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百合总RNA提取方法的比较和分析 被引量:20
1
作者 吴小萍 席梦利 +1 位作者 缪红艳 施季森 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第6期871-876,共6页
以卷丹、麝香百合品种富田和离体鲜切花的花蕾为材料,比较Trizol法、异硫氰酸胍法、CTAB改进法和SDS改进法提取总RNA的效果,结果表明,SDS改进法能有效去除多糖,提取的RNA中28SrRNA亮度约为18SrRNA的两倍,OD260/OD280值介于1.7~2.2之间... 以卷丹、麝香百合品种富田和离体鲜切花的花蕾为材料,比较Trizol法、异硫氰酸胍法、CTAB改进法和SDS改进法提取总RNA的效果,结果表明,SDS改进法能有效去除多糖,提取的RNA中28SrRNA亮度约为18SrRNA的两倍,OD260/OD280值介于1.7~2.2之间,卷丹RNA得率为132.52μg/g,富田RNA得率为186.88μg/g。进一步用SDS改进法分别提取富田外轮花瓣、内轮花瓣、雄蕊、雌蕊、叶和茎的RNA,同样可以获得完整的纯度高的RNA,其中28SrRNA亮度约为18SrRNA的两倍,OD260/OD280值介于1.7~2.2之间,说明此方法适用于百合各个组织RNA的提取。经RT-PCR获得了花发育基因的特异性条带,说明用SDS改进法从百合中提取的RNA质量好、产率高、完整性强,完全适合于百合进一步的分子生物学研究。 展开更多
关键词 百合 RNA sds改进法 多糖
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香蕉不同组织中总RNA提取方法的研究 被引量:14
2
作者 王尉 梁国鲁 谢江辉 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期62-67,共6页
针对香蕉组织中多糖、多酚等次生物质含量高的特点,以香蕉根、茎、叶、果实为试材,对其总RNA提取进行研究.比较了SDS法、改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取总RNA的效果,结果分析表明:改良SDS法能从香蕉根、茎、叶中获得质量... 针对香蕉组织中多糖、多酚等次生物质含量高的特点,以香蕉根、茎、叶、果实为试材,对其总RNA提取进行研究.比较了SDS法、改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取总RNA的效果,结果分析表明:改良SDS法能从香蕉根、茎、叶中获得质量高、完整性较好的总RNA,而改良CTAB法对果实的提取效果较佳,所得A 260/A 280均高于1.8,A 260/A 230大于2.0,28 S rRNA带的亮度约是18 SrRNA的2倍.其产率在根、茎、叶中均在400μg·g^(-1)以上,果实中可达49.34μg·g^(-1).以上2种方法所得的总RNA均能满足RT-PCR、Northern blot和cDNA文库建立等分子生物学研究,且具有快速、简便易行、成本较低的特点,适合于富含多糖、多酚的植物材料. 展开更多
关键词 香蕉 不同组织 总RNA提取 改良sds 改良CTAB法
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巨桉叶片总RNA提取方法比较 被引量:15
3
作者 杨婕 郭文硕 +3 位作者 叶小真 谢婉凤 张思庭 黄爱珍 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1272-1276,共5页
本研究以巨桉嫩叶为材料,通过试剂盒法、改良CTAB法和改良SDS法,进行巨桉嫩叶总RNA提取方法的比较试验,探讨适合巨桉嫩叶总RNA提取的方法。通过超微量分光光度计、凝胶电泳和RT-PCR对总RNA提取质量进行检验,结果表明:改良CTAB和改良SDS... 本研究以巨桉嫩叶为材料,通过试剂盒法、改良CTAB法和改良SDS法,进行巨桉嫩叶总RNA提取方法的比较试验,探讨适合巨桉嫩叶总RNA提取的方法。通过超微量分光光度计、凝胶电泳和RT-PCR对总RNA提取质量进行检验,结果表明:改良CTAB和改良SDS法均能获得高质量的总RNA,条带清晰,纯度高,效果稳定,均适用于桉树叶片总RNA提取。 展开更多
关键词 巨桉 总RNA 试剂盒法 改良CTAB法 改良sds
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野葛块根总RNA的不同提取方法比较研究 被引量:6
4
作者 肖旭峰 姜文轩 +1 位作者 吴才君 范淑英 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期147-150,共4页
以块根膨大与块根不膨大突变型的野葛块根为材料,比较Trizol、CTAB、SDS及改良SDS法提取野葛块根总RNA的效果,通过RNA产量、纯度及电泳图谱分析等,初步确立了一种有效提取野葛块根总RNA的改良SDS法。该方法提取的RNA OD260/OD280值介于... 以块根膨大与块根不膨大突变型的野葛块根为材料,比较Trizol、CTAB、SDS及改良SDS法提取野葛块根总RNA的效果,通过RNA产量、纯度及电泳图谱分析等,初步确立了一种有效提取野葛块根总RNA的改良SDS法。该方法提取的RNA OD260/OD280值介于1.7~1.9,电泳图谱清晰完整,产量高,成本低,完全适用于RT-PCR、cDNA-AFLP及Northern杂交等分子生物学后续试验。 展开更多
关键词 葛块根 总RNA提取 TRIZOL法 CTAB法 sds 改良sds
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菠萝果实不同部位总RNA提取方法比较 被引量:5
5
作者 袁晓丽 王蔚 +2 位作者 孙光明 杜丽清 张秀梅 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期132-134,共3页
以不同发育时期和不同部位的菠萝果实为材料,比较了改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取RNA的效果。结果表明:3种方法提取的RNA差异明显,其中改良SDS法的效果最佳,其提取的RNA质量较好,无DNA污染,OD260/OD280和OD260/OD230接近2... 以不同发育时期和不同部位的菠萝果实为材料,比较了改良SDS法、改良CTAB法和Trizol试剂盒法提取RNA的效果。结果表明:3种方法提取的RNA差异明显,其中改良SDS法的效果最佳,其提取的RNA质量较好,无DNA污染,OD260/OD280和OD260/OD230接近2.0,产量达到464.3μg/g.FW以上,该方法提取的RNA能满足RT-PCR、Northern blot和cDNA文库建立等分子生物学研究的需要。 展开更多
关键词 菠萝 果实 总RNA提取 改良sds
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分蘖洋葱叶片RNA提取方法的比较和分析 被引量:5
6
作者 黄钰 李旭双 +1 位作者 陈典 王勇 《北方园艺》 CAS 北大核心 2011年第14期111-113,共3页
以新鲜的分蘖洋葱叶片为材料,比较了Trizol法、Triz01改进法、SDS法、SDS改进法以及柱式植物RNA提取法提取总RNA的效果。结果表明:Trizol法和Trizol改进法所提取的RNA得率很低,且不能有效除去叶片中的多糖成分;SDS改进法能够有效的... 以新鲜的分蘖洋葱叶片为材料,比较了Trizol法、Triz01改进法、SDS法、SDS改进法以及柱式植物RNA提取法提取总RNA的效果。结果表明:Trizol法和Trizol改进法所提取的RNA得率很低,且不能有效除去叶片中的多糖成分;SDS改进法能够有效的去除分蘖洋葱叶片中的多糖,提取的RNA中28S RNA亮度约为18SRNA的2倍,OD260/OD280值介于1.7~2.2之间,但RNA的得率偏低,约为56.32/μg/g;柱式植物RNA提取法提取的RNA28S、18S、5S条带清晰,完整性好,RNA的得率最高,为123,58/2μg/g,完全适合于分蘖洋葱进一步的分子生物学研究。 展开更多
关键词 RNA 分蘖洋葱 sds改进法 柱式植物RNA提取法
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玄参新鲜根和干燥根总DNA提取方法的比较研究 被引量:2
7
作者 沈志雯 刘蕾 +2 位作者 徐瑾 杨业然 何聪芬 《北京工商大学学报(自然科学版)》 CAS 2009年第6期4-6,共3页
用十二烷基磺酸钠法分别提取玄参新鲜根及干燥根的DNA.电泳结果显示,从玄参新鲜根中可提取到完整DNA,而从"发汗"后的玄参干燥根中提取的DNA已降解.使用紫外分光光度法对新鲜根中提取的DNA进行纯度鉴定,A260/A280为1.83.结果表... 用十二烷基磺酸钠法分别提取玄参新鲜根及干燥根的DNA.电泳结果显示,从玄参新鲜根中可提取到完整DNA,而从"发汗"后的玄参干燥根中提取的DNA已降解.使用紫外分光光度法对新鲜根中提取的DNA进行纯度鉴定,A260/A280为1.83.结果表明,所采用的十二烷基磺酸钠法可经济高效地从玄参根部提取到高质量的DNA. 展开更多
关键词 玄参 DNA提取 十二烷基磺酸钠法
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山丹百合花蕾总RNA提取方法的比较
8
作者 张鲜艳 亢秀萍 王峰 《北方园艺》 CAS 北大核心 2013年第4期118-120,共3页
以SDS改进法、CTAB改进法及EASYAPIN试剂盒法3种方法提取山丹百合花蕾的总RNA,并通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测对其提取效果进行分析比较。结果表明:SDS改进法提取的RNA效果不显著,CTAB改进法提取的RNA产量高,但有大量的DNA污染,需... 以SDS改进法、CTAB改进法及EASYAPIN试剂盒法3种方法提取山丹百合花蕾的总RNA,并通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测对其提取效果进行分析比较。结果表明:SDS改进法提取的RNA效果不显著,CTAB改进法提取的RNA产量高,但有大量的DNA污染,需进一步纯化;EASYAPIN试剂盒法提取的RNA质量好,纯度高,完整性强,可直接进行下一步的分子生物学研究。 展开更多
关键词 山丹百合 CTAB改进法 sds改进法 EASYAPIN试剂盒法 RNA提取
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改进的SDS-CTAB法提取濒危植物连香树总DNA 被引量:30
9
作者 黄绍辉 方炎明 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2007年第1期98-101,共4页
对珍稀濒危植物连香树(Cercidiphyllum japonicum)的6种总DNA提取方法进行了对比试验,结果表明改进的SDS-CTAB法更适合于连香树总DNA提取。该方法提取的DNA经紫外消光值检测,其A260/A280为1.8532,优于CTAB法(1.4872)、SDS法(1.3552)、PV... 对珍稀濒危植物连香树(Cercidiphyllum japonicum)的6种总DNA提取方法进行了对比试验,结果表明改进的SDS-CTAB法更适合于连香树总DNA提取。该方法提取的DNA经紫外消光值检测,其A260/A280为1.8532,优于CTAB法(1.4872)、SDS法(1.3552)、PVP法(1.5079)、尿素法(1.1858)和高盐低pH法(1.4534)。琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增结果也得出同样的结论。 展开更多
关键词 连香树(Gercidiphyllum japonicum) DNA提取 改进的sds-CTAB
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富含多糖葡萄风信子花瓣总RNA提取方法研究 被引量:16
10
作者 郭翠英 王跃进 +1 位作者 刘雅丽 贺明阳 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期188-191,共4页
在普通CTAB法与SDS法提取RNA的基础上,从去除多糖和DNA污染两个方面进行优化,筛选出适于富含多糖类葡萄风信子花瓣RNA提取的方法,经检测OD260/280值在1.8~2.0之间,电泳28S条带和18SrRNA条带都很清亮,比值约1.5.对改进的CTAB法提取的总... 在普通CTAB法与SDS法提取RNA的基础上,从去除多糖和DNA污染两个方面进行优化,筛选出适于富含多糖类葡萄风信子花瓣RNA提取的方法,经检测OD260/280值在1.8~2.0之间,电泳28S条带和18SrRNA条带都很清亮,比值约1.5.对改进的CTAB法提取的总RNA进行RT-PCR能扩增出所需目的条带.有效去除多糖类物质污染对于富含多糖类花瓣组织RNA提取很重要. 展开更多
关键词 葡萄风信子 多糖 改良CTAB法 改良sds 总RNA提取
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孝顺竹RNA提取方法研究 被引量:18
11
作者 杨卫东 王敬文 +1 位作者 张金萍 费学谦 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2005年第6期769-772,共4页
提取纯度高、完整性好、不含DNA或其它杂质的总RNA是进行Northern杂交、cDNA合成、cDNA文库构建、RT-PCR及mRNA差异显示等分子生物学研究的基础.目前提取植物RNA方法有多种,这些方法设计旨在RNA提取过程中清除多糖、多酚等杂质污染.在... 提取纯度高、完整性好、不含DNA或其它杂质的总RNA是进行Northern杂交、cDNA合成、cDNA文库构建、RT-PCR及mRNA差异显示等分子生物学研究的基础.目前提取植物RNA方法有多种,这些方法设计旨在RNA提取过程中清除多糖、多酚等杂质污染.在提取高质量RNA的过程中,植物尤其木本植物通常含有大量的酚类、多糖和其他一些水溶性化合物与RNA共沉淀,影响了RNA功能[1].目前应用较多和较广的有5种方法,商业试剂盒TRIzol,以异硫氰酸胍为代表异硫氰酸酸胍法[1,2]、以阳离子去污剂CTAB代表CTAB法[3,4,5]、热硼酸盐法[6,7],和阴离子去污剂SDS为代表SDS法[8~11]等.结合蛋白质、多糖和多酚去除,以及RNA沉淀形成的这些方法,往往要依据不同植物进行适当改进. 展开更多
关键词 孝顺竹 RNA 提取 改良sds
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改良SDS法提取石韦基因组DNA的研究 被引量:10
12
作者 杜金子 陈丽梅 +2 位作者 黄荣韶 黎桦 黄棉 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期754-758,共5页
以7种石韦为试材,采用不同SDS提取液浓度(0.5%、1.5%、2.5%)、不同温浴时间(0.5、1、1.5、2h)对石韦基因组DNA进行提取,并测定基因组DNA的纯度和浓度。结果表明,改良SDS法完全适用于石韦基因组DNA的提取,而且1.5%为改... 以7种石韦为试材,采用不同SDS提取液浓度(0.5%、1.5%、2.5%)、不同温浴时间(0.5、1、1.5、2h)对石韦基因组DNA进行提取,并测定基因组DNA的纯度和浓度。结果表明,改良SDS法完全适用于石韦基因组DNA的提取,而且1.5%为改良SDS法提取石韦基因组DNA的适宜提取液浓度,1—1.5h为提取的最佳时间。 展开更多
关键词 石韦 基因组 DNA提取 改良sds
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茶树叶片总RNA提取方法的比较研究 被引量:10
13
作者 王梦娜 武艳 +1 位作者 程国山 张今今 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期95-99,共5页
针对茶树叶片中富含多酚类物质的特点,以陕西地方茶树代表种质紫阳槠叶种的叶片为材料,比较了Trizol法、异硫氰酸胍法和改良SDS-酸酚法三种不同的总RNA提取方法。结果表明改良SDS-酸酚法能够从新鲜叶片、冷冻叶片和干燥叶片中提取到质... 针对茶树叶片中富含多酚类物质的特点,以陕西地方茶树代表种质紫阳槠叶种的叶片为材料,比较了Trizol法、异硫氰酸胍法和改良SDS-酸酚法三种不同的总RNA提取方法。结果表明改良SDS-酸酚法能够从新鲜叶片、冷冻叶片和干燥叶片中提取到质量高、完整性好的总RNA,经检测28SrRNA亮度为18SrRNA的2倍,A260/A280值介于1.83~2.01之间。以鲜叶、冻叶和干燥叶片的总RNA为材料,进一步用于DDRT-PCR分析,均可获得清晰稳定的多态性结果。说明改良的SDS-酸酚法能抑制茶树叶片中多酚类物质对总RNA提取的影响,是一种适于茶树叶片总RNA提取的有效方法。 展开更多
关键词 茶树 改良sds-酸酚法 总RNA 多酚
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三种DNA提取方法对检测草莓镶脉病毒稳定性的研究 被引量:8
14
作者 冉策 陈柳 +4 位作者 陆家兰 刘正坪 魏艳敏 赵晓燕 尚巧霞 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2015年第3期200-204,共5页
草莓成熟叶片中含有大量的多糖、蛋白质、多酚和色素等物质,影响高质量DNA的提取和下游PCR反应的进行。为确定适用于PCR技术检测草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)的DNA提取方法,从草莓叶片中提取DNA后,对样品中的SVBV... 草莓成熟叶片中含有大量的多糖、蛋白质、多酚和色素等物质,影响高质量DNA的提取和下游PCR反应的进行。为确定适用于PCR技术检测草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)的DNA提取方法,从草莓叶片中提取DNA后,对样品中的SVBV进行特异性的PCR检测,比较确定不同DNA提取方法对PCR检测SVBV稳定性的影响。以感染SVBV的草莓叶片为材料,分别采用CTAB试剂盒法、高盐低pH法、改良SDS法提取草莓叶片的总DNA,将不同方法提取的DNA通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳法进行测定,对DNA产量和质量进行分析。结果表明,3种方法均能获得较为完整的DNA片段,用CTAB试剂盒提取的DNA质量最高,改良SDS法提取的DNA质量较低。将不同方法提取的DNA经过PCR反应特异性检测SVBV后,将与目的片段大小一致的PCR扩增产物经序列测定及分析,证明与SVBV的序列相吻合,证明了方法的可靠性,其质量能够满足PCR特异性检测需要。 展开更多
关键词 植物DNA提取 CTAB试剂盒 高盐低pH法 sds
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2种荔枝RNA提取方法的比较 被引量:4
15
作者 印华 周兆德 吴志祥 《热带农业工程》 2009年第2期1-3,共3页
比较利用TRIZOL法和改进SDS法2种方法提取荔枝叶片总RNA的可行性。通过琼脂糖凝胶电泳及紫外分光光度计检测,对提取所得RNA的完整性、纯度及浓度进行分析。试验结果表明,改进SDS法适合荔枝叶片总RNA的提取,能有效获得纯度高、完整性好的... 比较利用TRIZOL法和改进SDS法2种方法提取荔枝叶片总RNA的可行性。通过琼脂糖凝胶电泳及紫外分光光度计检测,对提取所得RNA的完整性、纯度及浓度进行分析。试验结果表明,改进SDS法适合荔枝叶片总RNA的提取,能有效获得纯度高、完整性好的RNA样品。 展开更多
关键词 荔枝 TRIZOL法 改进sds 总RNA 提取 纯度
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罗布麻总RNA提取方法比较研究 被引量:6
16
作者 李苗 李国旗 《北方园艺》 CAS 北大核心 2014年第11期93-96,共4页
以Trizol法、改进SDS法及RNA plant plus Reagent试剂盒法提取罗布麻的总RNA,并通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测对其提取效果进行比较分析,以筛选出罗布麻总RNA最佳提取方法。结果表明:Trizol法无法有效获得罗布麻总RNA,有较为显著的... 以Trizol法、改进SDS法及RNA plant plus Reagent试剂盒法提取罗布麻的总RNA,并通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测对其提取效果进行比较分析,以筛选出罗布麻总RNA最佳提取方法。结果表明:Trizol法无法有效获得罗布麻总RNA,有较为显著的降解现象;改进SDS法提取的罗布麻RNA总量较少、浓度低,且试验重复性差;RNA plant plus Reagent试剂盒法提取的RNA质量好,纯度高,完整性强,可直接作为后续相关分子生物学试验材料。 展开更多
关键词 罗布麻 TRIZOL法 改进sds RNA PLANT PLUS Reagent试剂盒法 总RNA提取
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黄芩高质量DNA提取方法研究 被引量:4
17
作者 丁芳林 彭书练 《湖南农业科学》 2010年第7期23-25,共3页
采用4种方法对富含多酚、多糖和小分子杂质的黄芩新鲜叶片进行了基因组DNA的提取,通过比较得到了一种以改良的SDS法为基础的分离高质量完整DNA的简便方法。结果表明,使用该方法从黄芩新鲜叶片中提取的基因组DNA可直接用于RAPD分析,可有... 采用4种方法对富含多酚、多糖和小分子杂质的黄芩新鲜叶片进行了基因组DNA的提取,通过比较得到了一种以改良的SDS法为基础的分离高质量完整DNA的简便方法。结果表明,使用该方法从黄芩新鲜叶片中提取的基因组DNA可直接用于RAPD分析,可有效地从富含多酚和多糖的药用植物组织中分离出高质量DNA。 展开更多
关键词 黄芩 DNA提取 改良sds RAPD
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两种适用于葡萄不同组织RNA提取方法的比较 被引量:4
18
作者 初雪鹏 佟少明 侯和胜 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期558-562,共5页
以不同葡萄组织为材料对目前常用的2种总RNA提取方法一改良SDS法和CTAB-LiCl法进行研究。2种RNA提取方法中均不使用酚。采用这两种方法从葡萄不同组织中均成功地提取到RNA,琼脂糖凝胶电泳结果显示28s和18SrRNA条带完整清晰。检测A260/A... 以不同葡萄组织为材料对目前常用的2种总RNA提取方法一改良SDS法和CTAB-LiCl法进行研究。2种RNA提取方法中均不使用酚。采用这两种方法从葡萄不同组织中均成功地提取到RNA,琼脂糖凝胶电泳结果显示28s和18SrRNA条带完整清晰。检测A260/A280 值分布在1.7-2.0之间,A260/A230值分布于1.9-2.3之间,说明RNA质量较高。管家基Actin和ACS5基因的检测表明2种方法所得RNA能够满足RT-PCR和基因克隆等研究需要。改良SDS法的RNA得率是CTAB-LiCl法的RNA得率的2~3倍,而CTAB-LiCl法获得的RNA纯度高。可以根据原料的数量和对RNA质量的要求来选取最佳提取方法。 展开更多
关键词 葡萄 改良sds CTAB-LiCl法 RNA提取
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3种方法提取湖北钉螺RNA的比较 被引量:4
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作者 许树俊 王康 +5 位作者 张敏红 陈文捷 管国宇 刘曼曼 徐蕾 孙恩涛 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期334-337,共4页
目的比较改良SDS法、TRIzol法和CTAB法对湖北钉螺RNA的提取效果,以期获得一种经济、高效,适于湖北钉螺大样本RNA的制备方法。方法采用改良SDS法、TRIzol法和CTAB法分别提取湖北钉螺RNA,利用核酸蛋白分析仪测定RNA浓度和纯度,通过浓度计... 目的比较改良SDS法、TRIzol法和CTAB法对湖北钉螺RNA的提取效果,以期获得一种经济、高效,适于湖北钉螺大样本RNA的制备方法。方法采用改良SDS法、TRIzol法和CTAB法分别提取湖北钉螺RNA,利用核酸蛋白分析仪测定RNA浓度和纯度,通过浓度计算产率,纯度以A260/A280、A260/A230表示;以1%琼脂糖凝胶电泳进一步检验RNA完整性;以β-acting为目的基因进行RT-PCR,验证提取的RNA能否满足RT-PCR的实验要求。结果经方差分析,3种方法的产率差异具有统计学意义(F=16 895.85,P<0.01);经LSD检验,改良SDS法产率较高,其次为TRIzol法,CTAB法产率较低。CTAB法提取的RNA纯度较高,A260/A280、A260/A230分别在1.8~2.0和2.0~2.2之间,其余两种方法的A260/A230均低于2.0。改良SDS法提取的RNA完整性较好,电泳结果显示28S、18S和5S条带完整清晰,条带之间无明显弥散现象;而TRIzol法未见28S条带,CTAB法仅见18S条带。3种方法提取的RNA经RT-PCR均能扩增出阳性条带。相比另外两种方法,改良SDS法成本低、耗时少。结论改良SDS法是一种经济、高效,适于湖北钉螺大样本RNA的制备方法。 展开更多
关键词 湖北钉螺 RNA提取 改良sds TRIZOL法 CTAB法 RNA质量
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割手密AFLP分子标记技术体系建立与优化 被引量:2
20
作者 刘许辉 段维兴 +5 位作者 刘新龙 杨海霞 高轶静 罗霆 宋焕忠 张革民 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期552-557,共6页
【目的】建立和优化割手密AFLP分子标记技术体系,为割手密遗传多样性分析、遗传图谱构建提供技术支持。【方法】以广西割手密GXS87-16、GXS85-30、GXS79-9、GXS96、GXS112、GXS212为材料,利用改良SDS法提取DNA,并用EcoRⅠ和MseⅠ酶切,... 【目的】建立和优化割手密AFLP分子标记技术体系,为割手密遗传多样性分析、遗传图谱构建提供技术支持。【方法】以广西割手密GXS87-16、GXS85-30、GXS79-9、GXS96、GXS112、GXS212为材料,利用改良SDS法提取DNA,并用EcoRⅠ和MseⅠ酶切,连接接头后,采用正交试验设计对影响预扩增反应和选择性扩增反应的主要成分如Mg2+、模板DNA、引物、dNTP、Taq聚合酶浓度进行优化。【结果】样品DNA用限制性内切酶EcoRⅠ和MseⅠ各3U于PCR仪过夜可完全酶切。经正交设计优化,较佳的预扩增体系包含0.4μLdNTPs(20mmol/mL),1.6μLMg2+(25mmol/mL),2.0μLEcoRⅠ-P(5pmol/mL),2.0μLMseⅠ-P(5pmol/mL),1UTaq酶(1U/μL),DNA模板稀释10倍;选择性扩增体系包含0.4μLdNTPs(20mmol/mL),0.8μLMg2+(25mmol/mL),1.0μLEcoRⅠ-AAG(6pmol/mL),1.0μLMseⅠ-CAG(6pmol/mL),3UTaq酶(1U/μL),DNA模板稀释20倍。以对优化反应体系扩增获得的PCR产物用5%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染后,可获得清晰的多态性指纹图谱。【结论】建立的割手密AFLP分子标记技术体系具有扩增条带清晰、多态性丰富的特点,可为构建割手密高密度遗传图谱提供技术支持。 展开更多
关键词 割手密 AFLP 改良sds 正交设计 优化
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