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基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
1
作者
韩晓乐
赵宁
+5 位作者
刘永晶
严自创
张强
周元帅
张瑞
许艳
《哈尔滨医科大学学报》
CAS
2017年第1期21-24,共4页
目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网...
目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络。随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估。结果各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子。结论基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物。
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关键词
乳腺癌亚型
mirna
—
tf
调控网络
mirna
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题名
基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
1
作者
韩晓乐
赵宁
刘永晶
严自创
张强
周元帅
张瑞
许艳
机构
哈尔滨医科大学生物物理学教研室
出处
《哈尔滨医科大学学报》
CAS
2017年第1期21-24,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(81372492)
文摘
目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络。随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估。结果各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子。结论基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物。
关键词
乳腺癌亚型
mirna
—
tf
调控网络
mirna
Keywords
breast
cancer
subtypes
mirna
-
tf
regulatory
network
mirna
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
韩晓乐
赵宁
刘永晶
严自创
张强
周元帅
张瑞
许艳
《哈尔滨医科大学学报》
CAS
2017
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