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3D reconstruction and capsid protein characterization of grass carp reovirus 被引量:35
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作者 Shah Sanket 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2005年第6期593-600,共8页
Grass carp reovirus (GCRV) is a relatively new virus first isolated in China and is a member of the Aquareovirus genus of the Reoviridae family. Recent report of genomic se-quencing showed that GCRV shared high degree... Grass carp reovirus (GCRV) is a relatively new virus first isolated in China and is a member of the Aquareovirus genus of the Reoviridae family. Recent report of genomic se-quencing showed that GCRV shared high degree of homology with mammalian reovirus (MRV). As a step of our effort to understand the structural basis of GCRV pathogenesis, we determined the three-dimensional (3D) structure of GCRV capsid at 17 ? resolution by electron cryomicro-scopy. Each GCRV capsid has a multilayered organization, consisting of an RNA core, an inner, middle and outer protein layer. The outer layer is made up of 200 trimers that are arranged on an incomplete T=13 icosahedral lattice. A characteristic feature of this layer is the depression re-sulting from the absence of trimers around the peripentonal positions, revealing the underlying trimers on the middle layer. There are 120 subunits in the inner layer arranged with T=1 symme-try. These structural features are common to other members of the Reoviridae. Moreover, SDS-PAGE analysis showed that GCRV virions contain seven structural proteins (VP1-VP7). These structural proteins have a high degree of sequence homology to MRV, consistent with the structural similarities observed in our study. The high structural similarities of isolated GCRV and MRV suggest that future structural studies focusing on GCRV entering into and replicating within its host cell are necessary in order to fully understand the structural basis of GCRV pathogenesis. 展开更多
关键词 grass carp reovirus (gcrv) ELECTRON cryomicroscopy three-dimensional structure CAPSID protein.
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四株草鱼呼肠孤病毒毒株的细胞感染特性比较研究 被引量:14
2
作者 方勤 肖调义 +3 位作者 李旅 邹桂平 章怀云 汪亚平 《中国病毒学》 CSCD 2002年第2期182-184,共3页
本文首次对低温保存的三株草鱼呼肠孤病毒GCRV873 、GCRV875、GCRV876与新分离的GCRV991毒株进行了细胞培养与病毒感染特性等比较研究。结果表明 ,GCRV873 、GCRV875、GCRV876在 - 30℃保存 10年后仍然具有一定的感染性 ,其滴度均在 10 ... 本文首次对低温保存的三株草鱼呼肠孤病毒GCRV873 、GCRV875、GCRV876与新分离的GCRV991毒株进行了细胞培养与病毒感染特性等比较研究。结果表明 ,GCRV873 、GCRV875、GCRV876在 - 30℃保存 10年后仍然具有一定的感染性 ,其滴度均在 10 2 TCID50 /mL以上 ,略低于从病鱼组织分离的GCRV991毒株的滴价。经传代培养后 ,四株GCRV的毒力逐渐升高 ,并趋于稳定 ;当感染复数 (MOI)为 0 .0 5PFU/cell时 ,测定四株GCRV的滴度均高于 10 8TCID50 /mL ,但略有差异。GCRV873 的滴度最高 ,可达到 6 .4× 10 11TCID50 /mL。连续传代的GCRV毒株在不同温度 (2 8℃、31℃、34℃、37℃、41℃ )条件下 ,均可感染CIK细胞 ;在 2 8℃时 ,感染效价最高 ,随着温度的升高 。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒毒株 细胞感染特性 比较研究
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草鱼呼肠孤病毒在CIK细胞中复制及形态发生的研究 被引量:18
3
作者 邹桂平 方勤 《中国病毒学》 CSCD 2000年第2期188-192,共5页
以草鱼呼肠孤病毒 (GCRV)感染的草鱼肾细胞系 (CIK)为模型 ,进行了草鱼呼肠孤病毒在细胞内的形态发生的研究。当病毒以感染复数为 5~ 10PFU/CELL感染CIK细胞时 ,在病毒感染细胞 4h以内的切片中 ,可观察到脱去部分外层衣壳的不完整病毒... 以草鱼呼肠孤病毒 (GCRV)感染的草鱼肾细胞系 (CIK)为模型 ,进行了草鱼呼肠孤病毒在细胞内的形态发生的研究。当病毒以感染复数为 5~ 10PFU/CELL感染CIK细胞时 ,在病毒感染细胞 4h以内的切片中 ,可观察到脱去部分外层衣壳的不完整病毒颗粒。感染细胞 8h ,可观察到浆胞内病毒发生基质 ,其内含有大量的直径约 5 0nm的亚病毒颗粒 ,无外层蛋白结构。感染 12~ 16h后 ,这些亚病毒颗粒装配上外层蛋白结构 ,形成直径为 72nm左右的成熟的病毒粒子。病毒感染细胞 8h后 ,开始出现典型的病毒包含体 ,16~ 2 0h小时病毒包含体裂解 ,继而释放出有感染性的子代病毒颗粒。 展开更多
关键词 gcrv CIK 致病机理 鱼类病毒 形态发生
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草鱼呼肠孤病毒TaqManreal-time PCR检测方法的建立 被引量:15
4
作者 周勇 曾令兵 +4 位作者 范玉顶 徐进 马杰 罗晓松 肖艺 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期774-779,共6页
利用RT-PCR技术扩增出草鱼呼肠孤病毒(GCRV)VP6蛋白编码区长度为1 250 bp的片段,克隆到pEGFP-N1载体上,构建重组质粒pEGFP-N1-VP6。经PCR鉴定确认正确后,以10倍梯度稀释pEGFP-N1-VP6重组质粒,作为标准模板进行TaqMan real-time PCR扩增... 利用RT-PCR技术扩增出草鱼呼肠孤病毒(GCRV)VP6蛋白编码区长度为1 250 bp的片段,克隆到pEGFP-N1载体上,构建重组质粒pEGFP-N1-VP6。经PCR鉴定确认正确后,以10倍梯度稀释pEGFP-N1-VP6重组质粒,作为标准模板进行TaqMan real-time PCR扩增,制作标准曲线,建立了草鱼呼肠孤病毒的荧光定量PCR检测方法。检测结果显示,标准曲线的相关系数(R2)达到0.998 09,斜率为-3.373;对初始模板定量检测的范围为1×101~1×106copies/μL;特异性试验结果表明,该方法可特异性地检测出草鱼呼肠孤病毒,而对鲤春病毒血症病毒(SVCV)、传染性造血器官坏死症病毒(IHNV)无检测信号。本研究建立的草鱼呼肠孤病毒TaqMan real-time PCR方法灵敏度高、特异性强,可进行定量分析,对草鱼出血病快速诊断与病毒病原定量检测有重要意义。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 VP6蛋白编码基因 TaqManreal-timePCR 检测
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Construction and Co-expression of Grass Carp Reovirus VP6 Protein and Enhanced Green Fluorescence Protein in the Insect Cells 被引量:13
5
作者 Qin FANG Eng Khuan Seng +1 位作者 Wen DAI Lan-lan ZHANG 《中国病毒学》 CSCD 2007年第5期397-404,共8页
Grass carp reovirus(GCRV),a disaster agent to aquatic animals,belongs to Genus Aquareovirus of family Reoviridea.Sequence analysis revealed GCRV genome segment 8(s8) was 1 296 bp nucleotides in length encoding an inne... Grass carp reovirus(GCRV),a disaster agent to aquatic animals,belongs to Genus Aquareovirus of family Reoviridea.Sequence analysis revealed GCRV genome segment 8(s8) was 1 296 bp nucleotides in length encoding an inner capsid protein VP6 of about 43kDa.To obtain in vitro non-fusion expression of a GCRV VP6 protein containing a molecular of fluorescence reporter,the recombinant baculovirus,which contained the GCRVs8 and eGFP(enhanced green fluorescence protein) genes,was constructed by using the Bac-to-Bac insect expression system.In this study,the whole GCRVs8 and eGFP genes,amplified by PCR,were constructed into a pFastBacDual vector under polyhedron(PH) and p10 promoters,respectively.The constructed dual recombinant plasmid(pFbDGCRVs8/eGFP) was transformed into DH10Bac cells to obtain recombinant Bacmid(AcGCRVs8/eGFP) by transposition.Finally,the recombinant bacluovirus(vAcGCRVs8/eGFP) was obtained from transfected Sf9 insect cells.The green fluorescence that was expressed by transfected Sf9 cells was initially observed 3 days post transfection,and gradually enhanced and extended around 5 days culture in P1(Passage1) stock.The stable high level expression of recombinant protein was observed in P2 and subsequent passage budding virus(BV) stock.Additionally,PCR amplification from P1 and amplified P2 BV stock further confirmed the validity of the dual-recombinant baculovirus.Our results provide a foundation for expression and assembly of the GCRV structural protein in vitro. 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 VP6蛋白 增强绿色荧光蛋白 杆状病毒表达系统 共表达
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两株水生呼肠孤病毒部分特性的比较 被引量:7
6
作者 方勤 丁清泉 +1 位作者 汪亚平 朱作言 《中国病毒学》 CSCD 2003年第5期464-467,共4页
水生呼肠孤病毒为感染水生动物的一类病原体,隶属于呼肠孤病毒科新建水生呼肠孤病毒属。草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)是引起中国南方淡水养殖草鱼暴发性出血病病原,鲅鱼呼肠孤病毒(Threadfin reovirus,TFV)是引起海水养殖... 水生呼肠孤病毒为感染水生动物的一类病原体,隶属于呼肠孤病毒科新建水生呼肠孤病毒属。草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)是引起中国南方淡水养殖草鱼暴发性出血病病原,鲅鱼呼肠孤病毒(Threadfin reovirus,TFV)是引起海水养殖鲅鱼病毒病病原。本研究将GCRV与新加坡TFV分离株进行了部分特性比较研究。结果表明,GCRV与TFV均能感染CIK细胞,但对其它鱼类细胞系的敏感性有所差异。此外,凝胶电泳与逆转录聚合酶链式扩增显示,GCRV与TFV核酸属不同的基因型。在多肽特性上,证实了GCRV的5条主要结构多肽具有与FTV及水生呼肠孤病毒相似的特性。Western blot检测显示,草鱼呼肠孤病毒与TFV结构蛋白拥有部分相同的抗原决定簇。 展开更多
关键词 水生呼肠孤病毒 草鱼呼肠孤病毒 鲅鱼呼肠孤病毒 特性
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草鱼呼肠孤病毒(GCRV)部分基因片段cDNA文库的构建 被引量:7
7
作者 方勤 田静 《中国病毒学》 CSCD 2000年第1期78-82,共5页
在随机六聚体引物浓度不变条件下 ,分别采用 0 .5、2、5μg草鱼呼肠孤病毒 (GCRV)单一片段RNA进行反转录cDNA合成及文库构建。结果表明 ,在GCRV RNA模板浓度大于 2 μg时 ,第二链cDNA合成产物可直接通过EB染色的琼脂糖凝胶电泳进行定量... 在随机六聚体引物浓度不变条件下 ,分别采用 0 .5、2、5μg草鱼呼肠孤病毒 (GCRV)单一片段RNA进行反转录cDNA合成及文库构建。结果表明 ,在GCRV RNA模板浓度大于 2 μg时 ,第二链cDNA合成产物可直接通过EB染色的琼脂糖凝胶电泳进行定量及鉴定。选择cDNA与载体连接比率为 5∶1,在高效电转化条件下 ,可获得 10 6 转化子 /μgcDNA的转化效率。阳性克隆子经酶切及PCR鉴定 ,约 4 5%以上的插入片段大于 50 0bp。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 双链RNA CDNA文库
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草鱼呼肠孤病毒RNA聚合酶基因功能区在原核细胞中的表达 被引量:6
8
作者 方勤 朱作言 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期86-88,共3页
An about 1.5kb functional domain sequence of GCRV-RdRp gene was obtained by using RT-PCR amplification.The amplified fragment was cloned into T7 promoted prokaryotic expression system pRSET-C vector and then was trans... An about 1.5kb functional domain sequence of GCRV-RdRp gene was obtained by using RT-PCR amplification.The amplified fragment was cloned into T7 promoted prokaryotic expression system pRSET-C vector and then was transformed into CaCl 2 treated TOP10F’and BL21(DE3)pLysS competent cells respectively.The recombinants were detected with restriction enzyme digestion and further confirmed the interest insert by sequencing pRSET-C/GCRV-RdRp plasmid,which was in frame with the N-terminal tag and in the proper orientation.SDS-PAGE revealed that the highly expressed fusion protein is produced by inducing with l nm IPTG,and its molecular weight is around 55kD,which is the right size corresponding to the predicted value.It indicated the fused protein was produced in the form of inclusion body with its yield remained steadly more than 60% of total bacterial protein. It also showed that the expressed protein was able to bind immunologically to rabbit anti-GCRV-VP2 serum. 展开更多
关键词 草鱼 呼肠孤病毒 RNA聚合酶 基因表达 原核细胞
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微载体规模化培养草鱼细胞与病毒的工艺及优化 被引量:6
9
作者 刘秋凤 曾令兵 +4 位作者 周勇 马杰 范玉顶 张辉 李瑞伟 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2013年第4期69-75,共7页
研究了在悬浮培养系统中使用微载体Cephodex规模化培养草鱼肾脏组织细胞CIK和草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的条件并进行了优化。结果表明,Cephodex是一种适合CIK细胞贴壁生长的微载体,搅拌方式(搅拌时间/静止时间)及血清浓度(0%、5%、10%、15%)... 研究了在悬浮培养系统中使用微载体Cephodex规模化培养草鱼肾脏组织细胞CIK和草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的条件并进行了优化。结果表明,Cephodex是一种适合CIK细胞贴壁生长的微载体,搅拌方式(搅拌时间/静止时间)及血清浓度(0%、5%、10%、15%)对CIK细胞在Cephodex微载体上的贴附效率有影响。贴附期以转速35 r/min、每静置45 min搅拌2 min的间歇搅拌方式最佳,8 h后细胞贴附率可达90%以上;细胞贴附期培养基中的血清浓度为5%。当Cephodex微载体用量10 mg/mL、细胞初始接种密度2.5×105cells/mL、连续搅拌速度40 r/min时可获得最佳的细胞生长效能。用优化的最佳工艺条件大规模培养CIK细胞,接种感染复数为0.1的GCRV病毒3 d后,培养细胞出现典型细胞病变效应,病毒滴度(lgTCID50/mL)为8.5。本项研究为草鱼出血病疫苗规模化制备技术研究奠定了基础。 展开更多
关键词 草鱼肾脏组织细胞系(CIK) 草鱼呼肠孤病毒(gcrv 微载体 大规模培养 工艺与优化
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草鱼呼肠孤病毒vp5基因诱饵重组载体的构建、转化与自激活作用检测 被引量:7
10
作者 谢吉国 闫秀英 +1 位作者 简纪常 吴灶和 《广东海洋大学学报》 CAS 2012年第3期42-48,共7页
根据草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)的vp5基因设计特异性引物,并扩增其开放阅读框序列(open reading frame,ORF),然后连接至pGBKT7载体上构建酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-vp5,转化至酵母菌Y2HGold,并进行PCR鉴定以及自激活性... 根据草鱼呼肠孤病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)的vp5基因设计特异性引物,并扩增其开放阅读框序列(open reading frame,ORF),然后连接至pGBKT7载体上构建酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-vp5,转化至酵母菌Y2HGold,并进行PCR鉴定以及自激活性和毒性检测。PCR、酶切以及测序表明,pGBKT7-vp5重组诱饵载体构建成功。自激活性和毒性检测显示,阳性重组菌株pGBKT7-vp5/Y2HGold和阴性对照菌株pGBKT7/Y2HGold在SD/-Trp平板上出现大小相一致的乳白色菌落,且在SD/-Trp/X-α-Gel、SD/-Trp/AbA+/X-α-Gel平板上生长出蓝色菌落,而在SD/-Trp/-Ade/-His无菌落出现。表明重组菌株pGBKT7-vp5/Y2HGold表达的融合蛋白激活了报告基因AUR1-C和MEL1,没有激活报告基因ADE2和HIS3并且对宿主菌无毒性。该重组诱饵载体可用于酵母双杂交系统进一步筛选cDNA文库中与其相互作用的蛋白。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 酵母双杂交系统 诱饵载体 自激活性
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化学合成小干扰RNA分子高效抑制草鱼呼肠孤病毒复制 被引量:7
11
作者 李兵 范玉顶 +3 位作者 李艳秋 徐进 周勇 曾令兵 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期388-394,共7页
采用化学合成法分别合成靶向草鱼呼肠孤病毒(GCRV)RNA基因组节段L2片段上的RNA聚合酶基因(RdRp)和S4片段上的外衣壳蛋白基因(OCP)的小干扰RNA分子siRNA-RdRp1 286、siRNA-RdRp1 441和siRNA-OCP117,脂质体转染法转染草鱼肾脏组织细胞系CI... 采用化学合成法分别合成靶向草鱼呼肠孤病毒(GCRV)RNA基因组节段L2片段上的RNA聚合酶基因(RdRp)和S4片段上的外衣壳蛋白基因(OCP)的小干扰RNA分子siRNA-RdRp1 286、siRNA-RdRp1 441和siRNA-OCP117,脂质体转染法转染草鱼肾脏组织细胞系CIK。转染6 h后用草鱼呼肠孤病毒感染细胞,48 h后收集感染细胞的培养液,微量培养法测定病毒lgTCID50/0.1mL值。以细胞管家基因-βactin mRNA水平为参照,RT-PCR法检测呼肠孤病毒siRNAs靶基因的mRNA水平。病毒滴度测定结果表明:转染siRNA-RdRp1 286、siRNA-RdRp1 441和siRNA-OCP117三种siRNAs的病毒滴度lgTCID50/0.1 mL分别为4.41±0.16、3.83±0.44和1.94±0.42,极显著低于阳性感染对照组的病毒滴度(7.92±0.52,P<0.01),转染siRNA阴性对照组的病毒滴度无明显变化(7.50±0.17,P>0.05)。RT-PCR检测结果显示:与阳性感染对照组比较,转染siRNA-RdRp1286、siRNA-RdRp1 441和siRNA-OCP117后的CIK细胞中GCRV mRNA水平显著下降,抑制率分别为82.08±2.15%、89.19±1.14%和92.62±0.17%,而转染阴性对照组对GCRV mRNA水平没有显著的影响(P>0.05)。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 RNA干扰 复制 抑制
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抗草鱼出血病病毒转基因稀有鮈鲫的初步研究 被引量:7
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作者 廖莎 陈芸 +3 位作者 杜富宽 汪亚平 廖兰杰 朱作言 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期837-842,共6页
研究采用草鱼H1基因启动子,以草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)外衣壳蛋白VP7基因为靶基因,以增强型绿色荧光蛋白(eGFP)为报告基因,构建了3个小发卡RNA(shRNA)表达载体pH1siGCRV(x)-CMVeGFP。CIK细胞感染实验表明,pH1siGCRV2-C... 研究采用草鱼H1基因启动子,以草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)外衣壳蛋白VP7基因为靶基因,以增强型绿色荧光蛋白(eGFP)为报告基因,构建了3个小发卡RNA(shRNA)表达载体pH1siGCRV(x)-CMVeGFP。CIK细胞感染实验表明,pH1siGCRV2-CMVeGFP具有较高的病毒抑制作用。通过显微注射将pH1siGCRV2-CMVeGFP导入稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)受精卵,获得转基因稀有鮈鲫P0代群体。转基因稀有鮈鲫攻毒实验显示,转基因稀有鮈鲫死亡率为30%,抗草鱼出血病能力显著提高。进一步的实时荧光定量PCR检测证实,转基因稀有鮈鲫脾脏、后肠和肝脏中GCRV的含量显著低于对照鱼,并随着时间的延续逐渐减少,转基因稀有鮈鲫体内GCRV的复制受到有效抑制。研究为抗草鱼出血病转基因鱼育种奠定重要基础。 展开更多
关键词 RNA干扰 小发夹RNA 草鱼出血病病毒 转基因鱼
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Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒在稀有鮈鲫中的传播途径
13
作者 倪秦伟 孙阳 +1 位作者 刘林怡 吕利群 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期139-148,共10页
为了研究Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒(GCRV-Ⅱ)的流行规律,本实验基于稀有鮈鲫感染GCRV-JX02的研究模型,利用分子生物学检测、逆转录实时定量聚合酶链式反应(RTqPCR)等方法开展GCRV-Ⅱ水平和垂直传播的研究。结果显示,水平传播中浸泡感染和共培... 为了研究Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒(GCRV-Ⅱ)的流行规律,本实验基于稀有鮈鲫感染GCRV-JX02的研究模型,利用分子生物学检测、逆转录实时定量聚合酶链式反应(RTqPCR)等方法开展GCRV-Ⅱ水平和垂直传播的研究。结果显示,水平传播中浸泡感染和共培养感染都能使稀有鮈鲫成为GCRV-Ⅱ的无症状携带者,阳性检出率分别为50%和80%;其中共培养感染直接导致8%的稀有鮈鲫死亡。感染后无症状的稀有鮈鲫经热休克处理,浸泡感染与共培养感染组的死亡率分别为57.14%和100%,总体阳性检出率分别为80.95%和100%。腹腔注射感染GCRV-JX02后存活的无症状稀有鮈鲫每0.01 g精巢与卵巢中病毒拷贝数分别为3.64×10^(6)和6.84×10^(6)个。垂直传播实验中稀有鮈鲫单个的卵子、未受精卵、受精卵和幼鱼的平均病毒拷贝数为1.98×10^(3)、1.15×10^(4)、4.75×10^(3)和6.74×10^(4)个,幼鱼中病毒的拷贝数显著高于卵子与受精卵时期,表明GCRV-JX02不仅能够在稀有鮈鲫中垂直传播,还能伴随幼鱼的发育不断扩增。本研究阐明了不同传播途径下GCRV-Ⅱ的传播潜力,有助于评估草鱼出血病的流行风险,且为筛选阻断草鱼呼肠孤病毒传播的药物提供了有效的动物模型。 展开更多
关键词 稀有鮈鲫 草鱼呼肠孤病毒 水平传播 垂直传播 热休克处理
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草鱼出血病分子流行病学及GCRV多样性研究 被引量:5
14
作者 黄毅昌 雷燕 +3 位作者 杨玉滔 闫秀英 简纪常 吴灶和 《安徽农业科学》 CAS 2016年第11期120-125,153,共7页
[目的]分析不同基因型GCRV分离株与患草鱼出血病草鱼症状的相关性。[方法]采用RT-PCR检测患病草鱼,应用生物信息学方法分析基因型内和基因型间不同分离株间的差异。[结果]对近3年来草鱼出血病分子流行病学分析发现,患草鱼出血病病鱼多为... [目的]分析不同基因型GCRV分离株与患草鱼出血病草鱼症状的相关性。[方法]采用RT-PCR检测患病草鱼,应用生物信息学方法分析基因型内和基因型间不同分离株间的差异。[结果]对近3年来草鱼出血病分子流行病学分析发现,患草鱼出血病病鱼多为"肠炎型"症状,且检测发现其病原多属于GCRV基因型Ⅲ型。对GCRV的多样性分析表明,不同分离株同源蛋白的同源率高达93%以上,却被给予完全不同的名称,给GCRV多样性研究带来一定的困难;同一基因型不同分离株同源蛋白间的变异位点较少,且功能位点发生变异的更少;不同基因型不同分离株同源蛋白间的保守位点较少,且这些保守位点中只有极少数位点为功能位点;不同基因型分离株同源结构蛋白间存在较大的差异,且同源非结构蛋白间的差异更为显著。[结论]草鱼出血病不同临床症状可能与其病原基因型不同有关。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 草鱼出血病 分子流行病学 多样性
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基因Ⅰ型草鱼呼肠孤病毒TaqMan Real-Time PCR检测方法的建立及应用 被引量:5
15
作者 殷亮 王庆 +6 位作者 曾伟伟 李永刚 王英英 刘春 梁红茹 石存斌 吴淑勤 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期570-576,共7页
为了建立和应用可检测基因I型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的荧光定量检测方法,实验根据基因I型GCRV的s6保守序列,分别设计扩增目的条带661bp普通引物(P1、P2)、扩增目的条带159bp荧光定量引物(F1、F2)和一条探针;同时构建含有目的片... 为了建立和应用可检测基因I型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的荧光定量检测方法,实验根据基因I型GCRV的s6保守序列,分别设计扩增目的条带661bp普通引物(P1、P2)、扩增目的条带159bp荧光定量引物(F1、F2)和一条探针;同时构建含有目的片段的PVAX1-S6作为标准质粒,10倍梯度稀释构建质粒拷贝数与Ct值的标准曲线(Y=-3.389X+38.076)。结果表明,此方法在3.9×10^7~3.9×10^1拷贝/uL之间相关性较好,R2为0.992,最小检测量为4拷贝/uL;且与基因Ⅱ型、Ⅲ型GCRV以及其他病原核酸无交叉反应。运用该方法检测16份草鱼出血病疑似样品,阳性结果为4份;而普通PCR检测仅2份显示阳性。本研究建立了针对基因I型GCRV的荧光定量检测方法,具有高效、特异、灵敏、可重复性强的优点,适合于目前基因I型GCRV的临床快速检测和病毒定量分析。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 基因I型 TAQMAN Real—Time PCR 定量分析
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环介导等温扩增联合横向流动试纸条检测草鱼呼肠孤病毒方法的建立 被引量:5
16
作者 刘露 李伟哲 肖勤 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期99-104,共6页
将环介导等温扩增技术(LAMP)与横向流动试纸条(LFD)联合建立一种快速检测草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的LAMP-LFD检测方法,并与实时荧光定量PCR(qPCR)技术进行对比。以GCRV S8片段为检测靶标,设计6条特异性引物(FIP/BIP,F3/B3,LF/LB),其中上游... 将环介导等温扩增技术(LAMP)与横向流动试纸条(LFD)联合建立一种快速检测草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的LAMP-LFD检测方法,并与实时荧光定量PCR(qPCR)技术进行对比。以GCRV S8片段为检测靶标,设计6条特异性引物(FIP/BIP,F3/B3,LF/LB),其中上游引物FIP以生物素(Biotin,BIO)标记,进行LAMP反应条件优化,同时设计1条羟基荧光素(Fluorescein amidite,FAM)标记的探针,用于LAMP反应产物的LFD检测。结果表明:LAMP最佳反应温度为63℃,反应时间40min。从LAMP扩增到LFD结果判读共需50min,比qPCR检测缩短近1h。LAMP-LFD与qPCR均可特异性检出GCRV,针对同一重组质粒的检测,LAMP-LFD的检测限为970fg,qPCR的检测限为97fg,虽然LAMP-LFD的检测灵敏度低于qPCR 10倍,但该方法操作简单,仪器设备依赖性低,可快速、特异地检测出GCRV,有望成为GCRV现场快速检测的常规技术手段。 展开更多
关键词 横向流动试纸条 环介导等温扩增技术 草鱼呼肠孤病毒 实时荧光定量PCR
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体外抗草鱼呼肠孤病毒药物筛选细胞模型的建立 被引量:4
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作者 安伟 曾令兵 +3 位作者 周勇 徐进 范玉顶 肖艺 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期972-978,共7页
以草鱼肾细胞系(CIK)和草鱼呼肠孤病毒为材料,采用噻唑蓝比色法分先给药后感染、先感染后给药、药物与病毒共孵育后感染3组进行抗草鱼呼肠孤病毒药物的筛选,建立了体外抗草鱼呼肠孤病毒药物筛选的细胞模型。先给药后感染试验组的结果表... 以草鱼肾细胞系(CIK)和草鱼呼肠孤病毒为材料,采用噻唑蓝比色法分先给药后感染、先感染后给药、药物与病毒共孵育后感染3组进行抗草鱼呼肠孤病毒药物的筛选,建立了体外抗草鱼呼肠孤病毒药物筛选的细胞模型。先给药后感染试验组的结果表明,穿琥宁在阻断草鱼呼肠孤病毒吸附和侵入细胞时效果最强,其次是利巴韦林和板蓝根,黄芩的阻断效果最弱;而在先感染后给药试验组中,穿琥宁、利巴韦林和黄芩抑制草鱼呼肠孤病毒增殖的作用显著,板蓝根抑制病毒增殖的作用不明显;在药物与病毒共孵育后感染试验组中,利巴韦林对草鱼呼肠孤病毒有一定的直接杀灭作用,黄芩、板蓝根和穿琥宁等的体外杀病毒效果不明显。该模型的建立确认了药物在CIK细胞上具有抑制草鱼呼肠孤病毒的作用,不同给药方式药物的作用效果不同,也为抗病毒药物的筛选提供了有效的技术平台。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒 CIK细胞 药物筛选 抗病毒 噻唑蓝
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基因Ⅰ型草鱼呼肠孤病毒VP7蛋白合成肽抗体的制备及应用 被引量:4
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作者 刘世旭 王庆 +3 位作者 常藕琴 周文礼 曾伟伟 王英英 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1849-1857,共9页
【目的】制备基因I型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)VP7蛋白合成肽抗体并验证其特异性,为研究VP7外衣壳蛋白在基因I型GCRV病毒与宿主间的相互作用及研制基因工程疫苗提供参考依据。【方法】以GCRV GZ1208株为模板进行RT-PCR扩增,运用在线生物信... 【目的】制备基因I型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)VP7蛋白合成肽抗体并验证其特异性,为研究VP7外衣壳蛋白在基因I型GCRV病毒与宿主间的相互作用及研制基因工程疫苗提供参考依据。【方法】以GCRV GZ1208株为模板进行RT-PCR扩增,运用在线生物信息学分析软件对VP7蛋白B细胞表位进行功能预测,选择位于VP7蛋白第26~39位氨基酸的多肽序列进行人工合成,与钥孔血蓝蛋白载体蛋白偶联后免疫新西兰白兔以获得VP7蛋白合成肽抗体,然后采用Western blotting和间接免疫荧光试验验证VP7蛋白合成肽抗体对基因I型GCRV的特异性识别能力。【结果】VP7蛋白氨基酸序列在基因I型GCRV中高度保守,其合成肽抗体效价约1∶256000。Western blotting分析结果显示,融合蛋白VP7约在55 kD处出现单一的特异性条带,而GZ1208株和JX0901株样品约在30 kD处出现对应的特异性条带,与预期结果基本一致;间接免疫荧光试验结果表明,VP7蛋白合成肽抗体可特异性识别感染基因I型GCRV的草鱼脑细胞(GCB),感染细胞中出现特异性绿色荧光信号,而感染其他基因型GCRV及正常未感染病毒的GCB细胞中均无特异性绿色荧光出现。【结论】制备获得的VP7蛋白合成肽抗体能特异性识别基因I型GCRV,而不识别其他基因型毒株,可用于草鱼出血病的临床诊断和基因I型GCRV的病原学研究。 展开更多
关键词 草鱼呼肠孤病毒(gcrv) 基因I型 VP7蛋白 原核表达 合成肽抗体
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表没食子儿茶素没食子酸酯衍生物及过硫酸氢钾复合物粉体外抑制Ⅰ型草鱼呼肠孤病毒的研究
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作者 徐伟 闻金萱 +2 位作者 李鹏飞 吕利群 王浩 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1432-1446,共15页
【目的】为了将表没食子儿茶素没食子酸酯(epigallocatechin gallate, EGCG)的2种衍生物和过硫酸氢钾复合物粉(compound potassium peroxymonosulfate powder, KMPS)运用于体外细胞实验中,以评估这3种药物对I型草鱼呼肠孤病毒(grass car... 【目的】为了将表没食子儿茶素没食子酸酯(epigallocatechin gallate, EGCG)的2种衍生物和过硫酸氢钾复合物粉(compound potassium peroxymonosulfate powder, KMPS)运用于体外细胞实验中,以评估这3种药物对I型草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus, GCRV)的抑制和杀灭效果。【方法】利用MUSE法和CCK-8法评估表没食子儿茶素没食子酸酯棕榈酸酯(epigallocatechin gallate palmitate,EGCG-P)、乙酰化表没食子儿茶素没食子酸酯(peracetylated epigallocatechin gallate, Ac EGCG)和过硫酸氢钾复合物粉3种药物对细胞的安全浓度,利用体外细胞感染病毒模型,使用不同浓度测试物处理病毒或细胞后感染病毒,通过实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, q RT-PCR)法分析不同测试物对病毒的抑制和杀灭效果。使用不同浓度测试物处理细胞后,利用q RT-PCR法检测宿主免疫相关基因变化情况。【结果】EGCG-P和Ac EGCG对GCRV-JX01感染细胞的抑制作用呈剂量依赖性,且EGCG-P的抑制效果优于Ac EGCG,EGCG-P浓度为10μg/m L和40μg/m L时病毒量相对于对照组上清中病毒的滴度分别降低了102 copies/μL和103 copies/μL,而Ac EGCG浓度为60μg/m L和120μg/m L时才能达到相同抑制效果。杀灭实验结果表明,EGCG-P、Ac EGCG和KMPS对GCRV-I毒株均有杀灭效果,最低有效杀灭剂量KMPS (5μg/m L)<EGCG-P (120μg/m L)<Ac EGCG (180μg/m L)。草鱼白细胞介素-1β (interleukin-1β, IL-1β)、白细胞介素-8 (interleukin-8, IL-8)、肿瘤坏死因子α (tumor necrosis factorα,TNFα)和髓样分化因子(medullary differentiation factor,My D88)相对于对照组在测试物中均有不同程度上调,其中EGCG-P (50μg/m L)和Ac EGCG (10μg/m L)处理组分别在8 h和24 h上调较为显著。【结论】EGCG-P、Ac EGCG和KMPS对GCRV-I均有良好的抑制效果和杀灭效果,其中EGCG-P和KMPS能够在40μg/m L较低浓度下对GCRV发挥显著性的抑制和杀灭效果,且在24h后 展开更多
关键词 草鱼出血病 草鱼呼肠孤病毒 表没食子儿茶素没食子酸酯棕榈酸酯 乙酰化表没食子儿茶素没食子酸酯 过硫酸氢钾复合物粉
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基因Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒病毒样颗粒的构建与鉴定
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作者 郜婷 吴斯宇 +6 位作者 高彩霞 夏苏东 尹纪元 王英英 李莹莹 石存斌 王庆 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期148-157,共10页
为研究Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)病毒样颗粒(VLPs)疫苗,实验利用杆状病毒-昆虫细胞表达系统(BEVS)将具有免疫原性的GCRV-VP3/VP4/VP35蛋白进行GCRV-VLPs的组装。实验将编码VP35蛋白的GCRV-s11基因克隆入杆状病毒载体pFastBacHTA^(TM),... 为研究Ⅱ型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)病毒样颗粒(VLPs)疫苗,实验利用杆状病毒-昆虫细胞表达系统(BEVS)将具有免疫原性的GCRV-VP3/VP4/VP35蛋白进行GCRV-VLPs的组装。实验将编码VP35蛋白的GCRV-s11基因克隆入杆状病毒载体pFastBacHTA^(TM),然后将鉴定正确的重组质粒转化至DH10Bac感受态细胞,筛选得到重组穿梭质粒Bacmid-VP35。将穿梭质粒Bacmid-VP35以及实验室前期构建的重组穿梭质粒Bacmid-VP3、Bacmid-VP4分别转染Sf9昆虫细胞获得重组杆状病毒pFHB-VP35、pFHB-VP3以及pFHB-VP4。利用Bac-PAK快速滴定试剂盒测定重组杆状病毒滴度,并通过间接免疫荧光(IFA)和蛋白质印迹法(Western blot)鉴定重组蛋白的表达情况。结果显示,实验获得了较高滴度的重组杆状病毒,并且重组蛋白在杆状病毒感染的Sf9昆虫细胞中正确表达。将成功表达蛋白的重组杆状病毒pFHB-VP35、pFHB-VP3以及pFHB-VP4共感染Sf9细胞组装GCRV-VLPs,通过透射电镜(EM)观察VLPs的组装情况。结果显示,GCRV-Ⅱ的3个蛋白在Sf9昆虫细胞中可以完成自我组装,形成与天然病毒结构形似的VLPs,直径为65~72 nm。本实验结果为进一步研制安全、高效的GCRV-VLPs疫苗奠定了基础。 展开更多
关键词 草鱼 草鱼呼肠孤病毒 重组杆状病毒 病毒样颗粒
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