧菌流行株以ST3克隆群为主。首次从国内副溶血性弧菌中分离出ST262型,有进一步分析研究意义。MLST分型能发现副溶血性弧菌间的关联,并与国内外菌株进行比较,发现新的ST型,是一种较好的分型方法。 展开更多
关键词 多位点序列分型 副溶血性弧菌 ST种类 优势型
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杭州地区单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子型别研究 被引量:8
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作者 俞骅 潘劲草 +5 位作者 汪皓秋 斯国静 刘涛 楼秀芹 张蔚 严杰 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期264-270,共7页
目的研究杭州地区单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)食品分离株的分子分型情况,了解当地流行株的型别特征。方法用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)的方法对单核细胞增生李斯特菌进行分子分型。PFGE结果进行聚... 目的研究杭州地区单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)食品分离株的分子分型情况,了解当地流行株的型别特征。方法用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)的方法对单核细胞增生李斯特菌进行分子分型。PFGE结果进行聚类分析,并绘制MLST数据的最小生成树。结果 6个血清型组成的133株杭州食品分离株共获得19个MLST型别,并发现1个新的ST型ST767。ST9和ST121是数量最多的型别。用AscI和ApaI酶切分别获得33和45个PFGE带型。结论杭州地区单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子型别分布广泛,大部分菌株是可引起人李斯特菌病的Lineage I和Lineage II菌株。食品中单核细胞增生李斯特菌的污染比较严重,应加强监测与管理以防食源性疾病的发生。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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北京市昌平区2012—2016年肠集聚性黏附大肠埃希氏菌耐药性、毒力基因及分子特征 被引量:8
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作者 舒高林 李东迅 +3 位作者 闻艳红 彭华 徐代庆 吴杨 《江苏预防医学》 CAS 2017年第2期128-132,共5页
目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位... 目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位点序列分型(MLST)及脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)进行分子分型分析。结果 15株EAEC耐药率为100.0%,耐多药率为80.0%。每株携带2~5个毒力基因,共有10种毒力基因谱;8个毒力基因阳性率由高到低分别为aap(100.0%)、CVD432(93.3%)、aggA(60.0%)、agg3A(40.0%)、astA(33.3%)、pic(20.0%)、aafA(13.3%),未检出pet阳性。MLST分型分析将15株EAEC菌分为9个ST型,其中有4个新ST型(STcpEC1、STcpEC2、STcpEC3、STcpEC4),以STcpEC1为优势ST型(占33.3%)。PFGE分析得到13种PFGE带型,相同ST型菌株PFGE带型、毒力基因相似系数均较高。结论北京市昌平区近5年EAEC菌耐药率、多重耐药率较高,毒力基因aap、CVD432、aggA检出率高,STcpEC1为优势ST型,PFGE带型具有高度多态性。 展开更多
关键词 肠集聚性黏附大肠埃希氏菌 耐药性 毒力基因 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的耐药性及毒力特征的分子生物学研究 被引量:7
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作者 师志云 马苗 +8 位作者 尹晓丽 王良方 侯晓慧 张玉英 李刚 王文 陶佳 李莎莎 贾伟 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期725-731,共7页
目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表... 目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表型,PCR分子生物学技术检测碳青霉烯酶等耐药基因以及荚膜血清型、毒力基因,多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对碳青霉烯类耐药高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)进行同源性分析。结果103株CRKP对临床常见抗菌药物表现为不同程度的耐药,mCIM联合eCIM试验结果显示94株CRKP产碳青霉烯酶,其中67.0%产金属酶,33.0%产丝氨酸碳青霉烯酶。耐药基因检出率依次为blaNDM 50.5%(52/103)、bla_(KPC)33.0%(34/103)、bla_(OXA-48)22.3%(23/103)、bla_(IMP)10.7%(11/103)。18种ST型中以ST11型35.3%(36/102)及ST76型22.5%(23/102)为主。CR-hvKP 10株,其中仅4株为荚膜血清K1型、10株均为菌毛黏附基因fim-H和铁载体相关基因ent-B携带者。10株CRhvKP菌株PFGE同源性分析显示以D族群居多,亲缘性接近;未发现同一病区同一时间段的暴发流行。结论该院CRKP菌株以产NDM-5型碳青霉烯酶为主,ST11型为优势流行株。已发现9.7%的CRKP为CR-hvKP菌株,应当引起临床和院感相关部门的重视,防止暴发流行。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌 耐药机制 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 毒力特征
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禽源多杀性巴氏杆菌多位点序列分型研究 被引量:7
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作者 李伟杰 田野 +3 位作者 岂晓鑫 蒋颖 魏财文 蒋桃珍 《中国兽药杂志》 北大核心 2017年第2期1-6,共6页
为了解国内禽源多杀性巴氏杆菌流行情况,对分离自18省份的84株多杀性巴氏杆菌采用荚膜多重PCR分型和多位点序列分型对其血清型和基因型进行鉴定。结果表明:禽源多杀性巴氏杆菌主要以血清A型为主,占96.4%(81/84);多位点序列分型可将禽源... 为了解国内禽源多杀性巴氏杆菌流行情况,对分离自18省份的84株多杀性巴氏杆菌采用荚膜多重PCR分型和多位点序列分型对其血清型和基因型进行鉴定。结果表明:禽源多杀性巴氏杆菌主要以血清A型为主,占96.4%(81/84);多位点序列分型可将禽源多杀性巴氏杆菌分为5种ST型,其中ST129为主要流行型,占94.0%(79/84)。本研究为我国禽源多杀性巴氏杆菌的流行病学监测和基因多样性提供了数据支持。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 荚膜分型 多位点序列分型
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幽门螺杆菌克拉霉素异质性耐药及其特征分析 被引量:7
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作者 孙路 何利华 +1 位作者 张艺瑶 张建中 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期391-395,共5页
目的对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)克拉霉素异质性耐药进行检测,并分析异质性耐药的遗传进化特征。方法对中国某医院50个^(13)C尿素呼气试验阳性患者的胃窦黏液标本进行HP分离培养,每个样本挑取16个HP单克隆(分离培养平板中不... 目的对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)克拉霉素异质性耐药进行检测,并分析异质性耐药的遗传进化特征。方法对中国某医院50个^(13)C尿素呼气试验阳性患者的胃窦黏液标本进行HP分离培养,每个样本挑取16个HP单克隆(分离培养平板中不满16个克隆者选取全部HP克隆),用Etest法测定各克隆的克拉霉素最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)。进一步在异质性克拉霉素耐药病例中选取6份样本(MIC值差异较大的样本)相关的81个幽门螺杆菌克隆,利用多位点序列(MLST)分析的方法进行初步进化分析。结果 44个分离培养阳性的样本中24个全敏感,9个全耐药,11个为异质性耐药;6个MIC值差异较大的样本,最大值与最小值差别在100~1 000倍间。每个样本的9~16个克隆可分为1~6个ST型,结合vacA基因差异,分为2~8个基因型。遗传进化树显示2个样本的敏感、耐药克隆分为两簇,余4个样本中ST型与耐药间无明显关联。结论 HP在中国感染存在明显的克拉霉素异质性耐药现象,传统药敏试验可能不足以充分反映克拉霉素异质性耐药的现象,可能会引起误判,应高度关注。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 异质性耐药 多位点序列分析
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重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分子流行病学研究 被引量:7
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作者 杨程茹 王英 +4 位作者 李莹 张吉生 曾令怡 胡可望 张晓丽 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期209-216,共8页
目的分析重症监护病房(ICU)临床来源耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子特征及流行情况,为感染控制及药物治疗提供实验室数据。方法收集2018年7月—2020年7月某院ICU分离的51株CRKP,采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度,多位点序列分... 目的分析重症监护病房(ICU)临床来源耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子特征及流行情况,为感染控制及药物治疗提供实验室数据。方法收集2018年7月—2020年7月某院ICU分离的51株CRKP,采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度,多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳分析菌株同源性,检测菌株耐药和毒力基因,接合试验验证质粒的转移性。结果药敏试验显示,CRKP对头孢他啶/阿维巴坦全部敏感,对替加环素耐药率最低(3.9%),其次是阿米卡星(49.0%)、多粘菌素(64.7%),对亚胺培南(96.1%)、美罗培南(98.0%)、左氧氟沙星(98.0%)和头孢他啶(100.0%)均高度耐药。51株CRKP中,mCIM试验阳性菌株49株(96.1%),eCIM试验阳性菌株1株(2.0%)。碳青霉烯酶基因blaKPC-2阳性菌株占96.1%。所有分离株中,高黏液表型阳性4株(7.8%),毒力基因阳性情况分别为:uge 100.0%,mrkD 94.1%,kpn 94.1%,fim-H 72.5%,aero 2.0%,rmpA 2.0%。ST11 CRKP在ICU中占98.0%(50/51),ST1373占2.0%(1/50)。检出1株ST1373的高毒力肺炎克雷伯菌。携带blaKPC-2基因菌株的接合试验成功率为12.2%。结论ICU存在产KPC-2的ST11 CRKP单克隆传播,同时携带一定的毒力基因。携带blaKPC-2基因的质粒可通过接合水平传播。头孢他啶/阿维巴坦对CRKP有较高的敏感性,可供临床治疗选择使用。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 分子流行病学 多位点序列分型 重症监护室 质粒接合
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深圳市副溶血弧菌O3:K6血清变异型病原学特征研究 被引量:7
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作者 鞠长燕 俞慕华 +2 位作者 黄锐敏 罗锦雁 段永翔 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期21-25,共5页
目的分析2006--2012年深圳市食物中毒中分离的副溶血弧菌03:K6血清变异型毒力基因和分子分型特征,及其与03:K6血清型的基因遗传关系。方法对深圳市2006--2012年食物中毒病例肛拭子样本中分离的115株副溶血弧菌进行PFGE分型,并根据... 目的分析2006--2012年深圳市食物中毒中分离的副溶血弧菌03:K6血清变异型毒力基因和分子分型特征,及其与03:K6血清型的基因遗传关系。方法对深圳市2006--2012年食物中毒病例肛拭子样本中分离的115株副溶血弧菌进行PFGE分型,并根据地域分布与分离时间的不同,选取了7株03:K6血清型为对照组,对其以及03:K6血清变异型分别进行tdh和trh毒力基因检测,群特异性PER(GS.PCR)和。邪基因检测,及多位点测序分型(MLST)。结果115株副溶血弧菌中,带型相似度〉80%的菌株占58.3%(67/115),其中,03:K6血清型占67%(44/67),01:KUT血清型占5%(4/67),03:K6血清变异型占28%(19/67)。03:K6血清变异型中,01:K25血清型占7%(5/67),04:K68血清型占10%(7/67),011:K36血清型占10%(7/67),其均携带tdh基因,不携带fm基因,GS—PCR扩增基因和ory8基因阳性占10/19,GS—PCR扩增基因和0#8基因阴性占5/19,GS—PCR扩增基因阴性、0邢基因阳性占4/19,ST-3型占17/19,ST-305型占2/19。对照组均携带tdh基因,不携带£旃基因,为GS—PCR扩增基因、o够基因阳性以及sT-3型。ST.305型与sT.3型在dtdS和pntA两个管家基因上有差异,在dtdS基因的第305个碱基处,ST-305型(147号等位基因)为T,sT-3型(4号等位基因)为C;在pntA基因的第33个碱基处,ST-305型(93号等位基因)为C,ST.3型(29号等位基因)为A。结论04:K68、01:K25、011:K36血清型毒力基因携带与03:K6血清型相似,且MLST结果一致,遗传关系接近,为03:K6血清变异型。 展开更多
关键词 弧菌 副溶血性 血清分型 电泳 凝胶 脉冲场 聚合酶链反应 多位点测序 分型
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