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茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析
被引量:
1
1
作者
王小纯
张珈敏
+3 位作者
蒋洪
俞海洋
谭莉
胡远扬
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期573-578,共6页
用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编...
用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编码区的一些特征 :A T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构 ,存在4个茎环结构 ,有哺乳动物内部核糖体进入位点 (IRES)的保守区域 ,即含保守基序GNRA的茎环A和A C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。
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关键词
茶尺蠖小RNA病毒
哺乳动物小RNA病毒
5’端非编码区
结构分析
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职称材料
题名
茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析
被引量:
1
1
作者
王小纯
张珈敏
蒋洪
俞海洋
谭莉
胡远扬
机构
武汉大学生命科学学院
河南农业大学农学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期573-578,共6页
文摘
用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编码区的一些特征 :A T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构 ,存在4个茎环结构 ,有哺乳动物内部核糖体进入位点 (IRES)的保守区域 ,即含保守基序GNRA的茎环A和A C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。
关键词
茶尺蠖小RNA病毒
哺乳动物小RNA病毒
5’端非编码区
结构分析
Keywords
Ectropis
oblique
picornavirus
mammalian
picornaviruses
5′
untranslation
region
structural
analysis
分类号
Q966 [生物学—昆虫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析
王小纯
张珈敏
蒋洪
俞海洋
谭莉
胡远扬
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
1
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