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向日葵异戊烯焦磷酸异构酶基因(ipi)的电子克隆和生物信息学分析 被引量：13
1
作者 化文平 王喆之 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2008年第1期81-86,共6页
用电子克隆方法获得向日葵异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)基因,并用生物信息学方法对此基因编码产物从氨基酸组成、理化性质、二级和三级结构以及功能进行预测和分析的结果表明,向日葵IPI为亲水性α/β蛋白,含有IPP异构酶结构域,其与其他植物... 用电子克隆方法获得向日葵异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)基因,并用生物信息学方法对此基因编码产物从氨基酸组成、理化性质、二级和三级结构以及功能进行预测和分析的结果表明,向日葵IPI为亲水性α/β蛋白,含有IPP异构酶结构域,其与其他植物的IPI在序列组成、结构及活性位点均有高度的相似性。 展开更多
关键词 异戊烯焦磷酸异构酶 电子克隆 向日葵 生物信息学
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蜡梅异戊烯基焦磷酸异构酶基因CpIPI的克隆及表达分析 被引量：5
2
作者 李瑞 张杰 +1 位作者 马婧 李名扬 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期35-41,共7页
从蜡梅花cDNA文库中克隆得到1个蜡梅异戊烯基焦磷酸异构酶基因,命名为CpIPI.CpIPI基因的cDNA全长为1 297bp,其中最大ORF框长为879bp,编码292个氨基酸残基.CpIPI蛋白质的相对分子量为33.4kDa,理论等电点为6.86.生物信息学分析表明,蜡梅Cp... 从蜡梅花cDNA文库中克隆得到1个蜡梅异戊烯基焦磷酸异构酶基因,命名为CpIPI.CpIPI基因的cDNA全长为1 297bp,其中最大ORF框长为879bp,编码292个氨基酸残基.CpIPI蛋白质的相对分子量为33.4kDa,理论等电点为6.86.生物信息学分析表明,蜡梅CpIPI蛋白属于典型的IPI蛋白,CpIPI基因是调控蜡梅萜类物质合成的关键基因.荧光定量分析结果表明,CpIPI基因在蜡梅的根中不表达,但是在茎、叶和花中都有表达,且在外瓣中的表达量最高.CpIPI基因在蜡梅不同花期的表达量具有不规律差异性.由此推测,蜡梅CpIPI基因可能参与与花器官形成发育相关的萜类物质的合成. 展开更多
关键词 蜡梅 异戊烯基焦磷酸异构酶 基因克隆 表达分析
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IPP异构酶基因遗传转化对雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)虾青素含量的影响 被引量：2
3
作者 王娜 林祥志 +1 位作者 马瑞娟 闫晋飞 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期1033-1041,共9页
采用RT-PCR技术,从雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)中克隆出IPP异构酶基因(ipiHp1),构建双元载体pCAMBIA3300-egfp-ipiHp1和基因枪转化载体pBlueScript SKⅡ-bar-egfp-ipiHp1,利用根癌农杆菌侵染法和基因枪转化法,将目的基因导入... 采用RT-PCR技术,从雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)中克隆出IPP异构酶基因(ipiHp1),构建双元载体pCAMBIA3300-egfp-ipiHp1和基因枪转化载体pBlueScript SKⅡ-bar-egfp-ipiHp1,利用根癌农杆菌侵染法和基因枪转化法,将目的基因导入雨生红球藻中,经过含50 g/mL草丁膦BBM培养基筛选得到阳性转化子。通过荧光观察报告基因egfp和PCR扩增分析,证明ipiHp1基因整合到转化子的基因组中。生物量测定结果表明大部分转化子的生物量与野生型相似。虾青素含量测定发现,农杆菌侵染法转化的转化子A3虾青素含量与野生型相比有显著变化,平均值达到16.49mg/g,与野生型相比提高了5.16%,而基因枪转化法转化的转化子虾青素含量与野生型无显著性差异。 展开更多
关键词 虾青素 雨生红球藻 IPP异构酶 遗传转化
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大豆异戊烯焦磷酸异构酶基因的电子克隆及生物信息学分析 被引量：6
4
作者 魏琦超 畅丽萍 +1 位作者 薛晓锋 周岩 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期96-100,共5页
利用电子克隆方法获得大豆异戊烯焦磷酸异构酶基因(IPI)的cDNA序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的一般理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行了预测和分析。结果表明,大豆异戊烯焦磷酸异构酶基因的c... 利用电子克隆方法获得大豆异戊烯焦磷酸异构酶基因(IPI)的cDNA序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的一般理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行了预测和分析。结果表明,大豆异戊烯焦磷酸异构酶基因的cDNA序列全长1384bp,包含一个906bp的ORF,编码301个氨基酸。大豆IPI酶为一亲水性的非分泌蛋白,α-螺旋和无规则卷曲是其主要的二级结构,该酶定位于叶绿体。 展开更多
关键词 大豆 异戊烯焦磷酸异构酶 电子克隆 生物信息学分析
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绿色杜氏藻异戊烯基焦磷酸异构酶基因(DvIPI)的生物信息学与诱导表达分析 被引量：2
5
作者 陈俊粤 龚一富 +2 位作者 马颖瑞 周丽亚 王何瑜 《生命科学研究》 CAS CSCD 2017年第3期201-207,共7页
异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,DvIPI)是绿色杜氏藻中类胡萝卜素等萜类物质合成过程中甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)通路上一个重要的限速酶。实验中获得绿色杜氏藻IPI基因的全长序列(Gen Bank序号:K... 异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,DvIPI)是绿色杜氏藻中类胡萝卜素等萜类物质合成过程中甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)通路上一个重要的限速酶。实验中获得绿色杜氏藻IPI基因的全长序列(Gen Bank序号:KX189195),该基因全长4 641 bp,开放阅读框(ORF)为1 147 bp,编码382个氨基酸,并含有3个CBS结构域。蛋白质预测结果表明,DvIPI分子呈亲水性,不含信号肽,也不存在跨膜区域;同时,DvIPI中α-螺旋所占比例最高,中部呈现不规则的扭曲缠绕,两边各自有一个扭曲的多肽链单独远离中心。系统进化树分析显示,DvIPI与细菌IPI亲缘关系较近,而与被子植物以及其他藻类IPI亲缘关系较远。定量检测结果与RT-PCR结果表明,茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,Me JA)浓度为50~100μmol/L时,对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素含量、叶绿素含量以及绿色杜氏藻IPI基因表达水平的影响最为明显,且三者的变化趋势基本一致,推测Me JA对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素、叶绿素的诱导作用可能与绿色杜氏藻类IPI基因有关。 展开更多
关键词 绿色杜氏藻 异戊烯基焦磷酸异构酶基因(ipi) 生物信息学 CBS结构域蛋白(CDCP) 茉莉酸甲酯(Me JA)
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