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L-色氨酸生物合成的代谢流量分析 被引量:15
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作者 王健 陈宁 +2 位作者 张蓓 谭青乔 张克旭 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期473-480,共8页
建立了谷氨酸棒杆菌合成L 色氨酸 (L Try)的代谢流量平衡模型 ,应用该模型计算出发酵中后期的代谢流分布并通过MATLAB软件线性规划得到Try理想代谢流分布。结果表明 75 1 5 %的碳架进入糖酵解 ,2 4 85 %的碳架进入HMP途径 ;但与理想... 建立了谷氨酸棒杆菌合成L 色氨酸 (L Try)的代谢流量平衡模型 ,应用该模型计算出发酵中后期的代谢流分布并通过MATLAB软件线性规划得到Try理想代谢流分布。结果表明 75 1 5 %的碳架进入糖酵解 ,2 4 85 %的碳架进入HMP途径 ;但与理想代谢流相比 ,应从遗传改造和发酵控制方面降低TCA循环的代谢流 ,减少副产氨基酸的生成 ,摸索最适的溶氧控制对提高Try产率至关重要。 展开更多
关键词 L—色氨酸 生物合成 代谢流量 线性规划 发酵
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L-缬氨酸生物合成中的代谢流量分析 被引量:8
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作者 张克旭 赵丽丽 +1 位作者 张蓓 陈宁 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期49-53,共5页
应用流量平衡模型 ,通过物料衡算和MATLAB线性规划方法得到了发酵中后期L 缬氨酸合成过程的代谢流量分步。代谢流分析结果表明 ,在分批培养生成L 缬氨酸的过程中 ,有62 8%的葡萄糖进入糖酵解途径生成L 缬氨酸 ,38 2 %进入HMP途径 ,仅 9... 应用流量平衡模型 ,通过物料衡算和MATLAB线性规划方法得到了发酵中后期L 缬氨酸合成过程的代谢流量分步。代谢流分析结果表明 ,在分批培养生成L 缬氨酸的过程中 ,有62 8%的葡萄糖进入糖酵解途径生成L 缬氨酸 ,38 2 %进入HMP途径 ,仅 9 2 %的碳架进入TCA循环。实验条件下的代谢流 (58)与理想代谢流 (92 31 )相比 ,仍应从遗传改造和发酵控制方面降低TCA循环的代谢流 。 展开更多
关键词 缬氨酸 代谢流分布 线性规划
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盾叶薯蓣糖化液发酵生产2,3-丁二醇 被引量:8
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作者 刘国兴 王元好 +4 位作者 孙丽慧 戴建英 孙亚琴 董悦生 修志龙 《过程工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期95-100,共6页
利用克雷伯氏杆菌以盾叶薯蓣糖化液为底物发酵生产2,3-丁二醇(2,3-BD),考察了2,3-BD浓度、生产强度、有机酸生成及代谢流量分布情况.结果表明,盾叶薯蓣中的有机酸成分能促进三羧酸循环途径和乙酸途径的代谢流,减弱琥珀酸途径的代谢流,... 利用克雷伯氏杆菌以盾叶薯蓣糖化液为底物发酵生产2,3-丁二醇(2,3-BD),考察了2,3-BD浓度、生产强度、有机酸生成及代谢流量分布情况.结果表明,盾叶薯蓣中的有机酸成分能促进三羧酸循环途径和乙酸途径的代谢流,减弱琥珀酸途径的代谢流,从而提高2,3-BD的浓度.以盾叶薯蓣糖化液为底物,采用批式流加方式,补加固体葡萄糖,发酵56h,发酵液中2,3-BD最终浓度达到80.20g/L,乙偶姻与2,3-BD浓度之和最终达到86.19g/L,生产强度达到1.54g/(L-h),比单独以葡萄糖为底物时分别提高了8.50%,7.38%和7.69%. 展开更多
关键词 克雷伯氏杆菌 盾叶薯蓣 2 3-丁二醇 代谢流量分布
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L-精氨酸高产菌的选育及基于代谢流量分布的育种机制 被引量:7
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作者 许正宏 熊筱晶 +1 位作者 窦文芳 陶文沂 《工业微生物》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期1-6,共6页
从分析钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum)的精氨酸合成途径入手,提出了一种通过选育脯氨酸结构类似物抗性突变株以提高其精氨酸合成能力的育种思路。采用亚硝基胍(NTG)诱变处理出发菌株YD8(His-,SGr1.2 mg/mL,D-Argr15 mg/mL),经含1... 从分析钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum)的精氨酸合成途径入手,提出了一种通过选育脯氨酸结构类似物抗性突变株以提高其精氨酸合成能力的育种思路。采用亚硝基胍(NTG)诱变处理出发菌株YD8(His-,SGr1.2 mg/mL,D-Argr15 mg/mL),经含15 mg/mL的脯氨酸结构类似物S-甲基半胱氨酸(S-MC)的抗性筛选获得精氨酸高产突变株YDM403(His-,SGr1.2 mg/mL,D-Argr15 mg/mL,S-MCr15 mg/mL),产酸水平可达29.4 g/L,较出发菌株YD8的产酸高出55.0%。通过代谢流量分布分析了菌株YD8和YDM403代谢网络的变化,结果表明,菌株YD8可能存在顺序反馈抑制作用,出发株YD8解除了Arg对Glu到Arg的反馈抑制,而YDM403又解除了Pro对Glu到Pro的反馈抑制,从而使中间物Glu累积量下降而对-αKG到Glu不再有反馈抑制,其通量提高,与此同时从Glu向Arg的代谢通量也相应增加。 展开更多
关键词 钝齿棒杆菌 精氨酸 代谢流量分布 菌种选育
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L-缬氨酸发酵过程的代谢流分析 被引量:4
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作者 李晓华 陈宁 +1 位作者 方正星 张克旭 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期254-258,共5页
通过对L-缬氨酸发酵过程的代谢流进行分析,可获得提高L-缬氨酸产量的代谢调控手段。本论文应用流量平衡模型,通过物料衡算和MATLAB 线性规划方法得到了L-缬氨酸发酵过程的代谢流量分布,并研究了L-缬氨酸发酵过程中的NADPH 及ATP 的代谢... 通过对L-缬氨酸发酵过程的代谢流进行分析,可获得提高L-缬氨酸产量的代谢调控手段。本论文应用流量平衡模型,通过物料衡算和MATLAB 线性规划方法得到了L-缬氨酸发酵过程的代谢流量分布,并研究了L-缬氨酸发酵过程中的NADPH 及ATP 的代谢通量分布。代谢流分析结果表明,在分批培养生成L一缬氨酸的过程中,HMP是L-缬氨酸生物合成的关键途径,发酵过程中的ATP 大部分以无效循环的形式消耗掉,应从遗传改造和发酵控制方面增大EMP 途径的流量,降低TCA 循环的代谢流,减少副产氨基酸的生成,进一步提高缬氨酸的产率。 展开更多
关键词 L-缬氨酸 发酵过程 代谢流 产量 流量平衡模型 线性规划 代谢通量分布
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丙酸杆菌的两种固定化细胞反应器发酵生产丙酸及其代谢通量分析 被引量:4
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作者 陈飞 冯小海 +2 位作者 吴波 李莎 徐虹 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第4期1034-1041,共8页
根据构建的费氏丙酸杆菌合成丙酸的生化反应网络,利用代谢通量分析法分析了课题组构建的两种固定化细胞反应器对丙酸发酵的影响。结果表明,固定化细胞发酵可以调节葡萄糖-6-磷酸、磷酸烯醇式丙酮酸和丙酮酸节点处的代谢通量分布,从而最... 根据构建的费氏丙酸杆菌合成丙酸的生化反应网络,利用代谢通量分析法分析了课题组构建的两种固定化细胞反应器对丙酸发酵的影响。结果表明,固定化细胞发酵可以调节葡萄糖-6-磷酸、磷酸烯醇式丙酮酸和丙酮酸节点处的代谢通量分布,从而最终影响生物量和各种有机酸的合成。与游离发酵相比,两种固定化发酵方式戊糖磷酸途径通量都有显著提高,乙酸和乳酸通量均有减少。与植物纤维床反应器主要靠直接加强丙酸合成途径使丙酸产率提高了242.72%不同,多点式棉纤维床反应器发酵主要是通过琥珀酸合成途径的增强而使丙酸产率提高了56.80%。比较了相关关键酶的比活,酶活变化与代谢通量结果基本一致。 展开更多
关键词 丙酸 植物纤维床反应器 多点式棉纤维床反应器 代谢通量分布
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Engineering and finetuning expression of SerC for balanced metabolic flux in vitamin B6 production
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作者 Kai Chen Linxia Liu +3 位作者 Jinlong Li Zhizhong Tian Hongxing Jin Dawei Zhang 《Synthetic and Systems Biotechnology》 SCIE CSCD 2024年第2期388-398,共11页
Vitamin B6 plays a crucial role in cellular metabolism and stress response,making it an essential component for growth in all known organisms.However,achieving efficient biosynthesis of vitamin B6 faces the challenge ... Vitamin B6 plays a crucial role in cellular metabolism and stress response,making it an essential component for growth in all known organisms.However,achieving efficient biosynthesis of vitamin B6 faces the challenge of maintaining a balanced distribution of metabolic flux between growth and production.In this study,our focus is on addressing this challenge through the engineering of phosphoserine aminotransferase(SerC)to resolve its redundancy and promiscuity.The enzyme SerC was semi-designed and screened based on sequences and predicted kcat values,respectively.Mutants and heterologous proteins showing potential were then fine-tuned to optimize the production of vitamin B6.The resulting strain enhances the production of vitamin B6,indicating that different fluxes are distributed to the biosynthesis pathway of serine and vitamin B6.This study presents a promising strategy to address the challenge posed by multifunctional enzymes,with significant implications for enhancing biochemical production through engineering processes. 展开更多
关键词 Vitamin B6 Phosphoserine aminotransferase SerC Protein engineering Multifunctional enzymes metabolic flux distribution
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溶氧强制振荡对L-苏氨酸发酵产率及其代谢流迁移的影响 被引量:3
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作者 黄金 谢希贤 +2 位作者 徐庆阳 温廷益 陈宁 《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第1期93-98,共6页
为有效降低L-苏氨酸发酵过程中副产物的积累,考察了发酵过程中的溶氧强制振荡对L-苏氨酸发酵产率及其多种副产物积累的影响,并深入探讨了振荡行为对L-苏氨酸生物合成代谢网络的代谢流分布的影响。结果表明:采用溶氧强制振荡工艺能够明... 为有效降低L-苏氨酸发酵过程中副产物的积累,考察了发酵过程中的溶氧强制振荡对L-苏氨酸发酵产率及其多种副产物积累的影响,并深入探讨了振荡行为对L-苏氨酸生物合成代谢网络的代谢流分布的影响。结果表明:采用溶氧强制振荡工艺能够明显提高L-苏氨酸的发酵产率和降低多种抑制性产物的合成。与非振荡工艺相比,经过36h培养,细胞生物量达到29.5g·L-1,苏氨酸的质量浓度达到118.9g·L-1,而乙酸质量浓度下降到0.8g·L-1,副产的其他氨基酸也大大降低。通过代谢流分析表明,在发酵后期的一个振荡周期(30h至31h)内,与非振荡组相比,HMP途径的代谢流量由6.5提高至95.88,CO2固定反应代谢流量由45.1提高至86.1,TCA循环相对代谢流量从1.86提高至17.78,从而导致苏氨酸对葡萄糖的质量转化率从30.0%增加至57.0%。溶氧强制振荡条件下的苏氨酸发酵液中各种副产物更少,更适合今后的大规模工业化生产。 展开更多
关键词 L-苏氨酸 强制振荡 乙酸 溶氧:代谢流分布
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葡萄糖浓度对杂交瘤细胞代谢通量分布的影响
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作者 张淑香 李东晓 +3 位作者 朱明龙 张旭 谭文松 张嗣良 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第12期3128-3134,共7页
将代谢工程理论应用于动物细胞的流加培养过程。通过构建代谢网络模型,研究了杂交瘤细胞从动态到拟稳态过程中物质和能量代谢通量的时间分布图。结果表明:当葡萄糖浓度较高时,葡萄糖在乳酸生成途径和TCA循环的代谢通量分配比例分别为90%... 将代谢工程理论应用于动物细胞的流加培养过程。通过构建代谢网络模型,研究了杂交瘤细胞从动态到拟稳态过程中物质和能量代谢通量的时间分布图。结果表明:当葡萄糖浓度较高时,葡萄糖在乳酸生成途径和TCA循环的代谢通量分配比例分别为90%和10%,ATP生成的比例分别为20%和60%,说明葡萄糖大部分经糖酵解途径生成乳酸,而进入TCA循环的少量部分则提供大部分的能量生成。当葡萄糖浓度降至其限制细胞生长的浓度时,进入TCA循环的葡萄糖比例逐步提高到100%,葡萄糖的氧化程度从0.6mmol.mmol-1增至4.52mmol.mmol-1,说明葡萄糖代谢逐渐从乳酸生成途径迁移到TCA循环,从无氧代谢逐渐转移到有氧代谢。 展开更多
关键词 代谢通量分布 杂交瘤细胞 流加培养 葡萄糖 TCA循环
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