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基于线性混合模型的红松人工林一级枝条大小预测模拟
被引量：
22
1
作者
董灵波
刘兆刚
+1 位作者
李凤日
姜立春
《应用生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期2447-2456,共10页
基于黑龙江省孟家岗林场60株人工红松955个标准枝数据,采用线性混合效应模型理论和方法,考虑树木效应,利用SAS软件中的MIXED模块拟合红松人工林一级枝条各因子(基径、枝长、着枝角度)的预测模型.结果表明:通过选择合适的随机参数和方差...
基于黑龙江省孟家岗林场60株人工红松955个标准枝数据,采用线性混合效应模型理论和方法,考虑树木效应,利用SAS软件中的MIXED模块拟合红松人工林一级枝条各因子(基径、枝长、着枝角度)的预测模型.结果表明:通过选择合适的随机参数和方差协方差结构能够提高模型的拟合精度;把相关性结构包括复合对称结构CS、一阶自回归结构AR(1)及一阶自回归与滑动平均结构ARMA(1,1)加入到一级枝条大小最优混合模型中,AR(1)可显著提高枝条基径和角度混合模型的拟合精度,但3种结构均不能提高枝条角度混合模型的精度.为了描述混合模型构建过程中产生的异方差现象,把CF1和CF2函数加入到枝条混合模型中,CF1函数显著提高了枝条角度混合模型的拟合效果,CF2函数显著提高了枝条基径和长度混合模型拟合效果.模型检验结果表明:对于红松人工林一级枝条大小预测模型,混合效应模型的估计精度比传统回归模型估计精度明显提高.
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关键词
红松人工林
枝条基径
枝条长度
枝条角度
线性混合模型
原文传递
吸烟和性别对身体质量指数遗传结构的影响(英文)
被引量：
2
2
作者
张斌
朱军
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期421-430,共10页
采用基于混合线性模型的关联分析方法,检测了身体质量指数(BMI)的相关基因及其相互作用,分析了吸烟和性别对身体质量指数的影响.研究的基因型和表型数据取自慢性阻塞性肺病研究数据库.结果检测到与身体质量指数有关的20个基因以及2对上...
采用基于混合线性模型的关联分析方法,检测了身体质量指数(BMI)的相关基因及其相互作用,分析了吸烟和性别对身体质量指数的影响.研究的基因型和表型数据取自慢性阻塞性肺病研究数据库.结果检测到与身体质量指数有关的20个基因以及2对上位性基因,并发现了受吸烟影响及与性别有关的特定基因及其作用方式.检测到与吸烟无关的9个基因,对BMI有较大影响(遗传率为31.23%),并且影响肥胖、糖尿病等7种疾病.吸烟导致的5个基因都能增加BMI,但并不导致肥胖、糖尿病等疾病.生物信息学分析揭示了与身体质量指数相关的基因存在复杂的遗传网络.研究结果表明,吸烟等生活行为的个性化检测对肥胖等复杂疾病的预防及治疗至关重要.
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关键词
慢性阻塞性肺病
全基因组关联分析
混合线性模型
条件分析
数量性状单岳苷酸多态性
身体质量指教
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职称材料
全基因组关联分析SGRQ遗传变异与吸烟的关系(英文)
被引量：
1
3
作者
郝心颖
朱军
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期431-439,共9页
慢性阻塞性肺病作为人类第四大疾病,它的遗传倾向和性别影响一直是热门话题,而吸烟被认为是肺疾病的主要危险因素.本文基于从dbGaP下载的数据,运用我们提出的混合线性模型方法和关联分析软件QTLNetwork,分析了慢性阻塞性肺病复杂性状的...
慢性阻塞性肺病作为人类第四大疾病,它的遗传倾向和性别影响一直是热门话题,而吸烟被认为是肺疾病的主要危险因素.本文基于从dbGaP下载的数据,运用我们提出的混合线性模型方法和关联分析软件QTLNetwork,分析了慢性阻塞性肺病复杂性状的遗传变异.运用全基因组关联条件定位的方法,检测到与吸烟无关的8个基因(CSMD1,CAPN8,TNS1,LOC643037,LRFN2,DGKH,FOXL1,DNAH11)、被吸烟诱导的6个基因(CSMD1,CNTNAP5,DGKH,MACROD2,CNIH3,DNAH11)和被吸烟抑制的5个基因(GSDMC,DGKH,LINC00426,METTL4,BMP2)及1对上位基因(CSMD1,LOC643037).其中,具有显著的高遗传性的基因有TNS1,DGKH,MACROD2,CNIH3,LINC00426,METTL4和GSDMC.讨论了吸烟及性别对SGRQ疾病基因表达的影响.
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关键词
慢性阻塞性肺病
全基因组关联分析
混合线性模型
条件基因定位
数量性状单核苷酸多态性
下载PDF
职称材料
题名
基于线性混合模型的红松人工林一级枝条大小预测模拟
被引量：
22
1
作者
董灵波
刘兆刚
李凤日
姜立春
机构
东北林业大学林学院
出处
《应用生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第9期2447-2456,共10页
基金
林业公益性行业科研专项(201004002007)
"十二五"国家科技计划项目(2012BAD22B0202)
长江学者和创新团队发展计划项目(IRT1054)资助
文摘
基于黑龙江省孟家岗林场60株人工红松955个标准枝数据,采用线性混合效应模型理论和方法,考虑树木效应,利用SAS软件中的MIXED模块拟合红松人工林一级枝条各因子(基径、枝长、着枝角度)的预测模型.结果表明:通过选择合适的随机参数和方差协方差结构能够提高模型的拟合精度;把相关性结构包括复合对称结构CS、一阶自回归结构AR(1)及一阶自回归与滑动平均结构ARMA(1,1)加入到一级枝条大小最优混合模型中,AR(1)可显著提高枝条基径和角度混合模型的拟合精度,但3种结构均不能提高枝条角度混合模型的精度.为了描述混合模型构建过程中产生的异方差现象,把CF1和CF2函数加入到枝条混合模型中,CF1函数显著提高了枝条角度混合模型的拟合效果,CF2函数显著提高了枝条基径和长度混合模型拟合效果.模型检验结果表明:对于红松人工林一级枝条大小预测模型,混合效应模型的估计精度比传统回归模型估计精度明显提高.
关键词
红松人工林
枝条基径
枝条长度
枝条角度
线性混合模型
Keywords
Pinus
koraiensis
plantation
branch
diameter
branch
length
branch
angle
linearmixed
model
.
分类号
S791.247 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
吸烟和性别对身体质量指数遗传结构的影响(英文)
被引量：
2
2
作者
张斌
朱军
机构
浙江大学空气污染与健康研究中心
浙江大学农业与生物技术学院农学系
浙江大学数学系
出处
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期421-430,共10页
基金
Project supported by the National Science Foundation of China(No.31371250)
文摘
采用基于混合线性模型的关联分析方法,检测了身体质量指数(BMI)的相关基因及其相互作用,分析了吸烟和性别对身体质量指数的影响.研究的基因型和表型数据取自慢性阻塞性肺病研究数据库.结果检测到与身体质量指数有关的20个基因以及2对上位性基因,并发现了受吸烟影响及与性别有关的特定基因及其作用方式.检测到与吸烟无关的9个基因,对BMI有较大影响(遗传率为31.23%),并且影响肥胖、糖尿病等7种疾病.吸烟导致的5个基因都能增加BMI,但并不导致肥胖、糖尿病等疾病.生物信息学分析揭示了与身体质量指数相关的基因存在复杂的遗传网络.研究结果表明,吸烟等生活行为的个性化检测对肥胖等复杂疾病的预防及治疗至关重要.
关键词
慢性阻塞性肺病
全基因组关联分析
混合线性模型
条件分析
数量性状单岳苷酸多态性
身体质量指教
Keywords
chronic
obstructive
pulmonary
disease
（COPD）
genome-wide
association
study
（GWAS）
linearmixed
model
conditional
analysis
quantitative
trait
single
nucleotide
polymorphism
（QTS）
bodymass
index
（BMI）
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
R394.1 [医药卫生—医学遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
全基因组关联分析SGRQ遗传变异与吸烟的关系(英文)
被引量：
1
3
作者
郝心颖
朱军
机构
浙江大学数学系
浙江大学农业与生物技术学院农学系
浙江大学空气污染与健康研究中心
出处
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期431-439,共9页
基金
Project supported by the National Science Foundation of China(No.31371250)
文摘
慢性阻塞性肺病作为人类第四大疾病,它的遗传倾向和性别影响一直是热门话题,而吸烟被认为是肺疾病的主要危险因素.本文基于从dbGaP下载的数据,运用我们提出的混合线性模型方法和关联分析软件QTLNetwork,分析了慢性阻塞性肺病复杂性状的遗传变异.运用全基因组关联条件定位的方法,检测到与吸烟无关的8个基因(CSMD1,CAPN8,TNS1,LOC643037,LRFN2,DGKH,FOXL1,DNAH11)、被吸烟诱导的6个基因(CSMD1,CNTNAP5,DGKH,MACROD2,CNIH3,DNAH11)和被吸烟抑制的5个基因(GSDMC,DGKH,LINC00426,METTL4,BMP2)及1对上位基因(CSMD1,LOC643037).其中,具有显著的高遗传性的基因有TNS1,DGKH,MACROD2,CNIH3,LINC00426,METTL4和GSDMC.讨论了吸烟及性别对SGRQ疾病基因表达的影响.
关键词
慢性阻塞性肺病
全基因组关联分析
混合线性模型
条件基因定位
数量性状单核苷酸多态性
Keywords
chronic
obstructive
pulmonary
disease
（COPD）
genome-wide
association
study
（GWAS）
linearmixed
model
conditional
gene
mapping
quantitative
trait
single
nucleotide
polymorphism
（QTS）
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线性混合模型的红松人工林一级枝条大小预测模拟
董灵波
刘兆刚
李凤日
姜立春
《应用生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
22
原文传递
2
吸烟和性别对身体质量指数遗传结构的影响(英文)
张斌
朱军
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
下载PDF
职称材料
3
全基因组关联分析SGRQ遗传变异与吸烟的关系(英文)
郝心颖
朱军
《浙江大学学报（农业与生命科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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