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百合抗逆基因遗传转化及转化后植株的抗逆性鉴定 被引量:3
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作者 郑雨娉 陈月 吕英民 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第5期804-812,共9页
【目的】获得抗逆性强的东方百合新材料。【方法】从卷丹(Lilium lancifolium)中克隆得到的抗逆相关基因LlZFHD 4和LlMYB3同源转化至东方百合‘索邦’和‘西伯利亚’。利用普通PCR检验2种基因是否成功整合到受体植物基因组。利用qPCR筛... 【目的】获得抗逆性强的东方百合新材料。【方法】从卷丹(Lilium lancifolium)中克隆得到的抗逆相关基因LlZFHD 4和LlMYB3同源转化至东方百合‘索邦’和‘西伯利亚’。利用普通PCR检验2种基因是否成功整合到受体植物基因组。利用qPCR筛选受体植物基因组中过表达2种基因的植株。通过测定寒冷和干旱胁迫后转基因植株的可溶性糖含量、相对电导率以及失水率来验证2种基因的功能。【结果】PCR结果表明,成功在受体植物基因组内检测到目的基因。qPCR结果表明,有4株植株的目的基因表达量高于对照组。可溶性糖含量和相对电导率结果表明,LlZFHD 4和LlMYB3基因可提高2种百合的抗寒性。失水率结果表明,LlZFHD4和LlMYB3基因可提高2种百合的抗旱性。【结论】得到4株转基因植株,检测结果表明,LlZFHD4和LlMYB3基因可提高2种百合的抗寒性和抗旱性。 展开更多
关键词 百合 同源转化 基因功能 抗寒 抗旱
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重组人白细胞介素-1受体拮抗剂卡那霉素抗性菌种的构建、表达、纯化及质量鉴定
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作者 殷婷婷 朱秋媚 +8 位作者 张宇 王江林 王明军 曲玲玲 朱翯 顾笑宇 刘景会 富锐丽 刘玉林 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2024年第6期672-678,686,共8页
目的构建卡那霉素抗性的重组人白细胞介素-1受体拮抗剂(recombinant human interleukin-1 receptor antagonist,rhIL-1Ra)菌种,并进行rhIL-1Ra蛋白的表达、纯化及质量鉴定,以降低β-内酰胺抗生素带来的风险。方法分别以氨苄抗性的质粒rh... 目的构建卡那霉素抗性的重组人白细胞介素-1受体拮抗剂(recombinant human interleukin-1 receptor antagonist,rhIL-1Ra)菌种,并进行rhIL-1Ra蛋白的表达、纯化及质量鉴定,以降低β-内酰胺抗生素带来的风险。方法分别以氨苄抗性的质粒rhIL-1Ra(A-rhIL-1Ra)、pET-28a为模板,进行PCR扩增,获得线性化载体和卡那霉素基因片段,经同源重组构建卡那霉素抗性的质粒rhIL-1Ra(K-rhIL-1Ra),测序正确后转化E.coli BL21(DE3),构建重组工程菌,经IPTG诱导表达后,进行CM Bestarose Fast Flow、DEAE Bestarose Fast Flow两步柱层析纯化。收集纯化产物,15%SDSPAGE、分子排阻高效液相色谱法(size-exclusion high-performance liquid chromatography,SEC-HPLC)、反相高效液相色谱法(reversed-phase high-performance liquid chromatography,RP-HPLC)检测纯度,串联质谱法检测质谱相对分子质量,Western blot法鉴定特异性,报告基因法检测生物学活性,液相色谱-质谱(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)法分析比对产品相关杂质。结果经菌落PCR及测序鉴定证明质粒K-rhIL-1Ra构建正确。表达的K-rhIL-1Ra蛋白相对分子质量约17000,主要以可溶性形式存在,表达量占菌体总蛋白的30%以上;两步纯化的K-rhIL-1Ra蛋白纯度分别为97%和99%,单体含量分别为99.33%和100%,色谱纯度分别为91.86%和96.96%,质谱相对分子质量与标准品(A-rhIL-1Ra蛋白)一致,可与小鼠抗人IL-1Ra单抗发生特异性反应;纯化的K-rhIL-1Ra蛋白生物学活性为1.29×10^(5)U/mg,相关蛋白化学修饰类型与标准品(A-rhIL-1Ra蛋白)一致。结论成功构建了K-rhIL-1Ra菌种,表达并纯化后的蛋白符合rhIL-1Ra的特征和质量标准,为rhIL-1Ra菌种变更及可比性研究奠定了基础。 展开更多
关键词 重组人白细胞介素-1受体拮抗剂 同源重组 抗性基因 菌种变更
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聚天门冬氨酸同源多肽对西红柿生长发育和抗病性的影响 被引量:5
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作者 杜中军 杨浩 +5 位作者 罗海燕 曹振木 徐立 吕烈武 王康林 王炳 《热带农业科学》 2012年第5期14-17,共4页
以夏红1号和长葫芦柿为试材,采用田间小区试验和田间调查试验,研究聚天门冬氨酸同源多肽对西红柿生物学性状和产量的影响。结果表明:聚天门冬氨酸同源多肽可增强西红柿生长势,使西红柿提早进入结果期,聚天门冬氨酸同源多肽对西红柿的增... 以夏红1号和长葫芦柿为试材,采用田间小区试验和田间调查试验,研究聚天门冬氨酸同源多肽对西红柿生物学性状和产量的影响。结果表明:聚天门冬氨酸同源多肽可增强西红柿生长势,使西红柿提早进入结果期,聚天门冬氨酸同源多肽对西红柿的增产作用达极显著水平,单位面积产量比对照增加9.33%;其销售量比对照增加37.52%,以销售收入核算的产出投入比达10.91,可显著提高西红柿的经济收益。田间试验调查发现:聚天门冬氨酸同源多肽对培育西红柿壮苗效果显著,对西红柿的大田长势及抗病方面也有显著的积极作用,并且病虫害的发生比对照明显减少。 展开更多
关键词 聚天门冬氨酸 同源多肽 西红柿 生长发育 抗病性
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The clinical challenges of homologous recombination proficiency in ovarian cancer: from intrinsic resistance to new treatment opportunities
4
作者 Teresa Zielli Intidhar Labidi-Galy +2 位作者 Maria Del Grande Cristiana Sessa Ilaria Colombo 《Cancer Drug Resistance》 2023年第3期499-516,共18页
Ovarian cancer is the most lethal gynecologic cancer. Optimal cytoreductive surgery followed by platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab is the conventional therapeutic strategy. Since 2016, the pharmac... Ovarian cancer is the most lethal gynecologic cancer. Optimal cytoreductive surgery followed by platinum-based chemotherapy with or without bevacizumab is the conventional therapeutic strategy. Since 2016, the pharmacological treatment of epithelial ovarian cancer has significantly changed following the introduction of the poly (ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARPi). BRCA1/2 mutations and homologous recombination deficiency (HRD) have been established as predictive biomarkers of the benefit from platinum-based chemotherapy and PARPi. While in the absence of HRD (the so-called homologous recombination proficiency, HRp), patients derive minimal benefit from PARPi, the use of the antiangiogenic agent bevacizumab in first line did not result in different efficacy according to the presence of homologous recombination repair (HRR) genes mutations. No clinical trials have currently compared PARPi and bevacizumab as maintenance therapy in the HRp population. Different strategies are under investigation to overcome primary and acquired resistance to PARPi and to increase the sensitivity of HRp tumors to these agents. These tumors are characterized by frequent amplifications of Cyclin E and MYC, resulting in high replication stress. Different agents targeting DNA replication stress, such as ATR, WEE1 and CHK1 inhibitors, are currently being explored in preclinical models and clinical trials and have shown promising preliminary signs of activity. In this review, we will summarize the available evidence on the activity of PARPi in HRp tumors and the ongoing research to develop new treatment options in this hard-to-treat population. 展开更多
关键词 PARP inhibitors homologous recombination proficiency ovarian cancer PARP inhibitor resistance replication stress
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多重耐药维氏气单胞菌porin基因敲除的构建及其耐药特性研究
5
作者 王晓磊 刘兆平 +6 位作者 李子雁 周厚宇 张开 温际富 宋一晓 刘云国 隋智海 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2023年第9期34-42,共9页
目的研究微孔蛋白基因porin对维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,A.veronii)耐药性的影响以解析A.veronii的耐药机制。方法以多重耐药的A.veronii WL-3为研究对象,采用同源重组双交换的方法构建Δporin敲除株,利用比浊法测定其生长曲线,... 目的研究微孔蛋白基因porin对维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,A.veronii)耐药性的影响以解析A.veronii的耐药机制。方法以多重耐药的A.veronii WL-3为研究对象,采用同源重组双交换的方法构建Δporin敲除株,利用比浊法测定其生长曲线,通过药敏纸片法分析其耐药性。结果以A.veronii WL-3基因组DNA为模板,利用overlap聚合酶链式反应技术扩增获得上下同源臂融合片段,并连接至自杀质粒pDM4中,重组成敲除质粒pDM4-Δporin。将pDM4-Δporin转化至感受态大肠杆菌SM10中,通过接合转移转入A.veronii WL-3中。通过同源重组双交换构建A.veronii WL-3Δporin敲除株。生长曲线显示与野生株相比,Δporin菌株的生长速度并无明显变化;抗生素耐药特征分析显示敲除porin基因会降低A.veronii对头孢氨苄、新霉素、四环素、环丙沙星等10种抗生素的敏感性,提高对多粘菌素B的敏感性。结论基因porin不是A.veronii生长所必需的,但会影响A.veronii对部分抗生素的敏感度。本研究所构建的敲除株可为深入研究porin在A.veronii的耐药机制提供必要材料。 展开更多
关键词 维氏气单胞菌 porin基因 同源重组 基因敲除 耐药性
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草地贪夜蛾鱼尼丁受体与双酰胺类杀虫剂的结合模式及抗性风险分析 被引量:4
6
作者 李康 王凯博 +5 位作者 陶丽红 李丽 李佳俊 吴文伟 肖春 叶敏 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期856-868,共13页
为研究草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda(以下简称FAW)对双酰胺类杀虫剂的抗性机制,根据FAW鱼尼丁受体(ranodine receptor,RyR)跨膜区域的氨基酸序列,通过同源建模的方法构建其三维结构;通过对比FAW与小菜蛾Plutella xylostella(以下简... 为研究草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda(以下简称FAW)对双酰胺类杀虫剂的抗性机制,根据FAW鱼尼丁受体(ranodine receptor,RyR)跨膜区域的氨基酸序列,通过同源建模的方法构建其三维结构;通过对比FAW与小菜蛾Plutella xylostella(以下简称DBM)RyR跨膜区域的氨基酸序列,发现两者具有较高的同源度,进而根据已报道的FAWRyR的突变位点I4734M及DBMRyR的突变位点G4946E(对应FAWRyR的G4891),在FAWRyR中引入突变,采用分子对接的方法分别分析其突变前后与5种双酰胺类杀虫剂的结合模式。结果表明:FAWRyR的I4734M突变模型与5种双酰胺类杀虫剂的亲和力与野生型的无明显差别,均存在氢键、卤键、疏水作用、π-π相互作用及π-阳离子作用等非共价相互作用;但G4891E突变模型与5种双酰胺类杀虫剂的亲和力下降、形成的作用力方式减少,从而影响RyR与双酰胺类杀虫剂的结合稳定性。本研究分析发现,FAWRyR的G4891E突变可能导致其对双酰胺类杀虫剂产生抗性,需在今后的研究中关注该突变。该研究结果还可会为基于鱼尼丁受体设计杀虫剂提供参考。 展开更多
关键词 草地贪夜蛾 鱼尼丁受体 双酰胺类杀虫剂 同源建模 突变位点 结合模式 抗性风险
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干酪乳杆菌05-21在酸、胆盐和渗透压胁迫条件下的同源抗性和交叉抗性反应研究 被引量:3
7
作者 林炜 张京生 +1 位作者 张世湘 郝彦玲 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2008年第11期4-6,28,共4页
对干酪乳杆菌在干酪生产和人体胃肠道环境中主要面临的酸、胆盐和渗透压3种胁迫条件下的同源抗性和交叉抗性进行研究。首先确定酸、胆盐、NaCl胁迫的亚致死水平和致死水平分别为pH值为5.0和pH值为3.5,质量浓度为0.5 g/L和3 g/L,20 g/L和... 对干酪乳杆菌在干酪生产和人体胃肠道环境中主要面临的酸、胆盐和渗透压3种胁迫条件下的同源抗性和交叉抗性进行研究。首先确定酸、胆盐、NaCl胁迫的亚致死水平和致死水平分别为pH值为5.0和pH值为3.5,质量浓度为0.5 g/L和3 g/L,20 g/L和180 g/L。同源抗性实验表明,酸诱导2h存活率可提高23倍,胆盐诱导提高25倍,NaCl诱导提高75倍。交叉抗性实验表明,酸诱导后菌体在胆盐、NaCl中存活率分别提高20倍和11倍;而NaCl诱导后菌体在胆盐中存活率提高250倍,但却不能诱导菌体的抗酸能力。稳定期菌体具有比对数期菌体更强的抗胁迫能力。实验结果为优化干酪生产工艺,提高干酪乳杆菌在胃肠道中的存活率提供了理论基础。 展开更多
关键词 干酪乳杆菌 同源抗性 交叉抗性 致死水平 存活率
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抗噬菌体甲型副伤寒沙门菌突变菌的构建及其生物学特性 被引量:2
8
作者 毛普加 冯梦蝶 +8 位作者 洪愉 毛小萍 许泽仰 赵继华 杨洪文 宋武战 黄芬 井申荣 曾韦锟 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期275-281,共7页
目的:采用同源重组基因敲除方法构建3株甲型副伤寒沙门菌(副甲)抗噬菌体突变菌,并研究其生物学特性。方法:通过PCR和融合PCR方法获得了2、3、5号同源臂片段,经酶切后与pYG4载体连接,构建pYG4-2、pYG4-3和pYG4-5同源重组质粒。经PCR测序... 目的:采用同源重组基因敲除方法构建3株甲型副伤寒沙门菌(副甲)抗噬菌体突变菌,并研究其生物学特性。方法:通过PCR和融合PCR方法获得了2、3、5号同源臂片段,经酶切后与pYG4载体连接,构建pYG4-2、pYG4-3和pYG4-5同源重组质粒。经PCR测序鉴定正确后,与野生型副甲菌进行同源重组,获得2、3、5号3株抗噬菌体突变菌。将3株突变菌和野生型副甲菌经不同种类和浓度的抗生素、不同pH值和温度及不同浓度的盐离子处理后,测量菌株的A595值,分析3株突变菌对抗生素、温度、pH值和盐离子的敏感性以及生长曲线。结果:PCR和融合PCR扩增出3个同源臂,构建的pYG4-2、pYG4-3和pYG4-5同源重组质粒经PCR测序表明构建成功;同源重组和抗噬菌体验证表明成功获得3株抗噬菌体突变菌。3株突变菌产生了卡那霉素抗性,且对链霉素表现出敏感性;2号菌表现出氨苄青霉素抗性,5号菌表现高温度耐受性;与野性型副甲菌比较,3株突变菌的生长曲线明显平缓,尤以2号突变菌最为突出。结论:成功构建抗噬菌体突变菌,并获得一些特殊的生物学特性。 展开更多
关键词 甲型副伤寒沙门菌 突变菌 同源重组 生物学特性 噬菌体抗性
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PARP inhibitors: clinical development, emerging differences, and the current therapeutic issues 被引量:2
9
作者 Pooja Murthy Franco Muggia 《Cancer Drug Resistance》 2019年第3期665-679,共15页
Following years in development, poly-adenosyl-ribose polymerase (PARP) inhibitors continue to advance the treatment of ovarian and breast cancers, particularly in patients with pathogenic BRCA mutations. Differences i... Following years in development, poly-adenosyl-ribose polymerase (PARP) inhibitors continue to advance the treatment of ovarian and breast cancers, particularly in patients with pathogenic BRCA mutations. Differences in clinical trial design have contributed to distinct indications for each of the PARP inhibitors. Toxicity patterns are also emerging that suggest agents differ in their normal tissue tolerance - beyond what might be expected by dose variations and/or exposure to prior treatment. PARP inhibitor resistance is an increasingly relevant issue as the drugs move to the forefront of advanced ovarian/breast cancer treatment, and is an active area of ongoing research. This review examines the PARP inhibitor clinical trials that have led to approved indications in ovarian and breast cancers, PARP inhibitor targets and pharmacological differences between the PARP inhibitors, emerging mechanisms of resistance, and key clinical questions for future development. 展开更多
关键词 poly-adenosyl-ribose polymerase inhibitors poly-adenosyl-ribose polymerase inhibition breast cancer ovarian cancer BRCA homologous recombination deficiency poly-adenosyl-ribose polymerase inhibitor resistance
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Rad51在恶性肿瘤转移和耐药中的作用及研究进展 被引量:1
10
作者 陆泓雨 付玮 丁士刚 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2022年第3期273-277,共5页
Rad51是同源重组的中心分子,其基本作用原理是形成Rad51-ssDNA核蛋白丝结构,在染色体联会配对期间侵入模板链。Rad51在恶性肿瘤中的作用主要包括:(1)与p53、p38和p21等细胞周期检查点分子相互作用,影响肿瘤的发展和转移;(2)Rad51表达减... Rad51是同源重组的中心分子,其基本作用原理是形成Rad51-ssDNA核蛋白丝结构,在染色体联会配对期间侵入模板链。Rad51在恶性肿瘤中的作用主要包括:(1)与p53、p38和p21等细胞周期检查点分子相互作用,影响肿瘤的发展和转移;(2)Rad51表达减少导致了部分上皮间质转化过程的逆转;(3)Rad51不同位点的突变可以显著影响肿瘤发展的风险和抗肿瘤治疗的结果;(4)部分微小RNA和长链非编码RNAs可以靶向Rad51的编码区并调控基因表达。近年来,各项研究中卵巢癌、乳腺癌和肺癌Rad51的高表达证实了上述机制,提示Rad51高表达与肿瘤转移和耐药高度相关。调节Rad51的表达可以逆转肿瘤耐药过程,有望成为肿瘤治疗和逆转肿瘤耐药的全新靶点。 展开更多
关键词 恶性肿瘤 RAD51 同源重组 肿瘤转移 耐药性
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基于pDS132的基因敲除中创伤弧菌氯霉素的耐药性变化及影响 被引量:1
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作者 凤梓涵 王静 +7 位作者 金虹 辛文文 康琳 王菁 高姗 李岩伟 袁媛 王景林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2632-2642,共11页
【背景】基于自杀载体的基因敲除在单基因敲除上的应用较为常见,但在多基因敲除过程中细菌耐药性的变化及对后续敲除的影响尚未明确。【目的】探究基于自杀载体pDS132的创伤弧菌vvhA与rtxA1双基因敲除株构建过程中,创伤弧菌对氯霉素耐... 【背景】基于自杀载体的基因敲除在单基因敲除上的应用较为常见,但在多基因敲除过程中细菌耐药性的变化及对后续敲除的影响尚未明确。【目的】探究基于自杀载体pDS132的创伤弧菌vvhA与rtxA1双基因敲除株构建过程中,创伤弧菌对氯霉素耐药性的变化及对后续基因敲除的影响。【方法】基于自杀载体pDS132的同源重组法构建创伤弧菌YJ016的单基因敲除株YJ016-ΔvvhA、YJ016-ΔrtxA1和双基因敲除株YJ016-ΔvvhAΔrtxA1,记录单交换筛选时的氯霉素浓度与筛选平板上成功重组的菌株所占比例。琼脂稀释法测定野生型与敲除株的氯霉素最低抑菌浓度(Minimum InhibitoryConcentration,MIC)和抗性突变频率,纸片扩散法测定菌株对其他药物的敏感性,分析其对单交换筛选的影响。【结果】单基因敲除株的氯霉素MIC及氯霉素抗性突变频率高于野生型;双基因敲除株的庆大霉素抑菌圈直径小于野生型。单基因敲除时,单交换重组菌株的占比为100%(20/20);在YJ016-ΔvvhA上敲除rtxA1基因,氯霉素筛选浓度为2、4μg/mL时,单交换重组菌株的占比分别为40%(8/20)、5%(1/20);在YJ016-ΔrtxA1上敲除vvhA基因,氯霉素筛选浓度为2、4μg/mL时,单交换重组菌株的占比均为0%(0/20)。【结论】基于自杀载体pDS132的基因敲除中创伤弧菌氯霉素的耐药性升高,可能影响后续单交换重组的筛选,该结果为基于自杀载体的同源重组技术应用于多基因敲除提供了参考。 展开更多
关键词 创伤弧菌 自杀载体 同源重组 基因敲除 耐药性
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副溶血性弧菌vtrB基因敲除菌株的构建及其在抵抗胆汁中的作用 被引量:1
12
作者 郜蓉 后来旺 +2 位作者 赵勇 潘迎捷 孙晓红 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期555-563,共9页
构建副溶血性弧菌转录调节因子VtrB(V.parahaemolyticus T3SS2 regulator B)敲除菌株和回补菌株,探讨VtrB在副溶血性弧菌抵抗胆汁中的作用。根据GenBank数据库中副溶血性弧菌vtrB基因上下游序列设计引物,通过融合PCR将vtrB基因上下游同... 构建副溶血性弧菌转录调节因子VtrB(V.parahaemolyticus T3SS2 regulator B)敲除菌株和回补菌株,探讨VtrB在副溶血性弧菌抵抗胆汁中的作用。根据GenBank数据库中副溶血性弧菌vtrB基因上下游序列设计引物,通过融合PCR将vtrB基因上下游同源臂融合并克隆入自杀质粒pDS132中,将重组自杀质粒转入大肠杆菌S17-1λpir中,再接合转移至副溶血性弧菌中进行同源重组,通过10%蔗糖筛选获得vtrB基因突变株ΔvtrB。将pBAD33-vtrB重组质粒电转入ΔvtrB突变株中获得回补菌株C-ΔvtrB。研究副溶血性弧菌野生型、突变株和回补株在2%脱氧胆酸盐(DOC)处理后的存活率。基于同源重组原理,经vtrB基因的PCR扩增和转录水平检测结果表明,成功获得副溶血性弧菌vtrB基因缺失突变株ΔvtrB和回补株C-ΔvtrB。与野生型和回补菌株C-ΔvtrB相比,ΔvtrB突变株在2%DOC处理20、40和60 min后的存活率分别为17%、4%和1%,vtrB基因的失活使得副溶血性弧菌对胆汁抵抗能力极显著降低(P<0.001),表现出存活能力的缺陷。由此表明,转录调节因子VtrB有助于副溶血性弧菌对胆汁的抵抗。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 vtrB基因 基因敲除 同源重组 胆汁抵抗
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金黄色葡萄球菌基因组编辑技术
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作者 王贞 周威 +2 位作者 张浩 胡梁斌 莫海珍 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期5332-5338,共7页
金黄色葡萄球菌是一种革兰氏阳性病原菌,可引发多种严重感染。分子遗传学操作是研究金黄色葡萄球菌基因功能和分子感染机制的重要手段。金黄色葡萄球菌因其限制性修饰系统使得对其进行遗传学操作总显得费时费力。此外,较低的DNA转化效... 金黄色葡萄球菌是一种革兰氏阳性病原菌,可引发多种严重感染。分子遗传学操作是研究金黄色葡萄球菌基因功能和分子感染机制的重要手段。金黄色葡萄球菌因其限制性修饰系统使得对其进行遗传学操作总显得费时费力。此外,较低的DNA转化效率和同源重组率也一直制约着相关研究的开展。本研究列举了近年来主流的金黄色葡萄球菌基因组编辑方法,包括基于基因等位替换的抗生素筛选和反向筛选系统、基于Ⅱ型内含子剪切的TargeTron系统以及重组的CRISPR/Cas9系统,从技术层面较为详细地介绍和比较了上述编辑技术的操作原理和试验流程,以期为相关领域的研究人员提供技术参考。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 同源重组 抗性筛选 反向筛选 TargeTron CRISPR/Cas9
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Red/ET同源重组系统介导的质粒载体快速构建
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作者 苏春 余佳 +1 位作者 邱荣国 唐莉 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期12-17,共6页
Red/ET重组技术是近年来建立的一种基于高效率体内同源重组的新型遗传工程技术,该技术简便、快速.首先,通过一步融合的方法将链霉素抗性基因和氯霉素抗性基因同时克隆至pUC19上,从而构建出含有正反选择标记的载体pRC;其次,用安普霉素抗... Red/ET重组技术是近年来建立的一种基于高效率体内同源重组的新型遗传工程技术,该技术简便、快速.首先,通过一步融合的方法将链霉素抗性基因和氯霉素抗性基因同时克隆至pUC19上,从而构建出含有正反选择标记的载体pRC;其次,用安普霉素抗性基因或者氯霉素抗性基因替换了常用表达载体pET-28b上的卡那霉素抗性基因,改变了其抗性选择标记,得到的表达载体pMT和pCT可以更广泛地应用于不同宿主中;最后,还将启动和终止表达的区域定点插入pACYC184载体中,使其成为可以独立表达蛋白的表达载体p184.本研究所得到的载体为大肠杆菌宿主菌中的基因克隆和蛋白表达提供了基础. 展开更多
关键词 RED ET技术 同源重组 抗性基因 一步融合 正反选择标记 克隆
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Direct cloning and transplanting of large DNA fragments from Escherichia coli chromosome
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作者 Ying Zhu Yan Yang +3 位作者 Pingping Den Yong Huang Mengxiang Ni Hongqing Fang 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2016年第10期1034-1041,共8页
We applied a resistance split-fusion strategy to increase the in vivo direct cloning efficiency mediated by Red recombination. The cat cassette was divided into two parts: cma (which has a homologous sequence with ... We applied a resistance split-fusion strategy to increase the in vivo direct cloning efficiency mediated by Red recombination. The cat cassette was divided into two parts: cma (which has a homologous sequence with cmb) and cmb, each of which has no resistance separately unless the two parts are fused together. The crab sequence was integrated into one flank of a target clon- ing region in the chromosome, and a linear vector containing the cma sequence was electroporated into the cells to directly capture the target region. Based on this strategy, we successfully cloned an approximately 48 kb DNA fragment from the E. coli DH1-Z chromosome with a positive frequency of approximately 80%. Combined with double-strand breakage-stimulated homologous recombination, we applied this strategy to successfully replace the corresponding region of the E. coli DH36 chromosome and knock out four non-essential genomic regions in one step. This strategy could provide a powerful tool for the heterologous expression of microbial natural product biosynthetic pathways for genome assembly and for the functional study of DNA sequences dozens of kilobases in length. 展开更多
关键词 Red homologous recombination resistance split-fusion target cloning transferring
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武汉市餐饮从业人员携带常见沙门菌的脉冲场凝胶电泳指纹及耐药谱特征分析
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作者 唐锋 熊燕 +3 位作者 陈智 王芳 张卉 赵滢 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期549-555,共7页
目的分析武汉市餐饮从业人员携带我国最常见沙门菌血清型菌株的脉冲场凝胶电泳指纹图谱及耐药谱,了解来自餐饮行业的沙门菌分离株流行病学特征。方法收集和鉴定武汉市2017年餐饮从业人员体检所检出的60株我国最常见5种沙门菌血清型(鼠... 目的分析武汉市餐饮从业人员携带我国最常见沙门菌血清型菌株的脉冲场凝胶电泳指纹图谱及耐药谱,了解来自餐饮行业的沙门菌分离株流行病学特征。方法收集和鉴定武汉市2017年餐饮从业人员体检所检出的60株我国最常见5种沙门菌血清型(鼠伤寒、肠炎、德尔俾、阿贡纳及山夫登堡)菌株。在脉冲场凝胶电泳检测后,应用BioNumerics 7.6软件进行遗传图谱的聚类分析,并应用微量肉汤稀释法开展耐药谱检测。结果在PFGE聚类分析中,16株阿贡纳分为8个型别(相似度49.9%~100.0%);9株山夫登堡分为4个型别(相似度70.3%~93.3%)、9株鼠伤寒分为3个型别(相似度为81.0%~96.8%)、18株德尔俾仅分为2个型别(相似度80.6%~100.0%)、8株肠炎分为5个型别(相似度为65.6%~92.3%)。在耐药谱方面,哌拉西林、头孢唑啉和氨苄青霉素耐药率最高(8.33%),四环素、氨苄西林/舒巴坦居其次(5.00%)。在各型菌中,鼠伤寒耐药率最高(33.33%),其次是肠炎(25.00%),包括1株环丙沙星耐药的鼠伤寒沙门菌。耐药菌株总体占比达11.67%,其中多重耐药株达71.43%。结论武汉市人群携带的阿贡纳和肠炎沙门菌差异性均较大,而鼠伤寒和德尔俾沙门菌同源性较高。鼠伤寒和肠炎沙门菌的多重耐药率较高。根据耐药谱结果,哌拉西林、头孢唑啉、氨苄青霉素及四环素已不适于临床经验性用药。 展开更多
关键词 沙门菌 脉冲场凝胶电泳 同源性 血清型 耐药性
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TALEN-Mediated Homologous Recombination Produces Site-Directed DNA Base Change and Herbicide-Resistant Rice 被引量:16
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作者 Ting Li Bo Liu +1 位作者 Chih Ying Chen Bing Yang 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2016年第5期297-305,共9页
Over the last decades,much endeavor has been made to advance genome editing technology due to its promising role in both basic and synthetic biology.The breakthrough has been made in recent years with the advent of se... Over the last decades,much endeavor has been made to advance genome editing technology due to its promising role in both basic and synthetic biology.The breakthrough has been made in recent years with the advent of sequence-specific endonucleases,especially zinc finger nucleases(ZFNs),transcription activator-like effector nucleases(TALENs) and clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPRs) guided nucleases(e.g.,Cas9).In higher eukaryotic organisms,site-directed mutagenesis usually can be achieved through non-homologous end-joining(NHEJ) repair to the DNA double-strand breaks(DSBs) caused by the exogenously applied nucleases.However,site-specific gene replacement or genuine genome editing through homologous recombination(HR) repair to DSBs remains a challenge.As a proof of concept gene replacement through TALEN-based HR in rice(Oryza sativa),we successfully produced double point mutations in rice acetolactate synthase gene(OsALS) and generated herbicide resistant rice lines by using TALENs and donor DNA carrying the desired mutations.After ballistic delivery into rice calli of TALEN construct and donor DNA,nine HR events with different genotypes of OsALS were obtained in T_0 generation at the efficiency of 1.4%—6.3%from three experiments.The HRmediated gene edits were heritable to the progeny of T_1 generation.The edited T_1 plants were as morphologically normal as the control plants while displayed strong herbicide resistance.The results demonstrate the feasibility of TALEN-mediated genome editing in rice and provide useful information for further genome editing by other nuclease-based genome editing platforms. 展开更多
关键词 TALEN Genome editing homologous recombination Gene replacement Site-directed mutagenesis Acetolactate synthase Herbicide resistance Rice
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抑制SIX1表达对急性髓系白血病耐药细胞HL-60/ADR的影响 被引量:1
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作者 李丽媛 聂子元 +3 位作者 张小艳 罗建民 杨琳 王茜 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1038-1043,共6页
目的:建立抑制同源盒基因1(SIX1)表达的HL-60细胞及耐阿霉素的HL-60细胞(HL-60/ADR),研究抑制SIX1对HL-60及HL-60/ADR细胞耐药作用的影响。方法:用慢病毒感染HL-60及HL-60/ADR细胞,经嘌呤霉素筛选获得稳定抑制SIX1表达的细胞株。采用CC... 目的:建立抑制同源盒基因1(SIX1)表达的HL-60细胞及耐阿霉素的HL-60细胞(HL-60/ADR),研究抑制SIX1对HL-60及HL-60/ADR细胞耐药作用的影响。方法:用慢病毒感染HL-60及HL-60/ADR细胞,经嘌呤霉素筛选获得稳定抑制SIX1表达的细胞株。采用CCK-8法检测各组细胞的增殖能力,流式细胞凋亡试剂盒检测细胞凋亡情况,实时定量PCR检测耐药相关基因的表达水平。结果:成功构建了抑制SIX1表达的HL-60及HL-60/ADR稳定转染细胞株。与对照组相比较,抑制SIX1的表达使HL-60及HL-60/ADR细胞的增殖明显受抑制(P<0.05),细胞的凋亡率显著增加(P<0.05),并且抑制SIX1表达后细胞对阿霉素的敏感性升高。结论:抑制SIX1的表达可以提高细胞对阿霉素的敏感性,其逆转耐药性的作用可能与促进细胞凋亡基因的表达有关。 展开更多
关键词 同源盒基因1 急性髓系白血病 耐药细胞 耐药性
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马铃薯广谱抗病Rpi-blb1同源基因抗性被进化晚疫病菌株克服 被引量:3
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作者 朱素贤 祝军 +4 位作者 李颖 Nijenhuis Maarten Bergervoet Marjan Rietman Hendrik Jacobsen Evert 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期241-246,共6页
马铃薯晚疫病广谱抗性基因Rpi-blb1(克隆于Solanum bulbocastanum)及其两个同源抗病基因Rpi-sto1(克隆于Solanum stoloniferum)和Rpi-pta1(克隆于Solanum papita)的抗性可能已被高度进化的晚疫病菌株所克服。为证实此观点,将从荷兰田间... 马铃薯晚疫病广谱抗性基因Rpi-blb1(克隆于Solanum bulbocastanum)及其两个同源抗病基因Rpi-sto1(克隆于Solanum stoloniferum)和Rpi-pta1(克隆于Solanum papita)的抗性可能已被高度进化的晚疫病菌株所克服。为证实此观点,将从荷兰田间和墨西哥野外S.bulbocastanum和S.stoloniferum病株上采集的晚疫病菌株重新接种于具有共同遗传背景(感病栽培品种Desiree)的Rpi-blb1及其同源基因转化体和3个野生种植株上,测试Rpi-blb1及其同源基因的抗性是否已被克服。结果表明,采自墨西哥野外S.stoloniferum的两个菌株Pic99189和Pic99192已经克服了Rpi-blb1及其同源基因的抗性;在野生种植株的测试中,只有S.papita的抗性明显地被菌株Pic99192所克服。同时发现在转基因植株离体叶片接种试验中,高抗晚疫病菌的转化体需要在多个转化体间进行选择。从采自中国4个不同地区晚疫病菌株接种sto1.Desiree转化体的小规模测试中可推断,Rpi-blb1及其同源抗性基因在中国仍具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 马铃薯 晚疫病 同源抗病基因
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Tribbles同源蛋白3的功能研究进展 被引量:3
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作者 王辉强 李玉环 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期1986-1994,共9页
Tribbles同源蛋白3 (TRB3)具有广泛的生物学功能,如参与肿瘤调控、胰岛素抵抗的发生、内质网应激反应、炎症调节和细胞生长分化的调控等。TRB3作为关键的"压力调节开关",参与众多疾病的调控,并作为很多疾病的生物标志物和潜... Tribbles同源蛋白3 (TRB3)具有广泛的生物学功能,如参与肿瘤调控、胰岛素抵抗的发生、内质网应激反应、炎症调节和细胞生长分化的调控等。TRB3作为关键的"压力调节开关",参与众多疾病的调控,并作为很多疾病的生物标志物和潜在的治疗靶点。本文就近年来有关TRB3的生物学功能研究做一概述,以期为TRB3功能的进一步研究提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 tribbles同源蛋白3 肿瘤 胰岛素抵抗 内质网应激 炎症 细胞分化
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