新型长链非编码RNA(lncRNA)的生物信息学研究进展 被引量：15

1

作者 原佳沛 张浩文 鲁志 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第7期634-640,共7页

非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)是指不被翻译成蛋白质的一类RNA,近几年来关于它们的功能研究越来越引起人们的重视.现在已经发现了一些中小型ncRNA,比如microRNA、snoRNA、tRNA等,但是关于长ncRNA(lncRNA)的研究还不够完善.本篇综述回... 非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)是指不被翻译成蛋白质的一类RNA,近几年来关于它们的功能研究越来越引起人们的重视.现在已经发现了一些中小型ncRNA,比如microRNA、snoRNA、tRNA等,但是关于长ncRNA(lncRNA)的研究还不够完善.本篇综述回顾了ncRNA特别是lncRNA的生物信息学研究进展,包括它们的研究历程、基本特点、与疾病的关系,以及对已有的预测非编码RNA的计算机方法进行了分析和比较,并且介绍了利用机器学习模型整合新一代高通量测序数据的方法. 展开更多

关键词 非编码rna 长链非编码rna 非编码rna预测 机器学习

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黄芩素抑制血管平滑肌细胞增殖作用及其机制研究 被引量：11

2

作者 李学堂 隋玉玲 《世界临床药物》 CAS 2017年第9期601-607,共7页

目的探索黄芩素抑制血管平滑肌细胞(VSMC)增殖的作用以及可能机制。方法体外培养人主动脉血管平滑肌细胞(HA-VSMC),经黄芩素处理。以异硫氰酸荧光素(FITC)染色法和细胞计数试剂盒-8(CCK-8)观察HA-VSMC增殖情况,采用流式细胞术观察细胞... 目的探索黄芩素抑制血管平滑肌细胞(VSMC)增殖的作用以及可能机制。方法体外培养人主动脉血管平滑肌细胞(HA-VSMC),经黄芩素处理。以异硫氰酸荧光素(FITC)染色法和细胞计数试剂盒-8(CCK-8)观察HA-VSMC增殖情况,采用流式细胞术观察细胞凋亡情况。微阵列分析成纤维细胞生长因子(FGF)18基因及长链非编码核糖核酸(LncRNA)AK021954基因,实时定量聚合酶链反应(RTQ-PCR)及免疫印迹法检测FGF18 mRNA和蛋白表达量。结果黄芩素可抑制HA-VSMC的增殖并促进其凋亡。微阵列分析显示,黄芩素处理的HA-VSMC的下游靶基因中FGF 18下调最明显,而LncRNA AK021954为显著上调基因。干扰LncRNA AK021954可促进HA-VSMC的增殖并抑制凋亡。结论黄芩素可抑制VSMC的增殖并促进其凋亡,其机制可能是过表达LncRNA AK021954基因以剂量依赖方式抑制VSMC增殖,并降低FGF18的表达水平。 展开更多

关键词 动脉粥样硬化 黄芩素 增殖 血管平滑肌细胞(VSMC) 成纤维细胞生长因子(FGF)18 长链非编码核糖核酸(lncrna)

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长链非编码RNA与恶性肿瘤发生发展关系的研究进展 被引量：11

3

作者 邓镇涛 许朋 王燕 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期2286-2288,共3页

人类基因组数目庞大,其形成的基因调控网络控制着组织、器官细胞的增殖、分化和凋亡。但是,整个基因组中仅约2%的基因是编码RNA,可以翻译成蛋白质,98%左右的基因为非编码RNA。之前人们普遍认为非编码RNA不能翻译有效的蛋白质产生相应的... 人类基因组数目庞大,其形成的基因调控网络控制着组织、器官细胞的增殖、分化和凋亡。但是,整个基因组中仅约2%的基因是编码RNA,可以翻译成蛋白质,98%左右的基因为非编码RNA。之前人们普遍认为非编码RNA不能翻译有效的蛋白质产生相应的功能,被视为基因组中的"废物"。目前,大量研究表明非编码RNA并不是基因组序列中没用的产物,而是未知的"黑暗物质",已有大量的研究发现非编码RNA在多种生物过程中起着重要的作用,并且在一些重大疾病如肿瘤、心血管的发生发展中发挥着不可小觑的作用。本文就长链非编码RNA在恶性肿瘤的发生发展中的作用机制做一综述。 展开更多

关键词 长链非编码rna 恶性肿瘤 肿瘤发生

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异甘草素通过Smad3/Arid2-IR/NF-κB轴改善顺铂诱导的急性肾损伤小鼠炎症反应 被引量：8

4

作者 文丹 廖媛 +2 位作者 李健春 张宇韦 樊均明 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第6期25-30,46,共7页

目的研究异甘草素(ISO)对顺铂诱导的急性肾损伤(AKI)小鼠的作用并探讨潜在调控机制。方法 30只C57BL/6雄性小鼠随机分为空白对照组(NC组),模型组(AKI组),异甘草素药物低剂量(ISO-L)和高剂量(ISO-H)处理组,厄贝沙坦阳性对照组(Irb组)。... 目的研究异甘草素(ISO)对顺铂诱导的急性肾损伤(AKI)小鼠的作用并探讨潜在调控机制。方法 30只C57BL/6雄性小鼠随机分为空白对照组(NC组),模型组(AKI组),异甘草素药物低剂量(ISO-L)和高剂量(ISO-H)处理组,厄贝沙坦阳性对照组(Irb组)。通过单次腹腔注射顺铂(20 mg/kg)建立AKI模型。在干预过程中,NC组和AKI组予以生理盐水,而ISO-L组和ISO-H组分别予以异甘草素7. 5 mg/kg、30 mg/kg,Irb组予以20 mg/kg厄贝沙坦,药物灌胃3 d后处死小鼠,收集血清检测肌酐、尿素氮,HE和PAS染色检测肾病理改变,免疫组化和免疫印迹法检测炎症关键因子(IL-6、IL-1β)和Smad3、NF-κB等关键蛋白活性,Real-time PCR检测炎症因子和长链非编码Arid2-IR改变情况。结果与AKI组比,异甘草素干预能明显改善小鼠肌酐和尿素氮(P <0. 05),且呈浓度依赖性调节;病理染色结果显示药物干预后肾炎性细胞浸润减少,肾损伤明显改善;而炎症因子、Smad3、NF-κB活性和长链非编码Arid2-IR等表达均出现显著下调(P <0. 05),表明异甘草素可以抑制Smad3/Arid2-IR/NF-κB轴的活化。结论异甘草素可有效减轻AKI小鼠肾炎症反应,其机制可能与调节Smad3/Arid2-IR/NF-κB轴有关。 展开更多

关键词 长链非编码rna(lncrna) Arid2-IR 异甘草素 急性肾损伤 炎症

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长链非编码RNA(lncRNA)及其在昆虫学研究中的进展 被引量：7

5

作者 朱斌 梁沛 高希武 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1272-1281,共10页

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的非编码RNA,主要通过转录调控和转录后调控调节基因的表达,也可通过影响蛋白质定位和端粒复制发挥其强大的生物学功能。本文在介绍lncRNA的特征、分类及其主要作... 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的非编码RNA,主要通过转录调控和转录后调控调节基因的表达,也可通过影响蛋白质定位和端粒复制发挥其强大的生物学功能。本文在介绍lncRNA的特征、分类及其主要作用机制的基础上,综述了有关昆虫lncRNA的鉴定及功能研究等方面的最新进展。近5年来已经从黑腹果蝇Drosophila melanogaster、小菜蛾Plutella xylostella和褐飞虱Nilaparvata lugens等8种昆虫中鉴定出了大量lncRNA,为进一步研究lncRNA在昆虫生长发育过程中的功能奠定了重要基础。非编码RNA参与调控害虫抗药性的分子机制已经成为昆虫毒理学研究的一个新兴领域,因此本文对有关lncRNA与害虫抗药性关系的最新研究进展也做了介绍。 展开更多

关键词 长链非编码rna 昆虫 分类 生物学功能 抗药性

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DLX6-AS1通过竞争性结合miR-15上调Caspase-1诱导巨噬细胞焦亡

6

作者 何琴 米娅丽 +2 位作者 冯熙熙 赵国军 侯连杰 《生命科学研究》 CAS 2024年第2期95-102,共8页

为探讨长链非编码RNA (long noncoding RNA, lncRNA) DLX6-AS1在巨噬细胞焦亡中的作用及相关机制,采用生物信息学分析、实时荧光定量PCR和双荧光素酶报告基因实验等,在THP-1巨噬细胞中分析并验证lncRNA DLX6-AS1下游微RNA (microRNA, mi... 为探讨长链非编码RNA (long noncoding RNA, lncRNA) DLX6-AS1在巨噬细胞焦亡中的作用及相关机制,采用生物信息学分析、实时荧光定量PCR和双荧光素酶报告基因实验等,在THP-1巨噬细胞中分析并验证lncRNA DLX6-AS1下游微RNA (microRNA, mi RNA)及mi RNA的下游靶基因;通过免疫荧光染色等实验检测DLX6-AS1/miR-15/caspase-1轴对巨噬细胞焦亡的影响。结果显示, DLX6-AS1在焦亡巨噬细胞中表达上调,敲降DLX6-AS1可抑制巨噬细胞焦亡,但这种抑制作用被mi R-15抑制剂逆转;mi R-15通过调控其靶基因caspase-1表达,抑制巨噬细胞焦亡。本研究表明, DLX6-AS1通过竞争性结合mi R-15,解除mi R-15对其靶基因caspase-1的抑制作用,从而诱导巨噬细胞焦亡,这将丰富lncRNA调控巨噬细胞焦亡的理论基础。 展开更多

关键词 长链非编码rna(lncrna) 微rna(mirna) 焦亡 巨噬细胞

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肝癌微血管浸润相关长链非编码RNA(lncRNA-MVIH)在结直肠癌中的表达 被引量：6

7

作者 唐曦 徐炎华 +2 位作者 汪春林 邱萍 胡娅 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期4414-4418,共5页

为了探讨长链非编码RNA肝癌微血管浸润相关mRNA(MVIH-lncRNA)在结直肠癌中的表达及其临床意义。本研究采用实时荧光定量PCR(RT-q PCR)检测MVIH-lncRNA在44例结直肠癌组织、44例癌旁组织和13例正常结肠组织中表达。研究结果表明:MVIH-lnc... 为了探讨长链非编码RNA肝癌微血管浸润相关mRNA(MVIH-lncRNA)在结直肠癌中的表达及其临床意义。本研究采用实时荧光定量PCR(RT-q PCR)检测MVIH-lncRNA在44例结直肠癌组织、44例癌旁组织和13例正常结肠组织中表达。研究结果表明:MVIH-lncRNA在结直肠癌组织中的表达显著高于癌旁组织(p<0.001)和正常结肠组织(p<0.001),并且MVIH-lncRNA的表达在正常结肠组织、癌旁组织、结直肠癌组织中呈递增趋势(p<0.001)。高表达MVIH-lncRNA与淋巴结转移相关,而与年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤分化不相关;MVIH-lncRNA表达上调患者生存时间更短(p=0.034),其在结直肠中高表达提示预后不良。本研究的结果表明MVIH-lncRNA在结直肠癌的早期诊断、预后评价中的具有重要的意义,为进一步研究MVIH-lncRNA在结直肠癌的发生发展中的分子机理奠定了研究基础。 展开更多

关键词 结直肠癌 长链非编码rna 肝癌微血管浸润相关Incrna 表达

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基于WGCNA联合LASSO算法胃癌预后lncRNA分子标志物筛选 被引量：6

8

作者 刘辉 张超 +4 位作者 景丽伟 张秋萌 常紫薇 李兴雨 史旋 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2021年第10期891-897,共7页

目的运用两种生物信息学方法筛选胃癌预后长链非编码RNA(lncRNA)分子标志物,为胃癌lncRNA分子机制研究提供基础。方法下载癌症基因图谱(TCGA)胃癌和癌旁的RNA测序数据和临床特征数据,针对差异表达基因采用加权基因共表达网络分析(WGCNA... 目的运用两种生物信息学方法筛选胃癌预后长链非编码RNA(lncRNA)分子标志物,为胃癌lncRNA分子机制研究提供基础。方法下载癌症基因图谱(TCGA)胃癌和癌旁的RNA测序数据和临床特征数据,针对差异表达基因采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和套索算法(LASSO)构建胃癌预后lncRNA模型,以绘制受试者工作特征曲线(ROC)及Kaplan-Meier曲线评价模型,绘制单基因ROC曲线筛选预后lncRNA标志物,并通过starBase数据库预测其可能靶基因。结果纳入345例胃癌及32例癌旁样本数据,WGCNA联合LASSO算法构建出包含有11个lncRNA的胃癌预后模型,模型的曲线下面积(AUC)为0.641,生存分析提示胃癌高风险组5年总体生存时间短于低风险组(P=0.0079),表明模型性能良好。单基因ROC曲线法发现LINC00665的AUC最大,为0.695,提示LINC00665为胃癌预后lncRNA分子标志物的可能性最大。靶基因预测分析,胃癌中LINC00665与靶基因HKR1成正相关(r=0.401,P<0.05)。结论WGCNA联合LASSO分析发现LINC00665是胃癌预后的可能lncRNA分子标志物,可能通过调控靶基因HKR1影响胃癌的发生发展过程。 展开更多

关键词 胃癌 预后 长链非编码rna 加权基因共表达网络分析 套索算法

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内源性竞争RNA在脓毒症调控作用中的研究进展

9

作者 杨慧慧 郭贺 +4 位作者 谭睿敏 闫娅婷 祖一文 葛晨 杜全胜 《中国急救医学》 CAS CSCD 2023年第12期990-998,共9页

脓毒症是最常见的急危重症之一,其发病率和病死率在全球仍较高,及时的诊断和治疗脓毒症已成为一个亟待解决的问题。内源性竞争RNA(ceRNA)包括长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)和假基因的非编码RNA(ncRNA),它们通过相同的微小RNA... 脓毒症是最常见的急危重症之一,其发病率和病死率在全球仍较高,及时的诊断和治疗脓毒症已成为一个亟待解决的问题。内源性竞争RNA(ceRNA)包括长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)和假基因的非编码RNA(ncRNA),它们通过相同的微小RNA(miRNA)反应元件(MRE)竞争结合miRNA,进而调节下游目标基因的表达。因此,ceRNA也就是内源性RNA的调节机制,当这种机制出现不平衡的情况下,可能参与脓毒症和其他各种疾病的发生。本文重点论述lncRNA、circRNA和假基因的分子特点、重要生物学功能和它们作为ceRNA在脓毒症病理生理中的调控机制,并且讨论了目前ceRNA研究尚未成熟致使其应用到脓毒症临床诊疗中所面临的困难和发展前景,这对于精准定位脓毒症敏感的早期生物标志物以及潜在治疗靶点至关重要,也为脓毒症的及时诊断、治疗和监管提供新线索。 展开更多

关键词 脓毒症 内源性竞争rna(cerna) 长链非编码rna(lncrna) 环状rna(circrna) 假基因 增殖 凋亡 焦亡 炎症反应

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长链非编码RNA SPRY4-IT1对髓母细胞瘤增殖及侵袭转移的影响 被引量：5

10

作者 史鹏飞 吉海龙 +3 位作者 罗永康 毛天明 陈茜 周开宇 《中国应用生理学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期78-82,共5页

目的:探讨长链非编码RNA SPRY4-IT1(Lnc RNA)对髓母细胞瘤增殖及侵袭转移的影响。方法:髓母细胞瘤Daoy细胞分为对照组和si-SPRY4-IT1组,分别利用脂质体Lipofectamine 2000将阴性对照荧光序列和SPRY4-IT1-si RNA转入细胞中,采用Real-time... 目的:探讨长链非编码RNA SPRY4-IT1(Lnc RNA)对髓母细胞瘤增殖及侵袭转移的影响。方法:髓母细胞瘤Daoy细胞分为对照组和si-SPRY4-IT1组,分别利用脂质体Lipofectamine 2000将阴性对照荧光序列和SPRY4-IT1-si RNA转入细胞中,采用Real-time PCR检测转染后各组细胞中SPRY4-IT1的表达情况,CCK-8实验及平板克隆形成实验检测细胞增殖能力的变化,以细胞体外侵袭、迁移实验分别检测细胞侵袭、迁移能力的变化,Western blot检测SPRY4-IT1对基质金属蛋白酶(MMP)-2和MMP-9蛋白的影响。结果:si-SPRY4-IT1组SPRY4-IT1 m RNA表达水平、细胞体外增殖能力、细胞侵袭、迁移能力、细胞MMP-2蛋白表达均较对照组明显降低(P<0.05),而MMP-9蛋白表达未见明显变化。结论:干扰长链非编码RNA SPRY4-IT1在髓母细胞瘤Daoy细胞中的表达能显著抑制细胞的增殖、侵袭和迁移能力。 展开更多

关键词 髓母细胞瘤 长链非编码rna(lncrna) SPRY4-IT1 增殖 侵袭迁移

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TNF-α调控牙周膜干细胞骨向分化中LncRNA的差异表达 被引量：5

11

作者 崔诗曼 张清彬 +2 位作者 左志向 曹威 赖世翔 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期318-322,共5页

目的:探讨肿瘤坏死因子-α(TNF-α)对人牙周膜干细胞(PDLSCs)成骨作用的影响,以及其中长链非编码(LncRNA)的差异表达情况。方法:分离培养PDLSCs,对照组细胞用成骨诱导液培养,实验组细胞用成骨诱导液+10 ng/ml TNF-α培养。通过茜素红染... 目的:探讨肿瘤坏死因子-α(TNF-α)对人牙周膜干细胞(PDLSCs)成骨作用的影响,以及其中长链非编码(LncRNA)的差异表达情况。方法:分离培养PDLSCs,对照组细胞用成骨诱导液培养,实验组细胞用成骨诱导液+10 ng/ml TNF-α培养。通过茜素红染色、RT-PCR和Western bolt检测两组细胞骨向分化,用高通量测序技术探究LncRNA的差异表达情况。结果:在TNF-α作用下,PDLSCs的骨向分化能力减弱;测序结果发现差异表达显著的长链非编码RNA上调的有57条,下调的有26条。结论:LncRNA可能与PDLSCs骨向分化的调控密切相关。 展开更多

关键词 牙周膜干细胞(PDLSCs) 肿瘤坏死因子-α(TNF-α) 长链非编码rna(lncrna) 骨向分化 炎症

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长链非编码RNA COL11A1-208在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义 被引量：5

12

作者 蒋英英 秦星 +1 位作者 张建军 陈万涛 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1334-1339,共6页

目的·研究长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)COL11A1-208在口腔鳞状细胞癌(简称口腔鳞癌)中的表达水平,并评价其在患者预后预测和诊断中的潜在价值。方法·采用lncRNA基因表达谱芯片检测6对口腔鳞癌组织及对应癌旁正... 目的·研究长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)COL11A1-208在口腔鳞状细胞癌(简称口腔鳞癌)中的表达水平,并评价其在患者预后预测和诊断中的潜在价值。方法·采用lncRNA基因表达谱芯片检测6对口腔鳞癌组织及对应癌旁正常组织中差异表达的lncRNA;采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测74对口腔鳞癌组织及癌旁正常组织中COL11A1-208的表达,并比较不同临床特征患者COL11A1-208表达水平的差异。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评价癌组织COL11A1-208水平在口腔鳞癌诊断中的潜能。Kaplan-Meier生存分析评估COL11A1-208表达水平对口腔鳞癌患者3年总体生存率的影响。结果·qPCR检测结果显示,COL11A1-208在74例口腔鳞癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织(P=0.000),与lncRNA基因芯片的结果一致。结合患者临床特征分析发现,TNM分期较晚(Ⅲ~Ⅳ)的口腔鳞癌组织的COL11A1-208表达水平显著高于分期较早(Ⅰ~Ⅱ)的癌组织(P=0.001);组织COL11A1-208水平用于诊断口腔鳞癌的ROC曲线下面积为0.702(95%CI 0.617~0.788,P=0.000),灵敏度和特异度分别为87.8%和54.1%;高表达COL11A1-208患者3年生存率显著低于低表达者(P=0.002)。结论·COL11A1-208在口腔鳞癌组织内高表达,在TNM分期较晚的癌组织表达水平更高;COL11A1-208可能在口腔鳞癌预后预测及诊断中有潜在应用价值。 展开更多

关键词 口腔鳞状细胞癌 长链非编码rna COL11A1-208 预后 诊断

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长链非编码RNA与急性髓系白血病关系的最新研究进展 被引量：4

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作者 方章 杨哲 +1 位作者 朱明明 郁多男 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期1414-1418,共5页

急性髓系白血病(AML)是一种髓系造血干/祖细胞恶性疾病。该病的确切病因目前尚不明确。因此,探究AML的发病机制与发现新的肿瘤标志物和治疗靶点相当重要。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类位于真核细胞中转录本长度超过2... 急性髓系白血病(AML)是一种髓系造血干/祖细胞恶性疾病。该病的确切病因目前尚不明确。因此,探究AML的发病机制与发现新的肿瘤标志物和治疗靶点相当重要。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类位于真核细胞中转录本长度超过200 nt的RNA分子,几乎不具有编码蛋白质的能力,但可在转录及转录后水平对其它基因的表达进行调控,从而参与多种肿瘤的发生发展。近年来,随着对lncRNA研究的不断深入,其在急性髓系白血病中承担的角色不断被报道和证实。本文就lncRNA UCA1、ANRIL、H19、HOTAIR、CCAT1、ZFAS1、LINC00152、LINC00265、HOXA-AS2、NEAT1、TUG1、IRAIN、PANDAR、LINC00899、SNHG5和KCNQ1OT1等长链非编码RNA与急性髓系白血病之间的关系作一综述,为AML的临床诊断及治疗提供潜在依据。 展开更多

关键词 长链非编码rna 急性髓细胞性白血病 生物标记物 靶向治疗

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缺氧诱导的lncRNA与肿瘤免疫逃逸 被引量：3

14

作者 程先硕 杨之斌 董坚 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期871-878,共8页

缺氧和免疫逃逸是肿瘤的两大特征,缺氧是促进肿瘤发生免疫逃逸的重要因素。近年来的研究结果表明,缺氧诱导的长链非编码RNA(HIL)是介导缺氧促进免疫逃逸的关键因子,是肿瘤诊断、治疗和预后评估的潜在标志物,具有较好的研究和临床转化价... 缺氧和免疫逃逸是肿瘤的两大特征,缺氧是促进肿瘤发生免疫逃逸的重要因素。近年来的研究结果表明,缺氧诱导的长链非编码RNA(HIL)是介导缺氧促进免疫逃逸的关键因子,是肿瘤诊断、治疗和预后评估的潜在标志物,具有较好的研究和临床转化价值,有望成为肿瘤免疫治疗的潜在靶点。本文综述了HIL在肿瘤发生发展及预后中最新的研究进展,讨论了HIL通过诱导上皮间质转化发生、血管生成、肿瘤干细胞形成、糖酵解、免疫细胞浸润、免疫因子释放、干扰抗原提呈机制和免疫检查点表达上调等多种机制诱导肿瘤发生免疫逃逸,探讨双靶向HIL与免疫检查点的联合肿瘤治疗新策略的可能性及临床意义,分析了HIL领域中关于普适性和组织特异性关键HIL及其调控肿瘤免疫机制的鉴定、HIL与肿瘤免疫治疗及疗效之间关系的明确,以及肿瘤联合治疗新策略临床转化的实现等关键问题及可能的解决办法,为实现靶向HIL与免疫检查点的肿瘤免疫治疗策略提供了理论基础。 展开更多

关键词 肿瘤 缺氧 缺氧诱导因子 长链非编码rna 免疫逃逸 免疫治疗

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长链非编码RNA LINC00152对人脑胶质瘤裸鼠移植瘤生长的影响及机制探讨 被引量：3

15

作者 金亮 金爱 赵立智 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第11期28-33,49,共7页

目的 观察长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA) LINC00152过表达对人脑胶质瘤U251荷瘤鼠肿瘤生长的影响并对其机制进行探讨。方法 慢病毒转染法上调U251细胞LINC00152表达水平,设立LINC00152过表达组(LV-LINC00152组)和空载对照组... 目的 观察长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA) LINC00152过表达对人脑胶质瘤U251荷瘤鼠肿瘤生长的影响并对其机制进行探讨。方法 慢病毒转染法上调U251细胞LINC00152表达水平,设立LINC00152过表达组(LV-LINC00152组)和空载对照组(LV组)细胞,以正常U251细胞作为空白对照组(control组);qRT-PCR检测LINC00152表达水平;构建U251荷瘤鼠模型,p-YAP抑制剂XMU-MP-1进行处理,测量肿瘤体积,实验终点称量瘤重;免疫组织化学染色观察肿瘤组织Ki67表达;蛋白印记实验检测YAP、p-YAP、LATS1、pLATS1蛋白表达。结果 与LV组相比,LV-LINC00152组LINC00152表达明显上调(P<0. 01)。实验终点时,与LV组荷瘤鼠肿瘤相比,LV-LINC00152组肿瘤体积显著增大,瘤重明显增加(P<0. 01);XMU-MP-1(1 mg/kg和3 mg/kg)处理明显降低LV-LINC00152组荷瘤鼠肿瘤体积和瘤重(P<0. 01),并呈剂量依赖性。LV组肿瘤组织Ki67呈弱阳性表达,而LV-LINC00152组呈强阳性表达;XMU-MP-1(1 mg/kg和3 mg/kg)处理后二者肿瘤组织Ki67呈弱阳性和阳性。与LV组相比,LV-LINC00152组肿瘤组织p-YAP和p-LATS1蛋白表达明显上调(P<0. 01);XMU-MP-1(1 mg/kg和3 mg/kg)处理可逆转p-YAP和p-LATS1蛋白表达(P<0. 01),并存在剂量依赖性。结论 长链非编码RNA LINC00152可诱导YAP磷酸化,促进脑胶质瘤生长,而p-YAP抑制剂XMU-MP-1能抑制长链非编码RNA LINC00152的上述生物学效应。 展开更多

关键词 长链非编码rna(lncrna) LINC00152 脑胶质瘤 生长 YAP蛋白 裸鼠

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子宫内膜癌中长链非编码RNA表达谱的生物信息学分析 被引量：3

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作者 建方方 车晓霞 冯炜炜 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期768-775,共8页

目的·分析子宫内膜癌组织和正常内膜组织中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达谱。方法·分别抽提21例子宫内膜癌组织和5例正常内膜组织的RNA,利用转录组测序技术分析并筛选2组差异表达lncRNAs。对获得的差... 目的·分析子宫内膜癌组织和正常内膜组织中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的差异表达谱。方法·分别抽提21例子宫内膜癌组织和5例正常内膜组织的RNA,利用转录组测序技术分析并筛选2组差异表达lncRNAs。对获得的差异表达lncRNAs进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析,并结合TCGA数据库对差异表达lncRNAs进行交集分析。结果·共筛选获得3060个差异表达lncRNAs,其中上调表达的有2046个,下调的有1014个。GO功能分析和KEGG通路分析结果显示,这些lncRNAs与细胞黏附、免疫反应、炎症反应、细胞增殖相关,并且主要富集在PI3KAkt信号通路、细胞黏附、细胞因子受体等通路上。交集分析显示,57个lncRNAs在测序结果和TCGA数据库中同时上调或下调。结论·lncRNAs在子宫内膜癌和正常内膜组织中的表达有显著差异,提示其可能在子宫内膜癌的发生及发展中起到了重要作用。 展开更多

关键词 子宫内膜癌 长链非编码rna 基因表达谱

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长链非编码RNA-HULC对结直肠癌细胞生长和转移的影响 被引量：3

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作者 徐飞 刘九洋 +3 位作者 黄超群 彭春伟 熊斌 杨肖军 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2018年第6期895-898,共4页

目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)HULC对结直肠癌(CRC)细胞增殖、侵袭、转移、凋亡以及体内成瘤等功能的影响。方法:通过si-RNA干扰技术构建肝癌高表达基因(HULC)低表达CRC细胞系,下调HULC表达水平后,用细胞克隆形成实验、Transwell侵袭... 目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)HULC对结直肠癌(CRC)细胞增殖、侵袭、转移、凋亡以及体内成瘤等功能的影响。方法:通过si-RNA干扰技术构建肝癌高表达基因(HULC)低表达CRC细胞系,下调HULC表达水平后,用细胞克隆形成实验、Transwell侵袭/转移实验以及流式细胞技术检测HULC对CRC细胞生物学行为的影响。进一步通过小鼠体内成瘤验证HULC的作用。结果:细胞克隆形成实验提示HULC可促进CRC细胞增殖,流式实验发现HULC可显著抑制CRC细胞的凋亡能力,Transwell侵袭和转移实验均发现HULC能显著促进CRC细胞的迁移及侵袭能力。动物实验发现稳定转染sh-HULC组的肿瘤大小和重量,以及肿瘤组织内Ki-67的染色阳性率明显小于对照组。结论:LncRNA-HULC表达可以促进结直肠癌细胞的生长、迁移和侵袭,并抑制凋亡。 展开更多

关键词 长链非编码rna HULC 结直肠癌 增殖 转移

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VTCN1调控结肠癌细胞长链非编码RNA和mRNA的全基因表达谱分析 被引量：2

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作者 褚以忞 周锋利 +5 位作者 徐莹 蒯榕 李吉 侯照远 杨大明 彭海霞 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期270-277,共8页

目的·探讨含V-set域T细胞激活抑制因子(V-set domain containing T cell activation inhibitor 1,VTCN1)在结肠癌中对下游长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA的调控作用。方法·利用慢病毒质粒在结肠癌细胞株SW1... 目的·探讨含V-set域T细胞激活抑制因子(V-set domain containing T cell activation inhibitor 1,VTCN1)在结肠癌中对下游长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA的调控作用。方法·利用慢病毒质粒在结肠癌细胞株SW1116中过表达VTCN1,抽提RNA并测序,与阴性对照组比较分析差异表达的lncRNA和m RNA,并任意选取差异表达的lncRNA(3条)和mRNA(2条)进行实时定量PCR(qRT-PCR)验证RNA测序结果的准确性。通过BLAST2GO和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析预测这些差异表达lncRNA和m RNA的相关功能。利用线上平台GEPIA18(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)分析差异表达lncRNA与结直肠癌患者生存期的相关性。结果·通过RNA测序在过表达VTCN1的SW1116细胞中发现了167条差异基因,包括39条lncRNA和128条m RNA。qRT-PCR检验结果与RNA测序结果变化趋势一致。生物信息学分析结果显示这些受VTCN1调控的差异基因可能参与了内质网中的蛋白处理、mRNA监控信号通路。另外,在过表达VTCN1的结肠癌细胞中明显上调的3条lncRNA(DNAJC9-AS1、HCG27和RP11-339B21.13),同时也是预测结直肠癌患者总生存期的独立因子。结论·在结肠癌细胞中VTCN1对下游多条lncRNA和mRNA具有调控作用,这些lncRNA和mRNA可能参与了内质网中的蛋白处理和mRNA监控信号通路。 展开更多

关键词 含V-set域T细胞激活抑制因子 结肠癌 长链非编码rna rna测序 生物信息学分析

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LncRNA XLOC015132对山羊黑色素沉积的影响及其lncRNA-miRNA-mRNA轴的预测

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作者 付琳 刘丽 +5 位作者 杨恒 王高富 任航行 周鹏 董贤文 张丽 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1329-1338,共10页

LncRNA在哺乳动物的基因组中被广泛转录,能够通过相应的miRNA和靶基因促进黑色素瘤的侵袭和转移。为探究LncRNA XLOC_015132的组织表达谱及其与黑色素沉积之间的关系,以酉州乌羊和酉州本地白山羊为试验对象,检测LncRNA XLOC_015132在各... LncRNA在哺乳动物的基因组中被广泛转录,能够通过相应的miRNA和靶基因促进黑色素瘤的侵袭和转移。为探究LncRNA XLOC_015132的组织表达谱及其与黑色素沉积之间的关系,以酉州乌羊和酉州本地白山羊为试验对象,检测LncRNA XLOC_015132在各组织中以及黑色素瘤细胞中的表达情况;同时,通过靶miRNA和靶基因预测,构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。qRT-PCR结果显示,LncRNA XLOC_015132在酉州乌羊脾脏、肺、肾脏、大脑、皮肤等组织中的表达量显著高于本地白山羊(P<0.05);LncRNA XLOC_015132在B16-F10黑色素瘤细胞中的定量分析结果显示,随着B16-F10细胞的增殖,LncRNA XLOC_015132表达量呈递增趋势;LncRNA XLOC_015132与互作分子的生物信息学分析结果显示,LncRNA XLOC_015132/miR-150-5p/CCND2轴可能通过激活PI3K-AKT、Wnt等信号通路,在黑色素沉积中发挥重要作用。综合上述结果,LncRNA XLOC_015132的表达与黑色素沉积可能存在正相关关系。本研究结果为深入探究山羊皮肤黑色素沉积的lncRNA调控理论研究提供了基础。 展开更多

关键词 长链非编码rna(lncrna) 黑色素沉积 组织表达 lncrna-mirna-mrna轴

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长链非编码RNA HULC在结直肠癌中的表达及预后价值 被引量：2

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作者 徐飞 刘九洋 +3 位作者 黄超群 彭春伟 熊斌 杨肖军 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2018年第2期244-247,278,共5页

目的：探讨长链非编码RNA（LncRNA）HULC在结直肠癌（CRC）中的表达及其预后价值。方法：利用实时定量PCR方法检测HULC在结直肠正常黏膜上皮细胞NCM460和CRC细胞,以及在35例CRC组织和配对癌旁组织中的表达情况,并分析其与CRC患者预后的... 目的：探讨长链非编码RNA（LncRNA）HULC在结直肠癌（CRC）中的表达及其预后价值。方法：利用实时定量PCR方法检测HULC在结直肠正常黏膜上皮细胞NCM460和CRC细胞,以及在35例CRC组织和配对癌旁组织中的表达情况,并分析其与CRC患者预后的关系。结果：HULC在CRC细胞内的表达水平显著高于NCM460,在CRC组织中的相对表达量为6.801±0.294（n=35）,癌旁组织中为3.883±0.309（n=35）,差异有统计学意义（P〈0.05）。Kaplan-Meier生存分析显示HULC低表达组CRC患者术后的生存时间明显高于高表达组,差异有统计学意义（P〈0.05）。结论：HULC在CRC细胞和组织内过表达,可作为CRC预后判断的一个潜在靶点。 展开更多

关键词 长链非编码rna 结直肠癌 诊断 预后

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