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渐近混合群体的混合连锁不平衡及其遗传连锁推断(英文)
1
作者
郭伟
冯荣锦
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期12-18,共7页
在渐近混合模型中,混合现象发生在每一世代,通过对其混合连锁不平衡的理论分析,发现混合连锁不平衡与两 个子群体间的基因频率差成正比。基于这一点,构造了一个对重组率严格单调的函数(△ker=△/(p1-p2),其中△代表连锁不 平衡),进而据...
在渐近混合模型中,混合现象发生在每一世代,通过对其混合连锁不平衡的理论分析,发现混合连锁不平衡与两 个子群体间的基因频率差成正比。基于这一点,构造了一个对重组率严格单调的函数(△ker=△/(p1-p2),其中△代表连锁不 平衡),进而据此推断标记基因座与疾病基因座的遗传连锁。应用人类基因组上不连锁的标记基因提供的连锁小平衡信息, 基于病人组数据构造了一个准似然比统计量。模拟结果显示,此检验可用于精确的基因定位。文章亦讨论了参数对检验的 影响。
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关键词
混合连锁不平衡(ALD)
连锁不平衡(LD)
渐近混合(
ga
)模型
隔离混合(HI)模型
似然比检验(LRT)
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职称材料
题名
渐近混合群体的混合连锁不平衡及其遗传连锁推断(英文)
1
作者
郭伟
冯荣锦
机构
香港大学统计及精算学系
出处
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期12-18,共7页
基金
This Work Was Supported by the Natural Science Foundation of China for Distinguished Young Scholars (No.10329102).
文摘
在渐近混合模型中,混合现象发生在每一世代,通过对其混合连锁不平衡的理论分析,发现混合连锁不平衡与两 个子群体间的基因频率差成正比。基于这一点,构造了一个对重组率严格单调的函数(△ker=△/(p1-p2),其中△代表连锁不 平衡),进而据此推断标记基因座与疾病基因座的遗传连锁。应用人类基因组上不连锁的标记基因提供的连锁小平衡信息, 基于病人组数据构造了一个准似然比统计量。模拟结果显示,此检验可用于精确的基因定位。文章亦讨论了参数对检验的 影响。
关键词
混合连锁不平衡(ALD)
连锁不平衡(LD)
渐近混合(
ga
)模型
隔离混合(HI)模型
似然比检验(LRT)
Keywords
admixture
linkage
disequilibrium
(ALD)
linkage
disequilibrium
(LD)
gradual
admixture
(
ga
)
model
hybrid
isolation
(HI)
model
likelihood
ratio
test
(LRT)
分类号
Q347 [生物学—遗传学]
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1
渐近混合群体的混合连锁不平衡及其遗传连锁推断(英文)
郭伟
冯荣锦
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006
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