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DNA methylation in hepatocellular carcinoma 被引量:17
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作者 Iris Tischoff Andrea Tannapfel 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2008年第11期1741-1748,共8页
As for many other tumors,development of hepatocellular carcinoma(HCC)must be understood as a multistep process with accumulation of genetic and epigenetic alterations in regulatory genes,leading to activation of oncog... As for many other tumors,development of hepatocellular carcinoma(HCC)must be understood as a multistep process with accumulation of genetic and epigenetic alterations in regulatory genes,leading to activation of oncogenes and inactivation or loss of tumor suppressor genes(TSG).In the last decades,in addition to genetic alterations,epigenetic inactivation of(tumor suppressor) genes by promoter hypermet hylation has been recognized as an important and alternative mechanism in tumorigenesis.In HCC,aberrant methylation of promoter sequences occurs not only in advanced tumors, it has been also observed in premalignant conditions just as chronic viral hepatitis B or C and cirrhotic liver. This review discusses the epigenetic alterations in hepatocellular carcinoma focusing DNA methylation. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma DNA methylation histone modification Tumor suppressor genes
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西达本胺联合顺铂对三阴乳腺癌细胞株MDA-MB-231的体外抗增殖作用及其机制的研究 被引量:4
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作者 项丹 姜藻 顾晓怡 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2013年第3期283-288,共6页
目的:探讨西达本胺联合顺铂对三阴乳腺癌细胞株MDA-MB-231的抑制作用及其可能的分子机制。方法:单独及联合给药后采用MTT法测定MDA-MB-231细胞的增殖,流式细胞仪(FCM)检测细胞凋亡率,Western blotting法分析乙酰化组蛋白H3及HDAC3的表... 目的:探讨西达本胺联合顺铂对三阴乳腺癌细胞株MDA-MB-231的抑制作用及其可能的分子机制。方法:单独及联合给药后采用MTT法测定MDA-MB-231细胞的增殖,流式细胞仪(FCM)检测细胞凋亡率,Western blotting法分析乙酰化组蛋白H3及HDAC3的表达水平,荧光定量PCR检测ERCC1表达水平。结果:MTT法检测发现,西达本胺单药和顺铂单药在体外对细胞株MDA-MB-231增殖都有一定的抑制作用,且呈浓度、时间依赖性;联合用药可起到协同效应。西达本胺可抑制MDA-MB-231细胞株HDAC3的表达,提高组蛋白H3的乙酰化水平。联合顺铂起到协同效应的分子机制主要是降低细胞株ERCC1的表达水平。结论:西达本胺联合顺铂在体外能协同抑制三阴乳腺癌细胞株MDA-MB-231的增殖。 展开更多
关键词 三阴乳腺癌 西达本胺 顺铂 组蛋白脱乙酰基酶类 基因 ERCC1
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茶树CsMCC1和CsMCC2基因的克隆及表达特征性分析
3
作者 代洪苇 刘洁强 +2 位作者 张丽 童华荣 袁连玉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期656-668,共13页
组蛋白乙酰化修饰由组蛋白乙酰化酶(histone acetyltransferases,HATs)和脱乙酰化酶(histone deacetylase,HDACs)共同催化完成,是重要的表观遗传调控方式之一,在植物生长发育、逆境胁迫响应和激素响应的调控过程中均具有重要意义,但对茶... 组蛋白乙酰化修饰由组蛋白乙酰化酶(histone acetyltransferases,HATs)和脱乙酰化酶(histone deacetylase,HDACs)共同催化完成,是重要的表观遗传调控方式之一,在植物生长发育、逆境胁迫响应和激素响应的调控过程中均具有重要意义,但对茶树(Camellia sinensis)组蛋白乙酰化修饰的研究还比较少。本研究从‘福鼎大白茶’茶树中克隆获得了2个HATs家族的MCC(MEIOTIC CONTROL OF CROSSOVERS)基因:CsMCC1和CsMCC2,通过生物信息学分析、实时荧光定量PCR技术(Real-time quantitative PCR,qRT-PCR)和亚细胞定位试验对其功能进行解析。结果显示,CsMCC1和CsMCC2基因分别位于茶树1号和7号染色体,分别编码257 aa和269 aa,均属于碱性不稳定亲水性蛋白,与拟南芥AtMCC1具有高度相似的基因结构和蛋白空间结构。系统进化树和保守结构域分析表明,CsMCC蛋白与葡萄、番茄的同源蛋白有较近的亲缘关系,MCC蛋白序列高度保守,均含有GNAT保守结构,属于HAT蛋白的GNAT(GCN5-related N-terminal acetyltransferases)亚家族。拟南芥原生质体亚细胞定位结果显示,CsMCC1和CsMCC2蛋白均定位于细胞质膜。启动子分析显示,在CsMCC1和CsMCC2基因启动子中包含多个与胁迫、光和植物激素调节响应相关的元件。转录组数据和表达分析发现,CsMCC1基因在叶、花和根发育早期的表达量明显高于后期;CsMCC2基因在茶树根部有最高表达,并在根部发育的较长阶段均有较高水平的表达量;2个CsMCC基因均能够被多种非生物胁迫(干旱、盐和冷)和外源激素(MeJA、GA3和IAA)诱导表达。蛋白相互作用预测分析显示,CsMCC蛋白与多个乙酰化转移酶相关蛋白具有关联性。综上所述,CsMCC1和CsMCC2基因具有通过组蛋白乙酰化修饰作用广泛参与茶树的生长发育和环境响应过程的潜能,可为进一步研究CsMCC基因在茶树中的功能提供理论参考。 展开更多
关键词 茶树 组蛋白乙酰化 CsMCC基因 表达分析
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A LIM Domain Protein from Tobacco Involved in Actin-Bundling and Histone Gene Transcription 被引量:2
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作者 Danièle Moes Sabrina Gatti +9 位作者 CEline Hoffmann Monika Dieterle Flora Moreau Katrin Neumann Marc Schumacher Marc Diederich Erwin Grill Wen-Hui Shen André Steinmetz Cldment Thomas 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2013年第2期483-502,共20页
The two LIM domain-containing proteins from plants (LIMs) typically exhibit a dual cytoplasmic-nuclear dis-tribution, suggesting that, in addition to their previously described roles in actin cytoskeleton organizati... The two LIM domain-containing proteins from plants (LIMs) typically exhibit a dual cytoplasmic-nuclear dis-tribution, suggesting that, in addition to their previously described roles in actin cytoskeleton organization, they partici-pate in nuclear processes. Using a south-western blot-based screen aimed at identifying factors that bind to plant histone gene promoters, we isolated a positive clone containing the tobacco LIM protein WLIM2 (NtWLIM2) cDNA. Using both green fluorescent protein (GFP) fusion-and immunology-based strategies, we provide clear evidence that NtWLIM2 local-izes to the actin cytoskeleton, the nucleus, and the nucleolus. Interestingly, the disruption of the actin cytoskeleton by latrunculin B significantly increases NtWLIM2 nuclear fraction, pinpointing a possible novel cytoskeletal-nuclear crosstalk. Biochemical and electron microscopy experiments reveal the ability of NtWLIM2 to directly bind to actin filaments and to crosslink the latter into thick actin bundles. Electrophoretic mobility shift assays show that NtWLIM2 specifically binds to the conserved octameric cis-elements (Oct) of the Arabidopsis histone H4A748 gene promoter and that this binding largely relies on both LIM domains. Importantly, reporter-based experiments conducted in Arabidopsis and tobacco proto-plasts confirm the ability of NtWLIM2 to bind to and activate the H4A748 gene promoter in live cells. Expression studies indicate the constitutive presence of NtWLIM2 mRNA and NtWLIM2 protein during tobacco BY-2 cell proliferation and cell cycle progression, suggesting a role of NtWLIM2 in the activation of basal histone gene expression. Interestingly, both live cell and in vitro data support NtWLIM2 di/oligomerization. We propose that NtWLIM2 functions as an actin-stabilizing protein, which, upon cytoskeleton remodeling, shuttles to the nucleus in order to modify gene expression. 展开更多
关键词 ACTIN BY-2 CYTOSKELETON DNA-BINDING histone genes LIM Nicotiana tabacum promoter regulation trans-acting factors.
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DNA序列进化过程中核苷酸替代的非独立性研究 被引量:3
5
作者 杨子恒 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1990年第5期354-359,共6页
本文评述了DNA序列间核苷酸替代数的估计方法,并通过对七个物种中组蛋白基因的比较对DNA进化的模型进行了考察。发现H2A基因第三位点上的碱基组成在物种间变异很大,并且跟H2A基因第一位点、H4基因第一、三位点及H2A上游,下游序列中的碱... 本文评述了DNA序列间核苷酸替代数的估计方法,并通过对七个物种中组蛋白基因的比较对DNA进化的模型进行了考察。发现H2A基因第三位点上的碱基组成在物种间变异很大,并且跟H2A基因第一位点、H4基因第一、三位点及H2A上游,下游序列中的碱基组成有强正相关,提示DNA序列进化过程中存在着物种特异的区域性约束力。可能的原因是高等真核生物中GC含量升高,或者是染色体重组使这些同源序列位于不同的等质区段,从而受到不同的选择突变压。密码内各位点上核苷酸替代的相关性分析表明不同位点的替代是非独立的,其原因可能是一次替代事件引起多个位点的变化。文中讨论了这些结果对进化树推断的意义。 展开更多
关键词 分子进化 核苷酸替代 DNA序列
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组蛋白甲基化修饰在小鼠早期胚胎发育中的建立与调控 被引量:1
6
作者 刘晓雨 高绍荣 《科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期26-32,共7页
组蛋白修饰作为重要的表观遗传修饰,在调控胚胎基因表达、胚胎细胞的命运决定及胚胎基因组的稳定性等方面均起了很重要的作用。微量测序技术的发展使从全基因组水平上检测植入前胚胎的组蛋白修饰成为可能。综述了近年来利用该技术对小... 组蛋白修饰作为重要的表观遗传修饰,在调控胚胎基因表达、胚胎细胞的命运决定及胚胎基因组的稳定性等方面均起了很重要的作用。微量测序技术的发展使从全基因组水平上检测植入前胚胎的组蛋白修饰成为可能。综述了近年来利用该技术对小鼠早期胚胎发育过程中的组蛋白甲基化修饰研究的最新进展,总结了在胚胎基因激活及第一次细胞分化过程中组蛋白H3K4me3和H3K27me3修饰不同的建立和动态变化趋势,这些研究为探索胚胎发育和细胞分化的表观调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 植入前胚胎 组蛋白修饰 二价基因 微量测序
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曲古抑菌素A对沙棘扦插苗响应干旱和复水及相关基因表达的影响
7
作者 李佳益 魏继华 +5 位作者 宋娅婷 陈宁 张国昀 罗红梅 刘湘杰 何彩云 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2023年第5期111-120,共10页
[目的]研究组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A(Trichostatin A,TSA)在20%聚乙二醇模拟干旱和干旱后复水条件下,对沙棘扦插苗叶片形态、光合指标、脯氨酸、丙二醛和脱落酸含量等生理特性和组蛋白去乙酰化酶、合成脱落酸和类黄酮相关基... [目的]研究组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A(Trichostatin A,TSA)在20%聚乙二醇模拟干旱和干旱后复水条件下,对沙棘扦插苗叶片形态、光合指标、脯氨酸、丙二醛和脱落酸含量等生理特性和组蛋白去乙酰化酶、合成脱落酸和类黄酮相关基因表达的影响。[方法]测定沙棘扦插苗干旱相关生理指标,实时定量PCR检测基因表达量。[结果]1μmol·L^(−1)TSA预处理的沙棘在同等干旱胁迫下耐旱性增强。与仅干旱处理相比,(1)叶片下垂和萎蔫程度降低,植株鲜质量下降程度更小,复水后植株恢复程度更大。(2)净光合速率、蒸腾速率、气孔导度、PSII最大光化学效率Fv/Fm值、PSII有效光化学量子产量Y(Ⅱ)值和叶绿素相对含量(SPAD)值均显著上调,复水后均下调。(3)脯氨酸和类黄酮含量显著上调,丙二醛和脱落酸含量显著下调,复水后趋势相同。(4)组蛋白去乙酰化酶基因HrHDA6和HrHDA19、脱落酸合成相关基因ABF1和NAC2表达均显著下调,类黄酮合成相关基因C4H2和CHS4表达均显著上调,复水后趋势相同。[结论]TSA通过调控沙棘扦插苗生理和基因表达参与对干旱胁迫的响应,可以提高沙棘的抗旱性,该研究为深入解析组蛋白乙酰化影响沙棘抗旱的调控机制奠定重要基础。 展开更多
关键词 沙棘 干旱胁迫 曲古抑菌素A 生理特性 组蛋白去乙酰化酶 基因表达
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小鼠不同细胞间表观遗传修饰的变化对Pdx-1基因转录表达的影响 被引量:1
8
作者 李明岳 余小舫 +2 位作者 鲍世韵 林宝行 王春友 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期786-790,共5页
目的:通过比较小鼠不同细胞类型之间Pdx-1基因转录起始区的表观遗传修饰差异,探讨表观遗传修饰对Pdx-1基因转录表达的作用。方法:采用免疫共沉淀-实时定量PCR法检测小鼠胚胎干细胞(mES)、小鼠成纤维细胞株NIH3T3细胞和小鼠β细胞株NIT-... 目的:通过比较小鼠不同细胞类型之间Pdx-1基因转录起始区的表观遗传修饰差异,探讨表观遗传修饰对Pdx-1基因转录表达的作用。方法:采用免疫共沉淀-实时定量PCR法检测小鼠胚胎干细胞(mES)、小鼠成纤维细胞株NIH3T3细胞和小鼠β细胞株NIT-1细胞Pdx-1和MLH1基因转录起始区DNA甲基化和组蛋白修饰(H3K4m3、H3K9m3和H3乙酰化)的状况。同时采用实时定量RT-PCR检测上述3种细胞各基因mRNA表达水平。分析基因的DNA甲基化水平、H3K4m3、H3K9m3和H3乙酰化修饰与基因表达之间的相互关系。结果:(1)以mES细胞为对照,NIT-1细胞的Pdx-1基因转录起始区呈低DNA甲基化和高H3K4m3修饰(P<0.05),NIH3T3细胞的Pdx-1基因的转录起始区的DNA甲基化、H3乙酰化、H3K4m3和H3K9m3修饰水平明显增高(P<0.05);(2)Pdx-1基因仅在NIT-1细胞表达,其表达与DNA甲基化存在等级负相关(r=-0.802,P<0.01),与H3K4m3修饰存在直线相关(r=0.997,P<0.01),与H3K9m3修饰存在等级负相关(r=-0.879,P<0.01);(3)管家基因MLH1的表达与所检测的表观遗传修饰无相关性。结论:DNA甲基化、H3K9m3与H3K4m3修饰能相互协调,共同调控Pdx-1基因的表达,对胚胎干细胞向β细胞分化具有重要意义。 展开更多
关键词 表观遗传修饰 DNA甲基化 组蛋白修饰 基因 Pdx-1
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酒精致小鼠胚胎心脏组蛋白H3K9高乙酰化失衡及其表突变 被引量:5
9
作者 潘博 孙慧超 +3 位作者 吕铁伟 吴晓云 朱静 田杰 《临床心血管病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期395-398,共4页
目的:揭示小鼠胚胎心脏发育过程中组蛋白H3K9乙酰化水平的时序性,阐明孕期饮酒对胚胎心脏组蛋白H3K9乙酰化及胚胎心脏发育相关基因表达的影响,并探讨其机制。方法:选择清洁级健康成年昆明小鼠60只,于孕期E7.5~E15.5连续予以10μl.g-1.... 目的:揭示小鼠胚胎心脏发育过程中组蛋白H3K9乙酰化水平的时序性,阐明孕期饮酒对胚胎心脏组蛋白H3K9乙酰化及胚胎心脏发育相关基因表达的影响,并探讨其机制。方法:选择清洁级健康成年昆明小鼠60只,于孕期E7.5~E15.5连续予以10μl.g-1.d-1、56%的饮用白酒连续灌胃作为酒精干预组,0.9%氯化钠溶液灌胃作为对照组。取E11.5、E14.5、E17.5孕鼠及新生小鼠心脏作为标本,利用Western blot观察正常小鼠胚胎心脏发育过程中组蛋白H3K9乙酰化水平的时序表达规律以及酒精干预后的变化;实时定量PCR检测心脏发育相关基因Mef2c和GATA4的mRNA表达。结果:小鼠胚胎心脏发育过程中,组蛋白H3K9乙酰化水平于发育早期(E11.5)开始升高,E17.5达到高峰,而新生时期降至较低水平;E17.5较E11.5和新生期均差异有统计学意义(均P<0.05)。酒精干预组E11.5、E14.5及E17.5的胚胎心脏组蛋白H3K9乙酰化水平较对照组分别升高2.35、1.47及1.56倍(均P<0.05)。同时,酒精干预组E14.5、E17.5的GATA4mRNA表达较对照组分别升高1.98、1.55倍(均P<0.05),而E14.5的Mef2cmRNA表达较对照组升高2.08倍(P<0.05)。结论:正常小鼠胚胎心脏发育过程中组蛋白H3K9乙酰化水平于早期开始升高,E17.5达到高峰,而新生时期下降至较低水平。孕期饮酒可导致胚胎心脏组蛋白H3K9高乙酰化失衡和心脏发育相关基因Mef2c、GATA4表达异常。 展开更多
关键词 心脏发育 酒精 组蛋白乙酰化 表突变 心脏发育相关基因
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非生物胁迫下植物组蛋白修饰参与基因表达调控的研究进展 被引量:4
10
作者 赵琳 王璞 +3 位作者 吴琦 宋瑞瑞 兰韬 云振宇 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期182-189,共8页
植物生长过程中不可避免的要面对不利的环境因素,它们已经进化出了灵活的基因表达重编程机制应对干旱、高盐、冷、热或洪涝等非生物环境胁迫。近年来,随着表观遗传学研究的不断深入,发现组蛋白翻译后修饰特性会受环境胁迫的影响而改变,... 植物生长过程中不可避免的要面对不利的环境因素,它们已经进化出了灵活的基因表达重编程机制应对干旱、高盐、冷、热或洪涝等非生物环境胁迫。近年来,随着表观遗传学研究的不断深入,发现组蛋白翻译后修饰特性会受环境胁迫的影响而改变,启动相关胁迫应答基因表达,或者充当胁迫应答转录因子的下游参与调控转录活动,组蛋白修饰已经被证实在植物逆境的响应过程中起着至关重要的作用。主要综述了非生物胁迫下植物组蛋白修饰参与基因转录应答的最新进展,以期为植物非生物胁迫耐受性的相关研究提供参考。 展开更多
关键词 组蛋白修饰 非生物胁迫 胁迫应答 基因表达调控
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The histone deacetylase inhibitor trichostatin A induces cell cycle arrest and rapid upregulation of gadd45β in LS174T human colon cancer cells
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作者 Tomoyuki Taniguchi Jun Iwashita +2 位作者 Jun Murata Kenji Ueda Tatsuya Abe 《Advances in Biological Chemistry》 2012年第1期43-50,共8页
Histone deacetylase (HDAC) inhibitors are considered as promising therapeutic agents against several malignant diseases because they inhibit cancer cell proliferation. The stress sensor genes of the growth arrest and ... Histone deacetylase (HDAC) inhibitors are considered as promising therapeutic agents against several malignant diseases because they inhibit cancer cell proliferation. The stress sensor genes of the growth arrest and DNA damage-inducible protein (gadd45) family exhibit disordered expression in several types of malignant diseases and are thus a novel target for cancer therapy. However, there have been only few investigations of whether HDAC inhibitors affect the expression of gadd45 genes. We examined the effects of a HDAC inhibitor, trichostatin A (TSA), on the time-dependent expression of gadd45 genes in the human colon cancer cell line LS174T. Addition of TSA to LS174T cells induced inhibition of cell proliferation by arresting the cell cycle. We found that TSA treatment of LS174T cells induced rapid upregulation of gadd45β mRNA expression within 15 min, reaching a peak level at 3 h. Although the time-dependent expression pattern of gadd45β mRNA was similar to that of gadd45β mRNA, the peak level of gadd45β was lower than that of gadd45β. TSA treatment also upregulated the mRNA level of p21Waf1/Cip1, a prolif- eration inhibitor, after 3 h, but downregulated the mRNA levels of cyclin D1, a proliferation inducer, after 3 h, and of c-Myc after 1 h. TSA treatment induced a certain level of apoptosis, but the mRNA level of p53, a potent apoptosis inducer, was down-regulated after 3 h. These results suggest that the up-regulation of p21Waf1/Cip1 and apoptosis was independent of p53 and that the early upregulation of gadd45β gene, which precedes the upregulation of p21Waf1/Cip1 and the downregulation of cyclin D1, are important in TSA-treated LS174T cells. 展开更多
关键词 histone DEACETYLASE Inhibitor GADD45 genes TRICHOSTATIN A LS174T Cells
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组蛋白去乙酰化酶在骨骼肌能量代谢调控中的潜在作用 被引量:2
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作者 尹苗苗 牛燕媚 傅力 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期189-192,共4页
T2DM等代谢性疾病的患病率逐年上升且出现发病年轻化的趋势,已成为现代社会人类健康的主要威胁,其发病机制之一是机体外周组织,特别是骨骼肌组织摄取葡萄糖功能受损引起的骨骼肌IR。最新研究显示,组蛋白去乙酰化酶(HDAC)在骨骼肌细胞代... T2DM等代谢性疾病的患病率逐年上升且出现发病年轻化的趋势,已成为现代社会人类健康的主要威胁,其发病机制之一是机体外周组织,特别是骨骼肌组织摄取葡萄糖功能受损引起的骨骼肌IR。最新研究显示,组蛋白去乙酰化酶(HDAC)在骨骼肌细胞代谢相关基因转录调控机制中发挥着重要作用,可为治疗代谢性疾病提供潜在药物作用靶点。 展开更多
关键词 组蛋白去乙酰化酶 胰岛素抵抗 骨骼肌代谢相关基因
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Scriptaid affects histone acetylation and the expression of development-related genes at different stages of porcine somatic cell nuclear transfer embryo during early development 被引量:1
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作者 ZHOU Yan HUANG YongYe +7 位作者 XIE WanHua SONG Qi JI Yuan ZHANG YanPing OUYANG HongSheng LAI LiangXue PANG DaXin TANG XiaoChun 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2013年第18期2044-2052,共9页
Although the somatic cell nuclear transfer(SCNT) technique has been used extensively for cloning and generating transgenic pigs,the cloning efficiency is still very low.It has been proposed that the low efficiency of ... Although the somatic cell nuclear transfer(SCNT) technique has been used extensively for cloning and generating transgenic pigs,the cloning efficiency is still very low.It has been proposed that the low efficiency of this technique is the result of incomplete epigenetic reprogramming and abnormal gene expression during early embryonic development.In this study,we investigate the effect of Scriptaid,a low-toxicity histone deacetylase inhibitor,on the developmental competence of porcine SCNT embryos.We found that treating SCNT embryos with 500 nmol/L Scriptaid for 15 h after activation significantly enhanced the blastocyst formation rate(27.7%) compared with the untreated group(control)(12.2%,P<0.05).Using an immunofluorescence technique to measure the average fluorescence intensity,we also found that treating SCNT embryos with Scriptaid increased the level of histone acetylation on histone H3 at lysine 14(acH3K14).Furthermore,treating embryos with Scriptaid increased the expression level of three genes that play important roles during embryonic development(Oct4,Klf4 at the blastocyst stage and Nanog at the 4-cell stage).Moreover,the expression level of the apoptosis-related gene Caspase-3 was significantly lower in the Scriptaid-treated SCNT embryos compared with the control SCNT embryos at the 4-cell and blastocyst stages.In conclusion,these results indicate that Scriptaid treatment improves the development and nuclear reprogramming of porcine SCNT embryos. 展开更多
关键词 体细胞核移植胚胎 组蛋白乙酰化 转基因猪 早期发育过程 免疫荧光技术 Caspase-3 细胞凋亡相关基因 克隆胚胎
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组蛋白修饰对酿酒酵母复制起始相关蛋白基因表达的调控 被引量:1
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作者 边金 郭艳飞 +2 位作者 张治 张淑慧 赵秀娟 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期2596-2602,共7页
真核生物的DNA复制是一个复杂且有序的过程,其中DNA复制起始参与调控众多生物学活动,对生物正常的生长发育具有重要作用。组蛋白修饰在调节DNA复制过程中具有重要作用。为了检测组蛋白特定位点的修饰对DNA复制起始的影响,本研究以酿酒... 真核生物的DNA复制是一个复杂且有序的过程,其中DNA复制起始参与调控众多生物学活动,对生物正常的生长发育具有重要作用。组蛋白修饰在调节DNA复制过程中具有重要作用。为了检测组蛋白特定位点的修饰对DNA复制起始的影响,本研究以酿酒酵母组蛋白H3/H4定点突变菌株为研究对象,采用倍比稀释表型分析法检测了组蛋白11种H3/H4甲基化、乙酰化突变菌株的生长情况,显示,以野生型菌株BY4741为对照,组蛋白H3/H4乙酰化突变菌株H3K64A、H3K56A、H3K14Q、H4K5R、H4K16Q以及组蛋白H4甲基化突变菌株H4K20Q表现为生长缺陷,其他菌株与BY4741生长情况基本一致;通过GeNorm和NormFinder软件分析得出本实验最适内参基因为β-actin;采用Real-time PCR检测了菌株细胞内复制起始相关蛋白基因mcm2、mcm10、cdc45的表达情况,表明,组蛋白H3/H4甲基化突变菌株H3K9A、H3R72K、H4K59A、H4K20Q胞内mcm2、mcm10、cdc45基因表达均显著下调(p<0.01),而H4R3A胞内mcm2、mcm10表达显著上调(p<0.05)、cdc45显著下调(p<0.01),组蛋白H3/H4乙酰化突变菌株H3K14Q、H4K5R、H4K8A、H4K16Q胞内mcm2表达显著下调(p<0.01),而在H3K64A、H3K56A胞内无显著变化,mcm10在6种组蛋白H3/H4乙酰化突变菌株内表达均下调(p<0.01),cdc45基因在H4K5R胞内表达无显著变化,在其余5种乙酰化突变菌株中表达均显著下调(p<0.01),为进一步阐明组蛋白特定位点修饰调控DNA复制起始的深入研究提供理论帮助。 展开更多
关键词 酿酒酵母组蛋白修饰 REAL-TIME PCR 复制起始相关蛋白 内参基因
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真菌核心组蛋白基因的分子特点与进化动力学模式
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作者 鞠建峰 赵国焓 许晓风 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期440-445,共6页
统计了不同真菌36个核心组蛋白基因的核苷酸组成与分布特点及密码子适应指数(CAI),分类计算了这些基因在种内及种间同义位点差异(pS)和非同义位点差异(pN)。结果发现:1)真菌H2A、H2B、H3、H4基因的平均GC%含量依次为:42.2、43.7、43.3和... 统计了不同真菌36个核心组蛋白基因的核苷酸组成与分布特点及密码子适应指数(CAI),分类计算了这些基因在种内及种间同义位点差异(pS)和非同义位点差异(pN)。结果发现:1)真菌H2A、H2B、H3、H4基因的平均GC%含量依次为:42.2、43.7、43.3和42.7,第3位密码子GC%含量依次为:34.7、42.6、32.0和30.9,平均CAI依次为:0.698、0.745、0.699和0.745;2)真菌4种组蛋白基因的pS和pN表现不同,其中H3和H4表现为pSpN,符合birth-and-death进化模式,H2A和H2B表现为pS≈pN,不符合birth-and-death进化模式;3)酵母的H2A和H2B甚至表现出了pN pS的情形,与协调进化相一致。真菌组蛋白基因的这些分子特点与进化动力学模式和其它生物组蛋白基因的明显不同。 展开更多
关键词 真菌组蛋白 分子进化 进化模式
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儿童H3 K27M突变型弥漫性中线胶质瘤治疗进展 被引量:1
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作者 罗敏捷 陈嘉志 张旺明 《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2020年第4期270-276,共7页
H3 K27M突变型弥漫性中线胶质瘤是好发于儿童的高级别胶质瘤,恶性程度高、预后极差,中位生存期不足1年,目前尚无标准治疗方案,手术切除和常规放化疗难以改善预后。随着近年立体定向肿瘤组织活检术的开展,肿瘤组织独特的生物学特性逐渐... H3 K27M突变型弥漫性中线胶质瘤是好发于儿童的高级别胶质瘤,恶性程度高、预后极差,中位生存期不足1年,目前尚无标准治疗方案,手术切除和常规放化疗难以改善预后。随着近年立体定向肿瘤组织活检术的开展,肿瘤组织独特的生物学特性逐渐得到澄清,新的靶向治疗方法如靶向化疗、对流增强给药、表观遗传学治疗、嵌合抗原受体T细胞治疗逐渐应用于临床试验。本文拟综述H3 K27M突变型弥漫性中线胶质瘤相关最新治疗研究进展并探讨下一步治疗目标。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 组蛋白类 儿童 基因 突变 化放疗 综述
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