基于高分辨熔解技术进行单核苷酸多态性基因分型的方法学评价 被引量：8

1

作者 尤崇革 李玉民 +3 位作者 马克君 施鑫鹤 郜莉娜 李菲菲 《中华临床医师杂志（电子版）》 CAS 2012年第7期I0024-I0028,共5页

目的评价高分辨熔解(HRM)技术进行单核苷酸多态性(SNP)基因分型的检验性能。方法以SNP位点rs1205C>T和rs4353A>G为例,采用盲法对361例已分型确认样本进行PCR-HRM检测评价其特异性和灵敏度;通过重复试验评价其重复性和再现性。稳... 目的评价高分辨熔解(HRM)技术进行单核苷酸多态性(SNP)基因分型的检验性能。方法以SNP位点rs1205C>T和rs4353A>G为例,采用盲法对361例已分型确认样本进行PCR-HRM检测评价其特异性和灵敏度;通过重复试验评价其重复性和再现性。稳健性评价主要考察DNA模板量和扩增循环数对PCR-HRM检测的影响。结果 PCR-HRM法检测361例标本的rs1205C>T和rs4353A>G两个SNP位点,结果除5例样本的熔解曲线发生飘移接受复查外,其余标本均一次直接基因分型;所有标本的最终分型结果完全正确即灵敏度和特异性达到100%。两个位点的10次批内和3次批间重复试验均显示PCR-HRM法的重复性和再现性良好。rs1205C>T和rs4353A>G的野生型与纯合突变型样本熔解峰Tm值的变异系数分别为0.7%与0.8%和0.6%与0.5%;统计学分析显示每个位点的两种纯合型样本Tm值之间均存在显著性差异(P<0.001),即可明确区分不同纯合基因型。DNA模板量的变化(10ng、20ng、50ng和100ng)和扩增循环数的波动(38、40和42次)均对PCR-HRM法正确基因分型影响不大。结论基于小片段扩增子对rs1205C>T和rs4353A>G两个SNP位点进行常规化PCR-HRM法基因分型在方法学上是可靠的,值得推广;同时这一评估模式也适于其他分子诊断方法的评价。 展开更多

关键词 高分辨熔解曲线 基因分型 检验性能 单核苷酸多态性

原文传递

人细小病毒B19实验室诊断技术研究进展

2

作者 任珊珊 赵兰青 许四宏 《中国医药生物技术》 2024年第2期161-164,共4页

人细小病毒B19(B19V)是细小病毒科的一种小的非包膜单链DNA,在人群中普遍存在。B19病毒能够通过呼吸道、血液、胎盘等进行传播,进而引起儿童传染性红斑、再生障碍危象、胎儿积水和宫内胎儿死亡等疾病。本文主要从B19病毒的基因分型、蛋... 人细小病毒B19(B19V)是细小病毒科的一种小的非包膜单链DNA,在人群中普遍存在。B19病毒能够通过呼吸道、血液、胎盘等进行传播,进而引起儿童传染性红斑、再生障碍危象、胎儿积水和宫内胎儿死亡等疾病。本文主要从B19病毒的基因分型、蛋白表达、感染机制及实验室检测技术等方面来综述B19病毒的性质和诊断情况,以期提供更多关于其生物学特性的信息,这可能有助于研究人员对检测方法的应用及发展有更深层次的了解。 展开更多

关键词 人细小病毒B19 基因分型 蛋白结构 检测技术 血清学检测 分子检测

下载PDF 职称材料

SARS-CoV-2 Omicron变异株荧光定量PCR鉴别方法的建立及应用 被引量：1

3

作者 牛培华 何雅青 +11 位作者 李晓燕 马红霞 朱琳 郑宝璐 魏欣仪 李诗敏 朱灿 卢清菊 孟君 彭博 王佶 马学军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期1-5,共5页

开发和评价一种用于鉴别Omicron变异株的荧光定量PCR方法。我们针对Omicron变异株S基因的两个特异性突变位点开发了一种基于荧光定量PCR的Omicron变异株分型方法(Omicron RT-qPCR)。通过测试临床样本来评价方法的特异性,通过标准品评价... 开发和评价一种用于鉴别Omicron变异株的荧光定量PCR方法。我们针对Omicron变异株S基因的两个特异性突变位点开发了一种基于荧光定量PCR的Omicron变异株分型方法(Omicron RT-qPCR)。通过测试临床样本来评价方法的特异性,通过标准品评价方法的灵敏度。Omicron RT-qPCR分型方法显示能够可靠地区分Omicron变异株和“野生型” SARS-CoV-2及Alpha、Beta、Delta变异株及甲型流感病毒。选取68例新冠疑似样本,全基因组测序(Whole genome sequencing,WGS)结果显示44例为Omicron变异株,Omicron RT-qPCR分型结果均为阳性;11例为Delta变异株,Omicron RT-qPCR分型结果均为阴性;另外,通过WGS分析未能成功分型的7例样本,通过Omicron RT-qPCR分型方法成功鉴定为Omicron BA.1和BA.2变异株。我们开发的Omicron RT-qPCR分型方法可以在普通的PCR检测实验室应用,为我国疾控系统和医疗机构及时监测SARS-CoV-2 Omicron变异株的传播提供可靠的技术支撑。 展开更多

关键词 SARS-CoV-2 Omicron变异株 基因分型 检测方法

原文传递

牛乳中A2β-酪蛋白功效特点及其检测方法研究进展 被引量：4

4

作者 高彩雯 罗龙龙 +5 位作者 任卫合 马石霞 余金凤 代安娜 丁功涛 陈士恩 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第3期19-24,共6页

牛乳总蛋白中酪蛋白约占80%,其中36%是β-酪蛋白。A_(2)β-酪蛋白和A_(2)β-酪蛋白是β-酪蛋白遗传变体中最常见的两种类型,A_(2)β-酪蛋白为天然原型。A_(2)β-酪蛋白和A_(2)β-酪蛋白消化酶解后会产生不同的生物活性肽,来源于A_(2)β... 牛乳总蛋白中酪蛋白约占80%,其中36%是β-酪蛋白。A_(2)β-酪蛋白和A_(2)β-酪蛋白是β-酪蛋白遗传变体中最常见的两种类型,A_(2)β-酪蛋白为天然原型。A_(2)β-酪蛋白和A_(2)β-酪蛋白消化酶解后会产生不同的生物活性肽,来源于A_(2)β-酪蛋白的BCM-7可能与1型糖尿病、心血管疾病、自闭症、精神分裂症、消化功能紊乱等人体慢性非传染性疾病的发生密切相关,A_(2)β-酪蛋白酶解后产生的BCM-7要比A_(2)β-酪蛋白少甚至不会产生β-酪啡肽-7(BCM-7)。β-酪蛋白基因多态性受常染色体上共显性基因控制,目前常用的检测方法为反相高效液相色谱法(RP-HPLC)、等电聚焦电泳(IEF)法和等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR)、单链构象多态性聚合酶链式反应(SSCP-PCR)等。文章对β-酪蛋白遗传变体A_(2)β-酪蛋白功能特点、遗传学特点及A_(2)β-酪蛋白基因检测方法进行综述,旨在为A_(2)β-酪蛋白应用于功能性食品,包括作为乳基料及添加到婴幼儿配方食品中的应用提供理论依据。 展开更多

关键词 A_(2)β-酪蛋白 功能特点 遗传学特点 基因分型 检测方法

原文传递

循环肿瘤细胞数量及分型检测在肾癌疗效评价中的作用 被引量：5

5

作者 王振龙 张鹏 +7 位作者 薛玉泉 张亚萍 杨小杰 薛力 李和程 李洪亮 刘文聘 种铁 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2019年第9期709-714,共6页

目的探讨循环肿瘤细胞(CTCs)数量及分型检测在肾癌疗效评价中的作用。方法选择2015年6月至2016年9月我院收治的47例肾癌患者,行根治性肾切除术10例,肾部分切除术37例。记录术前患者一般状况信息,术中肿瘤分级分期等信息。术前及术后每3... 目的探讨循环肿瘤细胞(CTCs)数量及分型检测在肾癌疗效评价中的作用。方法选择2015年6月至2016年9月我院收治的47例肾癌患者,行根治性肾切除术10例,肾部分切除术37例。记录术前患者一般状况信息,术中肿瘤分级分期等信息。术前及术后每3个月采集患者外周血7.5mL,应用纳米膜过滤、RNA原位杂交法进行CTCs数量及分型检测,并行胸部、上腹部、双肾计算机断层扫描(CT)等检测评估肿瘤有无远处转移。术后监测患者CTCs变化趋势,按以下方案进行分组:①影像学发现转移进展的患者,按进行治疗(包括切除转移灶或靶向治疗)和未予治疗分组;②CTCs呈进展趋势的患者(不论影像学是否发现转移灶),按进行分子靶向治疗和未进行靶向治疗分组。分别比较CTCs数量及间质型CTCs比例在2组患者中的差异。结果入组47例患者在随访期有5例发生病灶转移,其中针对2例个案(1例肺转移和1例双侧肾上腺转移患者)的CTCs实时监测发现,CTCs变化趋势与临床治疗转归一致,且均早于影像学检查发现疾病变化趋势。5例转移患者,3例给予治疗(1例行肾上腺转移灶切除,2例行分子靶向治疗),治疗后CTCs数量及间质型CTCs比例较治疗前均呈下降趋势,2例因患者原因未接受治疗,CTCs数量及间质型CTCs比例均呈进展趋势。CTCs呈进展趋势的患者16例,5例给予索拉菲尼分子靶向治疗(治疗2例,辅助治疗3例),11例未予治疗,靶向治疗组与未治疗组患者比较,CTCs数量及间质型CTCs比例下降。结论①CTCs具有评价肾癌治疗效果的作用,CTCs数量及间质型细胞比例的下降与治疗效果相关;②CTCs分型检测具有早期、灵敏的优势,可以作为实时监测治疗效果及疾病进展的手段;③分子靶向治疗具有降低肾癌CTCs数量及间质型CTCs比例的作用。 展开更多

关键词 循环肿瘤细胞 肾癌 分子靶向治疗 间质型循环肿瘤细胞 分型检测

下载PDF 职称材料

HPV基因分型、TCT检测在宫颈癌早期中的诊断效能分析

6

作者 钟桂艳 李芳 王艳 《四川生理科学杂志》 2023年第11期2030-2032,2068,共4页

目的:分析人乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus,HPV)基因分型结合液基薄层细胞学(Thin prep cytologic test,TCT)检测在宫颈癌早期诊断中的应用价值。方法:选取2021年6月至2023年1月在我院进行宫颈癌筛查的患者185例作为研究对象,均采用... 目的:分析人乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus,HPV)基因分型结合液基薄层细胞学(Thin prep cytologic test,TCT)检测在宫颈癌早期诊断中的应用价值。方法:选取2021年6月至2023年1月在我院进行宫颈癌筛查的患者185例作为研究对象,均采用HPV基因分型、TCT以及阴道镜下活检检查。以活检检查为金标准,比较HPV基因分型、TCT检测单独以及联合诊断早期宫颈癌效能以及病理学检查结果的一致性。结果:HPV基因分型的灵敏度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值分别为:87.93%、94.21%、69.92%、87.93%、64.04%,TCT检测分别为53.45%、85.16%、78.81%、53.45%、85.16%,HPV基因分型+TCT检测分别为93.10%、97.70%、96.61%、93.10%、93.44%,HPV基因分型+TCT检测的灵敏度、特异度、准确率、阳性预测值、阴性预测值均高于HPV基因分型、TCT检测单独检测(P<0.05);HPV基因分型、TCT检测单独以及联合诊断早期宫颈癌与病理学检查结果的一致性Kappa值分别为0.764、0.523、0.855。结论:HPV基因分型联合TCT检测可以补全两种方法单独应用的不足,还可提高宫颈癌早期诊断的灵敏度、检出率,降低漏诊、假阳性概率,可以在早期有效筛选宫颈上皮细胞病变。 展开更多

关键词 HPV基因分型 TCT检测 宫颈癌早期 应用研究

下载PDF 职称材料

荷斯坦牛κ-酪蛋白基因分型KASP检测方法的建立与应用

7

作者 赵凤 刘林 +6 位作者 杨宇泽 吕小青 麻柱 赵春颖 路永强 张建聪 邹杨 《中国奶牛》 2023年第7期49-52,共4页

为筛选κ-酪蛋白优势基因型,本研究设计4个SNP位点,利用基因组检测已知CSN3基因型的13头牛,采集抗凝血,提取基因组DNA,采用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)对样本进行分型,CSN3基因有AA、BB... 为筛选κ-酪蛋白优势基因型,本研究设计4个SNP位点,利用基因组检测已知CSN3基因型的13头牛,采集抗凝血,提取基因组DNA,采用竞争性等位基因特异性聚合酶链式反应(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)对样本进行分型,CSN3基因有AA、BB、EE、AB、AE、BE六种基因型。本研究实现了对北京地区213头荷斯坦种公牛及1003头母牛中CSN3三种常见变异体的全面筛选,从育种角度出发,基于κ-酪蛋白不同基因型与奶酪生产的产量和质量相关性,利用分子检测方法筛选与优良性状的优势基因型,发掘荷斯坦牛特色优质种质资源,为牧场选择合适的荷斯坦牛,提高乳蛋白率,从种源解决相关领域的技术瓶颈。 展开更多

关键词 荷斯坦牛 κ-酪蛋白 基因分型 检测方法

下载PDF 职称材料

皮肤性病门诊患者人乳头瘤病毒基因分型检测的临床分析 被引量：3

8

作者 刘志香 刘晓鹏 张洁 《中国卫生标准管理》 2018年第17期109-110,共2页

目的探讨皮肤性病患者不同病变类型的人乳头瘤病毒感染类型。方法随机选取2016年4月—2018年4月我院门诊就诊294例患者,对患者采用PCR-反向点对皮肤损伤和外阴局部HPV亚型进行检测。结果 HPV检出率为73.81%(217/294),其中单一型别感染57... 目的探讨皮肤性病患者不同病变类型的人乳头瘤病毒感染类型。方法随机选取2016年4月—2018年4月我院门诊就诊294例患者,对患者采用PCR-反向点对皮肤损伤和外阴局部HPV亚型进行检测。结果 HPV检出率为73.81%(217/294),其中单一型别感染57.1%(168/294),多重感染率为16.67%(49/294)。在217例HPV阳性标本中高危型感染52.53%(114/217),低危型感染29.03%(63/217),混合型阳性率为18.43%(40/217)。结论 HPV感染以单一型别感染和高危型感染为主,因此在临床中应加强对人乳头瘤病毒感染亚型检测,对于提升患者临床治疗有效率有着积极的作用和影响,还能够进一步提升患者康复率。 展开更多

关键词 皮肤性病 人乳头瘤病毒 基因分型 临床检测 病毒感染 应用技术

下载PDF 职称材料

人乳头瘤病毒分型检测技术的研究进展 被引量：2

9

作者 白雪 盛楠 +2 位作者 邹秉杰 张婕妤 周国华 《现代生物医学进展》 CAS 2017年第34期6785-6788,共4页

宫颈癌的发生与人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)感染密切相关,对HPV进行分型检测对宫颈癌的预防、诊断和治疗具有重要意义,因此近年来HPV检测技术不断革新。感染不同HPV亚型将会导致不同的临床症状,部分传统HPV检测手段由于无... 宫颈癌的发生与人乳头瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)感染密切相关,对HPV进行分型检测对宫颈癌的预防、诊断和治疗具有重要意义,因此近年来HPV检测技术不断革新。感染不同HPV亚型将会导致不同的临床症状,部分传统HPV检测手段由于无法分型,其局限性日益凸显。目前,HPV分型检测主要依赖于各种HPV DNA检测技术,但各种技术的检测原理、适用范围均不相同,给临床选择HPV检测方法带来了困扰。本文将就目前常用的HPV DNA分型检测方法进行简要介绍,并对各方法的适用范围进行比较,以期为临床选择合适的HPV检测方法提供参考。 展开更多

关键词 宫颈癌 人类乳头瘤病毒 分型检测

原文传递

563例宫颈意义不明的非典型鳞状上皮细胞病例HPV基因分型检测的临床回顾性分析 被引量：2

10

作者 何钒 蔡玲玲 +2 位作者 王飞 刘静 戴颂阳 《巴楚医学》 2018年第2期48-51,共4页

目的:探讨HPV基因分型检测对于细胞学诊断宫颈意义不明的非典型鳞状上皮细胞(ASC-US)病变的临床意义,为临床提供指导和管理依据。方法:选取2016年1月至2017年5月在宜昌市中心人民医院妇科门诊接受脱落细胞学检查,结果为ASC-US后行HPV基... 目的:探讨HPV基因分型检测对于细胞学诊断宫颈意义不明的非典型鳞状上皮细胞(ASC-US)病变的临床意义,为临床提供指导和管理依据。方法:选取2016年1月至2017年5月在宜昌市中心人民医院妇科门诊接受脱落细胞学检查,结果为ASC-US后行HPV基因分型检测的病例,对其结果进行回顾性分析。结果:筛选出的563例ASC-US病例中,HPV阳性病例295例,占总数的52.4%;不同年龄段的HPV阳性率差异具有统计学意义(P=0.020),其中19～29岁年龄段HPV阳性率最高;高危型HPV阳性病例264例,占总阳性病例的89.49%,不同年龄段的高危型HPV阳性率差异不具有统计学意义(P=0.963);感染率最高的HPV亚型分别是HPV16(21.36%),HPV58(19.32%)和HPV52(17.29%),均为高危型病毒。结论:HPV基因分型检测,尤其高危型HPV检测可以对ASC-US病例起到分流管理的作用。 展开更多

关键词 意义不明的非典型鳞状上皮细胞 人乳头瘤病毒 基因检测 宫颈病变

下载PDF 职称材料

69株食源性致病菌单核细胞增生李斯特氏菌的分子血清分型、二元基因分型与多位点序列分型研究 被引量：2

11

作者 李秀娟 高伟利 +2 位作者 史艳 崔玲玲 潘琢 《医学动物防制》 2016年第9期996-1000,共5页

目的对多种分子分型方法在单核细胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes,Lm)分型中的应用进行分析和比较,确定适合于不同实验室的分型检测方法,并进一步掌握食源性Lm的病原特征。方法采用分子血清分型、二元基因分型与多位点序列分... 目的对多种分子分型方法在单核细胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes,Lm)分型中的应用进行分析和比较,确定适合于不同实验室的分型检测方法,并进一步掌握食源性Lm的病原特征。方法采用分子血清分型、二元基因分型与多位点序列分型方法对分离自食品的69株Lm进行分型检测,并对结果进行分析。结果 69株Lm食品分离株中,1/2a型菌株有29株,1/2b型有19株,1/2c型有7株,4b型有14株。二元基因分型法将69株Lm食品分离株分为19个二元基因型(Binary type,BT型),DI值为91.60%;主要的BT型为BT146、BT254、BT222、BT82、BT159和BT190。多位点序列分型法将69株Lm食品分离株分为16个序列型(Sequencing type,ST型),DI值为89.98%;主要的ST型为ST8、ST87、ST2、ST1、ST3和ST9。结论分子血清学方法和二元基因分型方法具有操作简便、检测结果易于分析、较快提供检测结果的优点,可作为实验室的一线技术用以对李斯特氏菌病暴发的发现和确认。 展开更多

关键词 食源性致病菌 单核细胞增生李斯特氏菌 分子血清分型 二元基因分型 多位点序列分型 溯源检测

原文传递

肠道病毒VP1基因定型巢式RT-PCR反应体系建立及评价 被引量：2

12

作者 陈燕 杨爱平 +2 位作者 汪敏 胡萍芳 杨文娟 《中国卫生检验杂志》 CAS 2021年第2期162-164,190,共4页

目的建立一种快速、灵敏、特异的肠道病毒VP1基因分型巢式RT-PCR检测方法。方法根据Gen Bank发表的肠道病毒全基因组序列,收集国内外文献,将文献中用于测序分型的引物进行总结分析,在其VP1区设计并合成巢式RT-PCR引物,优化PCR反应条件,... 目的建立一种快速、灵敏、特异的肠道病毒VP1基因分型巢式RT-PCR检测方法。方法根据Gen Bank发表的肠道病毒全基因组序列,收集国内外文献,将文献中用于测序分型的引物进行总结分析,在其VP1区设计并合成巢式RT-PCR引物,优化PCR反应条件,建立检测肠道病毒基因分型的巢式RT-PCR方法。将200株肠道病毒通用阳性,EV71、CA16阴性的临床标本及阴性对照、EB病毒、登革热病毒、流感病毒、腺病毒用该方法进行巢式RT-PCR扩增,随机选择30例PCR产物进行测序,明确本区肠道病毒流行基因型。结果 200份临床病例样本巢式RT-PCR扩增,124例有准确PCR扩增条带,阳性率为62%;阴性对照、EB病毒、登革热病毒、流感病毒、腺病毒均未扩增出条带;23例测序成功,7例比对失败,其中检出16份CA6阳性,阳性率为69.5%,6份CA12阳性,阳性率为26.1%,1份CA10阳性,阳性率为4.3%。结论肠道病毒VP1基因分型巢式RT-PCR检测方法具有良好的灵敏度和特异度;本院就诊患儿肠道病毒基因型主要以CA6和CA12型为主。 展开更多

关键词 肠道病毒 巢式RT-PCR 基因分型 检测

原文传递

基于多重RT-PCR同时鉴定猪流感病毒不同HA和NA基因亚型的DHPLC检测方法的建立 被引量：2

13

作者 徐超 刘芳 +2 位作者 李轲 张巨洲 韩雪清 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期624-628,共5页

为建立快速、敏感并同时鉴定不同HA和NA基因亚型的猪流感病毒(SIV)的方法。本研究根据SIV的H1、H2、H3、H5、H9、N1及N2亚型基因的保守序列分别设计型特异性引物,建立了同时扩增SIV不同亚型的多重RT-PCR及变性高效液相色谱(DHPLC)的高... 为建立快速、敏感并同时鉴定不同HA和NA基因亚型的猪流感病毒(SIV)的方法。本研究根据SIV的H1、H2、H3、H5、H9、N1及N2亚型基因的保守序列分别设计型特异性引物,建立了同时扩增SIV不同亚型的多重RT-PCR及变性高效液相色谱(DHPLC)的高灵敏度和高通量分型检测方法。结果显示,该方法能够特异性的检测并鉴定H1、H2、H3、H5、H9、N1、N2等亚型SIV,而对猪瘟病毒、口蹄疫病毒、猪流行性腹泻病毒、猪繁殖和呼吸综合征病毒均无交叉反应,该方法的最低检出限为100拷贝/μL核酸。对76份猪流感鼻拭子样品临床样品检测结果表明,DHPLC与商业化荧光定量PCR检测试剂盒的检测结果完全一致。本研究建立的方法,特异性强、敏感性高、自动化程度高,为快速分型检测SIV提供技术支撑,并具有良好的应用前景。 展开更多

关键词 猪流感病毒 亚型 变性高效液相色谱技术 分型检测

下载PDF 职称材料

反转录环介导等温扩增技术对丙型肝炎病毒可视化分型检测 被引量：1

14

作者 赵娜 刘金霞 孙殿兴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期383-387,共5页

目的应用反转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP)可视化检测丙型肝炎病毒(HCV)1b和2a基因型,为RTLAMP技术应用于现场或基层医院提供初步探索经验。方法首先,收集临床阳性样本并用荧光定量PCR分型检测,把样本基本分为1型和非1型。然后分别根... 目的应用反转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP)可视化检测丙型肝炎病毒(HCV)1b和2a基因型,为RTLAMP技术应用于现场或基层医院提供初步探索经验。方法首先,收集临床阳性样本并用荧光定量PCR分型检测,把样本基本分为1型和非1型。然后分别根据HCV 1b和2a基因型设计RT-LAMP引物并优化反应条件,通过互换模板实验验证这2套引物的特异性,并通过检测稀释的模板以验证引物的灵敏度。同时用钙黄绿素进行产物显色,使HCV分型检测可视化。最后用RT-LAMP方法检测临床样本,并计算阳性率,应用配对卡方检验比较RT-LAMP和荧光定量PCR的统计学差异。结果优化好的RT-LAMP体系的特异性好,对HCV 1b型的检测灵敏度为103 IU/mL,2a型的检测灵敏度为104 IU/mL。另外,利用钙黄绿素进行产物检测的效果和电泳结果相当。通过对临床样本分型检测,HCV 1b型样本的RTLAMP检测结果和荧光定量PCR差异无统计学意义(P>0.05),HCV 2a型样本的RT-LAMP检测结果和荧光定量PCR差异有统计学意义(P<0.05),但是未检出的样本中有2例为HCV 2b型。结论 RT-LAMP对HCV的可视化分型检测具有较好的特异性和灵敏度,操作简便,具有在现场或基层医院的应用前景。 展开更多

关键词 丙型肝炎病毒(HCV) 反转录环介导等温扩增(RT-LAMP) 分型检测

下载PDF 职称材料

CYP3A5基因检测质控品制备及其应用研究 被引量：1

15

作者 鲍芸 肖艳群 +3 位作者 蒋玲丽 王雪亮 杨依绡 王华梁 《临床检验杂志》 CAS 2019年第2期142-145,共4页

目的通过构建体外质粒DNA作为质控样品开展他克莫司代谢基因——细胞色素P450 3A5(CYP3A5)基因检测室间质量评价计划(简称室间质评),评估参评实验室检测能力及存在的问题,提高临床实验室CYP3A5基因的检测质量。方法利用基因工程技术体... 目的通过构建体外质粒DNA作为质控样品开展他克莫司代谢基因——细胞色素P450 3A5(CYP3A5)基因检测室间质量评价计划(简称室间质评),评估参评实验室检测能力及存在的问题,提高临床实验室CYP3A5基因的检测质量。方法利用基因工程技术体外构建含CYP3A5*3(rs776746)位点上、下游序列的重组质粒,筛选CYP3A5*3 AA和GG基因型分别作为野生型和突变型样品,两者等比例混合后作为杂合突变型样品,并制备质控样品盘开展室间质量评价。依据回报结果计算各实验室成绩,汇总不同样品的总体符合率,并分析不同检测方法的符合率和检测错误类型。结果体外构建的重组质粒经Sanger测序验证分别含CYP3A5*3位点野生型和突变型序列。2017年两次室间质评中成绩满分的实验室分别为93.33%(14/15)和100%(17/17)。两次室间质评中,样品检测的总体符合率分别为96%(72/75)和100%(85/85)。荧光分子杂交法检测的样品符合率均为100%; Sanger测序法检测样品符合率为90%(27/30)和100%(40/40)。结论制备的质控样品能够有效监测试剂检测性能,具有良好的适用性。各实验室在CYP3A5*3基因位点检测总体准确率较高,但个别实验室检测能力有待提高。室间质评计划能帮助实验室发现检测中存在的问题,提高检测质量。 展开更多

关键词 细胞色素酶P450 3A基因 基因检测 质粒DNA 室间质量评价

下载PDF 职称材料

湖北咸宁地区正常人群与血吸虫疫区人群感染HBV基因型分析 被引量：1

16

作者 周建平 王鸣 +5 位作者 王忠提 张莉 占建波 杨红梅 吕静 詹发先 《实用预防医学》 CAS 2010年第10期2096-2098,共3页

目的了解咸宁市正常人群及血吸虫疫区人群乙肝病毒(HBV)基因型分布状态。方法取正常体检人员和血吸虫疫区例行体检人员中筛选出的HBsAg阳性携带者血清,用槽式PCR技术进行乙肝病毒基因分型检测。结果 86份HBsAg阳性血清标本(正常和血吸... 目的了解咸宁市正常人群及血吸虫疫区人群乙肝病毒(HBV)基因型分布状态。方法取正常体检人员和血吸虫疫区例行体检人员中筛选出的HBsAg阳性携带者血清,用槽式PCR技术进行乙肝病毒基因分型检测。结果 86份HBsAg阳性血清标本(正常和血吸虫疫区人群分别43例)中检出B型69份(80.23%)、BC型10份(11.62%)、C型4份(4.65%)。结论咸宁地区正常人群感染HBV基因型均为B型,血吸虫疫区人群感染HBV基因型以B型为主,其次为C型、BC混合感染型。 展开更多

关键词 乙型肝炎病毒 基因型 检测

原文传递

变性高效液相色谱法在α-血红蛋白稳定蛋白基因检测中的应用

17

作者 王志鹏 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期335-341,共7页

建立了采用变性高效液相色谱（DHPLC）对α-血红蛋白稳定蛋白（AHSP）基因进行基因分型和突变筛查的新方法。将AHSP基因序列分成6个片段,因第一、二、四、六个片段均含有1~2个常见单核苷酸多态性（single nu-cleotide polymorphism,SNP... 建立了采用变性高效液相色谱（DHPLC）对α-血红蛋白稳定蛋白（AHSP）基因进行基因分型和突变筛查的新方法。将AHSP基因序列分成6个片段,因第一、二、四、六个片段均含有1~2个常见单核苷酸多态性（single nu-cleotide polymorphism,SNP）位点,需单个标本分别进行检测;第三、五个片段不含有常见SNP位点,采用DHPLC结合DNA（脱氧核糖核酸）池的方法进行检测。以基因测序为金标准对所建立的AHSP基因检测方法进行方法学评价,结果显示：40个样品的DHPLC检测结果与测序结果之间完全吻合,说明所建立的检测方法能对AHSP基因6种常见SNP进行准确基因分型。应用DHPLC对365个样品的AHSP基因进行检测,发现2个罕见SNP（11 810G〉A和12 802C〉T）;同时还发现2个错义突变（AHSP D29V和AHSP V56G）,AHSP D29V突变为新突变,AH-SP V56G为罕见突变。结果表明采用DHPLC法可有效地对AHSP基因进行基因分型和突变筛查。 展开更多

关键词 变性高效液相色谱 α-血红蛋白稳定蛋白基因 基因分型 突变筛查

下载PDF 职称材料

人乳头瘤病毒基因分型检测方法及质量评价

18

作者 王瑞霞 王军 杨宗兵 《中国医疗器械信息》 2013年第5期17-20,共4页

人乳头瘤病毒基因分型检测对子宫颈病变的早期发现、宫颈细胞学异常的评估和管理,病程的进展,高度宫颈上皮内瘤变治疗后的随访,以及人群的流行病学状态和病毒疫苗的研制有重要意义。目前国内外对人乳头瘤病毒进行基因分型的方法主要集... 人乳头瘤病毒基因分型检测对子宫颈病变的早期发现、宫颈细胞学异常的评估和管理,病程的进展,高度宫颈上皮内瘤变治疗后的随访,以及人群的流行病学状态和病毒疫苗的研制有重要意义。目前国内外对人乳头瘤病毒进行基因分型的方法主要集中在以靶序列扩增为基础的检测技术和以信号放大为基础的检测技术两方面。但在HPV的检测应用中存在一定的困惑,如何评价这些方法,保障临床检测质量,更好地为临床服务,是检测机构思考的问题。本文就人乳头瘤病毒基因分型检测方法及质量评价要点进行简要阐述。 展开更多

关键词 人乳头瘤病毒 基因分型 检测 质量评价

下载PDF 职称材料

一种用于CYP3A5基因分型的电化学传感器阵列设计

19

作者 张海燕 王捷 +2 位作者 陈钰 吴小丽 刘仲明 《现代生物医学进展》 CAS 2011年第15期2967-2969,共3页

目的:设计一种用于检测CYP3A5基因分型的电化学传感器阵列及其不同基因型的判别方法。方法:设计的电化学基体由印刷电路板(PCB)组成,该电路板包含一组金电极。每个金电极表面修饰有包含单链捕获探针的自组装单分子膜。设计中使用二茂铁... 目的:设计一种用于检测CYP3A5基因分型的电化学传感器阵列及其不同基因型的判别方法。方法:设计的电化学基体由印刷电路板(PCB)组成,该电路板包含一组金电极。每个金电极表面修饰有包含单链捕获探针的自组装单分子膜。设计中使用二茂铁做为电活性指示剂,基因分型检测是通过两种不同电势的二茂铁衍生物分别标记等位基因特异性信号探针来实现。结果:该设计能构建一种快速准确、操作简便的DNA电化学传感器阵列检测系统。结论:本文设计为使用电化学方法检测基因分型提供了一种新方法和新技术。 展开更多

关键词 传感器 基因分型 检测

原文传递

TCT和HPV基因分型检测技术在宫颈癌筛查中的临床应用 被引量：19

20

作者 陆少颜 伍淑瑶 +5 位作者 梁小萍 陈泳言 谭忠伟 彭彧 严秋林 陈敏 《中国妇幼保健》 CAS 北大核心 2011年第11期1710-1711,共2页

目的:探讨导流杂交基因芯片技术(HybriMax)联合薄层液基细胞学(TCT)在宫颈癌筛查临床应用。方法:2009年1月～2010年3月1 500例患者的宫颈脱落细胞为标本来源,采用薄层液基细胞学技术进行细胞学检查,同时采用导流杂交基因芯片技术进行高... 目的:探讨导流杂交基因芯片技术(HybriMax)联合薄层液基细胞学(TCT)在宫颈癌筛查临床应用。方法:2009年1月～2010年3月1 500例患者的宫颈脱落细胞为标本来源,采用薄层液基细胞学技术进行细胞学检查,同时采用导流杂交基因芯片技术进行高危型人乳头瘤病毒分型检测,TCT≥ASCUS或HPV阳性的患者进行阴道镜下活组织病理学检查。结果:1 500例受检者TCT结果异常238例,占15.9%,HPV阳性者316例,占21.1%;CINⅡ以上检测敏感率TCT为75.9%～100.0%、HPV为80.0%～100.0%、TCT联合HPV检测为89.8%～100.0%,TCT联合HPV检测明显优于单次HPV检测或者单次TCT的检查。结论:HPV基因分型(HybriMax)与TCT联合检测时可提高宫颈癌前病变的检出率,是一种高效、便捷的宫颈癌筛查方法。 展开更多

关键词 薄层液基细胞学 人乳头瘤病毒基因分型 宫颈癌筛查

原文传递