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12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析 被引量：7
1
作者 崔亚茹 张坤山 +1 位作者 罗玉萍 李思光 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期379-384,共6页
很多microRNA(miRNA)基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇。miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义。miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用。本文采用miRBase数据库查询... 很多microRNA(miRNA)基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇。miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义。miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用。本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物种的miR-302基因簇。生物信息学分析表明,这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子区,但转录方向与LARP7基因转录方向相反。序列相似性分析显示,同一物种miR-302簇成员间以及不同物种相应miR-302簇成员间相似性均较高。进化分析表明,基因复制可能是miR-302基因簇进化的主要驱动力。 展开更多
关键词 基因簇 mir-302 分子进化
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胚胎癌F9细胞中Oct4对miR-302启动子的调控作用
2
作者 刘海英 黄青 +1 位作者 董静文 李莉 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2014年第4期258-260,265,共4页
目的:检测胚胎癌F9细胞中Oct4对miR-302启动子活性是否具有调节作用。方法:构建PGL3-P-miR-302启动子荧光素酶报告基因质粒并验证其活性,然后将0.5μg PGL3-P-miR-302分别与0.5和1.0 g Oct4表达质粒共转染至293T细胞中,检测过表达Oct4对... 目的:检测胚胎癌F9细胞中Oct4对miR-302启动子活性是否具有调节作用。方法:构建PGL3-P-miR-302启动子荧光素酶报告基因质粒并验证其活性,然后将0.5μg PGL3-P-miR-302分别与0.5和1.0 g Oct4表达质粒共转染至293T细胞中,检测过表达Oct4对miR-302启动子活性的影响;并将0.5μg PGL3-P-miR-302和Oct4 siRNA(2.0μg siRNA1和2.0μg siRNA2)共转染到F9细胞中,检测Oct4 RNA干扰对miR-302启动子活性的影响,以验证Oct4对miR-302启动子是否有调控作用。结果:成功构建了PGL3-P-miR-302启动子荧光素酶报告基因质粒,并证实了PGL3-P-miR-302在F9细胞中具有启动子活性;在T293细胞中,当Oct4表达质粒为0.5μg时miR-302启动子转录活性是对照组的2.6倍(P<0.05),当Oct4为1.0μg时miR-302启动子转录活性是对照组的4.3倍(P<0.05);在F9细胞中miR-302启动子的活性在转染Oct4 siRNA后明显下降,约为siRNA非特异性对照组的68%(P<0.05)。结论:Oct4对miR-302启动子具有正调节作用,miR-302可能是Oct4的靶基因之一。 展开更多
关键词 OCT4 mir-302 胚胎癌细胞 启动子
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见微知著——微核糖核酸对细胞命运的显著调控 被引量：1
3
作者 廖宝剑 薛燕婷 +1 位作者 潘光锦 裴端卿 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1077-1086,共10页
重编程和分化、转分化在再生医学的应用中有巨大的潜能。在这些细胞命运转变中,微核糖核酸(microRNA,miRNA)或者微核糖核酸簇通过基因转录后调控发挥了重要作用。该文将从细胞miRNA表达谱与细胞谱系决定,miRNA与胚胎干细胞(embryonic st... 重编程和分化、转分化在再生医学的应用中有巨大的潜能。在这些细胞命运转变中,微核糖核酸(microRNA,miRNA)或者微核糖核酸簇通过基因转录后调控发挥了重要作用。该文将从细胞miRNA表达谱与细胞谱系决定,miRNA与胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)多能性调控,miRNA与重编程、分化、转分化等方面综述领域内的最新进展,并结合该实验室在miR-302-367簇与重编程及神经干细胞转分化方面的研究工作展开对miRNA参与细胞命运调控的讨论。 展开更多
关键词 重编程 转分化 诱导多能干细胞 微核糖核酸 微核糖核酸簇 多能性维持 mir-302-367簇
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MicroRNA-302/367 cluster功能的研究进展
4
作者 吴宪 迟志娇 +2 位作者 王强 贺小英 马利兵 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期96-103,共8页
MircroRNA (miRNA)是一段长度约为22个nt的小型非编码RNA,广泛存在于真核生物中,具有调节基因表达的作用。对miRNA的鉴定、功能分析和调控机理研究已成为当今生物领域的热点。miR-302/367cluster属于胚胎干细胞特异性细胞周期调控miRNA... MircroRNA (miRNA)是一段长度约为22个nt的小型非编码RNA,广泛存在于真核生物中,具有调节基因表达的作用。对miRNA的鉴定、功能分析和调控机理研究已成为当今生物领域的热点。miR-302/367cluster属于胚胎干细胞特异性细胞周期调控miRNAs家族成员(embryonic stem cell-specific cell cycle-regulating family of microRNAs,ESCC miRNAs),通常由5个成员miR-302a、miR-302b、miR-302c、miR-302d及miR-367组成,大多分布在脊椎动物中。研究表明,该miRNAs簇对细胞多种生理过程起重要调控作用,如人胚胎干细胞(hESCs)多能性的维持、自我更新等。本研究概述了miRNA的合成及作用机理,ESCC miRNAs促进体细胞再程序化,并总结了miR-302/367 cluster在细胞周期调控、表观遗传修饰及一些细胞信号转导途径中的作用,为采用该类miRNAs诱导体细胞再程序化为iPS细胞(Induced pluripotent stem cells)提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 mir-302/367 cluster 体细胞重编程 细胞信号转导 细胞周期
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胚胎癌F9细胞中Oct4在miRNA302启动子上的募集 被引量：1
5
作者 刘海英 石宇 刘见桥 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1321-1323,共3页
目的检测胚胎癌F9细胞中Oct4是否能在miR302启动子上募集。方法采用荧光半定量Real-time PCR检测F9细胞中Oct4RNA干扰后Oct4及miR302表达量的变化,采用染色质免疫沉淀技术(CHIP)检测F9细胞中Oct4在miR302启动子上募集的情况。结果 (1)Oc... 目的检测胚胎癌F9细胞中Oct4是否能在miR302启动子上募集。方法采用荧光半定量Real-time PCR检测F9细胞中Oct4RNA干扰后Oct4及miR302表达量的变化,采用染色质免疫沉淀技术(CHIP)检测F9细胞中Oct4在miR302启动子上募集的情况。结果 (1)Oct4 RNA干扰后Oct4表达下降了56%,miR302的表达下降了38%,两者具有相似的表达趋势。(2)Oct4能在miR302启动子上募集。结论 F9细胞中Oct4及miR302的表达具有相关性,miR302启动子上有Oct4募集,Oct4对miR302启动子具有调节作用,miR302可能是Oct4的靶基因之一。 展开更多
关键词 OCT4 mir302 多能性 胚胎癌细胞
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