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西北部分地区苦马豆根瘤菌的遗传多样性
被引量:
9
1
作者
徐琳
徐佳洁
+2 位作者
刘巧莉
谢瑞美
韦革宏
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期69-75,共7页
苦马豆(Sphaerophysa salsula)是荒漠区重要的豆科植物。为了研究其共生根瘤菌的多样性,本试验采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析方法,对西北部分地区的苦马豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析。结果表明,57株供试菌株共...
苦马豆(Sphaerophysa salsula)是荒漠区重要的豆科植物。为了研究其共生根瘤菌的多样性,本试验采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析方法,对西北部分地区的苦马豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析。结果表明,57株供试菌株共产生了9种遗传图谱类型,对每种图谱类型的代表性菌株进行16S rDNA全序列分析的结果表明,它们分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)和Shinella kummerowiae。不同地域的菌株在多样性方面也有明显差异:分离自银川的苦马豆根瘤菌的Jaccard相似性系数较低;而来自民乐县和临泽县的菌株有着非常丰富的遗传多样性,其Simpson指数分别为0.826和0.710,Shannon-Wiener指数分别为1.831和1.530。以上结果为进一步确定西北地区豆科植物根瘤菌的系统分类地位提供了依据。
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关键词
Sphaerophysa
salsula
系统发育
16S
RDNA
PCR-RFLP
16SrDNA全序列
遗传多样性
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职称材料
加工型辣椒种质资源遗传多样性分析
被引量:
1
2
作者
韩娅楠
行文妍
+4 位作者
史艳艳
程志芳
常晓轲
董晓宇
姚秋菊
《山东农业科学》
北大核心
2024年第1期34-42,共9页
为了解加工型辣椒种质资源的遗传多样性,本研究对33份加工型辣椒种质的24个农艺性状、8个品质性状和炭疽病抗性进行遗传多样性、相关性和聚类分析。结果表明,24个农艺性状中株幅、果梗长度、果肉厚的Shannon-Wiener多样性指数(H′)较大...
为了解加工型辣椒种质资源的遗传多样性,本研究对33份加工型辣椒种质的24个农艺性状、8个品质性状和炭疽病抗性进行遗传多样性、相关性和聚类分析。结果表明,24个农艺性状中株幅、果梗长度、果肉厚的Shannon-Wiener多样性指数(H′)较大,性状遗传较丰富;单株产量变异系数最大(73.55%),心室数变异系数最小(9.18%)。单株产量与果肉厚、果纵径、果横径极显著正相关。8个品质性状中,辣椒素和二氢辣椒素含量的变异系数较大,分别为106.98%和112.44%。相关性分析表明,辣度与粗纤维和蛋白质含量显著正相关,与辣椒素和二氢辣椒素含量极显著正相关,与水分含量显著负相关。根据品质性状的隶属度将33份加工型辣椒种质聚为三大类群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),平均隶属度分别为0.32、0.47、0.64。炭疽病抗性与农艺、品质性状相关性分析表明,辣椒炭疽病抗性与水分含量、果纵径、心室数极显著正相关,与蛋白质、粗纤维含量极显著负相关。本研究结果可为加工型辣椒品种的应用及选育提供一定的理论依据。
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关键词
加工型辣椒
种质资源
农艺性状
品质性状
遗传多样性
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职称材料
中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析
被引量:
3
3
作者
管松
侯冠彧
+3 位作者
王东劲
曾鸿普
吴金山
马月辉
《家畜生态学报》
2009年第3期22-27,共6页
为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平。21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂...
为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平。21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂合度分别为0.840、0.768、0.825;多态信息含量分别为0.809、0.738、0.770,结果表明文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡均具有较大的遗传变异,且遗传多样性较为丰富。为中国热带鸡品种资源保护与开发提供了科学依据。
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关键词
文昌鸡
粤黄882
海南黎鸡
微卫星
遗传多样性
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职称材料
二种体色拟穴青蟹群体ISSR分析
被引量:
4
4
作者
蔡小辉
宋忠魁
+3 位作者
彭银辉
聂振平
赵鹏
苏琼
《台湾海峡》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期363-368,共6页
应用ISSR分子标记技术分析二种体色拟穴青蟹群体的遗传多样性.10条ISSR引物共扩增出81条带,其中73条表现出多态性,占总条带数的90.12%.暗红色和深绿色拟穴青蟹群体的多态性位点比率分别为81.48%和77.78%,暗红色群体的Nei’s基因多样性指...
应用ISSR分子标记技术分析二种体色拟穴青蟹群体的遗传多样性.10条ISSR引物共扩增出81条带,其中73条表现出多态性,占总条带数的90.12%.暗红色和深绿色拟穴青蟹群体的多态性位点比率分别为81.48%和77.78%,暗红色群体的Nei’s基因多样性指数(He=0.318 9)和Shannon’s信息指数(I=0.469 0)略高于深绿色群体(He=0.305 4,I=0.449 1).群体间的Nei’s遗传相似性(0.948 4)和遗传距离(0.052 9)表明,群体间遗传分化属于种内遗传分化.POPGENE和AMOVA分析表明,总的遗传变异主要来源于群体内个体间,群体间发生中等程度遗传分化,群体间存在强大的基因流.UPGMA聚类图可视化群体间和群体内的遗传变异,显示60个个体并没有按体色聚类.
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关键词
海洋生物学
拟穴青蟹
体色
ISSR
遗传多样性
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职称材料
麋鹿mtDNA控制区序列遗传多样性分析
被引量:
2
5
作者
孟浩
武慧娟
+2 位作者
张林源
韩春梅
高庆华
《经济动物学报》
CAS
2014年第1期15-18,23,共5页
为研究北京南海子麋鹿苑麋鹿的遗传多样性和进化系统,采用聚合酶链式反应(PCR)技术对13头麋鹿mtDNA控制区(D-环区)进行全序列扩增,对所得PCR产物进行测序,获得1 199 bp核甘酸序列片段,G+C含量占39.1%,其中仅有6个位点存在变异和转化,3...
为研究北京南海子麋鹿苑麋鹿的遗传多样性和进化系统,采用聚合酶链式反应(PCR)技术对13头麋鹿mtDNA控制区(D-环区)进行全序列扩增,对所得PCR产物进行测序,获得1 199 bp核甘酸序列片段,G+C含量占39.1%,其中仅有6个位点存在变异和转化,3种单倍型多样性为0.295,核苷酸多样性为0.039%。证明麋鹿的遗传多样性较低。将所测的麋鹿样本的mtDNA控制区序列与马鹿、坡鹿等鹿亚科动物进行比较,构建NJ分子系统发育树,研究其种间亲缘关系最近的为坡鹿、泽鹿。
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关键词
麋鹿
线粒体DNA
D-环区
分子进化
遗传性多样性
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职称材料
利用分子标记和形态学性状检测的陆地棉栽培品种遗传多样性
被引量:
67
6
作者
武耀廷
张天真
殷剑美
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第11期1040-1050,共11页
利用RAPD、ISSR和SSR 3种分子标记方法和 2年田间实验对国内外 36个陆地棉栽培品种的遗传多样性进行了研究。以 3种分子标记在 36个品种之间扩增的 2 82条多态性位点所赋值的 0、1数据 ,采用Nei和Li的方法 ,计算的品种成对相似系数从 0 ...
利用RAPD、ISSR和SSR 3种分子标记方法和 2年田间实验对国内外 36个陆地棉栽培品种的遗传多样性进行了研究。以 3种分子标记在 36个品种之间扩增的 2 82条多态性位点所赋值的 0、1数据 ,采用Nei和Li的方法 ,计算的品种成对相似系数从 0 5 745到 0 92 91 ,其品种平均数从 0 65 4 7到 0 75 2 4 ;又以 2年品种表现的性状平均数经正态标准化后 ,采用欧氏距离计算了成对品种的遗传距离。分别以相似系数和遗传距离矩阵 ,采用类平均法进行聚类分析 ,其聚类结果把供试品种大致分为国外品种、新疆品种、早熟类型品种和我国的中熟棉品种等几个类群 ;类内进一步分组表明 ,分子标记确定的遗传关系基本上与品种系谱的种质系统一致 ,但并不能按系谱或种植生态区域简单地归属 ;尽管分子标记数据计算的相似系数矩阵和表现型计算的遗传距离矩阵存在极显著的相关关系 (r=- 0 .335 ) ,但以遗传距离进行聚类分析的类内分组的组间特征不明显。分子标记是检测类内品种间遗传差异的有效方法 ,研究结果为棉花育种亲本选配提供了理论依据。
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关键词
棉花
分子标记
形态学
遗传多样性
聚类分析
陆地棉
品种
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职称材料
题名
西北部分地区苦马豆根瘤菌的遗传多样性
被引量:
9
1
作者
徐琳
徐佳洁
刘巧莉
谢瑞美
韦革宏
机构
西北农林科技大学生命科学学院
河西学院生命科学与工程系
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期69-75,共7页
基金
国家自然科学基金(30670372)
科技部农业微生物菌种资源整理、整合及共享试点子项目(2005DKA21201)
文摘
苦马豆(Sphaerophysa salsula)是荒漠区重要的豆科植物。为了研究其共生根瘤菌的多样性,本试验采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析方法,对西北部分地区的苦马豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析。结果表明,57株供试菌株共产生了9种遗传图谱类型,对每种图谱类型的代表性菌株进行16S rDNA全序列分析的结果表明,它们分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)和Shinella kummerowiae。不同地域的菌株在多样性方面也有明显差异:分离自银川的苦马豆根瘤菌的Jaccard相似性系数较低;而来自民乐县和临泽县的菌株有着非常丰富的遗传多样性,其Simpson指数分别为0.826和0.710,Shannon-Wiener指数分别为1.831和1.530。以上结果为进一步确定西北地区豆科植物根瘤菌的系统分类地位提供了依据。
关键词
Sphaerophysa
salsula
系统发育
16S
RDNA
PCR-RFLP
16SrDNA全序列
遗传多样性
Keywords
Sphaerophysa
salsula,
phylogeny,
16S
rDNA
PCR-RFLP,
16S
rDNA
sequencing,
genetic
di
-
versity
分类号
S154.3 [农业科学—土壤学]
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职称材料
题名
加工型辣椒种质资源遗传多样性分析
被引量:
1
2
作者
韩娅楠
行文妍
史艳艳
程志芳
常晓轲
董晓宇
姚秋菊
机构
河南省农业科学院蔬菜研究所
河南农业大学园艺学院
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第1期34-42,共9页
基金
现代农业产业技术体系项目(CARS-24-G-15)
河南省重点研发专项(221111110100)
+2 种基金
河南省农业科学院自主创新项目(2023ZC031)
河南省农业科学院创新团队专项(2023TD34)
河南省抗病抗逆辣椒良种攻关项目(2022010502)。
文摘
为了解加工型辣椒种质资源的遗传多样性,本研究对33份加工型辣椒种质的24个农艺性状、8个品质性状和炭疽病抗性进行遗传多样性、相关性和聚类分析。结果表明,24个农艺性状中株幅、果梗长度、果肉厚的Shannon-Wiener多样性指数(H′)较大,性状遗传较丰富;单株产量变异系数最大(73.55%),心室数变异系数最小(9.18%)。单株产量与果肉厚、果纵径、果横径极显著正相关。8个品质性状中,辣椒素和二氢辣椒素含量的变异系数较大,分别为106.98%和112.44%。相关性分析表明,辣度与粗纤维和蛋白质含量显著正相关,与辣椒素和二氢辣椒素含量极显著正相关,与水分含量显著负相关。根据品质性状的隶属度将33份加工型辣椒种质聚为三大类群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),平均隶属度分别为0.32、0.47、0.64。炭疽病抗性与农艺、品质性状相关性分析表明,辣椒炭疽病抗性与水分含量、果纵径、心室数极显著正相关,与蛋白质、粗纤维含量极显著负相关。本研究结果可为加工型辣椒品种的应用及选育提供一定的理论依据。
关键词
加工型辣椒
种质资源
农艺性状
品质性状
遗传多样性
Keywords
Processing-type
pepper
Germplasm
resources
Agronomic
traits
Quality
traits
genetic
di
-
versity
分类号
S641.303 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析
被引量:
3
3
作者
管松
侯冠彧
王东劲
曾鸿普
吴金山
马月辉
机构
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《家畜生态学报》
2009年第3期22-27,共6页
基金
国家科技基础平台项目(2005DKA21005-69)
文摘
为了解中国热带主要鸡品种的遗传资源现状,应用21对微卫星引物,检测了文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡3个群体,共138个体(公母各半)的遗传多样性水平。21个微卫星位点在三个群体检测的平均等位基因数为12.48,从3到32不等;三个群体平均遗传杂合度分别为0.840、0.768、0.825;多态信息含量分别为0.809、0.738、0.770,结果表明文昌鸡、粤黄882和海南黎鸡均具有较大的遗传变异,且遗传多样性较为丰富。为中国热带鸡品种资源保护与开发提供了科学依据。
关键词
文昌鸡
粤黄882
海南黎鸡
微卫星
遗传多样性
Keywords
Wenehang
Chicken
Guangdong
Huang
882
Hainan
Li
chicken
microsatellites
genetic
di
-
versity
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
二种体色拟穴青蟹群体ISSR分析
被引量:
4
4
作者
蔡小辉
宋忠魁
彭银辉
聂振平
赵鹏
苏琼
机构
广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室
出处
《台湾海峡》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期363-368,共6页
基金
广西自然科学基金资助项目(桂科自0991189)
广西教育厅科研课题经费资助项目(200809MS095)
广西海洋生物技术重点实验室开放基金资助项目(GKLMBT-0801)
文摘
应用ISSR分子标记技术分析二种体色拟穴青蟹群体的遗传多样性.10条ISSR引物共扩增出81条带,其中73条表现出多态性,占总条带数的90.12%.暗红色和深绿色拟穴青蟹群体的多态性位点比率分别为81.48%和77.78%,暗红色群体的Nei’s基因多样性指数(He=0.318 9)和Shannon’s信息指数(I=0.469 0)略高于深绿色群体(He=0.305 4,I=0.449 1).群体间的Nei’s遗传相似性(0.948 4)和遗传距离(0.052 9)表明,群体间遗传分化属于种内遗传分化.POPGENE和AMOVA分析表明,总的遗传变异主要来源于群体内个体间,群体间发生中等程度遗传分化,群体间存在强大的基因流.UPGMA聚类图可视化群体间和群体内的遗传变异,显示60个个体并没有按体色聚类.
关键词
海洋生物学
拟穴青蟹
体色
ISSR
遗传多样性
Keywords
c
marine
biology
Scylla
paramamosain
body
color
inter-simple
sequence
repeats
([SSR)
genetic
di
-
versity
分类号
P735 [天文地球—海洋生物学]
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职称材料
题名
麋鹿mtDNA控制区序列遗传多样性分析
被引量:
2
5
作者
孟浩
武慧娟
张林源
韩春梅
高庆华
机构
新疆兵团畜牧科技重点实验室
北京市理化分析测试中心
北京麋鹿生态实验中心
出处
《经济动物学报》
CAS
2014年第1期15-18,23,共5页
基金
塔里木大学校长基金创新群体项目(TDZKCX201201)
兵团技术转移计划项目(2011BD050)
文摘
为研究北京南海子麋鹿苑麋鹿的遗传多样性和进化系统,采用聚合酶链式反应(PCR)技术对13头麋鹿mtDNA控制区(D-环区)进行全序列扩增,对所得PCR产物进行测序,获得1 199 bp核甘酸序列片段,G+C含量占39.1%,其中仅有6个位点存在变异和转化,3种单倍型多样性为0.295,核苷酸多样性为0.039%。证明麋鹿的遗传多样性较低。将所测的麋鹿样本的mtDNA控制区序列与马鹿、坡鹿等鹿亚科动物进行比较,构建NJ分子系统发育树,研究其种间亲缘关系最近的为坡鹿、泽鹿。
关键词
麋鹿
线粒体DNA
D-环区
分子进化
遗传性多样性
Keywords
Elaphurus
davi
di
anus
(EIK)
mitochondrial
DNA
D-loop
molecular
evolution
genetic
di
-
versity
分类号
S864.3 [农业科学—野生动物驯养]
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职称材料
题名
利用分子标记和形态学性状检测的陆地棉栽培品种遗传多样性
被引量:
67
6
作者
武耀廷
张天真
殷剑美
机构
南京农业大学棉花研究所
出处
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001年第11期1040-1050,共11页
基金
国家杰出青年科学基金 (3 0 0 2 5 0 2 9)
高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划
教育部跨世纪人才基金资助
文摘
利用RAPD、ISSR和SSR 3种分子标记方法和 2年田间实验对国内外 36个陆地棉栽培品种的遗传多样性进行了研究。以 3种分子标记在 36个品种之间扩增的 2 82条多态性位点所赋值的 0、1数据 ,采用Nei和Li的方法 ,计算的品种成对相似系数从 0 5 745到 0 92 91 ,其品种平均数从 0 65 4 7到 0 75 2 4 ;又以 2年品种表现的性状平均数经正态标准化后 ,采用欧氏距离计算了成对品种的遗传距离。分别以相似系数和遗传距离矩阵 ,采用类平均法进行聚类分析 ,其聚类结果把供试品种大致分为国外品种、新疆品种、早熟类型品种和我国的中熟棉品种等几个类群 ;类内进一步分组表明 ,分子标记确定的遗传关系基本上与品种系谱的种质系统一致 ,但并不能按系谱或种植生态区域简单地归属 ;尽管分子标记数据计算的相似系数矩阵和表现型计算的遗传距离矩阵存在极显著的相关关系 (r=- 0 .335 ) ,但以遗传距离进行聚类分析的类内分组的组间特征不明显。分子标记是检测类内品种间遗传差异的有效方法 ,研究结果为棉花育种亲本选配提供了理论依据。
关键词
棉花
分子标记
形态学
遗传多样性
聚类分析
陆地棉
品种
Keywords
cotton
cultivar
molecular
marker
phenotypes
genetic
di
versity
cluster
analysis
分类号
S562 [农业科学—作物学]
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
西北部分地区苦马豆根瘤菌的遗传多样性
徐琳
徐佳洁
刘巧莉
谢瑞美
韦革宏
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2009
9
下载PDF
职称材料
2
加工型辣椒种质资源遗传多样性分析
韩娅楠
行文妍
史艳艳
程志芳
常晓轲
董晓宇
姚秋菊
《山东农业科学》
北大核心
2024
1
下载PDF
职称材料
3
中国热带地区三个鸡品种遗传多样性的微卫星分析
管松
侯冠彧
王东劲
曾鸿普
吴金山
马月辉
《家畜生态学报》
2009
3
下载PDF
职称材料
4
二种体色拟穴青蟹群体ISSR分析
蔡小辉
宋忠魁
彭银辉
聂振平
赵鹏
苏琼
《台湾海峡》
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
下载PDF
职称材料
5
麋鹿mtDNA控制区序列遗传多样性分析
孟浩
武慧娟
张林源
韩春梅
高庆华
《经济动物学报》
CAS
2014
2
下载PDF
职称材料
6
利用分子标记和形态学性状检测的陆地棉栽培品种遗传多样性
武耀廷
张天真
殷剑美
《Acta Genetica Sinica》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2001
67
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职称材料
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