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PEG11基因在体细胞核移植牛中印迹和DNA甲基化状态分析 被引量:5
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作者 张明月 杨文志 +6 位作者 石运娇 张萃 陈玮娜 崔亚丽 张巍巍 李宁 李世杰 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2154-2159,共6页
为了分析PEG11基因在体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)牛中的印记以及重编程状态,本研究应用RT-PCR产物直接测序法对PEG11基因在自然繁殖牛和新生死亡SCNT牛7个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)中的表达进行了分... 为了分析PEG11基因在体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)牛中的印记以及重编程状态,本研究应用RT-PCR产物直接测序法对PEG11基因在自然繁殖牛和新生死亡SCNT牛7个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)中的表达进行了分析。结果发现PEG11基因在自然繁殖牛的7个组织中均为单等位基因表达,表明PEG11基因在牛中是印记的;在SCNT牛肺脏中PEG11基因为双等位基因表达,而在其余6个组织中为单等位基因表达。进而用亚硫酸氢盐测序法分析自然繁殖牛和SCNT牛肺脏PEG11基因中54CpGs位点的甲基化状态,发现PEG11基因在SCNT牛肺脏中呈现与自然繁殖牛相似的高甲基化状态(97.26%),推测PEG11基因在新生死亡SCNT牛肺脏中印记紊乱可能是导致SCNT牛肺脏发育缺陷的原因之一,PEG11基因内部CGIs的甲基化不参与调控PEG11基因的基因组印记。 展开更多
关键词 PEG11基因 印记状态 体细胞核移植牛 DNA甲基化 器官缺损
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子痫前期患者胎盘组织PHLDA2基因印迹初步研究 被引量:3
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作者 黄桂琼 胡雅毅 王晓东 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期104-107,128,共5页
目的观察子痫前期患者胎盘组织母源性印迹基因PHLDA2印迹状态。方法收集21例正常妊娠和19例子痫前期患者胎盘组织,抽提样本DNA,PCR扩增,选择PHLDA2基因组变异比例较高的单核苷酸多态性(SNP)位点:rs13390为外显子1中C/T多态性(PHLDA2-1),... 目的观察子痫前期患者胎盘组织母源性印迹基因PHLDA2印迹状态。方法收集21例正常妊娠和19例子痫前期患者胎盘组织,抽提样本DNA,PCR扩增,选择PHLDA2基因组变异比例较高的单核苷酸多态性(SNP)位点:rs13390为外显子1中C/T多态性(PHLDA2-1),rs1056819为外显子2中G/A多态性(PHLDA2-2),直接测序筛选杂合子。将杂合子样本的RNA逆转录合成cDNA,PCR扩增直接测序判断PHLDA2基因印迹状态。结果正常妊娠与子痫前期胎盘PHLDA2-1(外显子1)SNP位点(C/T)均未发现杂合子,全为T/T纯合子;胎盘PHLDA2-2(外显子2)SNP位点(G/A)在子痫前期有4例(4/19)、正常妊娠有5例(5/21)杂合子表达,两组杂合子表达差异无统计学意义(P>0.05)。PHLDA2-2杂合子胎盘组织PHLDA2cDNA均只表达G单等位基因。结论子痫前期胎盘PHLDA2(PHLDA2-1及PHLDA2-2)基因多态性与正常妊娠相似,未发现PHLDA2基因印迹丢失现象。 展开更多
关键词 基因印迹 杂合子 印迹状态 子痫前期胎盘 PHLDA2
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非霍奇金淋巴瘤组织中p73基因印迹状态及甲基化 被引量:4
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作者 崔美英 张静静 +4 位作者 王冠男 高献争 张丹丹 高冬玲 李文才 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2011年第2期263-266,共4页
目的:探讨p73基因启动子区甲基化及基因印迹状态与非霍奇金淋巴瘤的关系。方法:取淋巴结活检新鲜标本40例,其中非霍奇金淋巴瘤20例(B细胞淋巴瘤16例,T细胞淋巴瘤4例),淋巴结反应性增生20例。采用逆转录聚合酶链反应-限制性片段长度多态... 目的:探讨p73基因启动子区甲基化及基因印迹状态与非霍奇金淋巴瘤的关系。方法:取淋巴结活检新鲜标本40例,其中非霍奇金淋巴瘤20例(B细胞淋巴瘤16例,T细胞淋巴瘤4例),淋巴结反应性增生20例。采用逆转录聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(RT-PCR-RFLP)的方法及甲基化特异性聚合酶链反应(MS-PCR)的方法分别检测上述组织中p73基因的印迹状态及启动子区域CpG岛的甲基化状态。结果:20例非霍奇金淋巴瘤p73基因杂合子表型8例,其中p73基因单等位基因表型7例;20例淋巴结反应性增生中p73基因杂合子表型6例,其中p73基因单等位基因表型5例,2组间等位基因表型比较差异无统计学意义(P>0.999)。20例非霍奇金淋巴瘤组织中p73基因启动子区甲基化频率为35.0%,而20例淋巴结反应性增生中均无p73基因启动子区甲基化(P=0.008)。结论:p73基因异常甲基化可能与非霍奇金淋巴瘤的发生有关。 展开更多
关键词 P73基因 甲基化 印迹状态 非霍奇金淋巴瘤
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前列腺癌组织中IGF-Ⅱ的基因印迹状态及其临床意义 被引量:2
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作者 刘卓炜 周芳坚 +6 位作者 罗艳敏 秦自科 王杜渐 罗俊航 韩辉 李永红 王欢 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第6期765-770,共6页
背景与目的:我国前列腺癌的发病率逐年上升,就诊时多为晚期患者,内分泌治疗后有效期短,继续治疗困难。胰岛素样生长因子Ⅱ(insulin-likegrowthfactorⅡ,IGF-Ⅱ)可促进多种细胞的增殖,抑制细胞凋亡;其表达受到基因印迹的调控,且基因印迹... 背景与目的:我国前列腺癌的发病率逐年上升,就诊时多为晚期患者,内分泌治疗后有效期短,继续治疗困难。胰岛素样生长因子Ⅱ(insulin-likegrowthfactorⅡ,IGF-Ⅱ)可促进多种细胞的增殖,抑制细胞凋亡;其表达受到基因印迹的调控,且基因印迹状态的改变与多种肿瘤的发生相关。本研究拟检测晚期前列腺癌组织中IGF-Ⅱ的印迹状态,并探讨印迹基因丢失与疾病进展的关系。方法:应用限制性酶切片段长度多态性分析法(restrictivefragmentlengthpolymorphism,RFLP),检测41例前列腺癌、27例前列腺增生和13例正常前列腺组织中的IGF-Ⅱ基因印迹状态。结果:前列腺癌、前列腺增生和正常前列腺组织中IGF-Ⅱ杂合子基因型分别为70.7%(29/41)、55.5%(15/27)和61.5%(8/13);58.6%(17/29)的前列腺癌组织中发生了IGF-Ⅱ的印迹丢失,高于前列腺增生组织(13.3%,P<0.05)和正常前列腺组织(12.5%,P<0.05)中的印迹丢失率。IGF-Ⅱ基因印迹状态与前列腺癌患者年龄无相关性,也与内分泌治疗前患者的血前列腺特异抗原值、伴发骨转移以及癌细胞的分化程度无显著相关。而全雄激素阻断治疗后,有印迹丢失的前列腺癌患者的1年无疾病进展生存率较无印迹丢失的患者低(70.0%vs.100.0%,P=0.039)。结论:晚期前列腺癌组织中IGF-Ⅱ基因印迹丢失发生率明显增高,并且印迹丢失与前列腺癌内分泌治疗后的进展恶化相关。 展开更多
关键词 基因印迹 前列腺肿瘤 胰岛素样生长因子 印迹状态 肿瘤进展
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DNA甲基化调控牛AQP1基因的胎盘特异性印记 被引量:2
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作者 刘晓倩 靳兰杰 +4 位作者 董艳秋 李冬杰 张萃 谷书凯 李世杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2181-2189,共9页
为揭示牛AQP1(aquaporin 1)基因在不同组织及胎盘中的印记状态,以及DNA甲基化修饰在印记中的调控机制,本研究采用基于SNP的PCR产物直接测序的方法,对32头健康雌性成年荷斯坦奶牛心组织及15个自然分娩后的胎盘试验样本进行检测,确定了5... 为揭示牛AQP1(aquaporin 1)基因在不同组织及胎盘中的印记状态,以及DNA甲基化修饰在印记中的调控机制,本研究采用基于SNP的PCR产物直接测序的方法,对32头健康雌性成年荷斯坦奶牛心组织及15个自然分娩后的胎盘试验样本进行检测,确定了5头杂合子个体牛和3个杂合子胎盘,对其组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)和胎盘进行AQP1等位基因表达分析及印记状态分析,利用亚硫酸氢盐测序法分析AQP1基因位于启动子和第一个外显子区的CpG岛在牛心、肝组织、2个胎盘和对应精子中的DNA甲基化状态。结果发现,在杂合子牛被检测的7个组织中,AQP1基因呈现双等位基因表达;而在胎盘中,AQP1基因为单等位基因表达。通过分析杂合子胎盘对应的亲本基因型,发现AQP1基因为母源等位基因表达,即父源印记。进一步比较分析AQP1基因启动子区CpG岛在牛组织、胎盘及对应精子中的甲基化状态,在双等位基因表达的心脏、肝脏组织中,该区域未发现差异甲基化区(differentially methylated regions,DMR);而在单等位基因表达的胎盘中,存在差异甲基化区,同时父源等位基因精子中为重甲基化状态。以上结果说明,牛AQP1基因为胎盘特异性单等位基因表达的父源印记基因,且AQP1基因位于启动子和第一个外显子区的CpG岛甲基化修饰参与调控牛胎盘的印记表达;在被检测的组织中为双等位基因表达。 展开更多
关键词 水通道蛋白1(AQP1)基因 印记状态 DNA甲基化
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H19基因在乳腺癌中的印迹状态和表达 被引量:2
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作者 叶静 韦伟 +4 位作者 张芳婷 于洁 房家智 龙霞 胡慧 《现代肿瘤医学》 CAS 2008年第11期1914-1916,共3页
目的:研究H19基因的表达和印迹状态与乳腺癌发生的关系。方法:采用半定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)与限制性片段长度多态性分析法(RFLP),对20例乳腺癌组织和30例乳腺非癌组织进行H19基因的表达和印迹状态检测。结果:75%(15/20)乳... 目的:研究H19基因的表达和印迹状态与乳腺癌发生的关系。方法:采用半定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)与限制性片段长度多态性分析法(RFLP),对20例乳腺癌组织和30例乳腺非癌组织进行H19基因的表达和印迹状态检测。结果:75%(15/20)乳腺癌标本有H19表达增加,H19表达量在乳腺癌组和乳腺非癌组中差异有显著性(t=3.217,P<0.01)。30例乳腺非癌组没有发现印迹丢失,20例乳腺癌组检测出3例印迹丢失,印迹丢失率为15%。结论:H19在乳腺癌中是致癌基因,其表达量增加和印迹丢失可能作为独立的因素在乳腺癌中发挥作用。 展开更多
关键词 H19 印迹状态 表达 乳腺癌
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乳腺癌中胰岛素样生长因子2印迹状态的研究 被引量:2
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作者 杨蓉 王友洁 +5 位作者 朱晓玲 高晓晖 孟利平 吴韶彬 吴宇 杜玉开 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期423-425,共3页
目的探讨乳腺癌中胰岛素样生长因子-2(IGF-2)的印迹状态与乳腺癌发生发展的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)和限制性片断长度多态性(RFLP)的方法,在47例乳腺癌组织中筛选IGF-2杂合标本,并用逆转录PCR-RFLP检测杂合标本IGF-2的印迹状态... 目的探讨乳腺癌中胰岛素样生长因子-2(IGF-2)的印迹状态与乳腺癌发生发展的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)和限制性片断长度多态性(RFLP)的方法,在47例乳腺癌组织中筛选IGF-2杂合标本,并用逆转录PCR-RFLP检测杂合标本IGF-2的印迹状态。结果在癌组织和癌旁组织中都发现了IGF2的印迹丢失,癌旁组织中IGF2的印迹丢失率(79.2%)比癌组织中的发生率(50.0%)高,两组的差异有统计学意义(P=0.035)。如果乳腺癌组织中发现有IGF-2印迹丢失,其对应的癌旁组织也发现了IGF-2的印迹丢失,但如果乳腺癌组织中为IGF-2印迹保持,则其对应的癌旁组织有的为IGF-2印迹保持,有的为IGF-2印迹丢失。结论IGF2的印迹丢失可能参与了乳腺癌的发展过程。 展开更多
关键词 乳腺癌 胰岛素样生长因子-2 印迹状态
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牛Ascl2基因印记及DNA甲基化状态分析 被引量:2
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作者 王梦楠 崔亚丽 +2 位作者 吴国江 李冬杰 李世杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1949-1956,共8页
为探讨Ascl2基因在成年牛不同组织中的印记状态,并揭示DNA甲基化在调控Ascl2基因印记中的可能作用。本研究首先应用基于核苷酸多态的RT-PCR产物直接测序法对Ascl2基因在牛7个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)中的表达及印记状态进... 为探讨Ascl2基因在成年牛不同组织中的印记状态,并揭示DNA甲基化在调控Ascl2基因印记中的可能作用。本研究首先应用基于核苷酸多态的RT-PCR产物直接测序法对Ascl2基因在牛7个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)中的表达及印记状态进行了分析,进一步应用亚硫酸氢盐测序法分析牛肺、肝和肾组织中Ascl2基因启动子区的等位基因特异的甲基化状态。RT-PCR产物测序结果显示,Ascl2基因印记表现出组织特异性,在肺和肝中为单等位基因表达,而在心、脾、肾、肌肉和脂肪5个组织中为双等位基因表达。亚硫酸氢盐测序发现,在Ascl2单等位基因表达的肺和肝中,2条亲本链的甲基化水平存在极显著差异(P<0.01),A链的甲基化水平(61.21%、87.28%)显著高于G链(24.70%、25.61%);而在Ascl2双等位基因表达的肾组织中,A链(54.70%)与G链(49.55%)的平均甲基化水平差异不显著(P>0.05)。以上结果表明,Ascl2基因启动子区DNA的甲基化修饰调控Ascl2基因的印记表达。 展开更多
关键词 Ascl2 印记状态 DNA甲基化 差异甲基化
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Gab1和Sfmbt2基因在成年普通牛8种不同组织中的印记状态分析 被引量:1
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作者 王冠楠 赵宇鹏 +4 位作者 陈玮娜 张萃 徐达 李冬杰 李世杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1000-1006,共7页
旨在揭示Gab1(Grb2-associated binding protein 1)和Sfmbt2(Scm-like with four mbt domains 2)基因在牛不同组织以及胎盘中的印记状态,本研究应用基于单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)的RT-PCR(Reverse transcrip... 旨在揭示Gab1(Grb2-associated binding protein 1)和Sfmbt2(Scm-like with four mbt domains 2)基因在牛不同组织以及胎盘中的印记状态,本研究应用基于单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)的RT-PCR(Reverse transcription-PCR)产物直接测序方法对Gab1和Sfmbt2基因在牛7个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉和脂肪)以及胎盘中的印记状态进行分析。结果显示,在被分析的7个组织和胎盘中均检测到Gab1和Sfmbt2基因的表达。通过比较杂合子牛基因组PCR扩增产物与RT-PCR扩增产物在SNP位点的测序峰图,发现Gab1和Sfmbt2在被检测的7个组织和胎盘中均为双等位基因表达,说明Gab1和Sfmbt2在牛的组织和胎盘中是非印记的。 展开更多
关键词 Gab1 Sfmbt2 印记状态 SNP
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印迹基因H19在早孕绒毛组织中印迹状态的研究 被引量:1
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作者 赵丹 俞丽丽 +2 位作者 李力 熊仁平 周元国 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期336-338,共3页
目的检测早孕绒毛组织中印迹基因H19印迹的状态,探讨其印迹状态与滋养细胞浸润能力之间的联系。方法PCR-RFLP方法检测93例正常早孕绒毛组织中H19的印迹状态。结果在93例正常早孕绒毛组织中,有42例为杂合子,杂合子基因型中有11例为双等... 目的检测早孕绒毛组织中印迹基因H19印迹的状态,探讨其印迹状态与滋养细胞浸润能力之间的联系。方法PCR-RFLP方法检测93例正常早孕绒毛组织中H19的印迹状态。结果在93例正常早孕绒毛组织中,有42例为杂合子,杂合子基因型中有11例为双等位基因的表达,其中所有双等位基因表达均在孕5~9周,而孕10~12周未发现有双等位基因的表达。结论在早孕期间,H19基因在绒毛组织中存在双等位基因的表达,主要集中在孕10周前,提示H19基因在滋养细胞中可能存在有动态变化,并与滋养细胞的浸润能力的变化有一定的联系。 展开更多
关键词 印迹状态 H19 滋养细胞
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牛MAGEL2的基因结构及在组织和胎盘中印记状态分析 被引量:1
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作者 陈玮娜 马超 +3 位作者 李瑾 张层层 李若梅 李世杰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期2006-2013,共8页
本研究旨在揭示牛PWS/AS(Prader-willi syndrome/angelman syndrome)印记区域中的MAGEL2(Melanoma antigen-like gene 2)基因的结构特点及其在成年牛组织及胎盘中的印记状态。生物信息学软件分析发现,牛MAGEL2基因位于21号染色体,为单... 本研究旨在揭示牛PWS/AS(Prader-willi syndrome/angelman syndrome)印记区域中的MAGEL2(Melanoma antigen-like gene 2)基因的结构特点及其在成年牛组织及胎盘中的印记状态。生物信息学软件分析发现,牛MAGEL2基因位于21号染色体,为单外显子蛋白编码基因,编码长为1183个氨基酸的多肽序列,其产物为MAGE家族成员之一。构建MAGEL2基因的进化树,发现牛MAGEL2基因与羊相似性最高。MAGEL2在不同物种之间具有较高的保守性。应用基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的RTPCR产物直接测序的方法分析MAGEL2在牛8个组织和器官(心,肝,脾,肺,肾,肌肉,脂肪和大脑)及胎盘的印记状态。比较杂合牛基因组PCR产物和RT-PCR产物在SNP位点的测序结果发现,MAGEL2基因在成年牛组织及胎盘中均为单等位表达,提示MAGEL2基因在牛中是印记的。 展开更多
关键词 MAGEL2 基因结构 印记状态 SNP
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牛Wif1基因印记及甲基化调控印记的分子机制研究
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作者 吴茜红 张明月 +2 位作者 杨文志 吴国江 李世杰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1325-1332,共8页
为了研究Wif1基因在牛中的印记状态和调控印记的分子机制,本研究首先应用基于单核苷酸多态(SNP)的测序方法,分析了Wif1基因在牛组织中的印记状态,结果发现,Wif1基因在牛中的印记表现出组织特异性,在肺中为单等位基因表达,而在心、肝、... 为了研究Wif1基因在牛中的印记状态和调控印记的分子机制,本研究首先应用基于单核苷酸多态(SNP)的测序方法,分析了Wif1基因在牛组织中的印记状态,结果发现,Wif1基因在牛中的印记表现出组织特异性,在肺中为单等位基因表达,而在心、肝、脾、肾、肌肉和脂肪6个组织中为双等位基因表达。进一步应用亚硫酸氢盐测序法分析Wif1基因启动子区29个CpG位点在牛肺(单等位基因表达)和肝(双等位基因表达)组织中等位基因特异的甲基化状态,结果发现,在肺和肝中,两条亲本链间的甲基化水平无显著差异(P>0.05)。进一步分析每个CpG位点在肺和肝中亲本链间甲基化率差异,发现与双等位基因表达的肝相比,肺中存在8个亲本链间甲基化率差异显著的CpG位点,其中3个(第1、2和6)位于转录因子的结合位点上。由于单个CpG位点的甲基化变化会影响转录因子的结合,推测这3个CpG位点的甲基化可能参与调控Wif1基因的组织特异性印记。 展开更多
关键词 Wif1 印记状态 DNA甲基化状态 CpG位点
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