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属级芯片筛查技术在马铃薯纺锤块茎类病毒属检测中的应用
被引量:
4
1
作者
张永江
辛言言
+1 位作者
朱水芳
邓丛良
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期514-523,共10页
建立马铃薯纺锤块茎类病毒属(Pospiviroid)类病毒有效的芯片筛查技术,对该属类病毒进行筛查。分析了该属类病毒序列,得到19条具有属级鉴定特征的探针。这些探针符合GC含量在40%与60%之间、单个核苷酸含量不大于50%、无多于4个核苷酸的...
建立马铃薯纺锤块茎类病毒属(Pospiviroid)类病毒有效的芯片筛查技术,对该属类病毒进行筛查。分析了该属类病毒序列,得到19条具有属级鉴定特征的探针。这些探针符合GC含量在40%与60%之间、单个核苷酸含量不大于50%、无多于4个核苷酸的连续重复及不形成多于6个核苷酸的发卡结构的标准;将探针点制到玻璃片基上制备芯片。芯片探针有效性实验结果表明,菊花矮化类病毒(Chrysanthemum stunt viroid,CSVd)及番茄雄性株类病毒(Tomato planta macho viroid,TPMVd)样品杂交可获得有效信号;灵敏度实验结果表明,该芯片可检测到200 pg/μL的总RNA。该芯片可用于Pospiviroid类病毒的筛查。
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关键词
马铃薯纺锤块茎类病毒属
属级探针
芯片
菊花矮化类病毒
番茄雄性株类病毒
原文传递
啤酒花矮化类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立
被引量:
1
2
作者
商明清
赵文军
+1 位作者
李世访
张永江
《植物检疫》
北大核心
2012年第2期16-19,共4页
啤酒花矮化类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了8条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用啤酒花矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结...
啤酒花矮化类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了8条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用啤酒花矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以特异性检测啤酒花矮化类病毒,可检测到2ng/μL的总RNA。该芯片可用于啤酒花矮化类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑。
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关键词
啤酒花矮化类病毒属
属级探针
寡核苷酸芯片
原文传递
苹果锈果类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立
被引量:
1
3
作者
张永江
辛言言
+1 位作者
朱水芳
李世访
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期151-156,共6页
苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯...
苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以获得有效的杂交信号,其灵敏度与RT-PCR电泳法相当。该芯片可用于苹果锈果类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑。
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关键词
苹果锈果类病毒属
属级探针
寡核苷酸芯片
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职称材料
题名
属级芯片筛查技术在马铃薯纺锤块茎类病毒属检测中的应用
被引量:
4
1
作者
张永江
辛言言
朱水芳
邓丛良
机构
中国检验检疫科学研究院
北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期514-523,共10页
基金
质检公益性行业科研专项(No.201110035)资助~~
文摘
建立马铃薯纺锤块茎类病毒属(Pospiviroid)类病毒有效的芯片筛查技术,对该属类病毒进行筛查。分析了该属类病毒序列,得到19条具有属级鉴定特征的探针。这些探针符合GC含量在40%与60%之间、单个核苷酸含量不大于50%、无多于4个核苷酸的连续重复及不形成多于6个核苷酸的发卡结构的标准;将探针点制到玻璃片基上制备芯片。芯片探针有效性实验结果表明,菊花矮化类病毒(Chrysanthemum stunt viroid,CSVd)及番茄雄性株类病毒(Tomato planta macho viroid,TPMVd)样品杂交可获得有效信号;灵敏度实验结果表明,该芯片可检测到200 pg/μL的总RNA。该芯片可用于Pospiviroid类病毒的筛查。
关键词
马铃薯纺锤块茎类病毒属
属级探针
芯片
菊花矮化类病毒
番茄雄性株类病毒
Keywords
Pospiviroid,
genus
level
probe
,
microarray,
chrysanthemum
stunt
viroid,
tomato
planta
macho
viroid
分类号
S435.32 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
啤酒花矮化类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立
被引量:
1
2
作者
商明清
赵文军
李世访
张永江
机构
山东省植物保护总站
中国检验检疫科学研究院
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《植物检疫》
北大核心
2012年第2期16-19,共4页
文摘
啤酒花矮化类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了8条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用啤酒花矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以特异性检测啤酒花矮化类病毒,可检测到2ng/μL的总RNA。该芯片可用于啤酒花矮化类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑。
关键词
啤酒花矮化类病毒属
属级探针
寡核苷酸芯片
Keywords
Hostuviroid
genus
level
probe
oligonucleotide
microarray
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
S41-30 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
苹果锈果类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立
被引量:
1
3
作者
张永江
辛言言
朱水芳
李世访
机构
中国检验检疫科学研究院
中国农业科学院植物保护研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期151-156,共6页
基金
国家质检总局科技计划项目(2010IK278)
质检公益性行业科研专项资助项目(201010256
+1 种基金
20111035
201210214)
文摘
苹果锈果类病毒属是重要的植物类病毒属,目前尚无有效的筛查方法。通过对该属类病毒的核苷酸序列进行分析筛选,设计了35条用于该属类病毒筛查的属级特异性探针并制备了寡核苷酸芯片。应用苹果锈果类病毒及柑橘矮化类病毒标准样品对该芯片进行验证,结果表明所建立的属级芯片可以获得有效的杂交信号,其灵敏度与RT-PCR电泳法相当。该芯片可用于苹果锈果类病毒属类病毒的筛查,为该属类病毒的检疫与防控提供技术支撑。
关键词
苹果锈果类病毒属
属级探针
寡核苷酸芯片
Keywords
Apscaviroid
genus
level
probe
Oligonucleotide
microarray
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
属级芯片筛查技术在马铃薯纺锤块茎类病毒属检测中的应用
张永江
辛言言
朱水芳
邓丛良
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
原文传递
2
啤酒花矮化类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立
商明清
赵文军
李世访
张永江
《植物检疫》
北大核心
2012
1
原文传递
3
苹果锈果类病毒属属级寡核苷酸芯片筛查方法的建立
张永江
辛言言
朱水芳
李世访
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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