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绿原酸抑制结肠癌HCT116细胞的机制研究 被引量：4
1
作者 向舒 唐宏伟 +3 位作者 周军 张胜 李湘洲 黄丹 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第23期4952-4957,共6页
目的探讨绿原酸对结肠癌HCT116细胞抑制作用的机制。方法以绿原酸处理HCT116细胞,未处理组为对照组,通过基因表达谱芯片筛选出处理前后的差异表达基因,应用Real-time PCR技术对胰岛素样生长因子结合蛋白3(IGFBP3)、肺腺癌转移相关转录本... 目的探讨绿原酸对结肠癌HCT116细胞抑制作用的机制。方法以绿原酸处理HCT116细胞,未处理组为对照组,通过基因表达谱芯片筛选出处理前后的差异表达基因,应用Real-time PCR技术对胰岛素样生长因子结合蛋白3(IGFBP3)、肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)、雄性性别决定基因相关高迁移率族盒基因(SOX4)、N-myc下游调节基因1(NDRG1)4个基因进行验证,Western blotting法检测上调基因中NDRG1的蛋白表达水平。结果基因表达谱芯片检测表明,经绿原酸处理后的结肠癌细胞中表达上调的基因为161个(差异倍数大于2),表达下调的基因为64个(差异倍数小于0.5)。这些基因主要涉及细胞信号转导、生物过程、细胞组分等功能。Real-time PCR检测证实IGFBP3、NDRG1基因经绿原酸处理后表达明显上调(P<0.05)。Western blotting检测表明,经绿原酸处理后NDRG1基因的蛋白表达水平上调。结论基因表达谱芯片结合Real-time PCR技术筛选出绿原酸处理后的差异表达基因,为揭示绿原酸抑制结肠癌细胞的作用机制提供依据。 展开更多
关键词 绿原酸 结肠癌 HCT116细胞 基因表达谱芯片 N-myc下游调节基因1
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高强度聚焦超声对人胰腺癌裸鼠移植瘤差异性表达基因的影响 被引量：1
2
作者 洪立立 郭志 +3 位作者 邢文阁 郭秀英 陈立军 武变荣 《介入放射学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第11期984-988,共5页
目的研究高强度聚焦超声(HIFU)辐照人胰腺癌移植瘤后差异性表达基因,从基因组学初步探讨HIFU的生物学机制。方法构建人胰腺癌裸鼠YY-1移植瘤模型,HIFU辐照后采用Agilent人类基因表达谱芯片检测差异性表达基因,反转录-聚合酶链反应(RT-P... 目的研究高强度聚焦超声(HIFU)辐照人胰腺癌移植瘤后差异性表达基因,从基因组学初步探讨HIFU的生物学机制。方法构建人胰腺癌裸鼠YY-1移植瘤模型,HIFU辐照后采用Agilent人类基因表达谱芯片检测差异性表达基因,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术验证上调基因HIF1a、SMAD4及下调基因Bcl-xl。结果与未辐照对照组相比,辐照组表达谱芯片分析发现与胰腺癌相关的差异性基因共65个,其中上调43个,下调22个。基因本体(GO)分析提示显著表达改变的基因富集于细胞核、细胞质部位,并与蛋白结合、金属离子结合、锌离子结合、转录调控、细胞凋亡等功能相关。RT-PCR检测结果与表达谱芯片分析结果一致。结论 HIFU辐照可引起一系列基因调控改变,这些差异性表达基因可能参与调控肿瘤生物学过程。 展开更多
关键词 高强度聚焦超声 胰腺癌 基因本体 表达谱芯片
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髓系KLF5基因缺失小鼠腹主动脉瘤形成的生物信息学分析
3
作者 常全 张娜娜 马冬 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2020年第6期692-698,共7页
背景腹主动脉瘤(AAA)是一种老年常见高死亡率的心血管系统疾病,发病机制不明确,临床上无有效治疗药物。本课题组前期研究发现,KLF5基因在人和小鼠AAA组织中表达升高,但是对于详细的KLF5基因调控炎症相关基因表达的网络分析未见报道。目... 背景腹主动脉瘤(AAA)是一种老年常见高死亡率的心血管系统疾病,发病机制不明确,临床上无有效治疗药物。本课题组前期研究发现,KLF5基因在人和小鼠AAA组织中表达升高,但是对于详细的KLF5基因调控炎症相关基因表达的网络分析未见报道。目的利用基因芯片技术对髓系KLF5基因表达缺失(LyKLF5-/-)小鼠AAA的差异表达基因进行生物信息学分析,探讨KLF5基因在AAA中的调控机制。方法研究时间为2015年1月-2019年4月。将SPF级KLF5-flox小鼠和SPF级LysM-cre小鼠杂交培育的雄性髓系遗传性LyKLF5-/-小鼠与同笼野生型(WT)C57BL/6小鼠各3只作为实验动物。通过CaPO4诱导小鼠AAA模型,并提取肾下腹主动脉组织总RNA行m RNA芯片筛查。对于筛选出的差异表达基因,利用在线数据库Metascape进行GO功能富集分析和KEGG富集分析,再利用STRING在线数据库进行蛋白互作网络分析。结果 mRNA芯片共筛选到上调表达基因646个,下调表达基因1 410个(|FC|≥2,P<0.05)。与WT小鼠比较,抑制炎症的基因在LyKLF5-/-小鼠表达增加,Bcas3、Hck基因表达分别上调3.96、3.14倍;促进炎症的基因在LyKLF5-/-小鼠表达降低,Retnla、Olig1、Tnfrsf11a分别下调7.68、5.07、3.66倍。GO功能富集分析显示上调差异基因主要参与多肽抗原合成和表达的调控、核苷二磷酸代谢过程、肌节组织的正向调节等过程;下调差异基因主要参与生长发育、细胞对葡萄糖刺激反应的胰岛素分泌调节、平滑肌细胞迁移的正调控等过程。KEGG富集分析显示上调差异基因主要影响破骨细胞分化、吞噬小体、氨基酸的生物合成等通路;下调差异基因主要影响血管平滑肌收缩、泛素介导的蛋白水解作用以及肌动蛋白细胞骨架的调控等通路。蛋白互作网络分析证实,小鼠髓系LyKLF5-/-导致参与血管炎症相关基因Bcas3、Hck表达上调和Retnla、Olig1、Tnfrsf11a表达下调。结论 Bcas3、Hck、Retnla 展开更多
关键词 主动脉瘤 腹 髓系细胞 KLF5基因 表达谱芯片 小鼠
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