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烟草属植物遗传多样性和亲缘进化关系的荧光AFLP分析
被引量:
20
1
作者
李凤霞
王卫锋
+2 位作者
王鲁
崔萌萌
孙玉合
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期2418-2427,共10页
【目的】研究烟草属不同亚属以及不同类型栽培烟草的遗传相似性关系,为明确烟草野生种和栽培烟草的遗传多样性水平、研究栽培烟草起源演化提供依据。【方法】利用CEQ8000遗传分析系统,对烟草属内4种类型的5份栽培烟草以及28份烟草野生...
【目的】研究烟草属不同亚属以及不同类型栽培烟草的遗传相似性关系,为明确烟草野生种和栽培烟草的遗传多样性水平、研究栽培烟草起源演化提供依据。【方法】利用CEQ8000遗传分析系统,对烟草属内4种类型的5份栽培烟草以及28份烟草野生种进行荧光AFLP分析,估算其遗传相似系数,并对28份烟草野生种、5份栽培烟草及其可能的祖先种分别进行UPGMA聚类分析。【结果】利用10对AFLP引物在33份种质中共扩增到2 423个片段,2 394个具有多态性。烟草属33份种质的遗传相似系数在0.021—0.860,平均为0.269。当相似系数为0.309时,28份野生烟草按其亚属聚为3类。2个栽培烟草种的5份不同类型烟草与其对应的可能祖先种首先聚为一类。在不同类型普通烟草中扩增到的AFLP共有片段,有97.7%可以在其可能的祖先种中找到。【结论】烟草属植物具有丰富的遗传多样性。栽培烟草进化过程中,其假设的祖先亲本都有一定贡献,其中N.sylvestris对普通烟草的形成贡献最大。
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关键词
烟草属
遗传多样性
亲缘进化关系
荧光AFLP
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职称材料
论我国兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松种间遗传进化关系(英文)
被引量:
7
2
作者
胡新生
王笑山
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
1999年第3期84-96,共13页
兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松是我国重要的木材树种,然而由于采用不同的性状进行分类,它们种间关系问题一直在争论着。国外研究人员如OstenfeldandLarsen(1930)等认为长白落叶松和华北落叶松为兴安落...
兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松是我国重要的木材树种,然而由于采用不同的性状进行分类,它们种间关系问题一直在争论着。国外研究人员如OstenfeldandLarsen(1930)等认为长白落叶松和华北落叶松为兴安落叶松的2个变种,而我国科学家则把它们视为两个单独的种,并且还认为长白落叶松有3个变种存在,而华北落叶松有1个变种存在。因此用分子遗传学方法研究兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松3个种间遗传进化关系有着重要的实际意义,例如种间杂种优势的利用潜势预测。至今植物分类研究所采用的性状已包括有表型形态、生殖、生化、蛋白质(同功酶)到RNA和DNA的分子标记等,进行综合性状分类比较。由于这些变量所经受的环境影响和所包含的各种历史事件(如突变、选择、连锁等)不同,因此应用不同性状分类时,有可能导致不一致的结果。本文分别从形态性状,包括球果和木材解剖特征等、染色体核型分析、同功酶变异、RAPD分析、叶绿体DNA的RFLP分析,以及叶绿体DNA3个非编码碱基序列(1452bp)对这3个落叶松种的遗传进化关系进行了详细的探讨和评述。从表型和生态适应性状变异看,这3个落叶松种可以较容易的区别出来,它们有着不同的生态特?
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关键词
兴安落叶松
长白落叶松
华北落叶松
遗传进化关系
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职称材料
基于线粒体基因的石珊瑚分子系统学研究
被引量:
6
3
作者
刘丽
李晓娜
+1 位作者
陈育盛
刘楚吾
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期814-820,共7页
以广东徐闻地区常见的6科10属17种石珊瑚的21个样本为研究对象,对线粒体COⅠ、16SrRNA和mtSSU三基因片段数据进行了联合分析,并计算了属间和科间遗传距离;利用邻接法、最大简约法和最大似然法分别构建了分子系统树。序列分析结果显示,...
以广东徐闻地区常见的6科10属17种石珊瑚的21个样本为研究对象,对线粒体COⅠ、16SrRNA和mtSSU三基因片段数据进行了联合分析,并计算了属间和科间遗传距离;利用邻接法、最大简约法和最大似然法分别构建了分子系统树。序列分析结果显示,石珊瑚线粒体基因碱基构成同样具有AT偏倚特征;石珊瑚属间的遗传距离显著大于属内遗传距离,而所有石珊瑚与两个外类种群的距离均大于石珊瑚之间的遗传距离;在系统发育树中,分子系统分类结果与形态学分类阐述的遗传进化关系略有差别,暗示传统形态学分类可能受珊瑚骨骼生长可塑性限制。
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关键词
石珊瑚
联合分析
分子系统分类
遗传进化关系
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职称材料
貂源冠状病毒与2019新型冠状病毒的遗传进化关系
被引量:
1
4
作者
杨艳玲
程世鹏
任林柱
《中国动物检疫》
CAS
2020年第4期21-26,共6页
为进一步明确貂源冠状病毒与新型人冠状病毒HCoV-19的遗传进化关系,比较了NCBI上公布的3株水貂冠状病毒、5株雪貂冠状病毒以及人冠状病毒HCoV-19和SARS-Cov的全基因组、ORF1a、ORF1ab和病毒表面蛋白Spike的序列同源性,分析了其遗传进化...
为进一步明确貂源冠状病毒与新型人冠状病毒HCoV-19的遗传进化关系,比较了NCBI上公布的3株水貂冠状病毒、5株雪貂冠状病毒以及人冠状病毒HCoV-19和SARS-Cov的全基因组、ORF1a、ORF1ab和病毒表面蛋白Spike的序列同源性,分析了其遗传进化关系,以及组成病毒的结构蛋白和非结构蛋白的种类、基因位置及氨基酸数量。结果显示:貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19全基因组、ORF1a、ORF1ab、Spike蛋白的相似性分别为68%、46.96%、52.44%、47.36%;貂源冠状病毒与HCoV-19不属于同一分支,且亲缘关系较远;同时,貂源冠状病毒与HCoV-19全基因组在蛋白组成、氨基酸数量、基因位置上均存在显著差异。结果表明,貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19不是同一种冠状病毒,此次在人群中流行的新型冠状病毒HCoV-19由貂源冠状病毒重组而成的可能性很小,因此可初步排除HCoV-19来源于水貂和雪貂的可能性。
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关键词
水貂冠状病毒
新型冠状病毒(HCoV-19)
基因组
遗传进化关系
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职称材料
题名
烟草属植物遗传多样性和亲缘进化关系的荧光AFLP分析
被引量:
20
1
作者
李凤霞
王卫锋
王鲁
崔萌萌
孙玉合
机构
中国农业科学院烟草研究所
中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第12期2418-2427,共10页
基金
国家烟草专卖局科技计划项目(110200601001)
文摘
【目的】研究烟草属不同亚属以及不同类型栽培烟草的遗传相似性关系,为明确烟草野生种和栽培烟草的遗传多样性水平、研究栽培烟草起源演化提供依据。【方法】利用CEQ8000遗传分析系统,对烟草属内4种类型的5份栽培烟草以及28份烟草野生种进行荧光AFLP分析,估算其遗传相似系数,并对28份烟草野生种、5份栽培烟草及其可能的祖先种分别进行UPGMA聚类分析。【结果】利用10对AFLP引物在33份种质中共扩增到2 423个片段,2 394个具有多态性。烟草属33份种质的遗传相似系数在0.021—0.860,平均为0.269。当相似系数为0.309时,28份野生烟草按其亚属聚为3类。2个栽培烟草种的5份不同类型烟草与其对应的可能祖先种首先聚为一类。在不同类型普通烟草中扩增到的AFLP共有片段,有97.7%可以在其可能的祖先种中找到。【结论】烟草属植物具有丰富的遗传多样性。栽培烟草进化过程中,其假设的祖先亲本都有一定贡献,其中N.sylvestris对普通烟草的形成贡献最大。
关键词
烟草属
遗传多样性
亲缘进化关系
荧光AFLP
Keywords
Nicotiana
genetic
diversity
genetic
evolutionary
relationship
fluorescent
AFLP
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
论我国兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松种间遗传进化关系(英文)
被引量:
7
2
作者
胡新生
王笑山
机构
中国林业科学研究院林业研究所
英国爱丁堡大学生态与资源管理学院
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
1999年第3期84-96,共13页
文摘
兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松是我国重要的木材树种,然而由于采用不同的性状进行分类,它们种间关系问题一直在争论着。国外研究人员如OstenfeldandLarsen(1930)等认为长白落叶松和华北落叶松为兴安落叶松的2个变种,而我国科学家则把它们视为两个单独的种,并且还认为长白落叶松有3个变种存在,而华北落叶松有1个变种存在。因此用分子遗传学方法研究兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松3个种间遗传进化关系有着重要的实际意义,例如种间杂种优势的利用潜势预测。至今植物分类研究所采用的性状已包括有表型形态、生殖、生化、蛋白质(同功酶)到RNA和DNA的分子标记等,进行综合性状分类比较。由于这些变量所经受的环境影响和所包含的各种历史事件(如突变、选择、连锁等)不同,因此应用不同性状分类时,有可能导致不一致的结果。本文分别从形态性状,包括球果和木材解剖特征等、染色体核型分析、同功酶变异、RAPD分析、叶绿体DNA的RFLP分析,以及叶绿体DNA3个非编码碱基序列(1452bp)对这3个落叶松种的遗传进化关系进行了详细的探讨和评述。从表型和生态适应性状变异看,这3个落叶松种可以较容易的区别出来,它们有着不同的生态特?
关键词
兴安落叶松
长白落叶松
华北落叶松
遗传进化关系
Keywords
L.gmelinii
(Rupr.)
Rupr,
L.olgensis
Henry,
L.principis
rupprechtii
Mayr.,
genetic
evolutionary
relationship
分类号
S791.220.1 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
基于线粒体基因的石珊瑚分子系统学研究
被引量:
6
3
作者
刘丽
李晓娜
陈育盛
刘楚吾
机构
广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期814-820,共7页
基金
国家海洋公益性行业科研专项,201105012号
广东省自然科学基金项目,S2011010000269号
广东省海洋渔业科技推广专项,A200908F01号
文摘
以广东徐闻地区常见的6科10属17种石珊瑚的21个样本为研究对象,对线粒体COⅠ、16SrRNA和mtSSU三基因片段数据进行了联合分析,并计算了属间和科间遗传距离;利用邻接法、最大简约法和最大似然法分别构建了分子系统树。序列分析结果显示,石珊瑚线粒体基因碱基构成同样具有AT偏倚特征;石珊瑚属间的遗传距离显著大于属内遗传距离,而所有石珊瑚与两个外类种群的距离均大于石珊瑚之间的遗传距离;在系统发育树中,分子系统分类结果与形态学分类阐述的遗传进化关系略有差别,暗示传统形态学分类可能受珊瑚骨骼生长可塑性限制。
关键词
石珊瑚
联合分析
分子系统分类
遗传进化关系
Keywords
Scleractinian,
Combined
analysis,
Molecular
systematics,
genetic
evolutionary
relationship
分类号
Q959.133 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
貂源冠状病毒与2019新型冠状病毒的遗传进化关系
被引量:
1
4
作者
杨艳玲
程世鹏
任林柱
机构
中国农业科学院特产研究所
吉林大学动物科学学院
出处
《中国动物检疫》
CAS
2020年第4期21-26,共6页
基金
“十三五”国家重大科研专项(2016YFD0500900)
中国农业科学院创新工程基金项目(20140204066NY)
国家自然科学基金面上项目(31772747).
文摘
为进一步明确貂源冠状病毒与新型人冠状病毒HCoV-19的遗传进化关系,比较了NCBI上公布的3株水貂冠状病毒、5株雪貂冠状病毒以及人冠状病毒HCoV-19和SARS-Cov的全基因组、ORF1a、ORF1ab和病毒表面蛋白Spike的序列同源性,分析了其遗传进化关系,以及组成病毒的结构蛋白和非结构蛋白的种类、基因位置及氨基酸数量。结果显示:貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19全基因组、ORF1a、ORF1ab、Spike蛋白的相似性分别为68%、46.96%、52.44%、47.36%;貂源冠状病毒与HCoV-19不属于同一分支,且亲缘关系较远;同时,貂源冠状病毒与HCoV-19全基因组在蛋白组成、氨基酸数量、基因位置上均存在显著差异。结果表明,貂源冠状病毒与新型冠状病毒HCoV-19不是同一种冠状病毒,此次在人群中流行的新型冠状病毒HCoV-19由貂源冠状病毒重组而成的可能性很小,因此可初步排除HCoV-19来源于水貂和雪貂的可能性。
关键词
水貂冠状病毒
新型冠状病毒(HCoV-19)
基因组
遗传进化关系
Keywords
mink
coronavirus
2019
novel
coronavirus(HCoV-19)
genome
genetic
evolutionary
relationship
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草属植物遗传多样性和亲缘进化关系的荧光AFLP分析
李凤霞
王卫锋
王鲁
崔萌萌
孙玉合
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
20
下载PDF
职称材料
2
论我国兴安落叶松、长白落叶松及华北落叶松种间遗传进化关系(英文)
胡新生
王笑山
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
1999
7
下载PDF
职称材料
3
基于线粒体基因的石珊瑚分子系统学研究
刘丽
李晓娜
陈育盛
刘楚吾
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2012
6
下载PDF
职称材料
4
貂源冠状病毒与2019新型冠状病毒的遗传进化关系
杨艳玲
程世鹏
任林柱
《中国动物检疫》
CAS
2020
1
下载PDF
职称材料
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