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低同源性蛋白质结构预测 被引量:2
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作者 倪立生 毛凤楼 +1 位作者 韩玉真 来鲁华 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第5期389-392,共4页
The development of human genome project calls for more rapid and accurate protein structure prediction method to assign the structure and function of gene products. Threading has been proved to be successful in protei... The development of human genome project calls for more rapid and accurate protein structure prediction method to assign the structure and function of gene products. Threading has been proved to be successful in protein fold assignment,although difficulties remain for low homologous sequences. We have developed a method for solving the sequence rearrangement problem in threading. By reshuffling secondary elements,protein structures with the same spatial arrangement of secondary structures but different connections can be predicted. This method has been proved to be useful in fold recognition for proteins of different evolutionary origin and converge to the same fold. 展开更多
关键词 蛋白质 结构预测 折叠模式识别 低同源性 收敛进化 基因组 二级结构
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基于伪氨基酸组成的G蛋白偶联受体超家族的识别 被引量:2
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作者 顾全 丁永生 +1 位作者 张同亮 沈懿珍 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第3期500-504,共5页
G蛋白偶联受体(GPCRs)是人体内最大的蛋白质受体家族,在制药业中起到很大作用。G蛋白偶联受体的功能和其超家族、子家族的分类密切相关,然而目前其空间结构却很难用实验方法获得。因此,如何用计算的方法预测G蛋白偶联受体的家族和超家... G蛋白偶联受体(GPCRs)是人体内最大的蛋白质受体家族,在制药业中起到很大作用。G蛋白偶联受体的功能和其超家族、子家族的分类密切相关,然而目前其空间结构却很难用实验方法获得。因此,如何用计算的方法预测G蛋白偶联受体的家族和超家族是生物信息学和蛋白质科学中重要的研究内容。根据Chou提出的伪氨基酸离散模型框架,使用近似熵的概念表示G蛋白序列附加特征,构造一种新的蛋白序列表示方法。采用FKNN(模糊K近邻)分类器作为预测工具,从最新的G蛋白数据抽取全部数据,经过去除同源性处理后,构成低同源性的新测试数据集。Jackknife测试结果验证了此方法的有效性。与之前的研究结果相比,取得了最高的预测精度。结果表明,此方法处理G蛋白偶联受体有很高的实用价值。 展开更多
关键词 G蛋白偶联受体 低同源性 伪氨基酸组成 近似熵 FKNN分类器
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基于迁移卷积神经网络的夜间低照度图像同源性的鉴定算法
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作者 庞展 张旭毅 《微型电脑应用》 2024年第4期178-181,共4页
图像的二次编辑和篡改大大降低了图像的可信度,受夜间光线影响,图像分类过程不稳定,图像来源取证准确率较差,为此,研究基于迁移卷积神经网络的夜间低照度图像同源性鉴定算法。基于迁移卷积神经网络,将夜间低照度图像分类,计算不同特征... 图像的二次编辑和篡改大大降低了图像的可信度,受夜间光线影响,图像分类过程不稳定,图像来源取证准确率较差,为此,研究基于迁移卷积神经网络的夜间低照度图像同源性鉴定算法。基于迁移卷积神经网络,将夜间低照度图像分类,计算不同特征图像之间的相关性;增强与降维处理夜间低照度图像,为图像同源性鉴定提供标识性依据;通过划分图像块,实现夜间低照度图像同源性鉴定。经实验论证分析,应用算法能使夜间低照度图像内容更为完整,细节显示更多,图像同源性鉴定准确率和类别纯度更高,具有有效性与实用性。 展开更多
关键词 迁移卷积神经网络 夜间低照度图像 图像增强 同源性鉴定 噪声特征 图像分块
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降血糖食品的研究进展 被引量:4
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作者 朱运平 任斐 《中国酿造》 CAS 北大核心 2022年第9期1-7,共7页
糖尿病是当今威胁人类生命健康的主要慢性疾病之一。市面上常见的降血糖药物往往有不同程度的副作用,寻找天然、低毒副作用的降血糖食品显得尤为重要。该文重点介绍常见的降血糖食品原料(包括桑叶、白芸豆、葛根、苦瓜和苦荞等)及主要... 糖尿病是当今威胁人类生命健康的主要慢性疾病之一。市面上常见的降血糖药物往往有不同程度的副作用,寻找天然、低毒副作用的降血糖食品显得尤为重要。该文重点介绍常见的降血糖食品原料(包括桑叶、白芸豆、葛根、苦瓜和苦荞等)及主要降血糖功能性成分物质,并综述了近几年来对这些功能性成分降血糖机理的研究进展,总结了降血糖食品原料在发酵食品及低血糖指数(GI)食品开发中的应用情况,以期为我国降血糖食品的开发提供理论基础。 展开更多
关键词 糖尿病 降血糖食品原料 发酵食品 低血糖指数食品 药食同源
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小麦低分子量谷蛋白一级结构分析 被引量:2
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作者 陈军营 吕德彬 +5 位作者 陈新建 崔党群 曹庆炜 程西永 许海霞 詹克慧 《麦类作物学报》 CAS CSCD 2003年第3期37-40,共4页
用数学统计方法和蛋白质序列分析软件对部分已测序的17种低分子量麦谷蛋白亚基含氮量、氨基酸含量及一级结构序列进行比较分析,以期从氨基酸层次上揭示其结构和功能及进化上的关系。结果表明:(1)其平均含氮量为17.8%;(2)氨基酸含量基... 用数学统计方法和蛋白质序列分析软件对部分已测序的17种低分子量麦谷蛋白亚基含氮量、氨基酸含量及一级结构序列进行比较分析,以期从氨基酸层次上揭示其结构和功能及进化上的关系。结果表明:(1)其平均含氮量为17.8%;(2)氨基酸含量基本恒定,以谷氨酰胺的含量最多,且常连接在一起;(3)存在119个保守性氨基酸残基和两个保守性片段,一个是“QQQ-PPFSQQ”,一个是“IP-VHPSILQQLNPCKVFLQQ-C-P-AM-Q-LARSQM-QS-CHVMQQQCCQQL-QIPQQSRYEAI-AI-YSIILQEQQ”(“-”表示各序列中不同的氨基酸);(4)X84960、X84961、Y14104;X13306、U86025、U86027、U86029两组亚基序列中各具有一定程度的同源性。 展开更多
关键词 小麦 低分子量麦谷蛋白 一级结构 保守性 同源性 氨基酸
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硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发 被引量:4
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作者 赵永涛 孔秀英 詹克慧 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1843-1848,共6页
获得小麦低分子量谷蛋白基因家族新成员,为深入研究该基因家族的组成及其在染色体上的分布与进化奠定基础。本研究根据已发表的小麦低分子量麦谷蛋白基因序列设计了1对简并引物,以从硬粒小麦品种Langdon BAC文库中筛选的携带小麦低分子... 获得小麦低分子量谷蛋白基因家族新成员,为深入研究该基因家族的组成及其在染色体上的分布与进化奠定基础。本研究根据已发表的小麦低分子量麦谷蛋白基因序列设计了1对简并引物,以从硬粒小麦品种Langdon BAC文库中筛选的携带小麦低分子量谷蛋白基因的BAC为模板,利用同源序列克隆技术克隆了1个MET类型的小麦低分子量谷蛋白基因LMWLDN-M,该基因编码350个氨基酸。利用LMWLDN-M与本实验室克隆的Langdon品种其他类型的小麦低分子量谷蛋白基因之间的SNP,设计了该类型基因特异的引物。以Langdon代换系和中国春小麦缺体-四体为模板进行PCR扩增,将该基因定位到小麦B基因组上。序列分析表明,LMWLDN-M为Glu-B3基因家族的一个新成员。 展开更多
关键词 硬粒小麦 低分子量麦谷蛋白 基因家族 同源序列克隆
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海洋低温脂肪酶MLP的同源模建及分子动力学模拟 被引量:1
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作者 纪晓峰 盛军 +2 位作者 郑媛 郝建华 孙谧 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期594-602,共9页
海洋低温脂肪酶(marine low-temperature lipase,MLP,登录号:ADM47601)是一株海洋细菌来源的新型脂肪酶,其具有耐碱性pH的优点,在生物能源、食品加工等行业具有良好的应用前景。作者从MLP的氨基酸序列入手,利用同源模建方法构建其三级结... 海洋低温脂肪酶(marine low-temperature lipase,MLP,登录号:ADM47601)是一株海洋细菌来源的新型脂肪酶,其具有耐碱性pH的优点,在生物能源、食品加工等行业具有良好的应用前景。作者从MLP的氨基酸序列入手,利用同源模建方法构建其三级结构,并通过Ramachandran图和Profile_3D图对模型的可靠性进行了验证。同时,通过"界面激活"实验和分子动力学模拟,对覆盖在活性位点区的"盖子域"进行了预测和分析。该研究结果将为今后更高性能突变株的获得及该酶空间折叠方式的研究等提供理论指导。 展开更多
关键词 海洋低温脂肪酶 同源模建 分子动力学模拟
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Electrical stimulation upregulates angiopoietin-1/Tie-2 mRNA expression in a rat model of focal cerebral ischemia
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作者 Shasha Li Yonghong Yang Qiang Gao Jing He Chengqi He 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2010年第19期1470-1474,共5页
Angiopoietin-1/tyrosine kinase with immunoglobulin and epidermal growth factor homology domains 2 (Tie-2) is a newly discovered signaling pathway of angiogenesis. Angiogenesis benefits recovery of neurological funct... Angiopoietin-1/tyrosine kinase with immunoglobulin and epidermal growth factor homology domains 2 (Tie-2) is a newly discovered signaling pathway of angiogenesis. Angiogenesis benefits recovery of neurological functions such as swallowing. In the present study, a rat model of dysphagia following stroke was induced by middle cerebral artery occlusion to investigate the influence of low frequency electrical stimulus with bidirectional square waves and triangular waves on angiopoietin-1/-13e-2 mRNA expression. Reverse transcription-polymerase chain reaction results showed that low frequency electrical stimulus significantly improved the neurological scores of the model rats, and increased angiopoietin-1/'13e-2 mRNA expression. This demonstrates that low frequency electrical stimulation can ameliorate neurological function in rats with focal brain ischemia, potentially through regulation of angiopoietin-1/-13e-2 expression in the angiogenesis pathway. 展开更多
关键词 low frequency electrical stimulation ANGIOPOIETIN-1 tyrosine kinase with immunoglobulin and epidermal growth factor homology domains middle cerebral artery occlusion model DYSPHAGIA
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制氧机电网暂降跳机故障分析及优化改造措施
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作者 张勇鹏 程谦胜 +2 位作者 陈志宏 陈连明 位天时 《冶金动力》 2021年第6期18-20,共3页
针对2台制氧机因电网暂降多次出现单台跳机和2台同时跳机的故障,对其原因进行了分析,提出低压负荷晃电治理措施,有效解决了此类故障。
关键词 高低压同源 暂态电压防御 晃电保护器
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