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大鼠再生肝8种细胞的葡萄糖代谢基因转录谱预示的代谢活动 被引量:6
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作者 张丽君 常翠芳 徐存拴 《河南科学》 2010年第2期167-171,共5页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的葡萄糖代谢基因转录谱及其预示的葡萄糖代谢活动,用percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用RatGenome2302.0芯片等检测上述细胞的葡萄糖代谢基因在大鼠肝再生中的表达变化,... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的葡萄糖代谢基因转录谱及其预示的葡萄糖代谢活动,用percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用RatGenome2302.0芯片等检测上述细胞的葡萄糖代谢基因在大鼠肝再生中的表达变化,用H-Cluster软件分析基因表达模式,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的生理活动.结果表明,48个葡萄糖代谢基因在大鼠肝再生中发生了有意义的表达变化,其中上调、下调和上/下调的基因数分别为20、14、14,上述细胞的相应基因数为14、8和0,11、6和0,6、4和0,7、11和0,11、6和2,6、5和1,12、5和0,9、9和1,呈现21种表达相关性.上述葡萄糖代谢基因转录谱预示,肝细胞和库普弗细胞的3-磷酸甘油醛合成增多,肝细胞和胆管上皮细胞的烯醇式丙酮酸合成增多,肝星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞的通过三羧酸循环产生ATP活动增强.结论:大鼠肝再生与葡萄糖代谢密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RatGenome2302.0芯片 基因表达谱分析 葡萄酸代谢
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大鼠肝再生中8种肝脏细胞的细胞免疫相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:4
2
作者 王磊 高静 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期302-306,共5页
目的了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的细胞免疫相关基因转录谱,及其预示的细胞免疫活动。方法用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞... 目的了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的细胞免疫相关基因转录谱,及其预示的细胞免疫活动。方法用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等8种细胞,用RatGenome2302.0芯片等检测细胞免疫相关基因在上述细胞中表达变化,用Cluster等软件及生物信息学和系统学生物等方法分析它们的表达模式及预示的生理活动。结果大鼠肝再生中40个细胞免疫相关基因发生了表达变化,相应细胞的基因数为19、19、9、19、19、21、22、21。肝再生启动阶段和进展阶段抗原肽-MHC复合物形成,NF-κB激酶活性和IL-2等细胞因子合成增加,终止阶段NF-κB促进细胞分化活动和caspase诱导T细胞凋亡活动增强。结论大鼠肝再生与细胞免疫相关。 展开更多
关键词 肝再生 Genome 230 2.0芯片 基因转录谱 细胞免疫 免疫磁珠分选 大鼠
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腈菌唑不同对映体对丽斑麻蜥性腺系统的影响 被引量:2
3
作者 朱飞龙 郝伟玉 +5 位作者 尹晶 常静 李济彤 李建中 李伟 王会利 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期147-155,共9页
腈菌唑(myclobutanil,MT)是一种应用广泛的手性杀菌剂,其手性对映体为(+)-腈菌唑(MT1)和(-)-腈菌唑(MT2)。腈菌唑手性单体具有不同的生物活性,但很少有其对爬行动物的对应选择毒性研究。为了评估腈菌唑手性单体对丽斑麻蜴性腺系统的毒... 腈菌唑(myclobutanil,MT)是一种应用广泛的手性杀菌剂,其手性对映体为(+)-腈菌唑(MT1)和(-)-腈菌唑(MT2)。腈菌唑手性单体具有不同的生物活性,但很少有其对爬行动物的对应选择毒性研究。为了评估腈菌唑手性单体对丽斑麻蜴性腺系统的毒性影响,将MT1(50 mg·kg-1)和MT2(50 mg·kg-1)以经口灌胃方式分别暴露给蜥蜴28 d。暴露期间,记录观察蜥蜴体重、血液中性激素(睾酮T和雌二醇E2)浓度以及性腺相关基因(3β-HSD、17β-HSD、CYP11A、CYP17、CYP19A、ER-α和AR)的表达图谱的变化。在MT1暴露组中,蜥蜴体重在28 d出现明显下降。而在MT2暴露组中,蜥蜴体重没有明显变化。雄性蜥蜴在经过1 d的暴露后,E2浓度在MT1暴露组中明显下降,而在MT2暴露组中明显上升。这些结果表明了腈菌唑手性单体的对映选择性毒性。在MT2暴露14 d后,雌性蜥蜴中CYP19A基因的表达上调弥补了体内E2浓度的降低。在MT1暴露的14 d,蜥蜴卵巢中观察到的CYP11A和CYP17基因表达下调以及CYP19A基因表达不变的这一现象解释了蜥蜴血液中E2和T的浓度减少。这些结果表明:MT1和MT2暴露对蜥蜴体内性激素造成不同的影响,而这些影响会相应改变性腺相关基因的表达。综上所述,MT1和MT2对性腺系统具有潜在的内分泌干扰效应,可能对蜥蜴造成不同程度的生殖损伤。 展开更多
关键词 腈菌唑 蜥蜴 内分泌干扰 基因表达图谱
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Gene Expression Profiles Predict Sensitivity of Prostate Cancer to Radiotherapy
4
作者 Lilach Agemy Itai Kela +5 位作者 Tova Waks Raphael M. Pfeffer Anat Bar-Shira Avi Orr-Urtreger Eytan Domany Zelig Eshhar 《Journal of Cancer Therapy》 2013年第4期11-26,共16页
Ionizing radiation (IR) is the most common treatment used to control localized primary prostate cancer (PC). However, for a significant number of patients, radiotherapy fails to adequately control the tumor. Thus, a m... Ionizing radiation (IR) is the most common treatment used to control localized primary prostate cancer (PC). However, for a significant number of patients, radiotherapy fails to adequately control the tumor. Thus, a main clinical problem today is the lack of a specific marker that may be used to predict the treatment outcome and to identify prostate cancer patients who are unlikely to respond to radiation therapy. In this study, we used human PC xenografts with predetermined radioresistant/sensitive phenotypes, and gene expression microarrays, correlated their specific transcripttional profiles with response to radiation. Employing unsupervised two-way hierarchical clustering, we identified four gene clusters displaying different expression patterns. Two clusters showed higher expression levels in the resistant xenografts and the other two clusters showed higher expression levels in the sensitive xenografts. Expression levels of 113 genes differed by at least 3 fold between sensitive and resistant xenografts. These genes represent members of several cellular pathways, some of which are known to be associated with response to radiation. All or several of these genes could serve as predictive tools to determine at biopsy the expected response of a particular tumor to radiotherapy. Indeed, the profiles we identified enabled us to predict the degree of radiosensitivity of a panel of established PC cell lines. Importantly, irradiation of the PC xenografts did not induce any significant changes in gene expression, regardless of their susceptibility phenotype. These data strongly support the first of two models: a: a random effect of irradiation on a homogeneous population of cells, rather than b: of a tumor comprised of a mixture of radioresistant and radiosensitive cell subpopulations. Our findings imply that each of the radio-phenotypes represents different intrinsic characteristics that affect the ability of a tumor to survive radiotherapy. 展开更多
关键词 PROSTATE Cancer Ionizing Radiation RADIORESISTANCE Radiosensitive gene MICROARRAY transcription profiles
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大鼠再生肝8种细胞的PPARγ信号通路相关基因转录谱预示脂类代谢活动 被引量:1
5
作者 秦波 郭学强 徐存拴 《河南科学》 2010年第7期786-790,共5页
为了解大鼠肝再生中肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等8种肝脏细胞的PPARγ信号通路相关基因转录谱及其预示的脂类代谢活动,按本卷2期张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,... 为了解大鼠肝再生中肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等8种肝脏细胞的PPARγ信号通路相关基因转录谱及其预示的脂类代谢活动,按本卷2期张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的PPARγ信号通路基因表达谱,分析其预示的生理活动.结果表明,41个PPARγ信号通路相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义的表达变化,其中上调、下调和上/下调的基因为9、9、23个,呈现15种表达相关性.相应细胞的基因数为10、6和1,10、12和2,7、7和0,16、8和3,18、7和1,10、6和1,11、20和0,13、9和4.它们的转录谱预示,胆管上皮细胞和星形细胞的脂肪合成、星形细胞和树突状细胞的胆固醇代谢、8种肝脏细胞的脂肪酸运输和脂肪细胞分化、星形细胞、窦内皮细胞和树突状细胞的脂肪酸氧化和糖异生、胆管上皮细胞和树突状细胞的能量代谢增强.上述结果表明,PPARγ信号通路与大鼠肝再生密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RatGenome2302.0芯片 PPARγ信号通路 基因表达谱分析
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大鼠肝再生中8种肝脏细胞的凝血反应相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:1
6
作者 崔胜男 高静 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期313-317,共5页
目的了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的凝血反应相关基因转录谱及其预示的生理活动。方法大鼠再生肝8种细胞的分离,基因表达变化检测,预示的生理活动分析用Cluster等软件及生物信息学和系统生物等方法进行,用MicrosoftExcel等软件分析基因... 目的了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的凝血反应相关基因转录谱及其预示的生理活动。方法大鼠再生肝8种细胞的分离,基因表达变化检测,预示的生理活动分析用Cluster等软件及生物信息学和系统生物等方法进行,用MicrosoftExcel等软件分析基因的表达模式。结果40个参与凝血反应的基因与肝再生相关,肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞的相应基因数为13、31、12、33、32、9、34、33。serpine1、a2m在上述8种细胞,vwf、klkb1在除库普弗细胞之外的7种细胞,其他基因在两种或两种以上细胞中发生有意义表达变化。上述基因转录谱预示,肝再生启动和进展阶段激肽释放酶和凝血酶原合成,凝血酶形成等活动增强。终止阶段纤维蛋白单体形成纤维蛋白聚合体等活动增强。结论大鼠肝再生与凝血反应密切相关。 展开更多
关键词 肝再生 Genome 230 2.0芯片 基因表达谱分析 凝血反应 免疫磁珠分选 大鼠
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大鼠再生肝8种细胞的脂肪酸代谢基因转录谱预示的生化活动
7
作者 郭学强 秦波 徐存拴 《河南科学》 2010年第3期296-300,共5页
为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪酸代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的脂肪酸代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的生理活动.结果表明,44个脂肪酸代谢基因在大鼠肝再生中发生了有... 为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪酸代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的脂肪酸代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的生理活动.结果表明,44个脂肪酸代谢基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为22、18、11、21、19、13、27、18,上调、下调和上/下调的基因个数为11、14和19,相应细胞的基因个数为6、15和1,7、8和3,3、8和0,16、3和2,12、7和0,8、5和0,6、21和0,9、5和4.肝细胞、胆管上皮细胞、星形细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等6种细胞的脂肪酸合成相关基因表达增强,肝细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等6种细胞的脂肪酸分解相关基因表达增强.上述结果预示大鼠肝再生中脂肪酸代谢活动增强,与大鼠肝再生密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 脂肪酸代谢
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大鼠再生肝8种细胞的脂肪代谢基因转录谱预示的生化活动
8
作者 郭学强 秦波 徐存拴 《河南科学》 2010年第5期542-546,共5页
为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的脂肪代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的代谢活动.结果表明,29个脂肪代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有... 为了解大鼠再生肝8种细胞的脂肪代谢基因转录谱及预示的生化活动,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的脂肪代谢基因表达变化,分析其表达相关性及预示的代谢活动.结果表明,29个脂肪代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义的表达变化,8种细胞的相应基因个数为18、14、7、9、8、10、14、17.上调、下调和上/下调的基因个数为13、6和10,相应细胞的基因个数为10、8和0,12、2和0,5、2和0,5、3和1,5、2和1,8、2和0,8、6和0,10、7和0.8种肝脏细胞的脂肪分解相关基因表达增强.肝细胞、胆管上皮细胞、星形细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞等6种细胞的脂肪合成相关基因表达增强.预示大鼠肝再生中脂肪代谢活动增强,与大鼠肝再生密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 230 2.0芯片 基因转录谱 脂肪代谢
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AW915115参与大鼠再生肝星形细胞的Notch信号转导
9
作者 郝晓霞 秦波 +2 位作者 陈晓光 张丽君 徐存拴 《河南科学》 2010年第9期1103-1107,共5页
为了解新基因AW915115在Notch信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片等检测上述细胞的Notch信号通路基因在大鼠肝再生中的表达变化,用BL... 为了解新基因AW915115在Notch信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片等检测上述细胞的Notch信号通路基因在大鼠肝再生中的表达变化,用BLAST、Microsoft Excel等软件分别分析新基因与已知基因的序列同源性和共表达关系,用生物信息学和系统生物学等方法分析上述基因参与的生理活动.结果表明,AW915115与活化Notch受体的N-乙酰葡糖基转移酶基因lfng同源,并且在2 h和12 h再生肝星形细胞中表达下调.根据上述基因的同源性和共表达关系推测,新基因AW915115参与大鼠再生肝星形细胞的Notch信号转导. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT GENOME 2302.0芯片 基因转录谱 Notch信号转导
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大鼠肝再生中肝脏细胞的基因转录谱预示AI408225促进抗原肽与TCR结合
10
作者 张明 于亚男 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期307-312,共6页
目的了解新基因AI408225与大鼠肝再生涉及的体液免疫相关性。方法大鼠再生肝8种细胞的分离,采用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法进行,用MicrosoftExcel、BLAST等软件分析基因的序列同源性及共表达关系,用生物信息学和系统生物... 目的了解新基因AI408225与大鼠肝再生涉及的体液免疫相关性。方法大鼠再生肝8种细胞的分离,采用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法进行,用MicrosoftExcel、BLAST等软件分析基因的序列同源性及共表达关系,用生物信息学和系统生物学等方法分析新基因参与的生理活动。结果93个参与体液免疫的已知基因与肝再生相关,肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、肝星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞、树突状细胞的体液免疫相关基因数为33、46、17、59、48、35、53、68。其中,cd4与AI408225同源和共表达。结论大鼠肝再生与体液免疫相关,AI408225参与MHCII-抗原肽-CD4-TCR复合物形成。 展开更多
关键词 肝再生 Genome 230 2.0芯片 基因表达谱 体液免疫 免疫磁珠分选 大鼠
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AA818342等6个新基因参与大鼠再生肝8种细胞的PLC信号转导
11
作者 李静雯 秦波 +2 位作者 陈晓光 于亚男 徐存拴 《河南科学》 2010年第8期931-940,共10页
为了解AA818342、BM389035、BF289002、BF403759、AI170687、AI715484等6个新基因在PLC信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的基因表达变化,分析新基因与已知基因的序列同源性、共表达关系及参与的... 为了解AA818342、BM389035、BF289002、BF403759、AI170687、AI715484等6个新基因在PLC信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,分离大鼠再生肝8种细胞,检测它们的基因表达变化,分析新基因与已知基因的序列同源性、共表达关系及参与的生理活动.结果表明,AA818342与col8a1同源,在30 h和72 h再生肝的卵圆细胞中表达下调,在各期再生肝的库普弗细胞中表达上调.BM389035与itga1同源,在168 h再生肝的树突状细胞中表达下调.BF289002与gnai1同源,在12 h和168 h再生肝的卵圆细胞表达上调.BF403759与cacna1d同源,在2 h再生肝的星形细胞表达上调.AI170687与mef2c同源,在36 h再生肝的树突状细胞中表达下调.AI715484与prkce同源,在2 h再生肝的星形细胞中表达上调.上述基因转录谱预示,AA818342等6个新基因属于PLC信号通路成分,参与大鼠再生肝8种细胞的PLC信号转导. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 RAT Genome2302.0芯片 基因转录谱 PLC信号转导
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大鼠再生肝8种细胞的基因转录谱预示BE115434和X76129参与凝血反应
12
作者 高静 常翠芳 徐存拴 《河南科学》 2010年第4期410-414,共5页
为了解新基因BE115434和X76129与大鼠再生肝的凝血反应相关性,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞、检测它们的基因表达变化,分析新基因的序列同源性、共表达关系及参与的生理活动.结果表明,X76129与纤溶酶原激活酶基因plaur同源... 为了解新基因BE115434和X76129与大鼠再生肝的凝血反应相关性,按张丽君[1]等方法分离大鼠再生肝8种细胞、检测它们的基因表达变化,分析新基因的序列同源性、共表达关系及参与的生理活动.结果表明,X76129与纤溶酶原激活酶基因plaur同源和共表达,BE115434与纤维蛋白活化因子抑制蛋白serpind1同源和共表达.它们的表达变化预示X76129和BE115434参与大鼠再生肝的凝血反应. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 Rat GENOME 230 2.0芯片 基因表达谱分析 凝血反应
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大鼠再生肝8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:4
13
作者 杨莹 张丽君 +1 位作者 刘焕之 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期176-180,共5页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的生物氧化相关基因转录谱及其预示的生理活动,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、星形细胞、窦内皮细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞等8种细胞,用Rat Genome2302.0芯片等检测生物氧化相关基因在上述细胞中表达变化,用H-Cluster等软件及生物信息学和系统学生物等方法分析它们的表达模式及预示的生理活动.结果表明:38个生物氧化相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,相应细胞的基因数为6,32,0,2,3,1,3,2个.肝再生启动阶段和进展阶段的NAD+合成增强,从NADH到O2的电子传递及ATP合成增强.终止阶段的FADH2分解减弱,从FADH2到O2的电子传递减弱.结论:大鼠肝再生与生物氧化密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 Rat Genome 230 2.0芯片 基因转录谱 生物氧化
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大鼠再生肝8种细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱预示的生理活动 被引量:1
14
作者 王撒 房连聪 +1 位作者 袁美玲 徐存拴 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期185-188,共4页
为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠... 为了解大鼠肝再生中8种肝脏细胞的嘧啶核苷酸代谢相关基因转录谱及其预示的代谢活动,分离大鼠再生肝的8种细胞,检测它们的嘧啶核苷酸代谢相关基因表达变化,分析其表达模式及预示的生理活动.结果表明,50个嘧啶核苷酸代谢相关基因在大鼠肝再生中发生了有意义表达变化,8种细胞的相应基因数为25、33、16、24、15、15、21和18.肝细胞、胆管上皮细胞、窦内皮细胞的通过嘧啶核苷酸前体合成嘧啶核苷酸活动增强,除树突状细胞外其他7种细胞的嘧啶核苷酸分解代谢减弱.结论:大鼠肝再生与嘧啶核苷酸代谢密切相关. 展开更多
关键词 大鼠肝再生 肝脏细胞 RAT Genome2302.0芯片 基因转录谱 嘧啶核苷酸代谢
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