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福建东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻的分子系统分类和遗传多样性研究
被引量:
9
1
作者
董志军
黄晖
+2 位作者
黄良民
李元超
周国伟
《台湾海峡》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期135-140,共6页
本研究利用核糖体大亚基5′端序列PCR-RFLP以及转录单元内间隔区(Internal TranscribedSpacer,ITS)序列分析相结合的方法,首次对福建东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻进行了分子系统分类和遗传多样性研究.PCR-RFLP分析发现东...
本研究利用核糖体大亚基5′端序列PCR-RFLP以及转录单元内间隔区(Internal TranscribedSpacer,ITS)序列分析相结合的方法,首次对福建东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻进行了分子系统分类和遗传多样性研究.PCR-RFLP分析发现东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻都属于C系群共生藻,而ITS序列的序列分析结果表明东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻都属于C1亚系群.研究结果表明ITS序列进化速度快,适合于造礁石珊瑚共生藻属亚系群水平的鉴定.而东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻的多样性低,暗示东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻共生系统面对外界环境压力的适应能力较低.
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关键词
造礁石珊瑚
共生藻
虫黄藻
东山岛
核糖体大亚基
转录单元内间隔区
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职称材料
福建古田红曲生产用红曲霉菌主要种类的鉴别
被引量:
10
2
作者
李志强
刘颖
+1 位作者
林风
吴丽云
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期64-69,共6页
以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascus sp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取物琼脂(C...
以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascus sp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取物琼脂(CYA)和甘油硝酸盐琼脂(G25N)培养基上的菌落形态特征进行初步分类,进而基于核糖体DNA内转录间隔区(rDNA internal transcribed spacer,rDNA ITS)、核糖体大亚基(28S nuclear ribosomal large subunit rRNA gene,LSU)和核糖体小亚基(18S nuclear ribosomal small subunit r RNA gene,SSU)的基因片段的测序结果,在Gen Bank中通过BLAST进行分子生物学方面的鉴定研究,并用ITS序列构建系统发育树。通过形态特征及3个基因序列的比对,认为所选取的60株古田红曲霉菌分别归属红色红曲霉菌(M.ruber)、丛毛红曲霉菌(M.pilosus)或紫色红曲霉菌(M.purpureus)3个种。
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关键词
红曲霉菌
ITS
LSU
SSU
鉴定
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职称材料
高产紫杉醇内生真菌J11的鉴定
被引量:
7
3
作者
刘明志
段中岗
+1 位作者
吕镇城
刘春霞
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1031-1038,共8页
从南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)的幼茎中分离出一株产紫杉醇内生真菌J11.菌株J11的发酵提取物经高分辨质谱分析,证实J11菌株可产紫杉醇.提取该菌株的基因组DNA,扩增核糖体internal transcribed spacer(ITS)和28S核糖体large ...
从南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)的幼茎中分离出一株产紫杉醇内生真菌J11.菌株J11的发酵提取物经高分辨质谱分析,证实J11菌株可产紫杉醇.提取该菌株的基因组DNA,扩增核糖体internal transcribed spacer(ITS)和28S核糖体large subunit rRNA gene(LSU)序列,经测序获得该菌的ITS序列和LSU序列.序列比对和检索结果表明,J11菌株为葡萄座腔菌(Botryosphaeria ssp.)属中的一个新菌株.形态学鉴定符合葡萄座腔菌属特征,高效液相色谱分析表明,J11菌株的紫杉醇含量约为615.1μg/L.本研究首次证实葡萄座腔菌J11是一株高产紫杉醇野生型菌株,具有潜在的应用前景.
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关键词
内生真菌
紫杉醇
葡萄座腔菌
核糖体内部转录间隔序列
28S核糖体大亚基基因
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职称材料
厌氧真菌系统发育分类及多样性研究进展
被引量:
1
4
作者
张亚伟
王月红
+1 位作者
张元庆
刘强
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期700-709,共10页
厌氧真菌[新毛孢菌门(Neocallimastigomycota)]是哺乳草食动物消化道内常见的微生物之一,在木质纤维性饲料原料的降解过程中起着至关重要的作用。了解厌氧真菌个体间的系统发育关系对于进一步了解它们的进化史,以及驱动它们在不同类型...
厌氧真菌[新毛孢菌门(Neocallimastigomycota)]是哺乳草食动物消化道内常见的微生物之一,在木质纤维性饲料原料的降解过程中起着至关重要的作用。了解厌氧真菌个体间的系统发育关系对于进一步了解它们的进化史,以及驱动它们在不同类型宿主内部及之间的生态位专门化的因素等方面至关重要。本文从系统发育分类学发展史、低等级的分类学多样性及相关分子层面的研究方法对近年来有关厌氧真菌系统发育分类及多样性的研究进行了概述,以期对相关的研究工作提供一定的参考和帮助。
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关键词
草食动物
厌氧真菌
系统发育
内部转录间隔区(ITS)
大亚基
rrna
基因(LSU)
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职称材料
我国代表地区须癣毛癣菌复合体的分子鉴定与分型研究
被引量:
12
5
作者
胡小平
万喆
+1 位作者
王晓红
李若瑜
《中国真菌学杂志》
2011年第2期70-76,共7页
目的对我国代表地区的须癣毛癣菌菌株进行分子再鉴定和分型研究。方法选取我国南北方8个省市地区经表型鉴定的须癣毛癣菌菌株47株,通过再培养形态观察、生理试验;PCR扩增核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和核糖体大亚基(LSU)D1-D2区...
目的对我国代表地区的须癣毛癣菌菌株进行分子再鉴定和分型研究。方法选取我国南北方8个省市地区经表型鉴定的须癣毛癣菌菌株47株,通过再培养形态观察、生理试验;PCR扩增核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和核糖体大亚基(LSU)D1-D2区,测序后利用数据库进行序列比对,对须癣毛癣菌复合体进行再鉴定;PCR扩增rDNA非转录间隔区(NTS)的三个串联重复亚单位S0、S1和S2区,进行种内分型,并比较不同部位来源菌株型别的差异性。结果我国南北方8个省市地区47株须癣毛癣菌中3株鉴定为断发毛癣菌,6株鉴定为无性型苯海姆节皮菌,其余均鉴定为万博节皮菌中的亲人型趾间毛癣菌;三对不同引物扩增38株趾间型毛癣菌和2株苯海姆节皮菌NTS区,共产生28种特征性带型。带型和菌株来源及发生部位无相关性。结论我国分离自人类须癣毛癣菌复合体的主要组成菌种为趾间毛癣菌;ITS区结合LSU D1-D2区测序有助于鉴定须癣毛癣菌复合体至种水平;NTS区的三个串联重复亚单位所产生的特征性指纹图提供了一种快速、稳定的分子生物学种内分型方法,可应用于趾间毛癣菌感染的流行病学研究。
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关键词
须癣毛癣菌复合体
rDNA内转录间隔区
核糖体大亚基D1-D2区
rDNA非转录间隔区
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职称材料
题名
福建东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻的分子系统分类和遗传多样性研究
被引量:
9
1
作者
董志军
黄晖
黄良民
李元超
周国伟
机构
中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室
出处
《台湾海峡》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期135-140,共6页
基金
中国科学院台站基金支持项目(YTZJJ0502)
国家海洋局908专项资金资助项目(908-ST-01-08-珊瑚礁调查)
国家自然科学基金资助项目(30200039、90211015)
文摘
本研究利用核糖体大亚基5′端序列PCR-RFLP以及转录单元内间隔区(Internal TranscribedSpacer,ITS)序列分析相结合的方法,首次对福建东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻进行了分子系统分类和遗传多样性研究.PCR-RFLP分析发现东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻都属于C系群共生藻,而ITS序列的序列分析结果表明东山岛附近海域3种优势种类造礁石珊瑚共生藻都属于C1亚系群.研究结果表明ITS序列进化速度快,适合于造礁石珊瑚共生藻属亚系群水平的鉴定.而东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻的多样性低,暗示东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻共生系统面对外界环境压力的适应能力较低.
关键词
造礁石珊瑚
共生藻
虫黄藻
东山岛
核糖体大亚基
转录单元内间隔区
Keywords
scleractinian
corals
symbiotic
dinoflagellate
zooxanthellae
Symbiodinium
Dongshan
Island
large
subunit
rrna
ITS
rrna
gene
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
福建古田红曲生产用红曲霉菌主要种类的鉴别
被引量:
10
2
作者
李志强
刘颖
林风
吴丽云
机构
福建省微生物研究所福建省新药(微生物)筛选重点实验室
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期64-69,共6页
基金
福建省公益类科研院所专项(2015R1009-4)
福建省公益类科研院所专项(2014R1009-6)
+2 种基金
福建省财政厅省直教育科研专项(闽财指[2015]1297号)
福州市仓山区科技创新公共服务平台项目(2015K03)
福州市仓山区科技计划项目(2015S05)
文摘
以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascus sp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取物琼脂(CYA)和甘油硝酸盐琼脂(G25N)培养基上的菌落形态特征进行初步分类,进而基于核糖体DNA内转录间隔区(rDNA internal transcribed spacer,rDNA ITS)、核糖体大亚基(28S nuclear ribosomal large subunit rRNA gene,LSU)和核糖体小亚基(18S nuclear ribosomal small subunit r RNA gene,SSU)的基因片段的测序结果,在Gen Bank中通过BLAST进行分子生物学方面的鉴定研究,并用ITS序列构建系统发育树。通过形态特征及3个基因序列的比对,认为所选取的60株古田红曲霉菌分别归属红色红曲霉菌(M.ruber)、丛毛红曲霉菌(M.pilosus)或紫色红曲霉菌(M.purpureus)3个种。
关键词
红曲霉菌
ITS
LSU
SSU
鉴定
Keywords
Monascus
rDNA
internal
transcribed
spacer
(ITS)
28S
nuclear
ribosomal
large
subunit
rrna
gene(LSU)
18S
nuclear
ribosomal
small
subunit
rrna
gene
(SSU)
identification
分类号
TQ925.7 [轻工技术与工程—发酵工程]
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职称材料
题名
高产紫杉醇内生真菌J11的鉴定
被引量:
7
3
作者
刘明志
段中岗
吕镇城
刘春霞
机构
惠州学院生命科学系
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第10期1031-1038,共8页
基金
惠州市科技计划项目(No.2011B020006012)~~
文摘
从南方红豆杉(Taxus chinensis var.mairei)的幼茎中分离出一株产紫杉醇内生真菌J11.菌株J11的发酵提取物经高分辨质谱分析,证实J11菌株可产紫杉醇.提取该菌株的基因组DNA,扩增核糖体internal transcribed spacer(ITS)和28S核糖体large subunit rRNA gene(LSU)序列,经测序获得该菌的ITS序列和LSU序列.序列比对和检索结果表明,J11菌株为葡萄座腔菌(Botryosphaeria ssp.)属中的一个新菌株.形态学鉴定符合葡萄座腔菌属特征,高效液相色谱分析表明,J11菌株的紫杉醇含量约为615.1μg/L.本研究首次证实葡萄座腔菌J11是一株高产紫杉醇野生型菌株,具有潜在的应用前景.
关键词
内生真菌
紫杉醇
葡萄座腔菌
核糖体内部转录间隔序列
28S核糖体大亚基基因
Keywords
endophytic
fungus
paclitaxel
Botryosphaeria
dothidea
nuclear
ribosomal
internaltranscribed
spacer
(ITS)
28S
nuclear
ribosomal
large
subunit
rrna
gene
(LSU)
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
厌氧真菌系统发育分类及多样性研究进展
被引量:
1
4
作者
张亚伟
王月红
张元庆
刘强
机构
山西农业大学动物科学学院
出处
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期700-709,共10页
基金
科技创新基金项目(2020BQ68)
优秀博士来晋奖励项目(SXBYKY2021014)
谷子高粱产业技术体系(CARS-06)。
文摘
厌氧真菌[新毛孢菌门(Neocallimastigomycota)]是哺乳草食动物消化道内常见的微生物之一,在木质纤维性饲料原料的降解过程中起着至关重要的作用。了解厌氧真菌个体间的系统发育关系对于进一步了解它们的进化史,以及驱动它们在不同类型宿主内部及之间的生态位专门化的因素等方面至关重要。本文从系统发育分类学发展史、低等级的分类学多样性及相关分子层面的研究方法对近年来有关厌氧真菌系统发育分类及多样性的研究进行了概述,以期对相关的研究工作提供一定的参考和帮助。
关键词
草食动物
厌氧真菌
系统发育
内部转录间隔区(ITS)
大亚基
rrna
基因(LSU)
Keywords
herbivores
anaerobic
fungi
phylogeny
internal
transcribed
spacer(ITS)
large
subunit
rrna
gene(LSU)
分类号
S811.6 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
我国代表地区须癣毛癣菌复合体的分子鉴定与分型研究
被引量:
12
5
作者
胡小平
万喆
王晓红
李若瑜
机构
北京大学第一医院皮肤性病科真菌室
北京大学真菌和真菌病研究中心
出处
《中国真菌学杂志》
2011年第2期70-76,共7页
基金
卫生部公益项目重点基金(200802026)
科技部十一五传染病重大专项课题(20082x10004-002)
文摘
目的对我国代表地区的须癣毛癣菌菌株进行分子再鉴定和分型研究。方法选取我国南北方8个省市地区经表型鉴定的须癣毛癣菌菌株47株,通过再培养形态观察、生理试验;PCR扩增核糖体DNA(rDNA)的内转录间隔区(ITS)和核糖体大亚基(LSU)D1-D2区,测序后利用数据库进行序列比对,对须癣毛癣菌复合体进行再鉴定;PCR扩增rDNA非转录间隔区(NTS)的三个串联重复亚单位S0、S1和S2区,进行种内分型,并比较不同部位来源菌株型别的差异性。结果我国南北方8个省市地区47株须癣毛癣菌中3株鉴定为断发毛癣菌,6株鉴定为无性型苯海姆节皮菌,其余均鉴定为万博节皮菌中的亲人型趾间毛癣菌;三对不同引物扩增38株趾间型毛癣菌和2株苯海姆节皮菌NTS区,共产生28种特征性带型。带型和菌株来源及发生部位无相关性。结论我国分离自人类须癣毛癣菌复合体的主要组成菌种为趾间毛癣菌;ITS区结合LSU D1-D2区测序有助于鉴定须癣毛癣菌复合体至种水平;NTS区的三个串联重复亚单位所产生的特征性指纹图提供了一种快速、稳定的分子生物学种内分型方法,可应用于趾间毛癣菌感染的流行病学研究。
关键词
须癣毛癣菌复合体
rDNA内转录间隔区
核糖体大亚基D1-D2区
rDNA非转录间隔区
Keywords
Trichophyton
mentagrophytes
complex
internal
transcribed
spacer
D1-D2
domain
of
the
large
-
subunit
rrna
gene
nontranscribed
spacer
分类号
R379.2 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
福建东山岛附近海域造礁石珊瑚共生藻的分子系统分类和遗传多样性研究
董志军
黄晖
黄良民
李元超
周国伟
《台湾海峡》
CAS
CSCD
北大核心
2008
9
下载PDF
职称材料
2
福建古田红曲生产用红曲霉菌主要种类的鉴别
李志强
刘颖
林风
吴丽云
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2017
10
下载PDF
职称材料
3
高产紫杉醇内生真菌J11的鉴定
刘明志
段中岗
吕镇城
刘春霞
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
7
下载PDF
职称材料
4
厌氧真菌系统发育分类及多样性研究进展
张亚伟
王月红
张元庆
刘强
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
5
我国代表地区须癣毛癣菌复合体的分子鉴定与分型研究
胡小平
万喆
王晓红
李若瑜
《中国真菌学杂志》
2011
12
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职称材料
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